1. Konfiguracja DMD
- Płytka DMD, światłowód UV (z kolimatorem) oraz obiektyw 4x są zamontowane pionowo na stole wibroizolacyjnym.
- Światłowód UV należy ustawić tak, aby światło padało na macierz luster pod kątem 45° względem płaszczyzny luster oraz 24° poniżej płaszczyzny luster (Rysunek 1).
- Obiektyw jest zamontowany w taki sposób, aby odległość od DMD do obiektywu odpowiadała ogniskowej danej soczewki.
- Poniżej obiektywu umieszcza się mikroskop odwrócony, tak aby skupione światło odbite od DMD mogło być wizualizowane przez mikroskop. Odległość od obiektywu do powierzchni polimeryzacji powinna odpowiadać w przybliżeniu odległości roboczej soczewki. Stolik mikroskopu może być następnie wykorzystany do regulacji tej odległości w celu precyzyjnego ustawienia ostrości obrazu. Odległość ta może się różnić w zależności od wybranej powierzchni polimeryzacji.
2. Podwójne konstrukty hydrożelowe do hodowli eksplantów tkankowych
A. Adhezja eksplantów DRG
- Pokryć ścianki wkładów do hodowli komórkowych z powłoką kolagenową w 6 dołkach (Corning) preparatem Rain-X, uważając, aby nie pokryć samej membrany. (Alternatywnie można zastosować hydrofobowy pisak do tworzenia barier).
- Nawilżyć wkłady przez noc, stosując 1,5 mL medium adhezyjnego w inkubatorze w temperaturze 37 °C i 5% CO2. Medium adhezyjne to medium neurobasal z dodatkiem 10% płodowej surowicy bydlęcej, 1% penicyliny/streptomycyny, 0,5mM L-glutaminy oraz 20 μg/mL NGF.
- Wyizolować embrionalne zwoje korzeni grzbietowych (DRG) z zarodków szczura w 15. dniu rozwoju (E-15). Zwoje DRG należy wysiać na wkładach 6-dołkowych z powłoką kolagenową, maksymalnie po cztery zwoje na wkład.
- Inkubować wkłady przez 2 godziny, aby umożliwić adhezję DRG do membrany.
B. Fotopolimeryzacja z użyciem dynamicznej maski
Cyfrowe urządzenie mikrolustrzane (DMD) to matryca 1024 x 768 pojedynczych luster, podobna do tych stosowanych w telewizorach projekcyjnych, która selektywnie odbija światło w zależności od położenia luster. W naszych celach DMD jest wykorzystywane do naświetlania światłem ultrafioletowym (UV) fotousieciowalnych hydrożeli, co pozwala w prosty i szybki sposób tworzyć określone geometrie hydrożeli. Rysunek 1 przedstawia konfigurację DMD oraz drogę światła UV. Choć nasze DMD jest jednostką autonomiczną, urządzenie to może zostać również zintegrowane z wieloma istniejącymi mikroskopami.
- Usuń cały nadmiar cieczy z wkładu i dodaj do jego wnętrza 500 μL medium do polimeryzacji. Medium do polimeryzacji zawiera 10% PEG (MW 1000) oraz 0,5% Irgacure 2959 rozpuszczone w medium neurobasal uzupełnionym o 20 μg/mL NGF oraz 1% Pen/Strep.
- Umieść wkład pod urządzeniem DMD na szklanym podstawce potraktowanym preparatem Rain-X.
- Za pomocą dołączonego podstawowego programu GUI ALP-3 załaduj odpowiedni czarno-biały obraz, który będzie służył jako „fotomaska” na DMD. Na potrzeby naszych badań wybrano kształt rozwidlający, aby umożliwić zastosowanie systemów kierowania wypustkami neurytów.
- Używając mikroskopu odwróconego do wizualizacji, wyrównaj eksplanty tkankowe z odpowiednim miejscem na fotomasce, wykorzystując źródło światła widzialnego odbitego od DMD.
- Zamień źródło światła widzialnego na źródło światła UV i naświetlaj roztwór PEG do momentu uzyskania wystarczającego stopnia sieciowania. (Dla podanych warunków i natężenia 5,0 Watts/cm2 padającego na DMD, sieciowanie może zostać ukończone w czasie tak krótkim jak 55 sekund). Powtórz procedurę dla wszystkich czterech DRG na wkładzie.
- Przepłucz każdy wkład trzy razy sterylnym DPBS z 1% Pen-Strep.
