Elementy cis-regulatorowe

Regulatory transkrypcyjne to białka, które wiążą się z krótkimi, specyficznymi odcinkami niekodującego DNA, znanymi jako sekwencje cis-regulatorowe. Te niezbędne składniki do regulacji genów są obecne w całym genomie.

Regulatory transkrypcji mogą wiązać się z sekwencjami cis-regulatorowymi na DNA w formie podwójnej helisy. Spiralna forma DNA ma dwa rowki różniące się wielkością. Szerszy rowek, znany jako główny rowek, jest bardziej dostępny niż mniejszy mniejszy rowek, co powoduje, że większość interakcji zachodzi w głównym rowku.

Krawędzie azotowych zasad są odsłonięte wzdłuż rowków i są zdolne do wiązania wodorowego i innych oddziaływań niekowalencyjnych.

To wiązanie regulatorów transkrypcji jest specyficzne dla sekwencji; jednak rozpoznawane są również blisko powiązane sekwencje. To powiązanie jest wysoce stabilne ze względu na wiele interakcji niekowalencyjnych

.

Sekwencje cis-regulatorowe mogą regulować każdy aspekt transkrypcji genów, w tym hamowanie lub inicjację transkrypcji, a także szybkość transkrypcji.

Można je ogólnie podzielić na te, które znajdują się w bliskiej odległości od miejsca transkrypcji i te, które są oddalone o tysiące par zasad. Te, które są blisko, są zwykle częścią sekwencji promotorowych, które inicjują transkrypcję genów.

Ci, którzy są dalej, mogą uczestniczyć w ulepszaniu lub wyciszaniu transkrypcji. Często zwarte upakowanie DNA w chromosomie powoduje, że sekwencje te są przestrzennie blisko genu, który regulują, nawet jeśli znajdują się daleko w sekwencji.

Kombinacja kilku sekwencji cis-regulatorowych kontroluje ekspresję większości genów. W rzadkich przypadkach gen będzie pod kontrolą tylko jednej sekwencji.