Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.

Artykuł metodologiczny

Hybrydyzacja in situ przy użyciu sond oligonukleotydowych do badania ekspresji RNA w skrawkach mózgu szczura

889 wyświetleń

⸱

8 lipca 2025

W tym artykule

Streszczenie

Źródło: Shokry, I. M., et al. Szybka hybrydyzacja In Situ przy użyciu sond oligonukleotydowych na mózgu szczurów z zespołem serotoninowym z przedrostkiem paraformaldehydu. J. Vis. Exp. (2015).

Ten film demonstruje wykrywanie syntezy RNA receptora serotoninowego za pomocą sond oligonukleotydowych w tkance mózgowej szczura dotkniętej zespołem serotoninowym. Protokół obejmuje wstępną obróbkę tkanek, hybrydyzację sondy i detekcję enzymatyczną w celu wizualizacji i ilościowego określenia ekspresji RNA receptora serotoninowego pod mikroskopem.

Protokół

Wszystkie procedury dotyczące próbek zwierzęcych zostały poddane przeglądowi i zatwierdzone przez odpowiednią komisję ds. oceny etycznej zwierząt.

1. Przygotowanie

  1. Przygotowanie i cięcie tkanek
    1. Szczury należy losowo podzielić na trzy grupy: świeże/solne (SAL; 0,9% NaCl), z prefiksem/SAL i z prefiksem/3,4-metylenodioksymetamfetaminą (MDMA; szczegóły w tabela 1).
    2. Podawać trzy dawki 1 ml/kg SAL i 10 mg/kg MDMA odpowiednio dootrzewnowo grupom SAL i MDMA w odstępie 2 godzin. Pozwól zwierzętom przetrwać leczenie przez 6 dni.
    3. W dniu 7 podaj 100 mg/kg ketaminy w połączeniu z 5 mg/kg ksylazyny dootrzewnowo szczurom w celu głębokiego znieczulenia (i.e., utrata mrugania rogówką i odruchy szczypania ogona).
    4. W przypadku grupy świeżej/SAL szybko odetnij głowy szczurom i usuń mózg do świeżego testu mózgu.
    5. W przypadku grup z prefiksem/SAL i z prefiksem/MDMA wykonaj nacięcie wzdłuż mostka około 10 -12 cm, a następnie odsłoń koniec mostka.
    6. Przytrzymaj koniec mostka hemostatem i przetnij przeponę bocznie po obu stronach ostrymi nożyczkami, a następnie przetnij w górę przez żebra i równolegle do płuc.
    7. Jedną ręką przytrzymaj brzuszny koniec serca małymi kleszczami. Drugą ręką przekłuć lewą komorę igłą strzykawkową 18 G (należy zauważyć, że strona adaptera igły jest połączona silikonowym wężem w kształcie litery Y z lodowatymi pojemnikami SAL i paraformaldehydowymi oraz pompami perystaltycznymi).
    8. Włączyć pompę SAL na średnim poziomie natężenia przepływu (~5 ml/min) i przekłuć prawy przedsionek kleszkami, aby umożliwić ucieczkę z krążenia powrotnego. Utrzymuj perfuzję SAL przez 30 minut.
    9. Włącz pompę paraformaldehydu na średnim poziomie i pozwól lodowate 4% paraformaldehydowi przenikać zwierzę przez 30 minut.
    10. Wyjmij narzędzie do perfuzji i odetnij głowę zwierzęciu. Wykonaj tylne przednie przecięcie przez linię środkową czaszki, a następnie trzepocz czaszką, aby odsłonić jamę czaszki.
    11. Wyjąć mózg szpatułką z jamy czaszki i umieścić mózg w probówce wirówkowej o pojemności 50 ml zawierającej 25 ml 4% paraformaldehydu. Trzymaj mózg w probówce zawierającej paraformaldehyd w lodówce o temperaturze 4 ºC przez 24 godziny.
    12. Przenieść mózg do probówki wirówkowej o pojemności 50 ml zawierającej 25 ml 30% roztworu sacharozy w temperaturze 4 °C przez 3 dni. Na koniec przechowuj mózg w plastikowych torebkach w temperaturze -80 °C do czasu użycia.
    13. Zamontuj mózg na uchwycie z pożywką do zatapiania i zamroź pożywkę zawierającą mózg w kriostacie w temperaturze -26 ºC. Pokrój świeżo zamrożony mózg na sekcje 20 μm, a mózg z prefiksem paraformaldehydu na sekcje 10 μm. Przenieś przekrój do szkiełka mikroskopowego o temperaturze pokojowej (RT), dotykając szkiełka do sekcji.
    14. Suszyć na powietrzu w temperaturze pokojowej przez 4 godziny. Szkiełka sekcyjne przechowywać w szczelnie zamkniętej torbie w temperaturze -80 °C do czasu użycia.
  2. Odwodnienie
    1. Pobrać szkiełka z zamrażarki o temperaturze -80 °C i przypisać sekcje do jednego z trzech testów: gen receptora serotoniny 5-HT2A (}ht2a), ppiB (gen izomerazy peptydyloprolilu B, kontrola pozytywna) lub dapB (bakteryjny gen reduktazy dihydrodipikolinianowej, kontrola ujemna); Zaznaczaj i oznaczaj sekcje długopisem (nie używaj ołówka). Zanurz szkiełka w 100% alkoholu o temperaturze pokojowej na 5 minut. Suszyć szkiełka przez 5 minut w dygestorium.
  3. Wstępnej obróbki
    1. Odpipetować 20 μl odczynnika Pretreat-1 (inaktywacja fosfatazy alkalicznej) do skrawków na szkiełkach. Umieść szkiełka na szynie stojaka w tacce na wilgoć (należy pamiętać, że taca jest przykryta pokrywką, aby utrzymać wysoką wilgotność, aby zapobiec parowaniu z roztworu reakcyjnego).
    2. Delikatnie potrząsaj tacką na wilgoć na poziomej wytrząsarce na niskich obrotach przez 10 minut. Umyj szkiełka dwukrotnie wodą podwójnie destylowaną (ddH2O) przez 2 minuty. Zanurzyć szkiełko w zlewce o pojemności 200 ml zawierającej 150 ml odczynnika Pretreat-2 (zerwanie wiązań krzyżowych wywołane wiązaniem paraformaldehydu). Gotuj szkiełka w sumie przez 5 minut w temperaturze 100 ºC (odbudowa struktury RNA wywołana ciepłem).
    3. Umyj szkiełka dwukrotnie za pomocą ddH2O przez 2 minuty. Umieść szkiełka w 100% alkoholu na 5 minut. Suszyć szkiełka przez 5 minut w dygestorium. Użyj pisaka hydrofobowego, aby narysować okrąg wokół wybranego obszaru w sekcji tkanki (e.g., struktury niekorowe, w tym wzgórze i podwzgórze, jak opisano na Rysunek 1).
    4. Odpipetować 10 μl odczynnika Pretreat-3 (zwiększa penetrację sondy) do każdego wybranego obszaru i przykryć tackę na wilgoć pokrywką. Umieścić blachę w piecu do hybrydyzacji wyposażonym w wytrząsarkę poziomą i ustawić temperaturę piekarnika na 40 °C; Delikatnie potrząsaj tacką przez 30 minut. Umyj szkiełka dwukrotnie za pomocą ddH2O przez 2 minuty.

