mogą być używane do oceny związków przy określonych wartościach pH. W tej sekcji zarejestrujesz widmo absorbancji wskaźnika neutralnego czerwonego w różnych. Protonowana forma neutralnej czerwieni jest czerwona, a forma zdeprotonowana jest żółto-pomarańczowa, co oznacza, że pochłaniają odpowiednio światło zielone i niebiesko-fioletowe. Tak więc formy kwaśne i zasadowe mają różne długości fal absorpcyjnych. Wiązanie białek zmienia właściwości neutralnej czerwieni, zmieniając zarówno jej absorbancję, jak i pKa.
Po zmierzeniu widma absorbancji wolnej neutralnej czerwieni przy kilku wartościach pH, dodasz do roztworów białko wiążące ryboflawinę lub RP i ponownie zmierzysz absorbancję. Intensywność absorbancji jest związana ze stężeniem, więc po laboratorium użyjesz widm do określenia pKa wolnej i związanej neutralnej czerwieni
.
-
Narysuj następującą tabelę w swoim notatniku laboratoryjnym. Ponumeruj kuwety od 1 do 10 i wymień dziewięć wartości pH buforu, których będziesz używać. Dziesiąta kuweta będzie ślepym zbiornikiem na wodę dejonizowaną.
nuta: Zawsze trzymaj kuwety za teksturowane boki i wytrzyj przezroczyste boki tuż przed włożeniem kuwety do spektrofotometru. Pamiętaj, aby wyrównać przezroczyste boki z wiązką światła w spektrofotometrze.
Tabela 2: Absorbancja wolnej i związanej czerwieni neutralnej
| Kuweta # | pH buforu | Abs. at λmax (Free NRH+) | Abs. at λmax (Bound NRH) |
| 1 | 5.0 | | |
| 2 | 5.5 | | |
| 3 | 6.0 | | |
| 4 | 6.5 | | |
| 5 | 7.0 | | |
| 6 | 7.5 | | |
| 7 | 8.0 | | |
| 8 | 8.5 | | |
| 9 | 11 | | |
| 10 | puste | | |
Kliknij tutaj, aby pobrać tabelę 2
-
Zdobądź dziesięć 1,5-mililitrowych kuwet i nakrętek i oznacz je od 1 do 10, aby pasowały do tabeli w twoim zeszycie laboratoryjnym.
-
Oznacz zlewkę o pojemności 25 ml jako 'DIH2O' i napełnij ją wodą dejonizowaną.
-
Spłucz swoje neutralne odpady wodne do kanalizacji i ponownie oznacz zlewkę jako 'wodny odpad buforowy'.
-
Oznacz zlewkę o pojemności 400 ml na używane końcówki do mikropipet.
-
Podłącz końcówkę do mikropipety o pojemności 1 ml i użyj jej do dozowania 1000 μL wody dejonizowanej do kuwety 10. To jest twój ślepy pistolet rozpuszczalnikowy.
-
Umieść 925 μL swojego buforu fosforanu monosodowego pH 7.0 w kuwecie 5.
-
Przynieś pozostałe puste kuwety do stołu buforowego. Kierując się tabelą w zeszycie laboratoryjnym, dozuj 925 μl każdego buforu do odpowiedniej kuwety za pomocą oznakowanych mikropipet. Należy uważać, aby nie używać tej samej końcówki pipety do różnych.
-
Gdy skończysz, przynieś z powrotem do swojego środowiska pracy. Tam ustaw mikropipetę o pojemności 200 μl na dozowanie 75 μl i przymocuj końcówkę do mikropipety.
-
Dozuj 75 μL neutralnej czerwieni do każdej z dziewięciu kuwet buforowych. Odwróć każdą kuwetę kilka razy, aby dokładnie wymieszać roztwory. nuta: Wymień końcówkę pipety, jeśli dotyka bufora.
