Wszystkie procedury związane z pobieraniem próbek zostały przeprowadzone zgodnie z wytycznymi IRB instytutu.
1. Uprawa biofilmów międzykrólestwowych
- Uprawiaj Streptococcus mutans (S. mutans) DSM 20523 oraz Candida albicans (C. albicans) NCPF 3179 na płytkach agarowych w temperaturze 37 °C w warunkach tlenowych.
- Przenieś pojedyncze kolonie każdego organizmu do probówek wypełnionych 5 mL infuzji mózgowo-sercowej (BHI). Uprawiaj przez 18 godzin w warunkach aerobowych w temperaturze 37 °C.
- Wirówka nocnych hodowli w 1 200 x g przez 5 minut. Usuń supernatant, ponownie zawiesij komórki w soli fizjologicznej i dostosuj OD550 nm do 0,5 dla C. albicans (~107 komórek /mL) i S. mutans (~108 komórek /mL). Rozcieńcz zawiesinę S. mutans w stosunku 1:10 sterylną solą fizjologiczną (~107 komórek /mL).
- Pipeta 50 μL jałowego roztworu ślinowego do wgłębień dolnej płyty optycznej z 96 dołkami do mikroskopii. Inkubuj przez 30 minut w temperaturze 37 °C. Przemyj studnie 3 razy 100 μL bezpłodnej soli fizjologicznej. Opróżnić studnie.
- Do każdego odwiertu dodaj 100 μL zawiesiny C. albicans . Inkubuj w temperaturze 37 °C przez 90 minut. Myj 3 razy sterylną solą fizjologiczną.
UWAGA: Nie opróżniaj całkowicie studni podczas mycia. Pozostawić zbiornik o pojemności 20 μL, aby uniknąć nadmiernych sił ścinania. - Do każdego dołku dodaj 100 μL surowicy płodowej z inaktywacją termiczną (inaktywowanej w temperaturze 56 °C przez 30 minut). Inkubuj w 37 °C przez 2 godziny. Myj 3 razy sterylną solą fizjologiczną. Opróżnić studnie, pozostawiając zbiornik o pojemności 20 μL.
- Do każdego odwiertu dodaj 100 μL zawiesiny S. mutans (przygotowanej w kroku 1.3). Dodaj 150 μL BHI zawierającego 5% sacharozy. Inkubuj w temperaturze 37 °C przez 24 godziny lub dłużej. Podczas uprawy starszych biofilmów codziennie zmieniaj medium na świeże BHI. Pod koniec fazy wzrostu biofilmu cross-kingdom przemyj 5 razy sterylną solą fizjologiczną.