- Dodaj 1,5 mL medium wzrostowego pod wkłady do hodowli komórkowych i pozostaw do wyrównania w inkubatorze na 30 minut. Medium wzrostowe to medium neurobasal zawierające 2% B-27, 1% Pen/Strep, 0,5 mM L-glutaminy oraz 20 μg/mL NGF.
C. Wtórny hydrożel
Puramatrix
- W zastosowaniach neuronalnych 1% Puramatrix rozcieńcza się zgodnie z instrukcjami producenta do stężenia 0,15% w sterylnym H2O i uzupełnia o rozpuszczalną lamininę w stężeniu 1 μg/mL.
- Wszelkie nadmiary pożywki należy usunąć z pustych przestrzeni PEG zawierających eksplanty DRG, używając sterylnego aplikatora z patyczkiem bawełnianym, chusteczki Kimwipe lub mikropipety.
- Do pustych przestrzeni PEG za pomocą mikropipety dodaje się Puramatrix, aby wypełnić wolną przestrzeń bez doprowadzenia do przelania. W zależności od objętości pustej przestrzeni, na jeden konstrukt zużywa się zazwyczaj ~ 1 μL.
- Proces samoorganizacji Puramatrix rozpoczyna się natychmiast po kontakcie z fizjologicznym roztworem soli, tzn. napęczniałym PEG, jednak pod insert dodaje się 1,5 mL pożywki wzrostowej i umieszcza go w inkubatorze na jedną godzinę, aby zapewnić całkowitą żelowanie.
- Początkowo Puramatrix ma lekko kwasowy odczyn, dlatego po godzinie należy wymienić pożywkę, aby umożliwić wyrównanie pH.
- Wymiana pożywki jest wymagana mniej więcej co 48 godzin. Należy dbać o to, aby całą pożywkę dodawać pod insert, aby chronić integralność mechanicznie słabego Puramatrix.
Agaroza
- W zastosowaniach neuronalnych agarozę rozcieńcza się do stężenia 1% w pożywce wzrostowej i umieszcza w kąpieli wodnej o temperaturze 60 °C aż do całkowitego rozpuszczenia agarozy (~1 godz.). Następnie do roztworu dodaje się rozpuszczalną lamininę w stężeniu 1 μg/mL.
- Należy usunąć całą nadmiarową pożywkę z pustych przestrzeni PEG.
- Do pustych przestrzeni PEG dodaje się agarozę, aby wypełnić wolną przestrzeń, nie dopuszczając do przelania. W zależności od objętości pustej przestrzeni, zazwyczaj stosuje się ~ 1 μL na konstrukt.
- W płytce 6-dołkowej schładza się wstępnie 1,5 mL pożywki wzrostowej (8 °C), a następnie wkłady zawierające agarozę przenosi się do schłodzonej pożywki i przechowuje w lodówce w temperaturze 8 °C przez co najmniej trzy minuty, aby umożliwić żelowanie agarozy.
- Na koniec wkłady przenosi się do 1,5 mL wstępnie ogrzanej pożywki wzrostowej (37 °C) i inkubuje w temperaturze 37 °C, wymieniając pożywkę co 48 godzin.
3. Podwójna enkapsulacja komórek 3D w hydrożelu
Podwójna enkapsulacja w hydrożelu jest odpowiednia przy użyciu dowolnego żelu samowyciszającego. Żel fotousieciowalny, w tym przypadku PEG, służy jako wsparcie strukturalne dla geometrycznej prezentacji żelu samowyciszającego, na przykład Puramatrix lub agarozy. Niektóre z metod, a w szczególności rodzaj żelu i wybór fotomaski, będą zależeć od konkretnego zamierzonego zastosowania.
- Wgraj odpowiednią maskę do DMD. W naszym zastosowaniu, jakim jest przeżywalność komórek, wybraliśmy prostą cylindryczną prezentację Puramatrix, aby ułatwić obrazowanie komórek. Badacze zajmujący się sygnalizacją komórkową mogą być zainteresowani geometrią przedziałową, aby umożliwić dyfuzję cząsteczek chemotaktycznych. Ponadto pokazano przybliżony model tętnicy, aby przedstawić możliwe zastosowanie w badaniach nad naczyniami krwionośnymi.
- Potraktuj ścianki poliestrowego insertu do hodowli komórkowej preparatem Rain-X i umieść go pod DMD na szkiełku pokrytym Rain-X.
- Dodaj do insertu 500 μL medium do polimeryzacji. Wywołaj sieciowanie PEG poprzez naświetlanie światłem UV przez 55 sekund.
- Przemyj trzy razy sterylnym DPBS oraz 1% Pen-Strep.
- Usuń całe nadmiarowe medium z pustych przestrzeni PEG.
