Badanie funkcji mitochondriów stanowi istotny parametr fizjologii serca, ponieważ mitochondria biorą udział w metabolizmie energetycznym, stresie oksydacyjnym, apoptozie, starzeniu się organizmu, encefalomiopatiach mitochondrialnych oraz toksyczności leków. W związku z tym istnieje duże zapotrzebowanie na technologie pozwalające mierzyć funkcje mitochondriów w sercu. Jedną z technik wykorzystujących podejście integracyjne do pomiaru funkcji mitochondrialnych jest respirometryczna analiza fosforylacji oksydacyjnej (OXPHOS).
Zasada oceny OXPHOS metodą respirometryczną opiera się na pomiarze stężenia tlenu przy użyciu elektrody Clarka. W miarę jak permeabilizowany pęczek włókien zużywa tlen, jego stężenie w zamkniętej komorze spada. Dzięki zastosowaniu wybranych protokołów miareczkowania substratami, inhibitorami i odsprzęgaczami, elektrony są dostarczane do konkretnych miejsc łańcucha transportu elektronów, co umożliwia ocenę funkcji mitochondriów. Przed analizą respirometryczną funkcji mitochondrialnych stosuje się mechaniczne i chemiczne techniki przygotowawcze w celu permeabilizacji sarkolemmy włókien mięśniowych. Permeabilizacja chemiczna wykorzystuje saponinę do selektywnego perforowania błony komórkowej przy zachowaniu architektury komórkowej.
Niniejszy artykuł szczegółowo opisuje etapy przygotowania włókien sercowych pozbawionych błon komórkowych za pomocą saponiny do pomiarów zużycia tlenu w celu oceny mitochondrialnego OXPHOS. Ponadto przedstawiono wskazówki dotyczące rozwiązywania problemów, a także określone substraty, inhibitory i odsprzęgacze, które mogą być wykorzystane do określenia funkcji mitochondriów w konkretnych miejscach łańcucha transportu elektronów. Co istotne, opisany protokół można łatwo zastosować do tkanek serca i mięśni szkieletowych różnych modeli zwierzęcych oraz próbek ludzkich.