1. Indukcja różnicowania komórek roju
NUTA: Poniższe kroki opisują, jak indukować różnicowanie V. parahaemolyticus w cyklu życiowym komórki roju i jak stymulować proliferację na powierzchniach stałych.
1. Zawiesić 4 g agaru do infuzji serca (HI) w 100 ml ddH2O w celu przygotowania płytek rojowych.
2. Ostrożnie zagotuj roztwór agaru HI w kuchence mikrofalowej i od czasu do czasu potrząsaj butelką, aż proszek się rozpuści. Autoklaw w temperaturze 121 °C przez 20 min.
3. Po autoklawowaniu schłodzić agar HI do temperatury 60-65 °C. Dodać 2,2'-Bipirydyl do końcowego stężenia 50 μM (roztwór podstawowy 50 mM w 100% etanolu). Dodać CaCl2 do końcowego stężenia 4 mM (roztwór podstawowy 4 M w ddH2O). W razie potrzeby dodaj antybiotyki do roztworu, aby utrzymać plazmidy.
NUTA: Jeśli planujesz użyć indukowalnego plazmidu, dodaj środek indukujący do jego końcowego stężenia.
UWAGA: 2,2'-Bipirydyl: Ostra toksyczność (doustna, skórna, wziewna). Podczas obchodzenia się z tą substancją chemiczną należy używać rękawic i okularów ochronnych.
4. Wlej 30 - 35 ml końcowego roztworu agaru HI do okrągłej płytki Petriego o średnicy 150 mm i pozwól agarowi zastygnąć.
5. Tuż przed wykryciem hodowli komórkowej suszyć płytkę agarową w temperaturze 37 °C przez co najmniej 10 minut (lub do momentu, gdy wszelkie pozostałości płynu znikną, ale nie dłużej) w pionie z otwartą pokrywką.
NUTA: Czas suszenia w dużym stopniu zależy od zastosowanego inkubatora, a mocno wysuszone płytki nie pozwolą na rojenie się V. parahaemolyticus. (Ten krok jest bardzo ważny!) Talerze muszą być świeże i nie powinny być starsze niż 2 - 3 godziny. Stare talerze będą zbyt suche, aby stymulować rojenie.
6. Zaszczepij niewielką ilość komórek z krawędzi pojedynczej kolonii do 5 ml bulionu Luria-Bertani (LB). Inkubować kulturę, wstrząsając w temperaturze 37 °C, aż do osiągnięcia OD600 = 0,8, zwykle trwa to około 2-3 godzin. Następnie komórki są gotowe do nakrycia na płytkach agarowych roju HI.
7. Umieścić 1 μl kultury komórkowej w środku płytki roju agaru HI (ryc. 1A).
8. Pozostaw miejsce do wyschnięcia (Rysunek 1B).
9. Uszczelnij płytkę przezroczystą taśmą z tworzywa sztucznego i upewnij się, że jest dobrze przymocowana, w przeciwnym razie może się odczepić podczas nocnej inkubacji (Rysunek 1C).
NUTA: Bardzo ważne jest, aby uszczelka była idealna. Unikaj tworzenia się pęcherzyków powietrza i fałd na taśmie podczas jej nakładania.
10. Inkubować płytkę w temperaturze 24 °C przez noc. Spowoduje to powstanie kolonii roju V. parahaemolyticus z rozbłyskami roju rozciągającymi się od obrzeży kolonii roju (ryc. 2).