Wszystkie procedury z udziałem ludzi zostały przeprowadzone zgodnie z instytucjonalnymi, krajowymi i międzynarodowymi wytycznymi dotyczącymi dobrobytu ludzi i zostały sprawdzone przez lokalną komisję rewizyjną instytucji.
1. Przygotowanie materiałów
- Odczynniki, przeciwciała i substancje chemiczne należy przechowywać zgodnie z Kartą Charakterystyki Substancji Niebezpiecznej (MSDS). Rozpuścić leki lub cytokiny w rozpuszczalnikach jako roztwory podstawowe, a następnie podwielokrotność do przechowywania w temperaturze -20 °C lub -80 °C.
nuta: Szczegółowe informacje dotyczące przygotowania materiału znajdują się w Tabeli materiałów.
2. Izolacja komórek jednojądrzastych krwi obwodowej (PBMC)
- Przed użyciem podgrzać roztwór gradientu gęstości (tabela materiałów) do temperatury 18–20 °C. Odwróć butelkę z roztworem kilka razy, aby zapewnić dokładne wymieszanie.
- Zebrać 3-5 ml próbki ludzkiej krwi żylnej do heparynizowanej fiolki i dobrze wymieszać, delikatnie odwracając probówkę kilka razy.
- Przygotować 4 ml roztworu gradientu gęstości w sterylnej probówce o pojemności 15 ml.
- Ostrożnie nałożyć 1 ml próbki krwi na roztwór gradientu gęstości.
- Wirować przy 400 x g przez 30 minut w temperaturze 18−20 °C (wyłączyć przerwę).
- Ostrożnie i natychmiast odessać warstwę kożucha kożuchowego komórek jednojądrzastych (około 1 ml) na raz, aby uniknąć naruszenia warstw do sterylnej probówki o pojemności 15 ml za pomocą sterylnej pipety o pojemności 1 ml.
- Dodać co najmniej 3 objętości (~ 3 ml) soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) do powłoki kożuchowej w probówce wirówkowej. Zawiesić komórki, delikatnie pipetując je w górę i w dół co najmniej 3 razy sterylną pipetą.
- Wirować przy 400 x g przez 10 minut w temperaturze 18−20 °C. Odessać supernatant.
- Zawiesić osad komórkowy w 5 ml podłoża podstawowego (tabela materiałów) i przenieść do kolby. Hodować komórki w inkubatorze do hodowli komórkowych w temperaturze 37 °C i 5% CO2 .
3. Wprowadzenie i rozbudowa CIK
- W dniu 0 hodować PBMC (1 x 106) w świeżej pożywce podstawowej zawierającej 1 000 j.m./ml IFN-γ przez 24 godziny w wilgotnym inkubatorze do hodowli komórkowych w temperaturze 37 °C i 5% CO2 .
- W dniu 1 odświeżyć pożywkę świeżą pożywką podstawową zawierającą 50 ng/ml przeciwciała anty-CD3, 1 ng/ml rekombinowanej ludzkiej (rh) IL-1α i 1,000 U/ml rh IL-2. Odświeżaj podłoże co 3 dni.
- W dniu 7 odświeżyć pożywkę świeżą pożywką podstawową zawierającą 1 000 U/ml rh IL-2. Odświeżaj pożywkę co 3 dni, aż do końca ekspansji komórek (dzień 14).
4. Immunofenotypowanie do oceny komórek CIK
- Umyj komórki CIK 10 ml sterylnego PBS. Wirować przez 10 minut przy 300 x g i temperaturze 18−20 °C, odessać supernatant i ponownie zawiesić komórki za pomocą 10 ml PBS. Policz liczbę komórek i zbadaj żywotność komórek za pomocą testu wykluczania błękitu trypanowego.
- Podziel komórki CIK na sześć sterylnych probówek o pojemności 1,5 ml o gęstości ~5–10 x 105 komórek/ml PBS. Oznaczyć i traktować w następujący sposób: Probówka 1, ślepa (bez przeciwciał); Probówkę 2 dodać 20 μl izotypu IgG1-FITC; Probówka 3, dodać 20 μl izotypu IgG1-APC mAbs; Probówka 4, dodać 20 μl CD3-FITC; Probówka 5, dodać 20 μl mAb CD56-APC; i probówkę 6, dodaj 20 μl CD3-FITC i 20 μl mAb CD56-APC.
