- Żywotność Staphylococcus aureus (S. aureus) po fotolizie FMN (ryc. 1)
- Przenieś kolonię S. aureus (BCRC 10451) z płytki hodowlanej do 10 ml bulionu lizogenicznego pobranego w 15 ml zakręconej probówki. Hodowla w shakerze w temperaturze 37°C przez 16 godzin.
- Przenieść 0,5 ml kultury do probówki wirówkowej o pojemności 1,5 ml. Dodaj wysterylizowaną wodę do probówki wirówkowej, aby rozcieńczyć kulturę do gęstości optycznej 0,5 przy 600 nm (OD600) (~6 x 107 jednostka tworząca kolonie [CFU]/ml).
- Przenieść 0,5 ml kultury do probówki wirówkowej o pojemności 1,5 ml, odwirować przy 14 000 x g przez 10 minut i zdekantować supernatant w celu uzyskania osadu komórkowego.
- Dodać 1 ml ryboflawino-5'-fosforanu (lub mononukleotydu flawinowego; FMN) roztwór buforowany (30, 60 i 120 μM FMN w buforze fosforanu potasu [PB]) do osadów komórkowych otrzymanych jak w kroku 1.3 i wirować. W celu kontroli napromienianej dodać 1 ml samego PB.
- Przenieść po 1 ml każdego z żywych roztworów komórek bakteryjnych zawierających 30 μM FMN i PB samodzielnie do szklanych probówek i naświetlić je światłem fioletowym o sile 10 W/m2 przez 30 minut.
- Przenieść po 1 ml każdego z żywotnych roztworów komórek bakteryjnych zawierających 30, 60 i 120 μM FMN i PB do szklanych probówek i naświetlić je niebieskim światłem o mocy 20 W/m2 przez 120 minut. Ustaw kolejną szklaną probówkę z 1 ml żywego roztworu komórek bakteryjnych zawierającego 120 μM FMN i naświetlaj ją niebieskim światłem o mocy 20 W/m2 przez 60 minut.
- Ustaw probówki zgodnie z opisem w krokach 1.5 i 1.6 i przykryj je grubą folią aluminiową. Te lampy służą jako ciemne elementy sterujące.
- Przechowywać komorę napromieniania (jak również ciemne elementy sterujące) w chłodni w temperaturze 9 ± 1 °C podczas 30-120 minutowego okresu napromieniania.
NUTA: Nie można ignorować ciepła uwalnianego przez diody elektroluminescencyjne (LED), ponieważ chipy LED umieszczone wewnątrz kubka mogą podgrzewać układ fotoreakcji podczas eksperymentów z napromienianiem. Eksperymenty przeprowadzono zatem w chłodni utrzymywanej w temperaturze 9 ± 1 °C. - Po napromienieniu przenieść 0,2 ml z każdego z roztworów reakcyjnych na płytkę z agarem Luria (LA). Rozprowadzić bakterie na płytce za pomocą szklanej pałeczki w kształcie litery L i inkubować przez noc w temperaturze 37 °C.
- Oblicz żywotną liczbę płytek i szybkość inaktywacji S. aureus po nocnym wzroście.
NUTA: Szybkość inaktywacji S. aureus oblicza się jako procentową redukcję, która jest równa [1 -I / D] ×100%, gdzie I i D oznaczają odpowiednio liczbę CFU w napromieniowanej próbce i ciemnej kontroli. Procentową redukcję definiuje się jako ujemną wartość współczynnika inaktywacji.