Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.

Artykuł metodologiczny

Technika ekstrakcji kwasów nukleinowych z krwi za pośrednictwem cząstek szkła magnetycznego

1.2K wyświetleń

8 lipca 2025

W tym artykule

Streszczenie

Źródło: Rosenstierne, M. W., et al. Szybka, bezpieczna i prosta ręczna ekstrakcja kwasów nukleinowych przy łóżku pacjenta w celu wykrycia wirusa w próbkach krwi pełnej. J. Vis. Exp. (2018).

Ten film demonstruje technikę ekstrakcji kwasów nukleinowych z pełnej ludzkiej krwi za pomocą cząstek szkła magnetycznego (MGP) — małych kulek magnetycznych pokrytych krzemionką. Po lizie komórek krwi za pomocą buforu do lizy, uwolnione kwasy nukleinowe wiążą się z powierzchnią MGP pokrytych krzemionką, ekstrahując cząsteczki z próbki.

Protokół

Wszystkie procedury związane z pobieraniem próbek zostały przeprowadzone zgodnie z wytycznymi instytutu IRB

1. Pobieranie krwi od pacjentów

UWAGA: Podejmij odpowiednie laboratoryjne środki bezpieczeństwa podczas pobierania pełnej krwi od pacjenta. Nosić rękawiczki i okulary. Jeśli pacjent przebywa w izolacji, należy postępować zgodnie z procedurami 4 poziomu bezpieczeństwa biologicznego.

  1. Aby pobrać dożylnie krew pełną od pacjenta, należy użyć igły motylkowej z rurką przedłużającą o małym otworze i rurki próżniowej do pobierania krwi zawierającej bufor do lizy/wiązania. Oprzyj rękę pacjenta w pozycji skierowanej w dół i umieść rurkę pobierającą niżej niż igła motylkowa. Włóż igłę motylkową do żyły pacjenta i przymocuj rurkę próżniową do pobierania krwi do przedłużki o małym otworze.
    nuta: Zapobiegnie to przepływowi zwrotnemu.
  2. Po pobraniu krwi wymieszaj zawartość probówki, obracając probówkę 5 - 10 razy.
    nuta: Ze względu na pozostałą próżnię w probówce do pobierania krwi zawierającej 1,6 ml buforu do lizy/wiązania, objętość pobranej próbki automatycznie wyniesie 1,6 ml.
  3. Zdezynfekuj zewnętrzną część rurki za pomocą 70% etanolu.
  4. Inkubować probówki przez 20 minut w temperaturze pokojowej.
    nuta: W tym miejscu można wstrzymać protokół, a pełne probówki do pobierania krwi można przechowywać w temperaturze -20 °C, 5 °C, 25 °C lub 37 °C przez co najmniej 1 miesiąc.
  5. Przejdź bezpośrednio do uproszczonej metody ekstrakcji NA.