- Odwirowuj komórki przy pożądanej gęstości do postaci pelletu. Należy zadbać o usunięcie całego medium z pelletu komórkowego przed mieszaniem, ponieważ Puramatrix rozpoczyna samoorganizację natychmiast po kontakcie z roztworem soli. Zawieś komórki w 0,15% Puramatrix rozcieńczonym w sterylnym H2O z dodatkiem 10% sacharozy.
- Wstrzyknij mieszaninę Puramatrix/komórki/sacharoza do pustych przestrzeni w PEG.
- Dodaj 1,5 mL medium wzrostowego pod insert i pozostaw do żelowania w inkubatorze przez jedną godzinę.
- Wymień medium po jednej godzinie, a następnie mniej więcej co 48 godzin.
4. Pojedyncza inkapsulacja komórek 3D w hydrożelu
Pojedyncza enkapsulacja w hydrożelu byłaby odpowiednia w każdej sytuacji, w której komórki mogą być badane wewnątrz fotousieciowalnego hydrożelu.
- Wczytaj odpowiednią maskę do urządzenia DMD. W badaniach nad przeżywalnością komórek ponownie wybrano podstawową maskę okrągłą reprezentującą cylinder. W zależności od dziedziny badań można ponownie zastosować maski podobne do tych przedstawionych w metodzie 4.
- Potraktuj poliestrowy insert do hodowli komórkowej preparatem Rain-X, a następnie umieść go pod urządzeniem DMD na szkiełku pokrytym Rain-X.
- Komórki w dowolnym pożądanym stężeniu można dodać bezpośrednio do 10% roztworu PEG, dokładnie mieszając w celu zapewnienia homogennego rozkładu.
- Dodaj 500 μL medium polimeryzacyjnego do insertu. Indukuj sieciowanie PEG poprzez naświetlanie światłem UV przez 55 sekund.
- Przemyj trzy razy sterylnym DPBS z dodatkiem 1% Pen-Strep.
- Wypełnij medium wzrostowym przestrzeń zarówno pod insertem, jak i nad nim, wymieniając medium mniej więcej co 2 dni.
5. Polimeryzacja cienkowarstwowego hydrożelu
- Wczytaj odpowiednią maskę na DMD.
- Potraktuj wkładkę do hodowli komórkowej z poliestru powleczonej kolagenem preparatem Rain-X, a następnie umieść ją na szkiełku powleczonym Rain-X.
- Dodaj wystarczającą ilość medium polimeryzacyjnego, aby zakryć dno wkładki (~250-300 μL dla wkładek do płytek 6-dołkowych). Pozostaw medium, aby przeniknęło przez membranę wkładki przez 30-45 minut w temperaturze pokojowej.
- Usuń nadmiar medium polimeryzacyjnego z wkładki za pomocą mikropipety lub chusteczki Kimwipe. Dodaj wystarczającą ilość oleju przezroczystego dla UV, aby całkowicie zakryć dno wkładki. Pozostaw wkładkę na 15-30 minut w temperaturze pokojowej, aby olej utworzył wyraźną warstwę nad medium polimeryzacyjnym nasycającym membranę wkładki.
- Umieść wkładkę i szkiełko pod DMD. Wywołaj sieciowanie PEG poprzez naświetlanie światłem UV. Ze względu na cienką warstwę PEG, sieciowanie może zostać zakończone w czasie nawet 15 sekund przy natężeniu 5.0 Watts/cm2 padającym na DMD.
- Przemyj wkładkę trzy razy sterylnym DPBS z dodatkiem 1% Pen-Strep. (Jeśli problemem jest utrzymywanie się tłustych osadów, do buforu do płukania można dodać łagodny detergent, taki jak Tween 20 (1%).)
- Przechowuj wkładkę w 6-dołkowej płytce do hodowli tkanek. Dodaj medium wzrostowe do zawiesiny komórek w pożądanym stężeniu, a następnie pipetuj wystarczającą objętość zawiesiny komórek do wkładki do hodowli komórkowej, aby uzyskać pożądaną gęstość komórek. Następnie dodaj pod wkładkę wystarczającą ilość medium wzrostowego, aby w pełni utrzymać żywotność komórek (~1.5 mL).
- Po upływie 48 godzin przemyj wkładkę trzy razy sterylnym DPBS z dodatkiem 1% Pen-Strep, aby usunąć wszystkie nieprzytwierdzone komórki. Wymieniaj medium mniej więcej co 48 godzin.
