1. Znakowanie fluorescencyjne i immunocytochemia
Uwaga: Znakowanie immunofluorescencyjne pierwotnych kultur komórek korowych zostało przeprowadzone w szklanych naczyniach do hodowli komórkowych o średnicy 35 mm i objętości roboczej 1 ml.
- Umyj naczynie ze szklanym dnem dwukrotnie roztworem soli fizjologicznej buforowanej fosforanami o pH 7,4 (PBS).
- Utrwal komórki 4% paraformaldehydem przez 15 minut w temperaturze pokojowej (RT).
- Przemyć komórki dwukrotnie PBS i przepuszczać 0,1% Triton X-100 w PBS przez 5 minut.
- Traktuj komórki przez 20 minut w temperaturze pokojowej barwnikiem specyficznym dla aktyny F (nitkowatym), AlexaFluor 488 Phalloidin (1:40, 25 μl falloidyny w 1 ml PBS).
- Przepłucz komórki dwukrotnie PBS i zablokuj 10% normalną surowicą kozią w temperaturze RT przez 1-2 godziny.
- Rozcieńczyć poliklonalne przeciwciało anty-MAP2 (białko 2 związane z mikrotubulami) (1:2,500) w PBS z 2% normalną surowicą kozią i inkubować O/N (przez noc) w temperaturze 4:0C.
- Po inkubacji dwukrotnie przepłukać w PBS.
- Rozcieńczyć przeciwciało drugorzędowe (Alexa Red 594-sprzężone z kozim przeciwciałem IgG przeciwko kurczakowi (1:500) 2% normalnej surowicy koziej i inkubować przez 2 godziny w temperaturze pokojowej.
- Spłucz PBS i dodaj 10 μl/naczynie barwnika Hoescht.
- Inkubować przez 3 minuty w temperaturze pokojowej i dwukrotnie przemyć PBS.
nuta: Oznaczone komórki są teraz gotowe do kroku 2 (zliczanie F-aktyny puncta).
- Zakonserwować próbkę komórkową 100 μl odczynnika zapobiegającego blaknięciu jako środka kryjącego szkiełko nakrywkowe i przechowywać w temperaturze 4:0C w ciemności do długotrwałego przechowywania.
nuta: Faloidyna jest stosunkowo stabilna w PBS w temperaturze +4 °C w ciemności przez okres do 1 tygodnia, a fluorescencję można zachować za pomocą odczynników zapobiegających blaknięciu szkiełek nakrywkowych. Jednak optymalne obrazy uzyskuje się po 1-3 dniach od barwienia, ponieważ falloidyna może zacząć dyfundować przy dłuższym przechowywaniu.
2. Liczenie F-aktyny Puncta
- Włącz mikroskop fluorescencyjny i przełącz na obiektyw 20×. Otwórz oprogramowanie mikroskopu i skonfiguruj program o rozmiarze obrazu 1280×960 pikseli i rozdzielczości obrazu 0,17 μm/piksel przy powiększeniu 1×.
- Uzyskaj obrazy współznakowanych neuronów F-aktyny/MAP2 pod zielonymi (495 nm) lub czerwonymi (613 nm) kanałami fluorescencyjnymi.
- Wybierz 5 zielonych (F-aktyna)/czerwonych (MAP2) znakowanych immunologicznie/niebieskich (Hoescht) obrazów fluorescencyjnych poszczególnych neuronów z wyraźnie zaznaczonymi trzpieniami dendrytycznymi.
- Zidentyfikuj struktury bogate w F-aktynę w segmencie dendrytycznym drugiego rzędu (zakres długości 25-75 μm) z ciągłą immunofluorescencją MAP2.
- Obróć zaznaczony obszar obrazów do poziomu poziomego. Skopiuj i wklej jako nowy obraz.
- Odejmij tło obrazów, stosując spójne dopasowanie dla każdego dania.
- Policz jasnozieloną punkcję F-aktyny i ręcznie prześledź długość wybranego segmentu dendrytycznego przez przeszkolonych niezależnych obserwatorów. Wyeksportuj dane do pliku arkusza kalkulacyjnego.
- Oblicz gęstość, dzieląc całkowitą puncta (N) znakowaną F-aktyną przez długość (L) dendrytów znakowanych MAP2. Wyraż dane jako liczbę F-aktyny puncta na 10 μm dendrytu
nuta: W każdym wybranym segmencie dendrytycznym uwzględniono Puncta (wielkość ≤1,5 μm) fluorescencji F-aktyny o natężeniu piku co najmniej 50% powyżej średniej intensywności barwienia w trzonie dendrytycznym.