Promotor eukariotyczny

Promotor jest głównym regulatorem ekspresji genów, który zawiera miejsca wiązania polimerazy RNA, enzymu odpowiedzialnego za transkrypcję, oraz czynniki transkrypcyjne, które ułatwiają lub hamują wiązanie polimerazy RNA.

Region promotora znajduje się głównie przed genem, który reguluje. Ma wyraźne cechy strukturalne, takie jak zakrzywiona struktura ze zdolnością do zginania się, gdy wiążą się regulatory transkrypcji i niska stabilność termodynamiczna ze względu na obecność regionów bogatych w AT.

U eukariontów ten region kontroli transkrypcji jest bardziej złożony niż u prokariontów. Oprócz głównego promotora, geny eukariotyczne mają wiele dodatkowych sekwencji cis-regulatorowych, które mogą wiązać czynniki transkrypcyjne.

Prokariotyczna polimeraza RNA wymaga czynnika sigma do związania się z promotorem, podczas gdy eukariotyczne polimerazy RNA wymagają kilku takich regulatorów.

Ponadto trzy różne polimerazy RNA u eukariontów, które wiążą się z różnymi promotorami, wymagają różnych regulatorów transkrypcji.

Rdzeń promotora eukariotycznego zawiera kilka charakterystycznych motywów, które współpracują ze sobą w różnych kombinacjach, aby umożliwić wiązanie polimerazy RNA.

Skrzynka TATA jest wysoce konserwatywna we wszystkich organizmach. Pudełka TATA są zwykle obecne w genach, które wykazują wysoki poziom ekspresji specyficznej dla komórki, takich jak białka biorące udział w różnicowaniu komórek.

Elementy inicjujące i dalsze elementy promotorowe składają się ze zdegenerowanych sekwencji, które podążają za określonym wzorcem nukleotydów, chociaż ich dokładna sekwencja jest różna.

Element inicjujący jest najczęstszym motywem promotora. Może pomóc w utrzymaniu podstawowego poziomu transkrypcji lub współpracować z TATA box w celu poprawy wiązania czynników transkrypcyjnych.

Dalszy element promotora znajduje się poniżej miejsca rozpoczęcia transkrypcji i początkowo został znaleziony w promotorach pozbawionych pudełka TATA. DPE często działa w połączeniu z elementem inicjującym w celu regulacji transkrypcji.

Wyspy CpG składają się z odcinków DNA, w których po cytozynie następuje guanina. Wyspy CpG zwykle regulują geny porządkowe, które są stale wyrażane w małych ilościach i nie wymagają wysokiego poziomu transkrypcji.