1. Testy cytometrii fosfoprzepływowej do oceny aktywności cytokin wytwarzanych przez zrąb
UWAGA: Oceń supernatant z zmodyfikowanego zrębu przed pierwszym eksperymentem, aby zweryfikować odpowiednią bioaktywność cytokiny generowanej przez zrąb dla indywidualnego eksperymentu. Po walidacji zmodyfikowanego zrębu dalsze badania nie są konieczne, chyba że zostaną wprowadzone zręby, które zostały wyprodukowane z nowym wektorem.
- Zakup linii komórkowych białaczki MUTZ5 i/lub MHH-CALL4 (reagujących na TSLP), rekombinowanych cytokin ludzkich i przeciwciał zatwierdzonych do stosowania w testach cytometrii fosfoprzepływowej w celu wykrycia odpowiednich celów fosforylacji.
- Rozmrozić zebrany supernatant z zrębu kontrolnego i eksprymującego cytokiny.
- Płytkie linie komórkowe białaczki w pożywce R20 (patrz tabela materiałów) w stężeniu 0,2 x 106 komórek na studzienkę na 96-dołkowej płytce do hodowli tkankowej. Płytka 3 dołki na warunek, aby umożliwić trzykrotne testy. Inkubować przez 2 godziny w temperaturze 37 °C. Czas ten pozwala na utratę fosforylacji, która wystąpiła w poprzednich warunkach hodowli.
UWAGA: 12 dołków na linię komórkową zapewnia potrójne testy dla każdego warunku eksperymentalnego pokazanego w kroku 1.4.
- Po 2 godzinach spędzonych w hodowli, przenieść komórki z każdej studzienki do oddzielnych probówek o pojemności 4 ml i odwirować przy 500 x g przez 5 minut, w temperaturze 4 °C. Zdekantować supernatant.
- Zawiesić komórki w 200 μl dla każdego z następujących warunków doświadczalnych (wykonać testy w trzech powtórzeniach): 1) tylko pożywka kontroli ujemnej, 2) pożywka kontroli dodatniej z rekombinowaną cytokiną w stężeniu (stężeniach) nasycenia (TSLP przy 15 ng/ml itd.), 3) supernatant zrębu kontrolnego ze zrębu kontrolnego i 4) supernatant zrębu cytokiny ze zrębu wytwarzającego cytokiny.
- Inkubować komórki przez czas określony w specyficznym komercyjnym teście fosfologicznym (np. 30 minut dla fosfo-STAT5 w MUTZ5 lub MHH-CALL4 w odpowiedzi na TSLP).
- Wirować przy 500 x g przez 5 minut w temperaturze 4 °C i zdekantować supernatant.
- Wykonaj barwienie metodą cytometrii fosfoprzepływowej zgodnie z protokołem producenta i zbierz dane z cytometrii przepływowej.
- Analizuj dane cytometrii przepływowej.
- Bramka na nienaruszonych komórkach w oparciu o rozproszenie światła do przodu (FSC, wskazuje rozmiar komórki) i z boku (SSC, wskazuje ziarnistość komórki).
- Określić medianę intensywności fluorescencji (MFI) nienaruszonych komórek w każdej próbce. Porównaj średnią MFI uzyskaną z potrójnych wartości supernatantu komórek zrębu z wartościami dodatnich i ujemnych pożywek.