- Delikatnie wymieszaj komórki CIK z przeciwciałami, delikatnie pipetując je w górę i w dół co najmniej 3 razy sterylną pipetą o pojemności 1 ml, a następnie inkubuj przez 30 minut w temperaturze pokojowej w ciemności.
- Odwirować probówki przez 10 minut przy 300 x g i temperaturze 18−20 °C. Odessać supernatant i zawiesić jednokrotnie osad komórkowy w 1 ml PBS. Delikatnie pipetować w górę i w dół co najmniej 3 razy za pomocą sterylnej pipety o pojemności 1 ml.
- Powtórz krok 4.4.
- Pozostaw probówki w ciemności przed analizą cytometrii przepływowej.
5. Rozpoznawanie znaczników CD
- Przenieść zawiesinę komórek do sterylnej probówki z okrągłym dnem o pojemności 5 ml z polistyrenu z nasadką sitkową (siatka 100 μm), delikatnie pipetując przez nasadkę. Ułóż rurki na karuzeli w kolejności.
- Otwórz oprogramowanie do analizy cytometrii przepływowej i utwórz folder eksperymentalny. Kliknij przycisk Nowa próbka, aby dodać próbkę i probówkę do eksperymentu i nazwij probówki w następujący sposób: Probówka 1, Pusta; Rurka 2, izotyp IgG1-CD3; Rurka 3, Izotyp IgG1-CD56; Rurka 4, CD3; Rurka 5, CD56; Rura 6, CD3CD56.
- Utwórz system bramkowania rozproszonego dla populacji komórek CIK (rysunek 1A).
- Wybierz Rura 1 (Pusta) i kliknij przycisk Wykres punktowy, aby utworzyć wykres FSC-A/SSC-A. Narysuj prostokątną bramkę na całej populacji komórek z progiem FSC-A >5 x 104, aby wykluczyć resztki komórek.
- Wybierz parametr SSC-A/SSC-H dla nowego wykresu punktowego i narysuj bramkę wielokątów wokół wszystkich pojedynczych komórek. Wybierz odpowiednio parametr Count/FITC (CD3) i Count/APC (CD56) dla nowego wykresu histogramu. Wybierz parametr FITC (CD3)/APC (CD56) dla nowego wykresu punktowego i narysuj bramkę z czterema kwadrantami, aby zdefiniować cztery subpopulacje.
- Rejestruj dane z 20 000 pojedynczych komórek w każdej próbce. Kliknij przycisk Załaduj próbkę, aby najpierw przeanalizować próbkę kontrolną pustą. Zidentyfikuj całą populację komórek CIK przy użyciu parametrów kanału CD56 i CD3.
- Powtórzyć krok 5.3 w celu zbadania wszystkich próbek.
- Otwórz pliki zawierające wartości statystyczne poszczególnych próbek, aby przeanalizować populacje komórek CIK i wydrukuj je ponownie w plikach analizy.
6. Hodowla i barwienie ludzkich komórek K562 przewlekłej białaczki szpikowej i komórek OC-3 raka jajnika
- Ogniwa K562
- Hodować komórki K562 w kompletnych pożywkach (pożywka podstawowa RPMI zawierająca 10% płodowej surowicy bydlęcej [FBS] i 50 U/ml antybiotyków i dostosować glukozę do 4,5 g/l) o gęstości 0,5−1 x 106 komórek/ml w kolbie do hodowli komórkowej i inkubować w wilgotnym inkubatorze w temperaturze 37 °C i 5%CO2.
- Przenieść pożywkę hodowlaną zawierającą komórki K562 do sterylnych probówek o pojemności 50 ml i zagnieżdżać komórki w temperaturze 300 x g przez 10 minut w temperaturze 18−20 °C w dniu doświadczenia.
- Odessać supernatant, ponownie zawiesić komórki w 5 ml sterylnego PBS i delikatnie wymieszać.
