$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Przygotowanie komórek docelowych do infekcji
- Nasiona komórek docelowych na dzień przed przeprowadzeniem eksperymentu na 96-dołkowej płytce ("płytce docelowej").
- Ułóż wystarczającą ilość komórek w studzience, aby zapewnić prawie zlewającą się (~90%) monowarstwę.
nuta: Będzie to zależeć od względnego rozmiaru docelowego typu komórki. Jeśli używasz ludzkich fibroblastów napletka (HFF), wysiewaj 20 000 komórek / studzienkę.
- Zazwyczaj należy wysiać 21 dołków (7 w dół na 3 w poprzek) na próbkę, co pozwala na analizę 4 próbek na płytkę.
- Wysiewaj dodatkowe 12 dołków na płytkę (tj. rząd 8), aby służyły jako kontrole.
2. Przygotowanie wirusa: mieszaniny przeciwciał
- Dodać 90 μl pożywki połączonej z przeciwciałem (i dobrze wymieszanej) w celu wytworzenia dwukrotnie pożądanego początkowego stężenia przeciwciał testowych do 3 dołków rzędu 1 świeżej płytki 96-dołkowej (płytki "rozcieńczającej").
nuta: Typowe stężenie wyjściowe przeciwciała wynosiłoby 20 μg/ml, ale powinno być określone empirycznie.
- Dodaj 60 μl pożywki do każdego z 18 dołków poniżej (tj. 6 w dół na 3 w poprzek) 3 dołków z kroku 2.1.
- Dodaj 60 μl pożywki do 12 dodatkowych studzienek (tj. rząd 8).
- Przenieść 30 μl rozcieńczenia przeciwciała z rzędu 1 do odpowiednich studzienek w rzędzie 2.
- Wymieszaj zawartość rzędu 2, pipetując płynnie w górę i w dół 20 razy za pomocą pipety wielokanałowej.
- Przenieść 30 μl rozcieńczenia przeciwciał z rzędu 2 do rzędu 3.
- Powtarzaj ten proces mieszania i przenoszenia, aż zawartość rzędu 7 zostanie wymieszana.
- Po wymieszaniu rzędu 7 wyrzucić 30 μl z dołków w rzędzie 7.
- Rozcieńczyć HCMV w kompletnym pożywce, tak aby 50 μl zawierało wystarczającą ilość cząstek zakaźnych, aby spowodować infekcję MOI=1, jeśli zostaną dodane bezpośrednio do komórek.
nuta: HCMV jest patogenem kategorii bezpieczeństwa biologicznego 2 (BSL-2). Upewnij się, że obowiązują odpowiednie procedury bezpieczeństwa i używaj końcówek filtrujących do wszystkich mediów narażonych na HCMV.
nuta: Wymaga to takiej samej liczby zakaźnych cząstek, jak jest w komórkach/studni, która będzie się różnić w zależności od typu komórki i tropizmu wirusa. W przypadku stosowania HFF zgodnie z powyższym opisem, wymagane stężenie wirusa wynosi 4x105 pfu/mL.
nuta: Upewnij się, że przygotowany jest wystarczający nadmiar rozcieńczonego wirusa (np. 10% ekstra).
- Dodać 60 μl rozcieńczonego preparatu wirusowego do wszystkich studzienek zawierających rozcieńczenia przeciwciał i 6 studzienek, które zawierają tylko 60 μl pożywki.
- Dodaj 60 μl pożywki tylko do pozostałych 6 dołków pożywki, aby służyły jako niezainfekowane kontrole.
- Inkubować powstałego wirusa: mieszaniny przeciwciał w temperaturze 37oC przez 1 godzinę.
3. Zakażenie komórek docelowych
- Usuń wszystkie nośniki z komórek docelowych.
- Za pomocą pipety wielokanałowej przenieść 100 μl mieszaniny wirusa: przeciwciała z płytki "rozcieńczającej" na komórki w równoważnej pozycji na płytce "docelowej".
- Inkubować komórki w temperaturze 37 °C, 5% CO2 przez 24 godziny.
4. Utrwalenie komórek
- Usuń wszystkie nośniki z cells.
nuta: W tym momencie nie ma potrzeby wymiany końcówek między studzienkami.
- Umyć wszystkie studzienki 200 μl soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) i wyjąć.
- Do wszystkich studzienek dodać 180 μL -20 oC, 100% etanolu.
