$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1A. Pierwotne tworzenie monowarstwy na krzemie
- Pokrój wafel silikonowy na 1 cm2 podłoża, odkurz i spłucz wodą i przefiltrowanym etanolem.
- Usuń zanieczyszczenia organiczne, zanurzając podłoża silikonowe w szklanym naczyniu zawierającym pasek Nano w temperaturze 75ºC. Po 15 minutach spłucz każde podłoże dejonizowaną, przefiltrowaną wodą.
- Umieść każde podłoże w 5% roztworze HF (uwaga: HF jest niezwykle niebezpiecznym materiałem), aby usunąć natywną warstwę tlenku. Po 5 minutach wysuszyć beztlenkowy krzem azotem
- Aby wytworzyć chlorowany substrat, należy natychmiast zanurzyć każdy beztlenkowy kawałek krzemu w fiolce scyntylacyjnej zawierającej 2 ml nasyconego PCl5 w chlorobenzenie. Roztwór ten należy przefiltrować do 0,2 μm.
- Na każdej fiolce należy zamontować kondensator fiolki i umieścić je w bloku grzewczym ustawionym na 112°C na jedną godzinę.
- Po zakończeniu reakcji pozostawić fiolki do ostygnięcia i spłukać każdą powierzchnię chlorobenzenem i wysuszyć pod przefiltrowanym azotem.
- Aby utworzyć substrat z końcami propenylowymi, należy umieścić każdą chlorowaną powierzchnię krzemu w fiolce ciśnieniowej zawierającej 4 ml chlorku propenylomagnezu. Umieścić każdą fiolkę ciśnieniową w bloku grzewczym w temperaturze 130 °C na 24 godziny.
- Wyjmij każdą fiolkę ciśnieniową z bloku grzewczego i pozostaw do ostygnięcia.
- Szybko spłucz każdą powierzchnię DCM i etanolem i wysusz pod przefiltrowanym azotem.
1B. Pierwotna formacja monowarstwowa na germanie
- Pokrój wafel germanowy na 1cm2 podłoża, odkurz i spłucz wodą i przefiltrowanym etanolem.
- Usuń zanieczyszczenia organiczne, zanurzając powierzchnie w szklanym naczyniu zawierającym aceton na 20 minut
- Umieść każdą powierzchnię w 10% roztworze HCl na 15 minut. Proces ten jednocześnie usuwa natywną warstwę tlenku i chloruje powierzchnię. Po 5 minutach wysuszyć podłoża azotem.
- Aby utworzyć substrat zakończony oktylem, należy umieścić każdą chlorowaną powierzchnię germanu w fiolce ciśnieniowej zawierającej 4 ml chlorku oktylomagnezu (2 mM). Umieścić każdą fiolkę ciśnieniową w bloku grzewczym o temperaturze 130 °C na 48 godzin.
- Wyjmij każdą fiolkę ciśnieniową z bloku grzewczego i pozostaw do ostygnięcia do temperatury pokojowej.
- Szybko spłucz każdą powierzchnię DCM i etanolem i wysusz pod przefiltrowanym azotem.
2. Funkcjonalizacja substratów NHS na krzemie i germanach
- Przygotować przefiltrowany 0,1 M roztwór NHS-diazyryny w czterochlorku węgla. Ostrzeżenie: Ogranicz ekspozycję na światło do minimum.
- Odpipetować kilka kropel roztworu na powierzchnie zakończone metylem. Pozwól, aby roztwór rozprzestrzenił się na całej powierzchni.
- Umieść powierzchnie pod lampą UV (☐= 254 nm, 4400/cm2 przy 0.74 cala). Pozwól powierzchniom reagować pod wpływem światła UV przez 30 minut, a następnie dodaj więcej NHS-diazyryny do powierzchni i pozwól reakcji postępować przez dodatkowe 30 minut.
- Spłucz powierzchnie zmodyfikowane przez NHS DCM i etanolem i wysusz pod przefiltrowanym azotem.
3. Funkcjonalizacja małych cząsteczek
- Substraty modyfikowane NHS reagować w 20 mM roztworze tert-butylokarbamoilu (Boc-) etylenodiaminy w dichlorometanie (DCM) przez dwie godziny w temperaturze pokojowej.
- Po reakcji przepłukać substrat modyfikowany Boc DCM i etanolem.
- Chronić substrat modyfikowany Boc za pomocą 25% kwasu trifluorooctowego (TFA) w DCM przez jedną godzinę w temperaturze pokojowej.
- Powstałą powierzchnię spłukać DCM, etanolem i 10% (w/v) wodorowęglanem potasu w wodzie i wysuszyć pod przefiltrowanym azotem.
- Przeanalizuj wszystkie powierzchnie za pomocą XPS, aby określić skład pierwiastkowy.
4. Przygotowanie kwaśnego pieczęci poliuretanowo-akrylowej (PUA)
- Rozcieńczyć akrylan A o 30% etoksylanem trimetylopropanu triakrylanem B w celu zmniejszenia lepkości. Dodać fotoinicjatory C i D do mieszaniny reakcyjnej (rysunek 6).
- Dodać 2-merkaptoetanosulfonian sodu (0,2 g, 1,22 mmol) do 4N roztworu HCl w dioksanie (10 ml) i mieszać w temperaturze pokojowej przez 2 minuty.
- Odfiltrować chlorek sodu najpierw przez drobny filtr szklany, a następnie przez 0,2 μm filtr strzykawkowy z membraną PTFE, aby uzyskać klarowny roztwór kwasu 2-merkaptoetanosulfonowego w dioksanie.
- Odparować dioksan pod zmniejszonym ciśnieniem
- Otrzymany kwas sulfonowy należy przereagować z 2 ml prepolimerowej mieszaniny poliuretanowo-akrylowej w temperaturze pokojowej, a następnie w próżni w temperaturze 50 °C. Należy upewnić się, że mieszanina została całkowicie uwolniona z uwięzionych pęcherzyków powietrza.
