Wszystkie procedury dotyczące próbek zwierzęcych zostały sprawdzone i zatwierdzone przez odpowiednią komisję ds. oceny etycznej zwierząt.
1. Kalibracja
- Włączyć mikroskop co najmniej 1 godzinę przed obrazowaniem, aby umożliwić stabilizację termiczną źródła lasera (patrz Tabela materiałów). Następnie włącz oprogramowanie do skanowania spektralnego (patrz Tabela materiałów) i kliknij przycisk Acquire w górnej części GUI (graficzny interfejs użytkownika) (Rysunek 1a).
- Włącz migawkę oprogramowania dla lasera światła białego (WLL) i lampy fotopowielacza (PMT) (Rysunek 1a).
- Wybierz tryb xyΛ z listy rozwijanej w trybie akwizycji, a następnie tryb wprowadzania lasera zostanie automatycznie zmieniony ze stałego procentu na stałą moc. Odznacz pole wyboru Automatyczny ruch SP. Następnie ustaw okno widmowe lasera wejściowego na 470–670 nm, a rozmiar kroku widmowego na 4 nm w ustawieniach skanowania lambda wzbudzenia λ (Rysunek 1b).
- USTAW zakres spektralny PMT na 450-690nm, klikając dwukrotnie lub przesuwając pasek regulacji zakresu widmowego (Rysunek 1c).
Uwaga: Ten zakres spektralny powinien obejmować pełne pasmo źródła wejściowego. - Wybierz soczewkę obiektywową zanurzoną w wodzie, odpowiednio o dużej aperturze numerycznej (NA > 0,7) i podaj dowolną wartość PMT i mocy lasera, aby aktywować AOBS () konfiguracji i przycisku Live Scan. Przełącz ścieżkę optyczną, sprawdzając odbicie w konfiguracji AOBS (Rysunek 1d).
- Zamontuj lustro referencyjne (patrz Tabela materiałów) na stoliku mikroskopu. Powierzchnia lustra powinna być skierowana w stronę soczewki obiektywu. Jeśli nie jest łatwo zamontować lustro na stoliku mikroskopu, przymocuj lustro do płaskiej płytki (e.g., szkło szkiełkowe).
- Kontroluj stolik mikroskopu, aby wyrównać płaszczyznę ogniskowej z powierzchnią lustra.
- Dostosuj wzmocnienie PMT i moc lasera, biorąc pod uwagę zakres dynamiczny detektora, a następnie zmień tryb wprowadzania lasera ze stałego procentu na stałą moc.
Uwaga: Jak to zwykle bywa, przy 570 nm stosuje się wzmocnienie PMT 500 (V) i względną moc lasera 0,1%. - Potwierdź w trybie pseudokolorowym, aby sprawdzić, czy nie ma nasycenia w całym zakresie długości fali. Jeśli zaobserwuje się nasycenie, zmniejsz moc lasera (rysunek 1a).
- Uruchom pobieranie skanowania lambda.
- Zdejmij lustro ze stolika i powtórz tę samą akwizycję bez próbki, aby uzyskać ciemne odniesienie (i.e., ciemne przesunięcie).
- Zapisz dane w formacie wielostosowym TIF.
2. SpeRe (Reflektometria spektralna) Pozyskiwanie obrazu
- Umieść zamontowaną tkankę na stoliku mikroskopu. Aby z grubsza wyrównać tkankę z płaszczyzną ogniskową soczewki obiektywu, użyj trybu fluorescencji szerokokątnej przez okular.
- Przy włączonym Skanowanie na żywo kontroluj stolik mikroskopu, aby wyrównać płaszczyznę ogniskowej do interesującego obszaru tkanki. Aby uniknąć szumu tła z szkiełka nakrywkowego, wybierz obszar docelowy o głębokości co najmniej 15 μm z granicy faz szkło-chusteczka.
- Uzyskaj stos obrazów spektralnych dla obszaru docelowego, stosując tę samą procedurę, jak opisano w krokach 1.1–1.10.
- Zapisz dane dla tkanki i ciemnego offsetu w formacie Multistacked TIF.
Uwaga: Eksperymentator może na tym etapie zrobić pauzę.
3. Przetwarzanie i analiza obrazu
- Otwórz dane spektralne (wielowarstwowy TIF) dla lustra referencyjnego i tkanki mózgowej w ImageJ.
- Wybierz ROI (obszary zainteresowania) dla otwartych stosów obrazów — centralny obszar dla lustra referencyjnego i segment włókna aksonowego dla tkanki mózgowej.
- Uzyskaj surowe widma dla wybranych ROI, uruchamiając Image → Stacks{{}} → Wykres profilu osi Z w menu ImageJ.
- Otwórz dane z ciemnego przesunięcia, jedno wykonane dla lustra referencyjnego, a drugie dla tkanki mózgowej.
- Uzyskaj widma dla ciemnych przesunięć, uruchamiając Image → Stacks → Wykres profilu osi Z w menu ImageJ.
- Zapisz wszystkie uzyskane widma, korzystając z opcji Kopiuj i wklej.
Uwaga: W przypadku obrazowania SpeRe zaleca się użycie centralnego pola obrazowania w celu zminimalizowania aberracji optycznych poza osią. Włókna aksonów mogą być strukturalnie niejednorodne na całej swojej długości. W związku z tym zaleca się wybranie zwrotu z inwestycji w małym segmencie aksonu, zwykle < 5 μm, w celu zminimalizowania artefaktu częściowej objętości.