2. Hybrydyzacja i amplifikacja

  1. Odpipetuj 10 μl odczynników sondy htr2a, ppiB i dapB na wybranych obszarach. Przykryj tackę na wilgoć pokrywką, aby zapobiec parowaniu odczynnika. Delikatnie potrząśnij wytrząsarką poziomą ustawioną na niską prędkość. Inkubować szkiełka w temperaturze 40 ºC w piecu przez 2 godziny.
  2. Szkiełka należy myć dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty. Odpipetować 10 μl odczynnika Amplification-1 na każdy wybrany obszar, wstrząsnąć i inkubować szkiełka w temperaturze 40 ºC przez 30 minut.
  3. Szkiełka należy myć dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty. Odpipetować 10 μl odczynnika Amplification-2 na każdy wybrany obszar, wstrząsnąć i inkubować szkiełka w temperaturze 40 ºC przez 15 minut.
  4. Szkiełka należy myć dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty. Odpipetować 10 μl odczynnika Amplification-3 na każdy wybrany obszar, wstrząsnąć i inkubować szkiełka w temperaturze 40 ºC przez 30 minut.
  5. Szkiełka należy myć dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty. Odpipetować 10 μl odczynnika Amplification-4 na każdy wybrany obszar, wstrząsnąć i inkubować szkiełka w temperaturze 40 ºC przez 15 minut.
  6. Szkiełka należy myć dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty. Odpipetować 10 μl odczynnika Amplification-5 na każdy wybrany obszar, wstrząsnąć i inkubować szkiełka w temperaturze RT przez 30 minut.
  7. Szkiełka należy myć dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty. Odpipetować 10 μl odczynnika Amplification-6 na każdy wybrany obszar, wstrząsnąć i inkubować szkiełka w temperaturze pokojowej przez 15 minut. Umyj szkiełka dwukrotnie buforem myjącym przez 2 minuty.

3. Detekcja sygnału

  1. Odpipetować 10 μl odczynnika Red do każdego wybranego obszaru (Należy pamiętać, że odczynnik jest mieszaniną Red-B i Red-A w stosunku 1:60 i należy go natychmiast zużyć). Umieść szkiełko w tacce na wilgoć na wytrząsarce poziomej w temperaturze pokojowej i delikatnie potrząsaj na niskich obrotach przez 10 minut.
  2. Umyj szkiełka dwukrotnie (ddH2O) przez 10 minut. Szkiełka suszyć w temperaturze 60 ºC w piekarniku przez 15 minut. Umieść szkiełka w ksylenie pod wyciągiem na 5 minut. Odpipetować 20 μl podłoża montażowego na bazie ksylenu na każdy wybrany obszar i przykryć szkiełkiem nakrywkowym.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Wyniki

Tabela 1. Projekt eksperymentalny

ŚwieżePrzedrostek paraformaldehydowya
SALbSALbMDMAc
Sonda docelowa (htr2a)√√√
Sonda dodatnia (ppiB...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

Nie stwierdzono konfliktu interesów.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Sonda kontroli negatywnej RNAscope-DapBZaawansowana diagnostyka komórkowa, INC310098
Wstępna obróbka RNAscope 4Zaawansowana diagnostyka komórkowa, INC320046
Zestaw odczynników RNAscope 2.0 HD - czerwonyZaawansowana diagnostyka komórkowa, INC310036
Sonda RNAscope - RN-PPIBZaawansowana diagnostyka komórkowa, INC313921
Szczur Htr2aZaawansowana diagnostyka komórkowa, INC300031
KriostatLeicaCM 1850
Wytrząsarka poziomaVWR88032-088
Piec do hybrydyzacjiThermo Fisher Naukowy222000
Szkiełko mikroskopowe Superfrost PlusFisher Naukowy12-550-15
Długopis hydrofobowyWektorH-4000
MikroskopOlimpProvis AX70

Tagi

Obróbka wstępna tkanekhybrydyzacja sondydetekcja enzymatycznareceptor serotoninowysubstraty chromogennekwantyfikacja mikroskopowa