- Granulować komórki w ilości 300 x g przez 10 minut. Odessać supernatant, ponownie zawiesić komórki w PBS i dostosować komórki K562 do stężenia 0,5-1 x 106 komórek/ml.
- Dodać 0,5 μl barwnika karboksyfluoresceiny sukcynimidylowej (CFSE) do 1 ml zawiesiny komórek K562 w sterylnej probówce o pojemności 15 ml o końcowym stężeniu 5 μM. Delikatnie wymieszać zawiesinę, pipetując w górę i w dół co najmniej 3 razy.
- Pozostawić probówkę w inkubatorze do hodowli komórkowych w temperaturze 37 °C i 5% CO2 na 10–15 minut.
- Dodać 9 ml PBS do probówki i osadzać komórki w masie 300 x g przez 10 minut. Zdekantować supernatant, a następnie zawiesić osad komórkowy w 10 ml kompletnej pożywki. Przenieść zawiesinę komórkową do kolby do hodowli komórkowej i umieścić w inkubatorze.
- Ogniwa OC-3
- Hodowla komórek OC-3 w kompletnych pożywkach (pożywka DMEM/F12 zawierająca 10% FBS i 50 U/ml antybiotyków) o gęstości 0,5–1 x 106 komórek w kolbie do hodowli komórkowej w temperaturze 37 °C i 5% CO2 .
- Odessać pożywkę hodowlaną i przemyć komórki PBS na 1 dzień przed eksperymentem.
- Odłączyć komórki, dodając 1 ml roztworu enzymu dysocjacji komórek (tabela materiałów) i inkubować przez 5 minut w temperaturze 37 °C.
- Zawieś komórki, dodając 5 ml PBS i delikatnie wymieszaj. Osadzać komórki w masie 300 x g przez 10 minut i odsysać supernatant. Ponownie zawiesić komórki w PBS i dostosować komórki do stężenia 0,5–1 x 106 komórek/ml.
- Dodać 0,5 μl barwnika CFSE do 1 ml zawiesiny komórek OC-3 w sterylnej probówce o pojemności 15 ml o końcowym stężeniu 5 μM. Delikatnie wymieszać zawiesinę, pipetując w górę iw dół co najmniej 3 razy.
- Pozostawić probówkę w inkubatorze do hodowli komórkowych w temperaturze 37 °C i 5% CO2 na 10–15 minut.
- Dodać 9 ml PBS do probówki i osadzać komórki w ilości 300 x g przez 10 minut. Zdekantować supernatant, a następnie zawiesić osad komórkowy z kompletną pożywką. Wysiać 5 x 10 5 komórek/studzienkę na 6-dołkową płytkę i inkubować w wilgotnym inkubatorze w temperaturze 37 °C i 5% CO2 przez noc.
7. Test cytotoksyczny
- Kohodowla komórek CIK i K562 (CIK-K562)
- Policzyć komórki K562 z kroku 6.1.7 i przetestować żywotność komórek za pomocą testu wykluczenia błękitu trypanowego. Dodaj 1 ml komórek K562 do każdej studzienki na płytce 6-dołkowej o gęstości 5 x 105/ml.
- Dodać 1 ml podłoża podstawowego z komórkami CIK lub bez komórek CIK z kroku 3.4 do płytki 6-dołkowej z kroku 7.1.1 w następujący sposób: Studzienka 1 = ślepa próba, same komórki K562 (5 x 105); Cóż, 2 = same komórki K562 barwione CFSE (5 x 105); Studnia 3 = komórki CIK (E [efektor], 25 x 105) + komórki K562 barwione CFSE (T [cel], 5 x 105); Dobrze 4 = komórki CIK (E, 50 x 105) + komórki K562 barwione CFSE (T, 5 x 105).
- Wymieszać zawiesiny komórek, delikatnie pipetując je w górę i w dół co najmniej 3 razy. Umieścić płytkę w inkubatorze na 24 godziny.
