1. Wytwarzanie urządzenia
Replikacja elementów mikroprzepływowych w materiałach elastomerowych została przeprowadzona w oparciu o metodę opisaną przez Duffy i wsp.1
- Wymieszać elastomer (polidimetylosiloksan; PDMS) oraz czynnik sieciujący z zestawu Silicone Elastomer Kit (Dow Corning, Midland, MI) w stosunku wagowym 9:1 i wylać na matrycę, tworząc warstwę o grubości 4 mm. Odgazować w celu usunięcia pęcherzyków powietrza, a następnie utwardzać mieszaninę w temperaturze 60°C przez 5 godzin. Oddzielić utwardzony PDMS od formy, aby uzyskać stempel z naniesionymi strukturami przepływowymi na elastomerze.
- Wyciąć otwory wlotowe i wylotowe za pomocą wycinaka do biopsji o średnicy 1.5 mm (Miltex, York, PA) zamontowanego na wiertarce stołowej. Usunąć wszelkie pozostałości materiału.
- Poddać stronę ze strukturami stempla oraz czyste szkiełko przedmiotowe działaniu plazmy tlenowej przez 8 minut w trawaczu plazmowym. Bezzwłocznie zetknąć ze sobą potraktowane powierzchnie, aby utworzyć między nimi wiązanie. Przechowywać zmontowany układ w temperaturze 60°C na podgrzewaczu do szkiełek przez co najmniej 5 godzin w celu wzmocnienia wiązania.
- Podłączyć rurki PTFE o średnicy wewnętrznej (ID) 0.032" (Cole Parmer, Vernon Hills, IL) do wlotów i wylotów, korzystając z interfejsu złożonego z męskich złączy luer lock przymocowanych do żeńskich złączy luer lock z kolcami (Qosina, Edgewood, NY).
- Przygotować układ przepływowy, wykorzystując zawory odcinające i łącznik w kształcie litery Y (Upchurch Scientific, Oak Harbor, WA; Rysunek 1). Zamontować urządzenie na mikroskopie. Podłączyć strzykawki do rurek za pomocą igieł 20G 1.5" (BD Bioscience, Rockville, MD).
2. Formowanie jednorodnych sferoidów
Sferoidy utworzono metodą wiszącej kropli2,3.
- Przeprowadź trypsynizację komórek pod sterylnym dygestorium do hodowli komórkowych.
- Odwiruj trypsynizowane komórki przy 2000 rpm przez 5 minut i resuspenduj w 6 ml świeżej pożywki. Rozcieńcz roztwór zapasowy do pożądanego stężenia końcowego (Tabela 1).
- Zdejmij pokrywkę płytki 48-dołkowej i umieść ją odwróconą do góry dnem w sterylnym dygestorium. Na pokrywce widoczne są obszary koliste odpowiadające każdemu dołkowi. Napełnij każdy dołek płytki 1 ml sterylnej wody w celu utrzymania wilgotności. Za pomocą mikropipety nanieś 20 μl kropli rozcieńczonego roztworu komórek w każdym obszarze kolistym. Ostrożnie odwróć pokrywkę i nałóż ją na płytkę z dołkami, upewniając się, że krople nie dotykają krawędzi dołków.
- Inkubuj płytkę w temperaturze 37°C przez określoną liczbę dni (Tabela 1). W każdej wiszącej kropli uformuje się sferoid.
3. Wprowadzenie sferoidów do urządzenia
W tej sekcji należy odnieść się do rysunku 1 i tabeli 2.
- Sterylizujemy urządzenie, przepłukując je 70% ethanolem wprowadzonym przez wlot przepływu. Następnie przepłukujemy PBS, a potem pożywką do hodowli komórkowej buforowaną HEPES. Pozostawiamy strzykawkę z pożywką SF podłączoną do rurek.
- Pobieramy 2-3 sferoidy do strzykawki SP, opukujemy strzykawkę, aby usunąć pęcherzyki powietrza, i podłączamy ją do wlotu pakującego urządzenia.
- Otwieramy zawór wlotowy VPin i zamykamy VFin. Otwieramy zawór wylotowy VPout i zamykamy VFout. Trzymamy strzykawkę pakującą pionowo z igłą skierowaną w dół; obserwujemy, aż sferoidy opadną na dno strzykawki do złącza luer-lock igły. Naciskamy tłok strzykawki pakującej i obserwujemy, jak sferoidy wpływają do rurek i przedostają się do urządzenia. Ponieważ otwarty jest tylko zawór wylotowy pakowania, sferoid wpłynie do komory urządzenia i zostanie zatrzymany przez słupki z tyłu (Rys. 2).
