1. Obrazowanie fluorescencyjne
- Obraz Drosophila } za pomocą mikroskopu fluorescencyjnego. Co 7 minut wychwytuj seryjne odcinki przez domenę wierzchołkową nabłonka nerwowego oka, w okolicy połączeń przylegających.
UWAGA: a) Odpowiednie sekcje szeregowe to zwykle 4-5 na stos z, składający się z kroków co 0,2 μm. b) Nieprawidłowości w topologii nabłonka, w tym łagodne nierówności i fałdy, mogą utrudniać uzyskanie ostrych obrazów dużych obszarów tkanki. Podczas obrazowania może się okazać, że część obszaru zainteresowania jest wyostrzona, a sąsiedni region jest nieostry. Włączenie małej kropli wody destylowanej między oko poczwarki a szkiełko nakrywkowe może wyeliminować niektóre ostre fałdy tkankowe, ale nie łagodnie nierówną topologię charakterystyczną dla wczesnych stadiów morfogenezy oka poczwarki. W takich przypadkach należy nadpróbkować tkankę, wydłużając stos z, aż zostaną uzyskane ostre wycinki dla całego pola. c) Przechwytywanie odcinków seryjnych co 7 minut powinno umożliwić obrazowanie na żywo przez 3 do 4 godzin bez znacznego zmniejszenia intensywności fluorescencji białka zielonej fluorescencji (GFP), która może pogorszyć jakość obrazu. Krótsze odstępy czasu mogą skrócić całkowity czas obrazowania. - Kontynuuj obrazowanie przez 3 do 4 godzin. Nie należy korzystać z funkcji automatycznego ustawiania ostrości i czasu, która jest dostępna w wielu mikroskopach fluorescencyjnych, ponieważ wzrost poczwarki i pompowanie hemolimfy przesuwa pozycję siatkówki i wymagane jest czujne ponowne ustawianie ostrości co 14-21 minut.
UWAGA: Obrazowanie trwające dłużej niż 4 godziny może spowolnić lub zatrzymać morfogenezę oka.
- Użyj odpowiedniego oprogramowania do dekonwolucji, aby zmniejszyć tło i zwiększyć kontrast obrazów sekcji szeregowej. Dla każdego pliku z-stack wykonaj następujące czynności w oprogramowaniu Leica Application Suite Advanced Fluorescence (LAS AF): Przejdź do panelu Narzędzia, wybierz Dekonwolucja 3D i kliknij Zastosuj.
- Wygeneruj maksymalny obraz projekcji (MP) dla każdego pliku stosu bez konwolucji: Przejdź do panelu Narzędzia, wybierz opcję Projekcja 3D i kliknij przycisk Zastosuj.
UWAGA: Algorytm MP może nie wygenerować jednolicie ostrego obrazu dla tkanki, która została poddana nadpróbkowaniu.
2. Przetwarzanie obrazu
- Automatyczne wyrównanie obrazu:
UWAGA: Żywa tkanka Drosophila będzie się przesuwać i rosnąć podczas procesu obrazowania. W związku z tym środki obrazów zebranych w kolejnych punktach czasowych mogą nie odpowiadać temu samemu punktowi w tkance Drosophila. Ponadto cała tarcza siatkówki obraca się o około 30° między ~21 a 23 godziną po utworzeniu poczwarki (APF). Aby podkreślić zachowania poszczególnych komórek i zmniejszyć rozproszenie uwagi spowodowane wzrostem organizmów, wyrównaj każdy obraz MP. Chociaż można to zrobić ręcznie, używane tutaj oprogramowanie do edycji obrazu ma wbudowane algorytmy, które mogą przyspieszyć ten proces.
- Na karcie Plik w menu głównym otwórz Skrypty i wybierz Załaduj pliki do stosu.
- Zaimportuj pliki obrazów MP do panelu Wczytaj warstwy i wybierz przycisk OK. Upewnij się, że opcja Próba wyrównania obrazów źródłowych nie jest zaznaczona automatycznie.
- UWAGA: Jeśli ta opcja jest wybrana, oprogramowanie może użyć algorytmu wyrównania, który zniekształca dane obrazu.
- Po załadowaniu wszystkich plików MP do panelu Warstwy upewnij się, że wszystkie obrazy są w porządku chronologicznym, tak aby najwcześniejszy punkt czasowy znajdował się na górze stosu warstw. Jeśli warstwy nie są w prawidłowej kolejności, przeciągnij je i upuść, aż zostaną poprawnie uporządkowane.
- Wybierz opcję Automatycznie wyrównaj warstwy na karcie Edycja w menu głównym. Wybierz opcję Zmień położenie i kliknij przycisk OK.
- Jeśli algorytm automatycznego wyrównywania nie zdoła ustawić ramek w odpowiednim punkcie centralnym, wprowadź drobne korekty za pomocą narzędzia Przesuń.