- Schłodzić otrzymany roztwór do temperatury pokojowej i polimeryzować między dwoma szklanymi szkiełkami mikroskopowymi lub szklanym szkiełkiem podstawowym i wzorcem przez wystawienie na działanie światła UV przez 2 godziny w temperaturze pokojowej.
- Po polimeryzacji ostrożnie odklej stempel od wzorca i umyj stempel etanolem i wodą, a następnie wysusz przefiltrowanym azotem.
5. Druk katalityczny i analiza SEM/AFM
- Umieść odpowiedni stempel poliuretanowo-akrylowy na wierzchu podłoża modyfikowanego przez NHS w temperaturze pokojowej na jedną minutę bez zewnętrznego obciążenia, które utrzymywałoby je razem.
- Po reakcji oddziel stempel i podłoże.
- Spłucz podłoże etanolem, wodą i etanolem, a następnie osusz przefiltrowanym azotem.
- Opłucz stempel etanolem, wodą i etanolem, a następnie wysusz przefiltrowanym azotem.
- Przechowuj stemple w temperaturze pokojowej przed następną aplikacją.
- Przeanalizuj wytworzony wzór za pomocą mikroskopii bocznych sił atomowych w trybie kontaktowym (AFM) i skaningowej mikroskopii elektronowej (SEM)
6. Modelowanie białek i mikroskopia fluorescencyjna
- Zanurzyć dwufunkcyjny substrat z wzorem NHS w kwasie lizyno-N,N-diacetowym (20 mM) i Et3N (100 mM) w DMF:H20 (1:1) w temperaturze pokojowej na 1 godzinę, a następnie spłukać wodą i etanolem.
- Inkubować podłoża w 50 mM roztworze NiSO4 przez 5 minut w temperaturze pokojowej.
- Nadmiernie przepłukać chelatowane substraty wodą i buforem wiążącym (20 mM NaP, 250 mM NaCl, 10 mM imidazolu, pH 7,5) i zanurzyć w przefiltrowanym roztworze GFP ( ̃40 μM) na 1 godzinę w temperaturze 0°C.
- Natychmiast przepłukać podłoża buforem wiążącym, a następnie PBS (pH 7,4).
- Utrzymuj substraty uwodnione w PBS w temperaturze 0°C, aż będą gotowe do analizy pod mikroskopią fluorescencyjną.
7. Modelowanie białek i mikroskopia fluorescencyjna
- Zanurzyć dwufunkcyjny substrat z wzorem NHS w kwasie lizyno-N,N-diacenowym (20 mM) i Et3N (100 mM) w DMF:H20 (1:1) w temperaturze pokojowej na 1 godzinę, a następnie spłukać wodą i etanolem.
- Inkubować substraty w 50 mM roztworze NiSO4 przez 5 minut w temperaturze pokojowej.
- Nadmiernie przepłukać chelatowane substraty wodą i buforem wiążącym (20 mM NaP, 250 mM NaCl, 10 mM imidazol, pH 7,5) i zanurzyć w przefiltrowanym roztworze GFP ( ̃40 μM) na 1 godzinę w temperaturze 0°C.
- Natychmiast przepłukać podłoża buforem wiążącym, a następnie PBS (pH 7,4).
- Utrzymuj substraty uwodnione w PBS w temperaturze 0°C, aż będą gotowe do analizy pod mikroskopią fluorescencyjną.
8. Reprezentatywne wyniki:
Przykład miękkiego litografii katalitycznego nano wzorca jest pokazany na rysunku 7. Podejście to tworzy chemoselektywne wzory na beztlenkowym krzemie i germanie, które mogą być ortogonalnie funkcjonalizowane z różnymi ugrupowaniami chemicznymi i biologicznymi. Reakcja między substratem funkcjowanym przez NHS a katalitycznie wzorzystym stemplem prowadzi do hydrolizy ugrupowań NHS w obszarach kontaktu konforemnego, dając wzorzyste dwufunkcyjne regiony substratu zawierające aktywowane i wolne kwasy karboksylowe NHS. Ze względu na bezdyfuzyjny charakter naszej metody, osiągamy rozdzielczość zbliżoną do fotolitografii. Na przykład rysunek 7 przedstawia cechy 125 nm, które zostały równomiernie odwzorowane na całej powierzchni podłoża krzemowego. Co ciekawe, stempel katalityczny może być wielokrotnie używany bez utraty wydajności.
Chemoselektywna funkcjonalizacja wzorzystych półprzewodników z biomolekułami otwiera perspektywę integracji tradycyjnych materiałów elektronicznych z wysoce selektywnymi substratami biologicznymi do zastosowań w dziedzinie badań, diagnostyki i analizy. Przykład takiej funkcjonalizacji pokazano na rysunku 8, gdzie krzem o wzorze NHS był selektywnie funkcjonalizowany cząsteczkami białka. Wykorzystując zróżnicowane reaktywności aktywowanych i wolnych kwasów karboksylowych, najpierw przymocowaliśmy heterobifunkcjonalne łączniki zakończone kwasem nitrylotrioctowym (NTA) do regionów funkcjonalizowanych przez NHS, a następnie wykorzystaliśmy powstałą powierzchnię z wzorem NTA jako matrycę do selektywnego przyłączania GFP znakowanego heksa-histydyną. Rysunek 8b wyraźnie pokazuje różnicę intensywności fluorescencji między regionami wolnego kwasu karboksylowego modyfikowanymi i hydrolizowanymi GFP. Rozmiar i kształt powtórzonych cech są spójne zarówno między powierzchnią wzorzystą NHS (rysunek 8a), jak i powierzchnią zmodyfikowaną GFP (rysunek 8b), co potwierdza niezwykłą stabilność powierzchni pasywowanych węglem i selektywność podejścia do tłoczenia. Protokół nie ogranicza się do białka znakowanego przez Hisa i może być stosowany do modelowania innych biomolekuł, w tym DNA i przeciwciał.

