1. Pobieranie próbek, przetwarzanie i analiza wewnątrzkomórkowych i emergentnych lm za pomocą cytometrii przepływowej (FCM)
- Przygotować mysią linię komórkową podobną do makrofagów RAW 264.7 w pożywce do hodowli tkankowych DMEM uzupełnionej 10% płodową surowicą cielęcą (odtąd określaną jako DMEM/FCS) przy użyciu kolby o pojemności 125 ml i inkubatora do hodowli tkankowej utrzymywanego w temperaturze 37 °C/5% CO2 . Dostosuj komórki do 1 x 106 komórek/ml i dodaj 1 ml (1 x 106 komórek) do studzienek 6-dołkowego naczynia do hodowli tkankowej.
- Przygotować Listeria monocytogenes, Lm, inokulum bakterii i zainfekować komórki objętością inokulum odpowiadającą MOI 50 (5 x 107 CFU).
- Po 1,5 godziny od zakażenia (hpi) zebrać pożywkę z pierwszego zestawu studzienek i umieścić w probówce mikrowirówkowej o pojemności 1,5 ml z 500 μl 4% paraformaldehydu (PFA) i umieścić na lodzie, aż wszystkie studzienki zostaną przetworzone.
- Aby zebrać wewnątrzkomórkowy Lm, dodaj 1 ml dsH 2O do studzienki i po 60 s przenieś powstały lizat wody do 1,5 ml probówki mikrowirówkowej z 500 μl 4% PFA. Wiruj energicznie przez 10 sekund i umieść na lodzie, aż wszystkie dołki zostaną przetworzone.
- W przypadku pozostałych studzienek usuń pożywkę i zastąp 1 ml DMEM/FCS 5 μg/ml gentamycyny, aby zabić zewnątrzkomórkowy Lm i natychmiast zwrócić komórki do inkubatora.
- Po 30 minutach (2 hpi) usuń pożywkę i zastąp ją DMEM/FCS bez gentamycyny.
- Po 2 i 4 godzinach (4 i 6 hpi) należy wykonać drugi i trzeci punkt czasowy, pobierając pożywki i lizaty.
- Probówki wirówkowe o stężeniu 10 000 x g przez 7 min. Usunąć supernatant bez naruszania osadu.
- Zawiesić każdą granulkę w koktajlu barwiącym zawierającym 50 μl 4% PFA i 15 μl falloidyny. Inkubować probówki w ciemności w temperaturze 4 °C przez 20 minut.
- Po inkubacji dodać 1 ml buforu FACS do każdej probówki i pipetować w górę iw dół, aby wymieszać.
- Wirować probówki o sile 10 000 x g przez 7 minut. Usunąć supernatant bez naruszania osadu.
- Zawiesić każdą osadkę w 400 μl buforu FACS do natychmiastowego użycia lub 200 μl buforu FACS i 200 μl 4% PFA, jeśli jest przechowywana do późniejszej analizy.
- Uruchom próbki na cytometrii przepływowej i przeanalizuj zebrane dane.