1. Transfekcja fluorescencyjnie znakowanych plazmidów
- Dzień przed transfekcją lub etykietowaniem wysiewaj astrocyty o pożądanej gęstości do obrazowania 24−48 godzin po transfekcji. Zalecana gęstość dla płytek 24-dołkowych lub studzienek ze szklanym dnem o średnicy 14 mm wynosi 2 x 104 komórki/dołek.
UWAGA: Protokół ten jest zoptymalizowany pod kątem transfekcji astrocytów posianych na szkiełkach nakrywkowych o średnicy 12 mm na płytkach 24-dołkowych lub studzienkach ze szklanym dnem o średnicy 14 mm przy użyciu metody opartej na lipofekcji. Odczynniki powinny być skalowane w zależności od wielkości naczynia hodowlanego, w którym rosną astrocyty. - Rozcieńczyć odczynnik do lipofekcji (tabela materiałów) w pożywce o zredukowanej surowicy (tabela materiałów). Aby zoptymalizować stosunek odczynnika do lipofekcji do DNA, należy przetestować szereg odpowiednich rozcieńczeń. Na przykład, jeśli używasz odczynnika zastosowanego w tym protokole (Tabela materiałów), rozcieńczyć 2, 3, 4 i 5 μl odczynnika do lipofekcji w 50 μl pożywki o obniżonej surowicy.
- Rozcieńczyć 5 μg DNA o wysokiej czystości w 250 μl pożywki o zredukowanej surowicy. Dodać 5 μl odczynnika wzmacniającego lipofekcję (tabela materiałów). Połączyć probówkę zawierającą odczynnik do lipofekcji z równą objętością mieszaniny wzmacniacza DNA i lipofekcji. Mieszać pipetując i inkubować w temperaturze pokojowej (RT) przez 15 minut.
- Usuń pożywkę do hodowli astrocytów i dodaj mieszaninę transfekcyjną (krok 1.3) do komórek kroplami. Po 6-godzinnej inkubacji w temperaturze 37 °C i 5% CO2 należy zastąpić kompleks transfekcyjny odpowiednią objętością pożywki do hodowli astrocytów (2 ml dla naczyń ze szklanym dnem o średnicy 14 mm). Inkubuj przez dodatkowe 24−72 godziny przed przystąpieniem do akwizycji obrazu. Ściśle monitoruj czas trwania etapu inkubacji, aby osiągnąć najlepszą równowagę między ekspresją białka a żywotnością komórek.
2. Znakowanie późnych endosomów/lizosomów za pomocą sond fluorescencyjnych
UWAGA: Niektóre ładunki mogą być znakowane przy użyciu barwników fluorescencyjnych o wysokim powinowactwie do białek specyficznych dla ładunku. Poniższy przykład pozwala na znakowanie późnych endosomów/lizosomów za pomocą fluorescencyjnej sondy acidotropowej.
- Rozcieńczyć sondę znakującą lizosomami (tabela materiałów) w 200 μl pożywki do hodowli astrocytów do stężenia roboczego 1 μM i zastosować do astrocytów z kroku 1.1 o gęstości 2 x 104 komórek/basenik. Inkubować przez 30 minut w temperaturze 37 °C.
- Umyj komórki raz ciepłym podłożem do hodowli astrocytów i zastąp je pożywką do obrazowania (tabela materiałów). Natychmiast przejdź do obrazowania na żywo.
3. Akwizycja obrazu za pomocą systemu obrazowania poklatkowego
UWAGA: Obrazowanie poklatkowe na żywo powinno być wykonywane przy użyciu mikroskopu fluorescencyjnego wyposażonego w szybką kamerę, określoną ostrość, komorę inkubacyjną i obiektyw olejowy 40x o dużej aperturze numerycznej (np. Plan-Apochromat 1.4NA). Dostępnych jest wiele programów do akwizycji obrazów poklatkowych. Wybór systemu mikroskopowego i oprogramowania do akwizycji powinien opierać się na ich dostępności i przydatności do celów konkretnego badania. Poniżej znajduje się kilka ogólnych wskazówek.
- Umieść komorę lub naczynie hodowlane w odpowiednim adapterze na stoliku mikroskopu. Używając światła epifluorescencyjnego, wybierz komórkę (komórki), które wyrażają białka fluorescencyjne lub sondę do nagrania. Dostosuj oświetlenie próbki fluorescencyjnej, aby zobrazować wybrane komórki za pomocą aparatu cyfrowego. Unikaj używania wysokiego oświetlenia, które może powodować fotowybielanie i fototoksyczność. Dostosuj ostrość i powiększenie.
- Rejestruj pojedyncze serie poklatkowe Z-stack z częstotliwością 1 klatki co 2 s w odstępach czasu od 300 s do 500 s za pomocą funkcji zoomu i określonego ostrości.
UWAGA: Dynamika ruchu (prędkość, częstotliwość ruchu itp.) będzie się różnić w zależności od białka będącego przedmiotem zainteresowania, dlatego przebieg czasowy akwizycji może wymagać korekty. Na przykład mitochondria są mniej ruchliwe niż lizosomy i wykazują częste przerwy. W tym przypadku bardziej odpowiednie jest ustawienie parametrów akwizycji na 1 klatkę co 5 s przez 800 s. - Zapisuj obrazy poklatkowe i eksportuj je jako pliki stosu AVI lub TIFF.