Rysunek 1. Ogólny schemat przedstawiający katalityczne drukowanie mikrokontaktowe

Rysunek 2. Struktura dwuwarstwowego układu molekularnego na Ge i Si. Pierwotna monowarstwa alkilowa tworzy stabilne wiązania Ge-C lub Si-C z podłożem i zapewnia chemicznie obojętny i ściśle upakowany system, który chroni powierzchnię pod spodem przed degradacją. (b) Wtórna warstwa wierzchnia tworzy stabilne wiązania C-C z pierwotną warstwą ochronną i zapewnia końcowe grupy funkcyjne

Rysunek 3. Schematy reakcji reprezentujące tworzenie pierwotnych monowarstw ochronnych na Si (A) i Ge (B)

Rysunek 4. Funkcjonalizacja chemiczna pierwotnej monowarstwy ochronnej z heterobifunkcyjnym donorem karbenu

Rysunek 5. Schemat reakcji przedstawiający modyfikacje małych cząsteczek substratów funkcjonalizowanych przez NHS i odpowiadające im widma XPS

Rysunek 6. Skład katalitycznej mieszaniny prepolimerowej, warunki polimeryzacji i obrazy SEM wzorzystego stempla modyfikowanego kwasem sulfonowym i odpowiadającego mu wzorca PMMA-Si

Rysunek 7. Obrazy tarcia SEM i AFM wzorzystych SAM na Si i Ge z kwaśnym stemplem

Rysunek 8. Softlitograficzne modelowanie i funkcjonalizacja pasywowanego krzemu cząsteczkami organicznymi i biologicznymi. a: Obraz SEM wzorzystego podłoża zmodyfikowanego przez NHS. b: Mikrofotografia fluorescencyjna podłoża modyfikowanego GFP.