$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. Generowanie krótkotrwałych ludzkich linii limfocytów T CD8 specyficznych dla antygenu7
- Wyizoluj mononuklearne komórki krwi obwodowej (PBMCs) z krwi zdrowych dawców dodatnich pod kątem HLA-A2, wykorzystując Ficoll-paque plus.
- Przenieś PBMCs do płytek 6-dołkowych w objętości 2 ml/dołek, przy zagęszczeniu 2 x 106 komórek/ml.
- Dodaj bezpośrednio do dołków peptyd HER-2/neu p369-377 wiążący się z HLA-A2 (sekwencja aminokwasowa KIFGSLAFL) lub peptyd grypy p58-66 wiążący się z HLA-A2 (GILGFVFTL) do końcowego stężenia 10 μg/ml i inkubuj w temperaturze 37 °C w atmosferze 5% CO2.
- W celu stymulacji i ekspansji limfocytów T dodawaj co 2 dni 250 μl/dołek świeżego medium uzupełnionego ludzką rekombinowaną IL-2 (roztwór stokowy: 50 jednostek/μl), aby uzyskać końcowe stężenie 50 jednostek/ml w medium hodowlanym.
- Ponownie stymuluj komórki hodowlane za pomocą napromieniowanych autologicznych PBMCs w stężeniu 2 x 106 komórek/ml, które były pulsowane przez 2 godziny peptydami w stężeniu 10 μg/ml (tymi samymi, które zastosowano w kroku 1.3); komórki te dodaj do hodowli w objętości 1 ml/dołek tydzień po pierwszej stymulacji peptydowej.
- Co 2 dni dodawaj ludzką rekombinowaną IL-2 oraz świeże medium do istniejących hodowli, zgodnie z opisem w kroku 1.4.
- Ponownie stymuluj komórki peptydem oraz napromieniowanymi autologicznymi PBMCs, zgodnie z opisem w kroku 1.5, tydzień po drugiej stymulacji peptydowej.
- Przygotuj komórki do użycia najwcześniej sześć dni po ostatniej re-stymulacji.
2. Przygotowanie komórek raka piersi
- Umieść stację pomiarową impedancji xCelligence (stacja xCelligence) w inkubatorze w temperaturze 37 °C z 5% CO2.
- Zbierz ludzkie komórki nowotworowe (SKBR3, BT20, MCF7 lub HCC1419) o 75% konfluencji, używając 0,25% trypsyny oraz wirowania (1 000 rpm przez 5 minut).
- Policz komórki nowotworowe za pomocą komory countingowej (hemocytometru) i resuspenduj je w pożywce RPMI dla komórek nowotworowych (uzupełnionej o 10% płodowej surowicy bydlęcej (FBS) i 500 jednostek/ml IFN-gamma) do stężenia 7,5 x 103 komórek nowotworowych/100 μl.
- Skonfiguruj oprogramowanie xCelligence, ustawiając stronę układu (layout), aby określić rozmieszczenie studzienek, oraz stronę harmonogramu (schedule), aby pomiary impedancji były wykonywane co 5 minut przez okres 40 godzin. Przez pierwsze 18 godzin system xCelligence będzie pomiarowi impedancji wyłącznie komórek nowotworowych.
- Dodaj 100 μl pożywki RPMI dla komórek nowotworowych do płytek E-plates xCelligence i wykonaj pomiar tła, mierząc impedancję w obecności samych płytek, bez komórek.
- Dodaj komórki nowotworowe do płytek E-plates w objętości 100 μl na studzienkę i umieść je w stacji xCelligence.
- Naciśnij przycisk start w oprogramowaniu xCelligence, aby rozpocząć pomiary impedancji komórek nowotworowych, które natychmiast zaczynają przytwierdzać się do płytek E-plates.