- Zamykamy zawór wlotowy VPin i zawór wylotowy VPout. Montujemy strzykawkę SF w pompie strzykawkowej. Otwieramy zawór VFin oraz zawór VFout. Wprowadzamy pożywkę do urządzenia z przepływem 3 μl/min.
4. Wprowadzenie czynnika wykrywającego apoptozę (CaspGLOW)
Po wypełnieniu komór sferoidami, należy pozostawić je na okres do 24 godzin w celu równowagi, aby ustanowić gradienty składników odżywczych i mikrośrodowiska przed wprowadzeniem czynników terapeutycznych lub wykrywających apoptozę. Ponieważ tkanki w komorach stykają się z nieprzepuszczalnymi ściankami od góry i od dołu, wzdłuż grubości tkanki (0.15mm) nie występują gradienty składników odżywczych. Po 24 godzinach inkubacji wszystkie warstwy komórek wzdłuż grubości tkanki są zatem równoważne, a jedyna heterogeniczność występuje w kierunku oddalenia od kanału przepływowego.
- Zamknij zawór VFin, zatrzymaj pompę strzykawkową, wyjmij strzykawkę SF z pompy i zastąp ją strzykawką zawierającą medium z markerem aktywnej kaspazy-3 CaspGLOW Red w stężeniu 0.25 μl/ml (Red-DEVD-FMK; Biovision, Mountain View, CA).
- Ręcznie przepłucz urządzenie 0,7 ml tego roztworu, aby zapewnić usunięcie starego medium. Zamontuj strzykawkę na pompie, wznowij przepływ i otwórz VFin. W ciągu 5–8 godzin czynnik wykrywający apoptozę dyfunduje do tkanki i fluorescencyjnie rozjaśnia regiony apoptotyczne. Czynnik wykrywający apoptozę w tym stężeniu jest utrzymywany we wszystkich kolejnych roztworach przepływowych wprowadzanych do urządzenia.
Uwaga:
- Heterogenność tkanki można potwierdzić, uzyskując liniowe profile intensywności fluorescencji, zgodnie z opisem w sekcji 6. Profile powinny wykazywać gradienty przestrzenne apoptozy, co potwierdza, że tkanka jest heterogenna pod kątem żywotności komórek.
- Do wykrywania apoptozy można również zastosować marker CaspGLOW Green Active Caspase-3 (Fluorescein-DEVD-FMK; Biovision). Marker ten zawiera zielony fluorofor fluoresceinę zamiast czerwonego fluoroforu rodaminy.
5. Wprowadzenie czynnika terapeutycznego
- Postępuj zgodnie z procedurą opisaną w krokach 4.1-4.2, aby wprowadzić 10 μM chlorowodorku doksorubicyny (Dox; Sigma-Aldrich, St. Louis, MO) zawierającego czynnik wykrywający apoptozę.
- Kontynuuj przepływ roztworu czynnika terapeutycznego przez określony czas. Zamknij zawór VFin i wyłącz pompę strzykawkową. Zastąp strzykawkę z lekiem strzykawką z nowym medium zawierającym czynnik wykrywający apoptozę. Pozostaw przepływ nowego medium przez 24–36 godzin, stale monitorując tkankę pod mikroskopem.
6. Mikroskopia time-lapse i szacowanie współczynników dyfuzji leków
Aby uzyskać najczystsze dane fluorescencyjne, należy wykonywać wszystkie obrazy, ustawiając ostrość mikroskopu na dolnych warstwach tkanek. Ze względu na brak gradientów składników odżywczych w kierunku pionowym (patrz Sekcja 4), dolne warstwy komórek są reprezentatywne dla wszystkich pozostałych warstw znajdujących się powyżej.
- Cały proces akwizycji został zautomatyzowany przy użyciu spersonalizowanego skryptu w programie IPLab (BD Bioscience, Rockville, MD). Należy pozyskać obrazy w świetle przechodzącym i fluorescencyjne upakowanego sferoidu przy powiększeniu 10x co 30 minut (Rys. 3A). Przed wprowadzeniem Dox należy pozyskać obraz fluorescencji tła. Aby uwzględnić duży rozmiar komory (1000 μm x 300 μm), należy pozyskać dwa sąsiadujące obrazy i połączyć je w mozaikę4.
- W celu matematycznego oszacowania współczynników dyfuzyjności leku, pierwszym krokiem jest wygenerowanie uśrednionych liniowych profili intensywności fluorescencji Dox za pomocą programu ImageJ. Należy zaznaczyć prostokątny obszar zainteresowania (ROI) obejmujący tkankę w komorze. Należy użyć polecenia Plot Profile, aby wygenerować profil średnich intensywności jako funkcji odległości od kanału przepływowego. Czynność tę należy powtórzyć dla maksymalnie 3 różnych punktów czasowych.
