Wszystkie procedury dotyczące próbek zwierzęcych zostały sprawdzone i zatwierdzone przez odpowiednią komisję ds. oceny etycznej zwierząt.
1. Protokół barwienia immunologicznego
- Jeśli próbki były przechowywane w 30% sacharozy, przepłucz je 3 razy przez 20 minut w 1x PBS na platformie bujanej.
- Umieść odcinki przewodu pokarmowego w roztworze blokującym na platformie bujanej na 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
- Usunąć roztwór blokujący i inkubować drogi pokarmowe z odpowiednią ilością przeciwciał pierwszorzędowych rozcieńczonych w roztworze blokującym przez 4 godziny w temperaturze pokojowej lub O/N w temperaturze 4 °C na platformie kołyszącej. Stosować rozcieńczenie 1:1,000 ludzkiego przeciwciała anty-Hu (surowica uzyskana od pacjenta), rozcieńczenie 1:1,000 przeciwciała przeciwko białku zielonej fluorescencji (GFP) kurczaka i rozcieńczenie 1:100 koziego przeciwciała anty-ChAT.
nuta: Wykorzystujemy ludzkie przeciwciało anty-Hu, które zostało uzyskane miejscowo od pacjenta; jednak przeciwciała anty-Hu są dostępne w handlu, na przykład mysie przeciwciała anty-Hu (stosować w rozcieńczeniu 1:500).
- Płucz przewód pokarmowy w 1x PBS 3 razy przez 5 minut, a następnie przez 1 godzinę w temperaturze RT na bujanej platformie.
- Zastąp 1x PBS przeciwciałami drugorzędowymi rozcieńczonymi w stosunku 1:500 w roztworze blokującym na platformie kołyszącej przez 4 godziny w temperaturze RT lub O/N w temperaturze 4 °C. Użyj barwnika anty-ludzkiego przeciw-ludzkiego reagującego z aminami, takiego jak Dylight, osła anty-kurczak Cy2 i ośła anty-koza Cy5. Jeśli używasz mysiego przeciwciała anty-Hu, użyj rozcieńczenia 1:500 barwnika anty-mysiego reagującego z aminami 405,
nuta: Intensywność endogennej ekspresji GFP i tdTomato oraz klarowność barwienia immunologicznego wzrastają wraz z wiekiem rozwojowym. Zazwyczaj barwiemy immunologicznie jelita embrionalne pojedynczo w probówkach o pojemności 0,2 ml ze 150 μl roztworu barwiącego, aby zmniejszyć objętość użytego przeciwciała, a także zapewnić skuteczne barwienie tkanki.
- Płucz przewód pokarmowy w 1x PBS 3 razy przez 5 minut, a następnie przez 1 godzinę w temperaturze RT na bujanej platformie.
- Umieść kilka kropli fluorescencyjnego podłoża montażowego z DAPI na szklanym szkiełku. Zanurz przewód pokarmowy w pożywce do montażu fluorescencji i dodaj szkło nakrywkowe bezpośrednio na chusteczkę. Fluorescencyjny nośnik montażowy -G jest rozpuszczalnym w wodzie związkiem, który zapewnia półtrwałe uszczelnienie.
nuta: Użyj pożywki do montażu fluorescencji, takiej jak Vectashield, pożywki montażowej na bazie glicerolu, która zapobiega blaknięciu przeciwciał i fotowybielaniu. Oba te produkty umożliwiają przechowywanie tkanek przez długi czas w temperaturze 4 °C.
- Uchwyć obrazy każdego fluoroforu za pomocą mikroskopu konfokalnego. Należy użyć długości fal wzbudzenia dla fluoroforów i filtrów zastosowanych w tabeli 1.
- Wykonuj komputerową analizę obrazu za pomocą odpowiedniego oprogramowania w zależności od typu konfokalnego używanego do przechwytywania obrazów.
Tabela 1: Długości fal wzbudzenia obrazowania konfokalnego, fluorofory i filtry. Przedstawiono długości fal wzbudzenia, wykrywalne fluorofory i zastosowane filtry. Informacje te można wykorzystać przy wyborze kombinacji przeciwciał drugorzędowych do immunofluorescencji wielobarwnej.
| Wzbudzenie | Emisja |
| Linia laserowa | Typ fluoroforu | Przykłady | Rurka fotopowielacza | Opcje filtrowania |
| 408 nm | niebieski | Alexa Fluor 405, Cascade Blue, Coumarin 30, DAPI, Hoechst, Pacific Blue, większość kropek kwantowych | 1 | BP 425-475 nm |
| 488 nm | zielony | Alexa Fluor 488, ATTO 488, Calcein, Cy2, eGFP, FITC, Oregon Green, YO-PRO-1 | cyfra arabska | BP 500-550 nm |
| 561 nm | czerwony | Alexa Fluor 546, 555, 568 i 594, Cy3, DiI, DsRed, mCherry, Fikoerytryna (PE), Jod propydyny (PI), RFP, TAMRA, tdTomato, TRITC | 3 | Ciśnienie krwi 570-620 nm |
| 638 nm | Daleki czerwony | Alexa Fluor 633 i 647, allofikocyjanina (APC), Cy5, TO-PRO-3 | 4 | BP 663-738 nm |