- Kohodowla komórek CIK i OC-3 (CIK-OC-3)
- Dodać 1 ml podłoża podstawowego z komórkami CIK lub bez komórek CIK z kroku 3.4 do płytki 6-dołkowej z kroku 6.2.7 w następujący sposób: Studzienka 1 = ślepa, same komórki OC-3 (5 x 105); Cóż, 2 = same komórki OC-3 barwione CFSE (5 x 105); No 3 = komórki CIK (E, 25 x 105) + komórki OC-3 barwione CFSE (T, 5 x 105); Cóż, 4 = komórki CIK (E, 50 x 105) + komórki OC-3 barwione CFSE (T, 5 x 105).
- Wymieszać zawiesiny komórek, delikatnie pipetując je w górę i w dół co najmniej 3 razy. Umieścić płytkę w inkubatorze na 24 godziny.
- Barwienie barwnikiem 7-aminoaktynomycyny D (7-AAD)
- Zawiesinę komórek CIK-K562 z kroku 7.1.3 należy pobrać bezpośrednio do sterylnej probówki o pojemności 15 ml.
- Pobrać zarówno zawiesinę, jak i przylegające komórki z grup CIK-OC-3 z kroku 7.2.2.
- Przenieść zawiesinę komórek do sterylnej probówki o pojemności 15 ml. Umyj studzienkę 1 ml sterylnego PBS, zbierz PBS i dodaj do probówki. Dodać 0,5 ml roztworu enzymu dysocjacji komórek i inkubować przez 5 minut w temperaturze 37 °C.
- Dodać 1 ml roztworu z tej samej probówki do odpowiedniego dołka i delikatnie wymieszać komórki, pipetując je w górę i w dół co najmniej 3 razy za pomocą sterylnej pipety o pojemności 1 ml. Zbierz wszystkie komórki w tej samej probówce.
- Wirować przy 300 x g przez 10 minut, odessać supernatant i ponownie zawiesić komórki w 1 ml sterylnego PBS. Osadzać komórki w stężeniu 300 x g przez 10 minut, odessać supernatant i ponownie zawiesić komórki w 100 μl sterylnego PBS.
- Dodaj 5 μl barwnika 7-AAD (zapas 50 ng/μl) do zawiesiny komórek. Delikatnie wymieszaj komórki, pipetując je w górę i w dół co najmniej 3 razy za pomocą sterylnej pipety o pojemności 1 ml. Inkubować przez 10 minut i pozostawić w ciemności przed analizą.
- Test zdolności cytolitycznych
- Wymieszać zawiesinę komórek z kroku 7.3.4 i powtórzyć kroki 5.1 i 5.2 jeden raz.
- Kliknij przycisk Nowa próbka, aby dodać próbkę i probówkę do eksperymentu i nazwij probówki w następujący sposób: Probówka 1, tylko komórki K562 (lub OC-3); Probówka 2, tylko ogniwa K562 (lub OC-3) barwione CFSE; Rura 3, E:T = 5:1; Rura 4, E:T = 10:1.
- Utwórz system bramkowania rozproszonego dla testu cytolitycznego (ryc. 2A).
- Wybierz Rura 1 i kliknij przycisk Wykres punktowy, aby utworzyć wykres FSC-A/SSC-A. Narysuj bramkę prostokątną nad wszystkimi zdarzeniami z progiem FSC-A >5 x 104, aby wykluczyć resztki komórek.
- Wybierz parametr SSC-A/CFSE dla nowego wykresu kropkowego. Wybierz parametr 7-AAD/CFSE dla nowego wykresu kropkowego i narysuj bramkę czterokwadrantową, aby zdefiniować cztery subpopulacje.
- Kliknij przycisk Załaduj próbkę, aby najpierw przeanalizować ślepą próbkę kontrolną.
- Dostosuj napięcie SSC-A i FSC-A. Zidentyfikuj populację martwych komórek przy użyciu parametrów kanału CFSE i 7-AAD. Zapisz dane z > 20 000 komórek CFSE+ w każdej próbce.
- Powtórzyć ppkt 7.4.6 dla badania wszystkich próbek.
- Otwórz pliki zawierające wartości statystyczne każdej pojedynczej próbki, aby przeanalizować populacje komórek niezdolnych do życia i wyeksportować dane do plików analizy.