Poniższy protokół przedstawia proces wycinania trzustki do obrazowania wirtualnych przekrojów oraz następującą po nim kwantyfikację wszystkich komórek beta znakowanych GFP w całej trzustce.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
Poniższy protokół przedstawia proces wycinania trzustki do obrazowania wirtualnych przekrojów oraz następującą po nim kwantyfikację wszystkich komórek beta znakowanych GFP w całej trzustce.
Część 1: Przygotowanie próbek
Część 2: Obrazowanie i ilościowe określanie powierzchni komórek beta w nienaruszonym trzustce

Rysunek 1A Analiza obrazu Virtual Slice całego rozkładu komórek beta w nienaruszonym trzustce dorosłego osobnika
Obrazy poszczególnych paneli optycznych trzustki samca myszy w wieku 10 tygodni, wykonane przy użyciu obiektywu 2x. Obrazy obejmują cały rozkład wysepek, w tym nawet małe skupiska komórek beta (<10 komórek).

Rycina 1B Analiza obrazowa wirtualnych przekrojów (Virtual Slice) całkowitego rozkładu komórek beta w nienaruszonym trzustce dorosłego osobnika
Zunifikowany wirtualny przekrój z grzbietową częścią trzustki po prawej stronie i brzuszna częścią trzustki po lewej stronie. Pasek skali wynosi 5 mm.
Reprezentatywne wyniki
Prawidłowe przygotowanie trzustki do obrazowania metodą Virtual Slice umożliwi efektywną kwantyfikację wszystkich beta-komórek znakowanych GFP w całej trzustce w postaci obrazu Virtual Slice z wyraźnymi i odrębnymi wysepkami. Skuteczne obrazowanie całej trzustki metodą Virtual Slice in situ zapewnia możliwość badania i ilościowego określania komórek beta, nie tylko w odniesieniu do pojedynczych wysp i całkowitej powierzchni wysp, ale także w zakresie rozkładu wielkości wysp, analizy regionalnej oraz wzorców wzrostu. Chociaż ImageJ pozwala na jednoczesne wykrywanie wszystkich komórek beta podczas analizy obrazów wirtualnych przekrojów, umożliwia on również kontrolę nad wyborem komórek beta do kwantyfikacji poprzez ograniczenie analizy do określonych wielkości wysp (według powierzchni lub średnicy) lub ich lokalizacji. Standardowa analiza wyklucza artefakty, np. zanieczyszczenia, które są mniejsze niż jedna pojedyncza komórka beta (<170 μm2) i rejestruje pole, obwód (odległość otaczającą dany obszar), kołowość (stopień zaokrąglenia, gdzie 1,0 reprezentuje idealne koło) oraz średnicę Fereta (najdłuższą odległość w obrębie obszaru) dla każdego wykrytego wysepki. Analiza Virtual Slice pozwala na ulepszenie obrazów wirtualnych przekrojów poprzez zastosowanie segmentacji Watershed, która rozróżnia i rozdziela nakładające się wysepki na poszczególne jednostki w zależności od ich kształtu. Analiza generuje ponadto serię szczegółowych obrazów, obejmujących maski obrazów dla niskiej i wysokiej intensywności (Rys. 1C), obrys wszystkich domniemanych wysepek, z których każda jest indywidualnie ponumerowana i wymieniona w tabeli z odpowiednimi informacjami (Rys. 1D), a także oryginalny obraz Virtual Slice (Rys. 1B). Należy zauważyć, że potencjalny błąd techniczny przy wyborze wartości progowych może zafałszować ilościowe oznaczenie wysepek poprzez włączenie zbędnego światła otaczającego duże struktury lub poprzez zmniejszenie całkowitej liczby wysepek, szczególnie w przypadku słabych sygnałów pochodzących z małych cząstek.

Rycina 1C Analiza obrazu Virtual Slice całej dystrybucji komórek beta w nienaruszonym trzustce dorosłego osobnika
Maska cząsteczek fluorescencyjnych wirtualnym przekroju. Kody kolorów: [1] niebieski: niska intensywność fluorescencji; [2] zielony: średnia intensywność fluorescencji; i [3] czerwony: wysoka intensywność fluorescencji.

Rysunek 1D Analiza obrazu z wirtualnego przekroju (Virtual Slice) całego rozkładu komórek beta w nienaruszonym trzustce dorosłego osobnika
Ilościowe oznaczenie poszczególnych wysepek/skupisk komórek beta. Należy zwrócić uwagę, że każda wysepka (w tym małe skupiska komórek beta) jest ponumerowana, a szczegółowe informacje na jej temat znajdują się w odpowiedniej tabeli. Dla każdej struktury określono cztery parametry: (1) powierzchnię; (2) obwód; (3) kolistość: stopień zaokrąglenia, gdzie wartość 1,0 reprezentuje idealne koło; oraz (4) średnicę Fereta: najdłuższą odległość w obrębie obszaru. Zwróćmy uwagę, że obiekt nr 706 obrazuje rozdzielczość analizy dla obszaru obejmującego zaledwie kilka komórek beta. Segmentacja metodą watershed (dzielenie wodne) wykrywa grupy sąsiadujących wysepek, takich jak ta przedstawiona na obrazie, i odpowiednio rozróżnia je jako odrębne wysepki (wysepki 154, 155 i 156).

Rysunek 1E Analiza obrazu Virtual Slice całego rozkładu komórek beta w nienaruszonym trzustce dorosłego osobnika
Trójwymiarowy wykres analizy wirtualnego przekroju, z osiami reprezentującymi pole powierzchni, obwód oraz średnicę Fereta. Każda kropka reprezentuje wysepkę.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Analiza obrazów wirtualnych przekrojów (Virtual Slice) wysepek oraz skupisk komórek beta w nienaruszonym trzustce zapewnia szeroki wgląd w całkowity rozkład wysepek. Dzięki temu możliwe jest badanie i porównywanie rozwoju oraz zmian w całkowitym rozkładzie wysepek w czasie. Przykład takiego podejścia zaprezentowano w naszej analizie powstawania wysepek trzustkowych (1). Kompleksowa analiza trzustek noworodków myszy w różnych punktach czasowych (P1-P21) wykazała, że wysepki powstają w wyniku podziału (fission). Podczas gd...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Nie zadeklarowano konfliktów interesów.
Badanie jest wspierane przez granty Public Health Service USA nr DK-081527, DK-072473 oraz DK-20595 przyznane University of Chicago Diabetes Research and Training Center (Animal Models Core), a także darowiznę od Kovler Family Foundation.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Pinceta | Miltex Inc. | ||
| Nożyczki | F.S.T. | 14001-13 | 01n2 |
| Nożyczki | F.S.T. | 14072-10 | 02s5 |
| Duże szkiełko przedmiotowe | Electron Microscopy Sciences | 71862-01 | 75x51x1.2mm |
| Duże szkiełko nakrywkowe | Ted Pella, Inc. | 260462 | 50x75mm |
| Szkiełko przedmiotowe | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0mm |
| Szkiełko nakrywkowe | Fisher Scientific | 12-458-5M | 75x25mm |
| Szkiełko nakrywkowe | Erie Scientific | koło 25mm | |
| Mikroskop fluorescencyjny | Olympus Corporation | ||
| Mikroskop do sekcji | Olympus Corporation | ||
| Stereo Investigator | MBF Bioscience | ||
| Myszy MIP-GFP | Jackson Laboratory |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.