Ludzkie pluripotencyjne komórki macierzyste (hPSCs), obejmujące ludzkie embrionalne komórki macierzyste (hESCs) oraz ludzkie indukowane pluripotencyjne komórki macierzyste (hiPSCs), stanowią obiecujące źródła komórkowe ze względu na ich nieograniczone zdolności do samoodnawiania oraz potencjał do różnicowania się w wiele typów komórek. Stan pluripotencji hPSCs jest zazwyczaj oceniany za pomocą takich technik jak qPCR, immunocytochemia oraz innych
in vitroi
in vivostrategie różnicowania na wiele typów komórek. Wśród nich opracowano techniki immunocytochemiczne do rutynowej charakterystyki stanu niedróżnicowanego hPSC w oparciu o analizę kandydatów na wewnątrzkomórkowe i powierzchniowe biomarkery komórkowe. Biorąc pod uwagę fakt, że hPSC rosną w postaci kolonii, pojawiają się problemy z rutynowym ilościowym określaniem ekspresji tych markerów na poziomie pojedynczych komórek. Analizy przepływowe służą do rozwiązania tego problemu, lecz wymagają liczby komórek i zastosowania odczynników, które zazwyczaj nie sprzyjają rutynowej ocenie kontroli jakości kultur hPSC. Zatem opracowanie praktycznych i powtarzalnych metod tworzenia monowarstw komórkowych z zachowaną integralnością do oceny markerów niesie ze sobą wiele korzyści w badaniach nad komórkami macierzystymi. Przynosi to znaczące korzyści w analizie immunocytochemicznej, ponieważ poszczególne komórki z monowarstwy można łatwo obserwować i ilościowo oceniać pod kątem ekspresji specyficznych markerów. W tym celu skonstruowano i zoptymalizowano własny aparat do cytospiningu z przeznaczeniem do barwień immunocytochemicznych. Na potrzeby niniejszego protokołu przeanalizowano ekspresję dwóch markerów powierzchniowych (SSEA3/SSEA4) w wariancie linii komórek macierzystych BG01.