Artykuł metodologiczny

Chromatografia gazowa w przestrzeni nadpowierzchniowej: technika oceny stężenia etanolu w zarodkach danio pręgowanego

2.2K wyświetleń

8 lipca 2025

W tym artykule

Streszczenie

Źródło: Lovely, C. B. et al. Kwantyfikacja poziomów etanolu w zarodkach danio pręgowanego za pomocą chromatografii gazowej w przestrzeni głowy. J. Vis. Exp. (2020).

Ten film demonstruje użycie chromatografii gazowej w przestrzeni czołowej do określenia stężenia etanolu w zarodkach ryb danio pręgowanych. Metoda ta stanowi użyteczne narzędzie do jakościowej i ilościowej analizy lotnych związków organicznych.

Protokół

Wszystkie procedury dotyczące modeli zwierzęcych zostały sprawdzone przez lokalny instytucjonalny komitet opieki nad zwierzętami oraz weterynaryjną komisję rewizyjną JoVE.

1. Pomiar objętości embrionalnej za pomocą wyporności wody

UWAGA: W tym protokole używane są zarodki po 24 godzinach od zapłodnienia (hpf) (Rysunek 1). Zarodki użyte do pomiarów objętości nie są wykorzystane w analizie etanolu.

  1. Umieścić 10 zarodków i płyn pozazarodkowy w probówce mikrowirówkowej o pojemności 1,5 ml oznaczonej objętością 250 μl (ryc. 2A). Dodać wodę do linii napełniania o pojemności 250 μl (patrz próbka z barwioną wodą na rysunku 2B).
  2. Powtórz krok 1.1, aby ustawić pojemniki dla zarodków, z których usunięto kosmówkę.
    1. Aby usunąć kosmówkę, umieść zarodki w ich kosmówce na 100-milimetrowej szalce Petriego z 2 mg/ml koktajlu proteazy w pożywce dla zarodków w temperaturze pokojowej (RT) przez 10 minut. Co kilka minut delikatnie obracaj zarodki, aby przerwać kosmówkę.
    2. Gdy wszystkie zarodki są wolne od kosmówki, usunąć zarodki pozbawione kosmówki z koktajlu proteazy/pożywki zarodkowej i umieścić na nowej szalce Petriego o średnicy 100 mm ze świeżą pożywką zarodkową w celu umycia zarodków. Powtórz ten krok prania jeszcze 1 raz (w sumie 2 prania). Przenieś zarodki na świeżą szalkę Petriego o średnicy 100 mm.
  3. Używając możliwie najmniejszej końcówki i bez uszkadzania zarodków, ostrożnie usuń cały płyn z okolic zarodków za pomocą mikropipetora p200 (ryc. 2C) i zważ wodę na wadze z dokładnością <0,1 mg. Aby określić objętość próbki 10 zarodków, odejmij masę/objętość pobranej wody (1 ml wody = 1 g wody) od 250 μl. Aby określić objętość pojedynczego zarodka, podziel różnicę między 250 μl a wagą usuniętej wody przez 10,
    figure-protocol-1
    figure-protocol-2

2. Leczenie embrionów etanolem

  1. Zebrać zarodki ze zbiorników godowych i umieścić na standardowej szalce Petriego o średnicy 100 mm. Odliczyć nie więcej niż 100 zarodków na pojedynczą szalkę Petriego i inkubować w temperaturze 28,5 °C.
    nuta: Jeśli kosmówka ma zostać usunięta (krok 1.2), należy ją usunąć przed dodaniem etanolu.
  2. Przy 6 hpf dodać do 100 zarodków na nową, standardową szalkę Petriego o średnicy 100 mm z pożywką dla zarodków lub pożywką dla zarodków + 1% etanolu (v/v). Przykryj, ale NIE uszczelniaj szalki Petriego. Umieścić zarodki w inkubatorze niskotemperaturowym ustawionym na temperaturę 28,5 °C na 18 godzin lub do momentu, gdy zarodki osiągną punkt czasowy rozwoju wynoszący 24 hpf.