- Przed wprowadzeniem Dox należy pozyskać obraz fluorescencji tła, aby zmierzyć autofluorescencję tkanki. Od uzyskanych profili intensywności należy odjąć średnią intensywność fluorescencji tła, a następnie znormalizować każdy profil przez odpowiadającą mu intensywność maksymalną, aby uzyskać
(x,t)(Rys. 3B).
- Kolejnym krokiem jest ocena efektywnego współczynnika dyfuzji D dla Dox w tkance nowotworowej. Dyfuzję Dox można przedstawić za pomocą następującego równania5

gdzie erfc to dopełniająca funkcja błędu, x to odległość w głąb tkanki od kanału, a t to czas po wprowadzeniu Dox (patrz Rys. 3). W każdym rozważanym punkcie czasowym należy zastosować następujący schemat iteracyjny:
- Przyjąć wartość szacunkową dla D
- Obliczyć prawą stronę równania dla każdego położenia x
- Obliczyć sumę kwadratów błędów (residuum) między obiema stronami
- Zmodyfikować D, aby zminimalizować residuum
- Należy wyciągnąć średnią z optymalnych wartości D uzyskanych w każdym punkcie czasowym, aby oszacować średni efektywny współczynnik dyfuzji Dox w tkance.
7. Reprezentatywne wyniki:
Zastosowane urządzenia mikroprzepływowe zapewniły optycznie dostępne komory hodowlane o wymiarach 1mm x 0.3mm x 0.15mm do wzrostu trójwymiarowej tkanki nowotworowej. Wielokomórkowe sferoidy nowotworowe zostały wprowadzone do tych komór i zatrzymane przez dwa filtry w postaci słupków z tyłu. Metoda wiszącej kropli pozwoliła na szybkie formowanie sferoidów o spójnym rozmiarze i kształcie z kilku linii komórkowych. Sferoidy pomyślnie hodowano w urządzeniu przez maksymalnie 3 dni. Wzrost w komorach wiązał się z powtarzalną modyfikacją mikrootoczenia wewnątrz sferoidów. Apoptoza występowała rzadziej w komórkach znajdujących się w pobliżu kanału przepływowego, a częściej głębiej w tkance. Urządzenie wykorzystano do oszacowania współczynnika dyfuzji doksorubicyny w tkance nowotworowej. Uzyskana wartość 8.75 x 10-7 cm2s-1 jest zgodna z wartością 9.1 x 10-7 cm2s-1 zgłaszaną wcześniej6 dla raka piersi u ludzi.
| Linia komórkowa | Wymagane stężenie komórek | Czas inkubacji |
| LS174T | 300 komórek/μL | 2-3 dni |
| T47D | 750 komórek/μL | 3-4 dni |
| MDA-MB-231 | 150 komórek/μL | 5–6 dni |
Tabela 1. Parametry dla sferoidów w metodzie wiszącej kropli
| Część | Opis |
| SF | Strzykawka przepływowa |
| SP | Strzykawka do upakowania |
| VFin | Zawór wlotowy przepływu |
| VPin | Zawór wlotowy upakowania |
| VFout | Zawór wylotowy przepływu |
| VPout | Zawór wylotowy upakowania |
Tabela 2. Strzykawki i zawory w układzie przepływowym

Rysunek 1. Schemat układu przepływu VFin i VFout: zawory wlotowe i wylotowe przepływu; VPin i VPout: zawory wlotowe i wylotowe pakowania; SF i SP: strzykawki przepływowe i pakujące. Strzykawka pakująca oraz zawory wlotowe i wylotowe pakowania są wykorzystywane podczas wprowadzania sferoidu do komory. Strzykawka przepływowa oraz zawory wlotowe i wylotowe przepływu służą do późniejszego doprowadzania medium.

Rysunek 2. Schemat sferoidu uwięzionego w komorze urządzenia. Sferoid jest wprowadzany do komory w urządzeniu, gdzie zostaje zatrzymany przez dwa filtrujące słupki znajdujące się w tylnej części komory.

Rycina 3. Dyfuzja doksorubicyny w tkance nowotworowej na urządzeniu. A. Nałożony obraz światła przechodzącego i fluorescencji czerwonej tkanki, pokazujący lokalizację i stężenie doksorubicyny (na czerwono). Pasek skali odpowiada 250 μm. B. Znormalizowany liniowy profil intensywności fluorescencji doksorubicyny.