1. Inokulacja bakterii magnetotaktycznych (MTB)
UWAGA: Kultury szczepów AMB-1, MS-1 i MSR-1 można uzyskać komercyjnie (tabela materiałów).
UWAGA: Wszystkie poniższe czynności należy wykonać w sterylnych warunkach, pod płomieniem palnika Bunsena.
- Inokulacja szczepów MSR-1, AMB-1 i MS-1 w płynnym podłożu
- Zamknij pustą butelkę po 125 ml surowicy korkiem z kauczuku butylowego i aluminiową uszczelką zaciskaną. Wprowadzić dwie igły do butelki przez korek i podłączyć strzykawkę do jednej z nich. Podłączyć strzykawkę do butli o średnicyO2 za pomocą tego samego typu rurki, co rurka używana w stacjiN2.
- PozwólO2 przepływać przez butelkę przez około 30 minut, aby upewnić się, że całe powietrze w butelce zostało zastąpione przezO2. Usuń obie igły, dopuszczając do lekkiego nadciśnienia w butelce, a następnie autoklawu. Przed użyciem pozwól butelce ostygnąć do temperatury pokojowej.
UWAGA: Aby zaoszczędzić czas, wykonaj kroki 1.1.1 i 1.1.2 podczas przygotowywania pożywki i autoklawuj butelkę wraz z pożywką lub roztworami podstawowymi. - Wysterylizuj górne części korków zarówno butelki ze świeżą pożywką, jak i butelkiO2, nakładając na nie kilka kropelek 70% roztworu etanolu i przepuszczając je przez płomień palnika Bunsena.
- Za pomocą sterylnej strzykawki i igły pobrać 1 mlO2 z butelkiO2 i przenieść do butelki ze świeżą pożywką. Na tym etapie należy upewnić się, że igła ściśle przylega do strzykawki, aby uniknąć przedostania się powietrza do strzykawki.
- W przypadku użycia inokulum z innej kultury wyhodowanej w szklanej butelce, wysterylizuj korki zarówno butelki ze świeżą pożywką, jak i starszej butelki hodowlanej, nakładając na nie kilka kropelek 70% roztworu etanolu i przepuszczając je przez płomień palnika Bunsena. Jeśli używasz inokulum z probówki z zamrożoną kulturą, po prostu pozwól mu rozgrzać się do temperatury pokojowej z probówką zamkniętą pod płomieniem palnika Bunsena.
- W przypadku stosowania inokulum z innej kultury wyhodowanej w szklanej butelce, należy zaszczepić 1 ml starszej kultury w świeżej pożywce. W przypadku stosowania inokulatu z zamrożonego wywaru, należy zaszczepić tylko 0,1 ml w celu rozcieńczenia glicerolu lub dimetylosulfotlenku (DMSO) stosowanego w procesie zamrażania. W obu przypadkach należy użyć sterylnej igły i sterylnej strzykawki.
- Inkubować kulturę w temperaturze 32 °C i po 4-7 dniach zaszczepić ją w świeżej pożywce.
- Inokulacja MSR-1 w półstałym podłożu o gradiencie O2
- Sprawdź, czy probówka ze świeżą pożywką wykazuje dobrze zdefiniowany interfejs tlenowo-beztlenowy (OAI), zmaterializowany przez interfejs od różowego do bezbarwnego.
- Jeśli inokulum pochodzi z innej półstałej kultury o gradiencie stężeńO2, należy zebrać bakterie, pipetując 50 μl kultury za pomocą sterylnej końcówki pipety umieszczonej na opasce utworzonej przez bakterie. Powoli zaszczepiaj te bakterie w OAI w świeżej pożywce (różowy/bezbarwny interfejs), unikając zakłócania interfejsu. Jeśli inokulum pochodzi z zamrożonej hodowli, należy postępować w ten sam sposób ze 100 μl inokulum.
- Zamknąć probówkę i pozwolić bakteriom rozwijać się w temperaturze od 25 °C do 30 °C. Przenieść do świeżej pożywki, stosując tę samą procedurę, zanim pasmo bakterii dotrze do powierzchni pożywki.
2. Obserwacja bakterii
- Wysterylizuj korek butelki hodowlanej, nakładając na nią 70% roztwór etanolu i przepuszczając go przez płomień palnika Bunsena. W przypadku podłoża półstałego otwórz rurkę pod płomieniem palnika Bunsena. Użyj sterylnej igły i sterylnej strzykawki, aby usunąć bakterie.
- Użyj metody wiszącej kropli8, aby upewnić się, że bakterie są zarówno magnetyczne, jak i ruchliwe.
UWAGA: Mikroskopia z kontrastem fazowym daje doskonałe wyniki, ale nie jest obowiązkowa. Odpowiednie są powiększenia od 10X do 60X.