3. Przygotowanie przepływu pracy przed przetwarzaniem zarodków do chromatografii gazowej w przestrzeni głowy

  1. Przygotować roztwór 5 M NaCl w wodzie (potrzebne będzie 450 μl na probówkę z próbką), aby zdenaturować wszystkie białka i zapobiec metabolizmowi etanolu. Przygotować koktajl proteazy w stężeniu 2 mg/ml w pożywce zarodkowej.
  2. Oznaczyć 1,5 ml probówki mikrowirówkowej i fiolkę chromatografu gazowego o pojemności 2 ml dla każdej próbki. Oznaczyć dodatkowe fiolki do chromatografu gazowego o pojemności 2 ml dla wzorców etanolu opisanych poniżej, a także powietrze, wodę i ślepe próby koktajlu 5 M NaCl/proteazy.
  3. Ustawić trzy mikropipety p200, dwie ustawione na 50 μl, a trzeci zestaw na 200 μl; mikropipetor p1000 ustawiony na 450 μl i mikropipetor p2 ustawiony na 2 μl. W przypadku szklanych pipet używanych do przenoszenia zarodków z szalek Petriego do probówek mikrowirówek o pojemności 1,5 ml należy szybko przepuścić końcówkę pipety przez płomień, aby wygładzić krawędzie i nie uszkodzić zarodków podczas wciągania ich do pipety.

4. Przetwarzanie embrionów do chromatografii gazowej w przestrzeni głowy

UWAGA: Zarówno zarodki w ich kosmówkach, jak i te wcześniej usunięte z ich kosmówek są traktowane tak samo dla spójności w obliczaniu współczynników rozcieńczenia.

  1. Używając dwóch mikropipetorów p200 ustawionych na 50 μl, narysuj 50 μl roztworu koktajlu proteazy do jednego i wciągnij 50 μl wody do drugiego.
  2. Za pomocą szklanej pipety i mikropipetora szybko umieść 10 zarodków (z kroku 2.2) w probówce do mikrowirówek o pojemności 1,5 ml i zamknij nakrętkę (jak opisano na rysunku 2A). Powtórz tę czynność dla wszystkich próbek, które mają być badane, kontroli i zarodków poddanych działaniu etanolu.
  3. Używając mikropipetora p200 ustawionego na 200 μl, szybko otwórz nakrętkę i usuń wszystkie resztki pożywki z zarodków (jak opisano na rysunku 2C). Szybko umieść pipetę zawierającą 50 μl wody w probówce i szybko, ale delikatnie (aby nie uszkodzić zarodków) dodaj, a następnie usuń wodę. Szybko dodać 50 μl roztworu koktajlu proteazy z pipety oczekującej i zamknąć nakrętkę probówki (Rysunek 2D).
    nuta: Wykonuj ten proces pojedynczo próbkę.
  4. Pozostaw próbkę w temperaturze pokojowej przez 10 minut, aby koktajl proteazy mógł zdegradować kosmówkę. Następnie szybko dodaj 450 μl 5 M NaCl i zamknij nakrętkę probówki (rysunek 2E). Wirować próbki przez 10 minut. Aby przyspieszyć proces, ustaw mieszalnik tak, aby wirował wiele próbek w tym samym czasie.
    UWAGA: Dodaj niewielką ilość (~100 μL) mieszanki kulek krzemionkowych (2 rozmiary, kulka 0,5 mm i 1 mm) do dowolnej probówki z zarodkami starszymi niż 24 hpf. U starszych zarodków struna grzbietowa pozostanie nienaruszona niezależnie od tego, jak długo są one homogenizowane.
  5. Po homogenizacji przez 10 minut szybko usunąć 2 μl homogenizowanego supernatantu z zarodków i dodać do fiolki z chromatografem gazowym. Szybko zamknąć fiolkę nakrętką z politetrafluoroetylenu.

5. Przygotowanie roztworów do produkcji mediów i etanolu

  1. Aby przygotować wzorce pożywki, należy rozcieńczyć pożywkę 10-krotnie roztworem koktajlu 5 M NaCl/proteaza. Dodać 2 μl każdej próbki do fiolki z chromatografem gazowym i zamknąć pokrywą z politetrafluoroetylenu.
  2. Aby przygotować wzorce etanolu, należy utworzyć seryjne rozcieńczenie 100% etanolu w 5 M roztworze koktajlu NaCl/proteazy do następujących stężeń: 0,3125, 0,625, 1,25, 2,5, 5, 10, 20 i 40 mM. Dodać po 2 μl każdego wzorca do fiolki z chromatografem gazowym i zamknąć nasadką z politetrafluoroetylenu.