-
Gdy już zmieszasz neutralną czerwień z każdym buforem, zrób zdjęcie lub zapisz kolory roztworów.
-
Włącz ręczny spektrofotometr i pozwól źródłu światła się rozgrzać. Gdy będzie gotowy, utwórz nowy eksperyment, aby zmierzyć absorbancję w funkcji długości fali dla wolnej neutralnej czerwieni
.
-
Włóż kuwetę z wodą dejonizowaną i uzyskaj spektrum wody dejonizowanej. Ustaw go jako tło rozpuszczalnika lub puste.
-
Następnie usuń puste miejsce i włóż kuwetę neutralnej czerwieni do buforu o najniższym pH, który będzie miał najwyższe stężenie protonowanej neutralnej czerwieni.
-
Zdobądź spektrum, które powinno pokazywać jeden silny szczyt. Zidentyfikuj długość fali odpowiadającą najwyższemu punktowi tego piku lub maksimum. Zapisz tę długość fali w notatniku laboratoryjnym jako lambda max dla protonowanej wolnej neutralnej czerwieni.
-
Zapisz dane i wyjmij kuwetę. Zapisz absorbancję w notatniku, a następnie zbierz widma dla kuwet 2 - 9, korzystając z tej samej procedury.
-
Zapisz długość fali punktu izobestowego w swoim notatniku laboratoryjnym. W tym miejscu wszystkie widma krzyżują się na jednej długości fali. Jeśli widmo nie przecina się w tym punkcie, opróżnij i wyczyść kuwetę, przygotuj nową próbkę i spróbuj ponownie.
-
Gdy zakończysz zbieranie widm dla wszystkich dziewięciu kuwet, zapisz i eksportuj dane.
-
Utwórz nowy eksperyment do pomiaru absorbancji w stosunku do długości fali dla związanego neutralnego koloru czerwonego.
-
Dopasuj nową końcówkę do mikropipety o pojemności 200 μl i dodaj 75 μl roztworu białka wiążącego ryboflawinę do każdej kuwety, łącznie z ślepą próbą. Wysuń końcówkę, zabezpiecz nasadki kuwety i kilkakrotnie odwróć kuwetę, aby wymieszać roztwory.
-
Włóż kuwetę 10 do spektrofotometru i ustaw ją jako ślepą próbę rozpuszczalnika.
-
Zdobądź widmo próbki o najniższym pH i zidentyfikuj długość fali odpowiadającą maksimum najbardziej intensywnego szczytu. Zapisz to w swoim notatniku laboratoryjnym jako maksimum lambda neutralnej czerwieni związanej z protonem.
-
Zdobądź widma dla kuwet 2 - 9 w taki sam sposób, jak to zrobiłeś dla bezpłatnych próbek neutralnej czerwieni. Zapisz w tabeli intensywność przy lambda max dla neutralnej czerwieni związanej z protonem, wraz z długością fali w punkcie izobestycznym.
-
Gdy skończysz, zapisz swoje dane, wyeksportuj je do późniejszej analizy i wyłącz spektrofotometr.
-
Odłóż cały sprzęt i wyrzuć zużyte końcówki do pipet do zatwierdzonego pojemnika na odpady lub kosza na śmieci.
-
Opróżnij kuwety do wodnej zlewki na odpady buforowe i przepłucz kuwety do zlewki wodą dejonizowaną.
-
Opróżnij nadmiar NaOH do podstawowego odpływu i przepłucz cylinder z podziałką wodą.
-
Spłucz podstawowe odpady wodne do kanalizacji dużą ilością wody z kranu, razem z innymi odpadami wodnymi.
-
Umyj swoje szkło, nakrętki do kuwet i mieszadło zgodnie ze standardowymi procedurami laboratoryjnymi. Wyczyść powierzchnie robocze wilgotnym ręcznikiem papierowym, a zużyte ręczniki papierowe i chusteczki laboratoryjne wyrzuć do kosza laboratoryjnego.