Wszystkie procedury związane z pobraniem próbek zostały wykonane zgodnie z wytycznymi instytutu IRB.
1. Znakowanie komórek nowotworowych za pomocą retrowirusa eksprymującego białko zielonej fluorescencji
UWAGA: Mikroskopia poklatkowa do analizy migracji komórek nowotworowych wymaga stabilnego, długoterminowego znakowania fluorescencyjnego komórek w kulturze plastrowej. Sugeruje się stosowanie retrowirusa, ponieważ selektywnie infekuje on dzielące się komórki, wzbogacając w ten sposób znakowanie fluorescencyjne w populacji komórek nowotworowych, w przeciwieństwie do mikrogleju lub innych typów komórek obecnych w wycinku. Standaryzacja infekcji sugeruje, że miano wirusa wynoszące 104 jtk/μl powoduje wystarczającą ekspresję białka zielonej fluorescencji do śledzenia i analizy migracji komórek. Zwiększone miano wirusa, użycie nieselektywnego wirusa (np. adenowirusa, lentiwirusa) lub inne sposoby znakowania wszystkich komórek mogą uniemożliwić identyfikację wyraźnych granic komórkowych podczas migracji, komplikując w ten sposób analizę. W razie potrzeby można wykorzystać i zoptymalizować alternatywne markery fluorescencyjne.
- Uzyskaj retrowirusa do infekcji wycinków guza za pomocą standardowych protokołów5,14 lub z dostępnego na rynku źródła. Rozcieńczyć supernatant wirusa, dodając odpowiednią objętość do nieuzupełnionej pożywki neuronalnej, aby uzyskać miano wirusa10-4 CFU (jednostki tworzące kolonie) / μl.
- Między 7 - 10 dniami hodowli należy zainfekować interesujące kultury plastrów guza 5 - 10 μL wirusa (10,4 CFUs/μL). Umieść wirusa delikatnie kroplami na powierzchni każdego wycinka tkanki. Zmniejszyć objętość dodawanego supernatantu, jeśli plasterek unosi się na powierzchni wkładki. Płytki zawierające kultury warstw należy umieścić z powrotem w inkubatorze.
- Oceń wycinki pod kątem znakowanych komórek nowotworowych, zaczynając po 24 godzinach od infekcji wirusowej. To opóźnienie czasowe będzie się różnić w zależności od inkorporacji wirusa i kinetyki ekspresji genów fluorescencyjnych. W przypadku zastosowanych tutaj konstruktów wirusowych potrzeba było 72 godzin, aby zaobserwować silny sygnał fluorescencyjny za pomocą standardowego mikroskopu epifluorescencyjnego.
UWAGA: Rzadko zdarza się, że plasterki wykazują głównie obwodowy rozkład komórek znakowanych wirusem, co może komplikować obrazowanie konfokalne. Aby uniknąć tej komplikacji, spróbuj zmniejszyć grubość plastra i różnice grubości na całym plasterku. Jeśli kultura plastrów ma grubszy obszar w pobliżu środka, może to uniemożliwić odpowiednią penetrację składników odżywczych, ograniczając w ten sposób populację aktywnie dzielących się komórek nowotworowych. Testem jakościowym do badań przesiewowych w kierunku tego powikłania jest dodanie odczynnika barwnika tetrazolowego (tj. MTT (bromek 3-(4,5-dimetylotiazol-2-ylo)-2,5-difenylotetrazoliowy)) do pożywki do hodowli warstw. Obszary plasterka, które nie zmieniają koloru na niebieski po dodaniu odczynnika, wskazują na brak aktywności metabolicznej i pogorszenie zdrowia plasterka.
2. Poklatkowe skanowanie laserowe pojedynczym fotonem Konfokalne obrazowanie migracji komórek nowotworowych
UWAGA: Po udanej transdukcji i potwierdzeniu zdrowia hodowli, komórki można obrazować w warunkach kontrolnych, a następnie przez równy okres obrazowania w warunkach leczenia. Korzystając z tego protokołu, komórki zostały pomyślnie zobrazowane i śledzone przez 12 godzin w każdym stanie. Jednak krótsze lub dłuższe okresy obrazowania i manipulacji środowiskowej mogą być również pouczające.
- Ładowanie mikroskopu
- Przed obrazowaniem umieść 1 ml świeżego podłoża w plasterkach w naczyniu ze szklanym dnem.
