Jądra Drosophila melanogaster stanowią istotny model do badania utrzymania i różnicowania komórek macierzystych, mejozy oraz interakcji między somą a linią zarodkową. Jądra są zazwyczaj izolowane od dorosłych samców od 0 do 3 dni po wyjściu z poczwarki. Jądra much dzikiego typu można łatwo odróżnić od innych tkanek ze względu na ich żółty kolor, natomiast jądra much mutantów white, będących częstym tłem genetycznym w eksperymentach laboratoryjnych, są podobne kształtem i kolorem do jelit muchy. Przeprowadzenie sekcji na szklanym szkiełku przedmiotowym z czarnym tłem znacznie ułatwia identyfikację jąder. Jądra są usuwane z much za pomocą igieł sekcyjnych. W porównaniu z protokołami wykorzystującymi pęsety do sekcji jąder, nasza metoda jest znacznie szybsza, co pozwala wprawnej osobie na wypreparowanie jąder z 200-300 much dzikiego typu na godzinę, co daje 400-600 jąder. Jądra z much white lub z mutantów o zmniejszonym rozmiarze jąder są trudniejsze do wypreparowania i zazwyczaj pozwalają na uzyskanie 200-400 jąder na godzinę.