6. Przygotowanie chromatografii gazowej w przestrzeni głowy

UWAGA: Chromatografia gazowa w przestrzeni głowy jest używana do ilościowego określania poziomu etanolu, a nie do separacji.

  1. Ustaw grzałkę automatycznego podajnika próbek na 58 °C i włącz. Pozwól, aby grzałka osiągnęła temperaturę 58 °C i włącz przewody powietrza i wodoru gazowego zasilające chromatograf gazowy (do jonizacji płomieniowej używanej do ilościowego oznaczania etanolu).
    UWAGA: Psi powinno być ustawione tak, aby chromatograf działał prawidłowo zgodnie ze specyfikacjami producenta. Upewnij się, że przewód helu jest włączony i ustawiony na odpowiednie psi.
  2. W przypadku przegrody należy upewnić się, że liczba wstrzykiwanych próbek nie wynosi >100. W przypadku włókna iniekcyjnego upewnij się, że liczba wstrzykniętych próbek nie wynosi >500.
    UWAGA: Jeśli którykolwiek z nich przekracza liczbę wstrzyknięć, należy je zmienić przed uruchomieniem próbek testowych.
  3. Włącz oprogramowanie analityczne i upewnij się, że stacja robocza jest prawidłowo skonfigurowana. Przechowuj wszystkie dane zgodnie ze standardami laboratorium/działu. Utwórz nową listę próbek dla próbek, które mają zostać uruchomione.
  4. Zainicjuj metodę uruchamiania i poczekaj, aż detektor płomieniowo-jonizacyjny ustabilizuje się przed uruchomieniem próbek. Po ustabilizowaniu uruchom metodę uruchamiania oprogramowania, aby wyczyścić światłowód.

7. Pomiary próbek za pomocą chromatografii gazowej w przestrzeni czołowej

  1. Po zakończeniu metody uruchamiania utwórz 1 nowy wiersz na próbkę na liście próbek. Z menu metod w oprogramowaniu do analizy załaduj 436 Prąd spme etanol 2013 3min absorbować 2_5min rg bieg. METH dla każdej próbki z listy próbek.
    1. Wypełnij listę próbek, zaczynając od powietrza, wody, 5 M półfabrykatów koktajlu NaCl/proteazy. Następnie wprowadź normy w kolejności, od 0,3125 do 40 mM. Postępuj zgodnie z normami z drugą rundą półfabrykatów koktajlowych powietrze, woda i 5 M NaCl/proteaza.
    2. Wprowadzić wszystkie homogenizowane próbki supernatantu zarodka do badania, od najniższego do najwyższego przewidywanego stężenia etanolu. Zakończ wchodząc w trzecią i ostatnią rundę półfabrykatów koktajlu powietrza, wody i 5 M NaCl/proteazy.
  2. Dodać fiolki z chromatografem gazowym do automatycznego podajnika próbek w kolejności, w jakiej próbki zostały wprowadzone. Pozostaw próbki do ogrzania przez 10–15 minut. Uruchom przykładowe przebiegi w oprogramowaniu.
  3. Po uruchomieniu wszystkich próbek i końcowych półfabrykatów aktywuj metodę zamykania w oprogramowaniu, dodając końcową próbkę do listy próbek i uruchamiając tryb wstrzymania. METAMFETAMINA. Utwórz kopię zapasową wszystkich danych uzyskanych podczas próbnych przebiegów. Wyłącz urządzenie w następującej kolejności: grzałka automatycznego podajnika próbek, zbiornik wodoru i dopiero gdy temperatura chromatografu osiągnie 30 °C, zbiornik powietrza. Pozostaw zbiornik helu włączony, aby zachować kolumnę wosku.

8. Integracja piku etanolu w próbce i analiza stężenia próbki

UWAGA: Wszystkie wartości od 8.3 zostały obliczone w pliku Excel, który wszystkie równania zostały wstępnie wypełnione.