- Pozwól, aby pożywka w naczyniu ze szklanym dnem zrównoważyła się w inkubatorze przez 15 minut.
UWAGA: W tym momencie rozpuszczalne środki znakujące, takie jak fluorescencyjnie sprzężone lektyny (tj. izolektyna IB4 do znakowania mikrogleju) lub skrzyżowane z ligandem kropki kwantowe, można dodać do pożywki do hodowli warstwowej w celu identyfikacji subpopulacji komórkowych podczas obrazowania. - Przenieś wkładkę, która ma być zobrazowana, do naczynia ze szklanym dnem za pomocą sterylnych kleszczy w okapie z przepływem laminarnym. Przetransportuj naczynie do stolika mikroskopowego.
- Utrzymuj kultury plastrów w temperaturze 37 °C i 5% atmosferzeCO2 w szczelnie zamkniętym inkubatorze pod mikroskopem. Stosować sterylne nawilżanieH2Ow komorze inkubacyjnej, jeśli jest dostępne, aby zapobiec nadmiernemu parowaniu pożywki (szczególnie ważne w przypadku dłuższych eksperymentów obrazowych).
- Wykorzystaj mikroskop konfokalny z dużym odległością roboczą, 10-krotnym obiektywem powietrznym i wzbudzeniem laserowym dla pojedynczych fotonów i/lub wielu fotonów. nuta: Upewnij się, że soczewka obiektywu mikroskopu zapewnia odpowiednią odległość roboczą. Ze względu na dodatkową wysokość od inkubatora ze stopniem, naczynia ze szklanym dnem i wkładki do hodowli tkankowej, kluczowe znaczenie mają cele związane z dużą odległością roboczą.
- Zabezpiecz szklaną płytę dolną, zdejmij plastikową pokrywę szalki Petriego i przykryj membraną przepuszczającą gaz.
- Akwizycja obrazu
- Użyj mikroskopu, aby wizualnie sprawdzić wycinek i zlokalizować odpowiednie pole o odpowiedniej gęstości fluorescencyjnie znakowanych komórek nowotworowych między krawędzią plastra a środkiem. Unikaj pól obrazowania na krawędzi wycinka, ze względu na zwiększoną podatność na przesunięcia tkanek podczas obrazowania. W celu ograniczenia tego przesunięcia można zastosować harfy do krojenia tkanek.
- Użyj oprogramowania do obrazowania w trybie analizy wielowymiarowej, aby ustawić pierwszą (dolną) i ostatnią (górną) granicę stosu Z, tak aby wszystkie pozycje, które mają być zobrazowane, zawierały widoczny fluorescencyjny sygnał komórkowy. Obrazowanie przez 150 - 200 μm wycinka, ze stałym krokiem Z wynoszącym 10 μm, zapewniło odpowiednią rozdzielczość do śledzenia ścieżek komórek (można ją dostosować do indywidualnych potrzeb obrazowania).
- Jeśli mikroskop jest wyposażony w stolik z napędem silnikowym, upewnij się, że na każdą akwizycję Z-stack jest odpowiedni czas. Ustaw odstęp czasu między akwizycjami tak, aby był równy czasowi skanowania na pozycję x liczbie pozycji do zobrazowania (tj. zobrazowane obszary guza).
UWAGA: Do jednoczesnego wzbudzenia zielonych i czerwonych fluoroforów należy użyć dwuliniowego programu laserowego skanowania liniowego, z jednoczesnym wzbudzeniem 488 nm i 633 nm. Wybrana długość fali wzbudzenia laserowego będzie się różnić w zależności od ekspresji poszczególnych białek fluorescencyjnych. - Utrzymuj jednolitą moc lasera i konfokalne ustawienia otworków między obrazowanymi obszarami guza. Wykorzystaj najniższe ustawienie mocy lasera potrzebne do wyraźnego rozgraniczenia ciał komórek nowotworowych i procesów w celu ograniczenia fototoksyczności. Konkretne jednostki parametrów obrazowania (tj. moc i ustawienia otworka konfokalnego) będą się różnić w zależności od specyfikacji mikroskopu i źródła laserowego.
- Skompensuj potencjalne parowanie mediów, dodając 2-3 stopnie "buforowe" stosu Z w płaszczyznach ogniskowych posuwających się w kierunku celu. To skutecznie zapobiega opuszczaniu przez tkankę zakresu akwizycji stosu Z w płaszczyźnie pionowej.