| Agaroza, UltraPure | Invitrogen | 16500 | Sprawdzanie sonikacji (Sekcja 4.3.6) |
|---|
| Albumina, Surowica bydlęca (BSA), Bez proteazy, izolacja szoku cieplnego, min. 98% | Sklep BioShop | ALB003 | Rozwiązanie blokujące |
|---|
| Przeciwciało przeciwko Isl1 | Magazyn DSHB | 39,3F7 | Inkuacja przeciwciał za pomocą kulek (sekcja 5.6) |
|---|
| Bioruptor Pico | Diagenoda | B01060010 | Sonikacja chromatyny (sekcja 3.3) |
|---|
| Wirówka 5424 R | Eppendorf | 5404000138 | Sonikacja chromatyny (sekcja 3.5), kontrola sonikacji (sekcja 4.3.1, 4.3.3 i 4.3.4) |
|---|
| Wirówka 5804 R | Eppendorf | 22623508 | Zbieranie, sieciowanie i zamrażanie komórek (sekcja 1.3), liza komórek (sekcja 2.2 i 2.3), sonikacja chromatyny (sekcja 3.1) |
|---|
| Kompletny, mini, wolny od EDTA koktajl inhibitorów proteazy | Roche | 4693159001 | Dodawany do wszystkich, z wyjątkiem buforu proteinazy K i buforu elucji ChIP |
|---|
| Sól sodowa kwasu deoksycholowego | Fisher Scientific | Zobacz materiał BP349 | Bufor do lizy 3, bufor do płukania o wysokiej zawartości soli i bufor do płukania LiCl |
|---|
| EDTA, 0,5 m, sterylny roztwór, pH 8,0 | Sklep BioShop | Zobacz materiał EDT111 | Bufor do lizy 1-3, sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.1), bufor do płukania o wysokiej zawartości soli, bufor do płukania LiCl i bufor elucyjny ChIP |
|---|
| Alkohol etylowy bezwodny, 100% | Alkohole komercyjne | P006EAAN | Sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.3.3) |
|---|
| Formaldehyd, 36,5-38%, zawiera 10-15% metanolu | Sigma | F8775 | Komórki do zbierania, sieciowania i zamrażania (sekcja 1.1) |
|---|
| Glicerol, klasa odczynnika, min 99.5% | Sklep BioShop | GLY002 | Bufor do lizy 1 |
|---|
| Glicyna, klasa biotechnologiczna, min. 99% | Sklep BioShop | GLN001 | Komórki do zbierania, sieciowania i zamrażania (sekcja 1.2) |
|---|
| Glikogen, klasa RNA | Thermo Scientific | Czynnik R0551 | Sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.3.3) |
|---|
| HEPES, 1 M sterylnie przefiltrowany roztwór, pH 7,3 | Sklep BioShop | HEP003 | Bufor do lizy 1, bufor do płukania o wysokiej zawartości soli |
|---|
| Chlorek litu (LiCl), klasa odczynnika | Sklep biologiczny | LIT704 | Bufor płuczący LiCl |
|---|
| Kulki magnetyczne do ChIP (Dynabeads Protein G) | Dynabeads Protein G (kulki magnetyczne do ChIP) | Dynabeads Protein G (kulki magnetyczne do ChIP) | Inkubacja przeciwciał z kulkami (sekcja 5) |
|---|
| Stojak magnetyczny (DynaMag-2 Magnet) | Invitrogen | Numer katalogowy 12321D | Używany w wielu krokach w sekcjach: 5 |
|---|
| N-lauroilosarkozyna, roztwór soli wodnej, 30% roztwór wodny, ≥97,0% (HPLC) | Sigma | Numer katalogowy: 61747 | Bufor do lizy 3 |
|---|
| Etoksylowany oktylofenol (IGEPAL CA630) | Sklep BioShop | NON999 | Bufor do lizy 1 i bufor do płukania LiCl |
|---|
| Fenol:Chloroform:Alkohol izoamylowy, klasa biotechnologiczna (25:24:1) | Sklep BioShop | PHE512 | Sprawdzanie sonikacji (Sekcja 4.3.1) |
|---|
| Sól fizjologiczna buforowana fosforanami (PBS), 1x | Corning | 21040CV | Zbieranie, sieciowanie i zamrażanie komórek (sekcja 1.3) i chromatyna sonikująca (sekcja 3.1), inkuacja przeciwciał za pomocą kulek (sekcja 5.1) |
|---|
| Podstawowy zasilacz PowerPac | Przedsiębiorstwo BioRad | 1645050 | Sprawdzanie sonikacji (Sekcja 4.3.6) |
|---|
| Roztwór proteinazy K, klasa RNA | Invitrogen | 25530049 | Sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.2) |
|---|
| Wolne od rnazy A, Dnazy i proteazy | Thermo Scientific | EN0531 | Sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.3.2) |
|---|
| Chlorek sodu (NaCl), BioReagent | Sigma | Zobacz materiał S5886 | Bufor do lizy 1-3, bufor do płukania o wysokiej zawartości soli |
|---|
| Dodecylosiarczan sodu (SDS), stopień elektroforezy | Sklep BioShop | Zobacz materiał SDS001 | Sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.1), buforu do przemywania o wysokiej zawartości soli i buforu elucyjnego ChIP |
|---|
| Koraliki soniczne i probówki Bioruptor 15 ml | Diagenoda | C01020031 | Sonikacja chromatyny (sekcja 3.1 i 3.2) |
|---|
| Mieszalnik termiczny F1.5 | Eppendorf | 5384000020 | Sekcja 4.2, 4.3.2 i 4.3.5 |
|---|
| Roztwór chlorowodorku Trizma (Tris-HCl), z certyfikatem BioPerformance, 1 M, pH 7,4 | Sigma | Zobacz materiał T2194 | Bufor 10 mM Tris-HCl |
|---|
| Roztwór chlorowodorku Trizma (Tris-HCl), z certyfikatem BioPerformance, 1 M, pH 8,0 | Sigma | Zobacz materiał T2694 | Bufor do lizy 2, bufor do lizy 3, sprawdzanie sonikacji (sekcja 4.1), bufor płuczący LiCl i bufor elucyjny ChIP |
|---|
| VWR Mini Tube Rocker, zmienna prędkość | Firma VWR | Numer katalogowy: 10159-752 | Używany w wielu krokach w sekcjach: 1, 2, 5, 6 i 7 |
|---|
| 2-[4-(2,4,4-trimetylopentan-2-ylo)fenoksy]etanol, Triton X-100, klasa odczynnika | Sklep BioShop | TRX506 | Bufor do lizy 1, chromatyna sonikująca (sekcja 3.4) i bufor do płukania o wysokiej zawartości soli |
|---|