- Inkubować płytkę w temperaturze -20 oC przez co najmniej 30 min.
nuta: Ten etap można przedłużyć do co najmniej jednego miesiąca, pod warunkiem, że w miarę jak zaczyna parować, zostanie dodany dodatkowy etanol.
nuta: Od tego momentu płytka jest bezpieczna w obsłudze w warunkach BSL-1 i można używać końcówek bez filtra.
5. Wykrywanie komórek zakażonych wirusem za pomocą immunofluorescencji (IF)
- Usuń etanol z talerza.
- Umyj wszystkie studzienki 200 μl PBS i wyjmij.
- Dodać 200 μl PBS do wszystkich studzienek i inkubować przez 5 minut.
- W międzyczasie przygotuj pierwszorzędowe rozcieńczenie przeciwciał w PBS.
- Wymagane będzie 100 μl mysiego monoklonalnego anty-IE w skali 1:2000 na studzienkę (należy zauważyć, że rozcieńczenie dotyczy specyficznego przeciwciała wymienionego w materiałach).
UWAGA: Rozcieńczenie przeciwciała stosowanego w IF może wymagać optymalizacji, jeśli stosowana jest alternatywa.
- Mieszaj wirowo, aby zapewnić wystarczające wymieszanie.
- Usunąć PBS ze wszystkich studzienek i dodać 100 μl rozcieńczenia przeciwciał pierwszorzędowych.
- Inkubować w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę.
- Usuń przeciwciało pierwotne ze wszystkich studzienek.
- Dodać 200 μl PBS i inkubować przez 5 minut.
- W międzyczasie przygotuj przeciwciało drugorzędowe i rozcieńczenie 4′,6-diamidyn-2-fenyloindolu (DAPI) w PBS.
- Wymagane będzie 100 μl anty-mysiej IgG sprzężonej z fluoroforem w stosunku 1:2000 i 1 μg / ml DAPI na studzienkę.
- UWAGA: Rozcieńczenie przeciwciała drugorzędowego stosowanego w IF może wymagać optymalizacji, jeśli stosowana jest alternatywa.
- Mieszaj wirowo, aby zapewnić wystarczające wymieszanie.
- Usunąć PBS ze wszystkich studzienek i dodać 100 μl przeciwciała wtórnego/rozcieńczenia DAPI.
- Inkubować płytkę w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę, chroniąc przed światłem.
- Usuń przeciwciało wtórne/DAPI ze wszystkich studzienek.
- Umyj wszystkie studzienki 200 μl PBS i wyjmij.
- Dodać 200 μl PBS do wszystkich studzienek i inkubować przez 5 minut.
- Usunąć PBS i dodać 100 μl PBS do wszystkich studzienek i przechowywać, chroniąc przed światłem, w temperaturze 4 oC do momentu przygotowania do obrazu.
nuta: Płyty mogą być przechowywane przez okres do jednego miesiąca przy minimalnej utracie jakości sygnału/obrazu.
6. Obrazowanie i liczenie zainfekowanych komórek
- Aby łatwo i dokładnie określić ilościowo infekcję, zobrazuj co najmniej 25% każdej studzienki, zarówno w kanale niebieskim (DAPI, jądra), jak i przeciwciała drugorzędowym (HCMV immediate-early protein (IE)).
nuta: Sygnał generowany przez immunofluorescencję IE powinien przypominać sygnał barwienia jądrowego i należy sprawdzić obrazy, aby to potwierdzić.
- Można to zrobić ręcznie, ale zaleca się użycie mikroskopu automatycznego.
nuta: Powiększenie będzie zależało od instrumentu, ale ponieważ obrazowane są duże struktury (jądra), zazwyczaj wystarczają obiektywy 4X/10X.
- Po uzyskaniu obrazów przetworzyć je za pomocą wybranego programu do analizy oprogramowania.
- Najpierw zidentyfikuj jądra za pomocą niebieskiego kanału, aby obliczyć liczbę obecnych komórek.
- Tylko te obszary muszą być następnie sprawdzone pod kątem sygnału w kanale czerwonym, ponieważ IE jest białkiem zlokalizowanym jądrowo, aby obliczyć liczbę zainfekowanych komórek.
- Po obliczeniu liczby zakażonych komórek i całkowitej liczby komórek oblicz procent infekcji na podstawie dołka.
- Wartości te można skorygować o poziomy wykrywania tła, odejmując średni odsetek infekcji zaobserwowany w niezainfekowanych studniach od wszystkich innych studzienek.
nuta: Powinno to być znacznie poniżej 1%. Jeśli jest większy niż 1%, procedura analizy wymaga optymalizacji.
- Te skorygowane w tle wartości mogą być teraz wykreślane, badane i analizowane zgodnie z potrzebami.