  1. Po zakończeniu metody wyłączania kliknij Otwórz chromatogram. Otwórz folder zawierający wyniki. Próbki są automatycznie integrowane z tym programem.
  2. W wynikach upewnij się, że zostały zintegrowane właściwe piki (piki etanolu od 2 do 2,5). Po potwierdzeniu wszystkich próbek wydrukuj lub wyeksportuj wyniki.
  3. Wykreślić na wykresie wysokość piku wzorców etanolu. Obliczyć nachylenie, punkt przecięcia z osią Y i wartości R2 dla wzorców etanolu (R2 powinien wynosić >0,99).
    nuta: Wartości te zostaną wykorzystane do określenia stężenia etanolu na podstawie wysokości piku próbki.
  4. Dla każdej próbki należy odjąć wysokość piku próbki od punktu przecięcia Y wzorców etanolu. Podzielić tę wartość przez nachylenie wzorców etanolu, aby uzyskać wartość etanolu dla każdej próbki w fiolkach GC.
    figure-protocol-3
  5. Aby obliczyć stężenie etanolu w zarodkach, należy najpierw obliczyć współczynnik rozcieńczenia dla każdej próbki. Weź pomiar objętości obliczony w kroku 1.3 niniejszego protokołu i podziel go przez pomiar objętości plus 500 μl. Odpowiada to 5 M roztworowi koktajlu NaCl/proteazy dodawanemu do każdej próbki podczas przetwarzania zarodków (etapy 4.3 i 4.4).
    figure-protocol-4
  6. Stosując ten współczynnik rozcieńczenia próbki, pomnożyć przez wartość etanolu w próbce dla każdej próbki. Wyniki będą w stężeniu mM. Obliczyć próbki referencyjne pożywki, mnożąc wartość alkoholu etylowego w pożywce przez współczynnik rozcieńczenia 10,
    figure-protocol-5
    figure-protocol-6

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Wyniki

figure-results-1
Rysunek 1: Obraz zarodka w 24 godzinie po zapłodnieniu (hpf) wewnątrz kosmówki. Zarodek i żółtko są otoczone płynem pozaembrionalnym, który znajduje się wewnątrz kosmówki.

figure-results-2
Rysunek 2: Protokół pomiaru objętości zarodka i przetwarzania zarodków do analizy. (A) Dziesięć zar...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

Nie stwierdzono konfliktu interesów.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Automatyczny podajnik próbek, CP-8400Varian powiedział:Autosampler do chromatografu gazowego
etanolLaboratoria DeconNumer katalogowy 2701
Fiolka do chromatografu gazowego z przegrodą politetrafluoroetylenową/silikonową i plastikową nasadką 2 mlAgilent8010-0198Można ponownie użyć fiolek po oczyszczeniu, ale nie nakrętek/przegród
Chromatograf gazowy, CP-3800Varian powiedział:
helŚwiadczone na podstawie umowy z uczelnią
Kolumna kapilarna HP InnowaxAgilent19095N-123IGrubość folii 30 m x 0,53 mm x 1,0 μm
Hyrdogen (Błona Śluzowa)Świadczone na podstawie umowy z uczelnią
Probówka do mikrowirówek 1,5 mlFisher Naukowy2682002
Końcówki do mikropipet 10 μLFisher Naukowy13611106
Końcówki do mikropipet 1000 μLFisher Naukowy13611127
Końcówki do mikropipet 200 μLFisher Naukowy13611112
Mikropipeta Pipetman L p1000LGilsonFA10006M
Mikropipeta Pipetman L p200LGilsonFA10005M
Mikropipeta Pipetman L p2LGilsonFA10001M
Przegroda z politetrafluoroetylenu/silikonu i plastikowa nasadkaAgilent5190-7021Wymienne nasadki/przegrody do fiolek do chromatografu gazowego
Zespół włókien do mikroekstrakcji w fazie stałej Karboksen/PolidimetylosiloksanMillipore Sigma57343-UWłókna wymienne
Stacja robocza do chromatografii gwiaździstejVarian powiedział:Oprogramowanie chromatograficzne
Thermogreen Niski (LB-2) SeptaMillipore SigmaNumer katalogowy: 23154Wymiana przegrody wlotowej

Przedruki i uprawnienia

Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE

Poproś o pozwolenie

Tagi

Lotne zwi zki organicznefiolka chromatograficznagaz no nykomora detekcjianaliza wysoko ci pikuobliczanie czynnika rozcie czeniaprzygotowanie pr bki

Powiązane artykuły