2. Uproszczona ekstrakcja NA krwi pełnej

  1. Aby oczyścić NA z krwi zebranej inaktywowanej buforem do lizy/wiązania, wymieszaj zawartość probówki, obracając rurkę próżniową ręcznie 5 - 10 razy.
  2. Ostrożnie zdejmij pokrywę rurki i opróżnij pokrywę.
  3. Wlać przygotowaną porcję MGP (1 ml) bezpośrednio do probówki do pobierania krwi.
  4. Umieścić nową pokrywkę z nieużywanej probówki do pobierania krwi na probówce zawierającej próbkę.
  5. Umieść palec na wieczku, aby upewnić się, że probówka jest szczelnie zamknięta i wymieszaj zawartość probówki, obracając probówkę do pobierania krwi ręcznie 5 - 10 razy.
  6. Umieść probówkę w uchwycie magnetycznym i przytrzymaj palec na pokrywie, aby upewnić się, że rurka jest szczelnie zamknięta.
  7. Odwróć kilka razy ręcznie uchwyt magnetyczny z rurką, aby upewnić się, że wszystkie MGP są zebrane z boku rurki z magnesem.
    nuta: Uchwyt magnetyczny można zastąpić wydłużonym magnesem i gumową opaską.
  8. Zdjąć pokrywkę probówki i wyrzucić zawartość probówki za pomocą jednorazowej pipety lub po prostu wsypując zawartość do probówki zbiorczej o pojemności 50 ml.
    nuta: Należy unikać wydostawania się aerozoli z probówki o pojemności 50 ml, zamykając probówkę pokrywką.
  9. Wlać przygotowaną porcję buforu do przemywania -1 (WB-1, 4 ml) bezpośrednio do probówki do pobierania krwi.
  10. Umieść pokrywkę na tubie i połóż palec na pokrywce, aby upewnić się, że rurka jest szczelnie zamknięta.
  11. Wyjmij rurkę z uchwytu magnetycznego, trzymając pokrywę mocno dokręconą palcem.
    nuta: Jeśli używasz magnesu i gumowej receptury, po prostu zdejmij gumkę i magnes z tuby.
  12. Ponownie zawiesić MGP, obracając probówkę do pobierania krwi ręcznie 5 - 10 razy.
  13. Powtórz kroki 2.6 - 2.8.
  14. Wlać przygotowaną porcję WB-2 (1,5 ml) bezpośrednio do probówki do pobierania krwi.
  15. Umieść pokrywkę na tubie i wyjmij probówkę z uchwytu magnetycznego.
    nuta: Jeśli używasz magnesu i gumowej receptury, po prostu zdejmij gumkę i magnes z tuby.
  16. Umieść palec na pokrywie, aby upewnić się, że rurka jest szczelnie zamknięta.
  17. Ponownie zawieś MGP, ręcznie obracając probówkę do pobierania krwi na kilka sekund.
  18. Powtórz kroki 2.6 - 2.8.
  19. Wlać przygotowaną porcję WB-3 (3 ml) bezpośrednio do probówki do pobierania krwi.
  20. Umieść pokrywkę na tubie i wyjmij probówkę z uchwytu magnetycznego.
    nuta: Jeśli używasz magnesu i gumowej receptury, po prostu zdejmij gumkę i magnes z tuby.
  21. Umieść palec na pokrywie, aby upewnić się, że rurka jest szczelnie zamknięta.
  22. Ponownie zawiesić MGP, obracając probówkę do pobierania krwi ręcznie 5 - 10 razy.
  23. Powtórz kroki 2.6 - 2.8.
  24. Wlać przygotowaną porcję buforu elucyjnego (EB, 100 μl) bezpośrednio do probówki do pobierania krwi.
  25. Umieść pokrywkę na tubie i wyjmij probówkę z uchwytu magnetycznego.
    nuta: Jeśli używasz magnesu i gumowej receptury, po prostu zdejmij gumkę i magnes z tuby.
  26. Zawiesić MGP w EB, stukając palcem w probówkę do pobierania krwi 5 - 10 razy.
    nuta: W tym miejscu można wstrzymać protokół, a probówki można przechowywać w temperaturze -20 °C.
  27. Przenieść jedną kroplę (5 - 8 μl) zawieszonych MGP do dalszej mieszaniny reakcyjnej amplifikacji NA za pomocą jednorazowej pipety o pojemności 1,5 ml (można zastosować dowolny dalszy diagnostyczny test amplifikacji NA, taki jak amplifikacja izotermiczna za pośrednictwem pętli (LAMP) / lampa z odwrotną transkrypcją (rt-LAMP) lub ilościowe testy łańcuchowej reakcji polimerazy (qPCR)/RT-qPCR).
    nuta: Pola na będą trzymać się MGP, więc upewnij się, że używasz MGP w dalszej reakcji amplifikacji NA. Przed użyciem wymieszać zawiesinę MGP. Po wymieszaniu MGP zbiorą się na dnie probówki.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

Nie stwierdzono konfliktu interesów.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Probówki Vacutainer K2 EDTA (4 ml)Becton Dickinson368861
Plus Pobieranie KrwiBecton Dickinson362725
Igła 23G x 1Becton DickinsonNumer katalogowy: 300800
Strzykawka LUER LOK (3 ml)Becton Dickinson309658
Igła motylkowa z rurką przedłużającą o małym otworzeJørgen Kruuse A/S121714
1% VirkonNomeco A/S849265
Zestaw do izolacji DNA MagNA Pure LC I - Bufor do lizy/wiązania - WkładRoche Diagnostics A/S3246752001
Zestaw do izolacji całkowitych kwasów nukleinowych MagNA Pure LCRoche Diagnostics A/S3038505001
Biobankowanie Nunc™ i probówki kriogeniczne do hodowli komórkowych (1,8 mL)Thermo Fisher Naukowy375418
Biobankowanie Nunc™ i probówki kriogeniczne do hodowli komórkowych (3,6 mL)Thermo Fisher Naukowy379189
Biobankowanie Nunc™ i probówki kriogeniczne do hodowli komórkowych (4,5 mL)Thermo Fisher Naukowy379146
Magnes DynaMag-5™Thermo Fisher NaukowyNumer katalogowy 12303D
Pipeta transferowa (3,5 ml)SarstedtNumer katalogowy: 86.1171.010
Pipety transferowe Thermo Scientific™ Samco™ z cienką końcówką (1,5 mL)Thermo Fisher Naukowy231
Thermo Scientific™ Nunc™ 50 ml stożkowe sterylne probówki wirówkowe z polipropylenuThermo Fisher Naukowy339652
powiedział: powiedział: powiedział: powiedział: powiedział: szt.

Tagi

Magnetyczne cz steczki szklaneprzetwarzanie pr bek krwikoraliki powlekane krzemionktraktowanie buforem lizuj cymseparacja magnetycznaetapy przemywania buforemuwalnianie buforem elucyjnymprzygotowanie do analiz w dalszych etapachr czna technika przy kowa