1. Barwienie immunologiczne wycinków organoidów
- Umieść szkiełka mikroskopowe zawierające skrawki organoidów w słoiku do kopiowania z 50 ml wstępnie podgrzanego 1x PBS, przechowując do 10 szkiełek tyłem do siebie.
nuta: Wszystkie skrawki organoidów należy zanurzyć w cieczy.
- Inkubować przez 45 minut w temperaturze 37 °C w celu odżelatynizacji szkiełek.
- Płukać 1x 50 ml 1× PBS przez 5 minut w temperaturze pokojowej: Przenieś szkiełka do słoika zawierającego świeże 1× PBS.
- Przenieść szkiełka do słoika zawierającego 50 ml świeżo przygotowanej glicyny (tabela 1) i inkubować przez 10 minut w temperaturze pokojowej.
- Przenieść szkiełka do słoika zawierającego 50 ml 0,1% trytonu (Tabela 1) i przepuszczać przez 10 minut w temperaturze pokojowej.
- Myć 1× PBS przez 5 min 2x.
- Przygotuj naczynie do barwienia immunologicznego z papieru o grubości 3 mm nasączonego 1× PBS. Osusz szkiełka chusteczką wokół plastrów i ułóż je na papierze o grubości 3 mm. Za pomocą pipety Pasteura pokryć całą powierzchnię szkiełek roztworem blokującym (Tabela 1), 0,5 ml na szkiełko. Inkubować przez 30 minut w temperaturze pokojowej.
- Usuń nadmiar roztworu blokującego i osusz szkiełka chusteczką wokół plastrów. Umieścić 50 μl przeciwciała pierwszorzędowego (tabela 2) rozcieńczonego w roztworze blokującym na skrawkach i przykryć szkiełkami nakrywkowymi. Umieść plastry w przygotowanym wcześniej naczyniu do barwienia immunologicznego. Inkubować przez noc w temperaturze 4 °C.
- Przenieś szkiełka do słoika z 50 ml TBST (Tabela 1), pozwól szkiełkom opaść i myj TBST przez 5 minut 3x.
- Umieścić 50 μl przeciwciała drugorzędowego rozcieńczonego w roztworze blokującym na skrawkach i przykryć szkiełkami nakrywkowymi. Umieść plastry we wcześniej przygotowanym naczyniu do barwienia immunologicznego. Inkubować przez 30 minut w temperaturze pokojowej, chronić przed światłem.
- Przenieś szkiełka ponownie do słoika do kopiowania i myj 50 ml TBST przez 5 minut 3x.
- Osusz szkiełka chusteczką wokół plastrów i umieść plastry we wcześniej przygotowanym naczyniu do barwienia immunologicznego. Za pomocą pipety Pasteura dodaj 0,5 ml roztworu DAPI na całą powierzchnię szkiełek. Inkubować przez 5 minut w temperaturze pokojowej.
- Powtórz krok 1.9.
- Ostrożnie osusz szkiełka chusteczką. Stopniowo dodawaj 50 μl podłoża montażowego wzdłuż szkiełka, a następnie ostrożnie opuść szkiełko nakrywkowe na każde szkiełko, lekko je zginając, aby uniknąć pęcherzyków.
Tabela 1: Roztwory do przygotowania organoidów do kriosekcji i barwienia immunologicznego. Wymieniono wszystkie składniki i objętości używane do przygotowania roztworów stosowanych do przygotowania organoidów do kriosekcji i barwienia immunologicznego.
Żelatyna/sacharoza
Stężenie końcowe: 7,5%/15% w/w | 1. Zważ 15 g sacharozy i 7,5 g żelatyny w sterylnej szklanej butelce Schott i dobrze wymieszaj
2. Podgrzej PBS 1x w temperaturze 65 °C
3. Dodaj podgrzany PBS 1x do końcowej masy 100 g i dobrze wymieszaj
4. Umieść szklaną butelkę Schott na płycie grzewczej o temperaturze 65 °C i potrząsaj, aż żelatyna się rozpuści
5. Inkubować w temperaturze 37 °C do momentu ustabilizowania się roztworu |
Glicyna
Stężenie końcowe: 0,1 M | Dodaj 0,37 g glicyny do 50 ml świeżo przygotowanego PBS 1x. |
Roztwór Triton
Stężenie końcowe: 0,1 % w/v | 1. Przygotować 10 % wywar Triton X-100: 5 g Triton X-100 w 50 ml PBS 1x
2. Dodaj 0,5 ml bulionu Triton X-100 do 50 ml PBS 1x. |
TBST
20 mM Tris-HCl pH 8,0, 150 mM NaCl, 0,05 % w/v Tween-20 | 20 ml Tris 1 M
30 ml NaCl 5 M
5 ml Tween-20 (10 % bulionu: 5 g Tween-20 w 50 ml wody)
Napełnij do 1 l wodą. |
| Rozwiązanie blokujące | Dodać 5 ml płodowej surowicy bydlęcej (FBS, stężenie końcowe: 10 % v/v) do 50 ml TBST. |
| Rozwiązanie DAPI | Dodać 15 μl roztworu podstawowego DAPI (1 mg/ml) do 10 ml wody destylowanej |
| Mówił | 1. Dodać 2,4 g Mowiolu do 6 g glicerolu i wstrząsać przez 1 godzinę na podgrzanym talerzu w temperaturze 50 °C
2. Dodaj 6 ml wody destylowanej i wstrząsaj przez 2 godziny
3. Dodaj 12 ml Tris 200 mM (pH 8,5) i wstrząsaj przez 10 min
4. Wirować przy 5 000 × g przez 15 minut5. Podwielokrotność porcji i przechowywać w temperaturze -20 °C. |
Tabela 2: Przeciwciała pierwszorzędowe. Wymieniono podstawowe przeciwciała, klony i zoptymalizowane rozcieńczenia stosowane do barwienia immunologicznego.
powiedział:
szt.
szt.
szt.
szt.
szt.
powiedział:
szt.
główna)
szt.
powiedział:
powiedział:
powiedział:
szt.
| przeciwciało | Gatunki żywicielskie | Rozcieńczeniu |
| BARHL1 | królik | 1/500 |
| KALBINDYNA | królik | 1/500 |
| MAP2 | mysz | 1/1000 |
| N-CADHERIN | mysz | 1/1000 |
| NESTIN (Gniazdo) | mysz | 1/400 |
| OLIG2 | królik | 1/500 |
| PAX6 (wersja | królik | 1/400 |
| Klasa SOX2 | mysz | 1/200 |
| TBR1 | królik | 1/200 |
| TBR2 | królik | 1/200 |
| TUJ1 | mysz | 1/1000 |