6. Reprezentatywne wyniki
Przykłady podwójnych konstrukcji hydrożelowych zawierających eksplanty zzęsłów korzeni grzbietowych (DRG) przedstawiono na rysunku 2. Zauważmy, że migracja komórek i wydłużanie neurytów są ograniczone do obszaru konstrukcji podwójnego hydrożelu dopuszczającego obecność komórek. Rysunek 3 przedstawia zdysocjowane komórki enkapsulowane w podobny sposób wewnątrz podwójnych konstrukcji hydrożelowych. Ze względu na dynamiczny charakter maski fotolitograficznej DMD, geometria dostępna do enkapsulacji jest ograniczona jedynie wymiarami i rozdzielczością optyki. Enkapsulacja komórek była możliwa również wewnątrz pojedynczego fotopolimeryzowalnego hydrożelu, PEG, a test żywotności (live/dead) został przeprowadzony, co wykazano na rysunku 4. Enkapsulacja w PEG służy jedynie jako przykład, ponieważ PEG nie stanowi idealnego środowiska dla komórek neuronalnych. W związku z tym żywotność komórek uzyskana w naszych konstrukcjach z PEG jest zrozumiałe niska. Na koniec, na rysunku 5 przedstawiono przykłady wykorzystania cienkich filmów PEG jako wzorowanej warstwy ograniczającej adhezję komórek na wkładkach do hodowli komórkowej. Ponadto na rysunku 6 zaprezentowano przykłady możliwych „nieprawidłowych” wyników.
Wyniki te stanowią jedynie niewielką część możliwych zastosowań metod opracowanych w naszym laboratorium. Mają one na celu zademonstrowanie łatwości, wszechstronności i wykonalności naszego podejścia i mogą zostać potraktowane jako „dowód koncepcji” dla badaczy chcących opracować własne adaptacje.

Rysunek 1. Schematyczny rysunek drogi światła wykorzystywanej w fotolitografii. Wstawka: Światło UV oświetla DMD pod kątem 45°, 24° poniżej płaszczyzny macierzy luster.

Rycina 2. Oznakowany wzrost i proliferacja w konstrukcjach z podwójnego hydrożelu zawierających zwoje korzeni grzbietowych (DRG). A-D) Obrazy przedstawiające spolimeryzowane konstrukcje z PEG (szare) z neurytami oznakowanymi Beta III tubuliną (zielone) oraz jądrami komórkowymi barwionymi DAPI (niebieskie). Eksplanty DRG znajdują się w Puramatrix i są rozmieszczone w okrągłych obszarach wzoru, a neuryty rosną w kierunku rozgałęzienia (rozgałęzień).

Rysunek 3. Podwójne konstrukty hydrożelowe zawierające komórki znakowane calceiną AM, markerem żywych komórek, po 48 godzinach w pożywce wzrostowej. A-D) Różne kształty PEG, wypełnione Puramatrix zawierającym zdysocjowane neurony DRG (~5x103 komórek/mL).

Rycina 4. Pojedyncza konstrukcja hydrożelowa zawierająca żywe komórki znakowane Calcein AM (zielony) oraz martwe komórki znakowane etydinium homodimerem-1 (czerwony) po 24 godzinach w pożywce wzrostowej (5x103 cells/mL).

Rycina 5. Restrykcyjny dla komórek PEG spolimeryzowany w postaci cienkiej warstwy z użyciem „wzorca testowego”, aby selektywnie przytwierdzić dysocjowane komórki do pokrytej kolagenem membrany w podkładkach przepuszczalnych. A, B) Żywe komórki zostały znakowane po 48 godzinach Calcein AM (zielony), natomiast martwe komórki znakowano etydium homodimerem-1 (czerwony). Minimalna adhezja komórek występuje w obszarze zawierającym cienką warstwę PEG.

Rysunek 6. Reprezentatywne obrazy niepożądanych wyników. A) Częściowa polimeryzacja PEG, prowadząca do powstania nieużytecznej konstrukcji z PEG. Nieprawidłowa polimeryzacja może wystąpić z powodu obecności menisku w medium pre-polimerowym, niewystarczającej ilości medium polimeryzacyjnego, niewystarczającej ekspozycji na UV lub niewłaściwego ustawienia ostrości optyki. B) Obraz przedstawiający spolimeryzowane konstrukcje z PEG (szary) z neurytami znakowanymi Beta III tubuliną (zielony) oraz jądrami komórkowymi barwionymi DAPI (niebieski). Neuryty były w stanie rosnąć poza wzorcowanymi kanałami z PEG. Często dzieje się tak w sytuacji, gdy Puramatrix przelewa się na górną część PEG podczas wtryskiwania.