3. Ko-kultura guza z limfocytami T CD8
- Gdy komórki nowotworowe przyłączą się i podwoją do liczby 1,5 x 104 komórek nowotworowych na dołek (około 18 godzin po początkowym wysianiu), zebrać limfocyty T przygotowane w sekcji 1 poprzez delikatne skrobanie i mieszanie
- Wirować przy 1 000 rpm przez 5 minut, policzyć limfocyty T za pomocą hemocytometru i resuspendować je w medium RPMI z 10% FBS w różnych proporcjach, zaczynając od maksymalnego stosunku 1 komórki nowotworowej do 40 limfocytów T, a następnie rozcieńczać 2-krotnie, aż do osiągnięcia stosunku 1 komórki nowotworowej do 1,25 limfocytów T. Na przykład: w dołku znajduje się 1,5 x 104 komórek nowotworowych. Aby uzyskać stosunek 1:40, należy dodać 6 x 105 limfocytów T na dołek i rozcieńczać limfocyty T 2-krotnie, aż do osiągnięcia stosunku 1,5 x 104 komórek nowotworowych do 1,875 x 104 limfocytów T na dołek (stosunek 1:1,25).
- Wstrzymać pracę stacji xCelligence i wyjąć płytkę E-plate.
- Usunąć medium z dołków za pomocą pipety i dodać do dołków 200 μl samego medium lub limfocyty T w odpowiedniej proporcji.
- Umieścić płytkę E-plate z powrotem w stacji xCelligence i wznowić program oprogramowania xCelligence, aby pomiary impedancji były wykonywane co 5 minut przez około 20 godzin po dodaniu limfocytów T.
- Znormalizować wyniki po zakończeniu analizy.
4. Test uwalniania chromu (CRA)7
- Podczas pracy z 51Cr oraz komórkami docelowymi znakowanymi 51Cr należy przestrzegać instytucjonalnych procedur bezpieczeństwa radiologicznego. Zawsze stosować odpowiednie osłony w celu ograniczenia ekspozycji na promieniowanie.
- Inkubować komórki nowotworowe przez 2 godziny w stężeniu 1 x 106 komórek nowotworowych/ml z dodatkiem 10 μl/ml świeżego 51Cr (0,005 Ci/ml).
- Przemyć komórki nowotworowe w 10 ml pożywki RPMI z 10% FBS i odwirować przy 1000 obr./min przez 5 minut. Przenieść komórki nowotworowe do 96-dołkowej płytki o okrągłym dnie w ilości 1 x 105 komórek nowotworowych w 100 μl na dołek.
- Dodać limfocyty T w różnych stosunkach, zaczynając od 1 komórki nowotworowej na 40 limfocytów T, a następnie rozcieńczać dwukrotnie, aż do uzyskania stosunku 1 komórki nowotworowej do 1,25 limfocytu T. Przykładowo, w każdym dołku znajduje się 1 x 105 komórek nowotworowych. Aby uzyskać stosunek 1:40, należy dodać 4 x 106 limfocytów T na dołek i rozcieńczać limfocyty T dwukrotnie, aż do osiągnięcia stosunku 1 x 105 komórek nowotworowych do 1,25 x 105 limfocytów T na dołek (stosunek 1:1,25).
- Dodać do płytki kontrole spontanicznego i maksymalnego uwalniania komórek nowotworowych. W celu obliczenia spontanicznego uwalniania 51Cr z komórek nowotworowych, do sześciu dołków, z których każdy zawiera 1 x 105 komórek nowotworowych w 100 μl, dodać 100 μl pożywki RPMI z 10% FBS. W celu obliczenia maksymalnego uwalniania 51Cr z komórek nowotworowych, do sześciu dołków, z których każdy zawiera 1 x 105 komórek nowotworowych w 100 μl, dodać 100 μl 0,1% Triton X-100 w PBS, który powoduje lizę wszystkich komórek.
- Inkubować płytki przez 5 godzin w temperaturze 37 °C przy 5% CO2.
- Po inkubacji pobrać 50 μl supernatantu z każdego dołka i przenieść go na płytkę Luma.
- Suszyć płytki przez noc, a następnie zmierzyć CPM za pomocą licznika gamma.
5. Obliczanie procentu lizy
- Pomiar impedancji: Odczytaj wartość impedancji, raportowaną jako indeks komórkowy (CI), w wybranych punktach czasowych i wykorzystaj następujący wzór do określenia procentowej lizy: (CI tylko guz - (CI guz + limfocyty T)) / (CI tylko guz) *100.
- CRA: Wykorzystaj następujący wzór do określenia procentowej lizy: (CPM eksperymentalny - CPM spontaniczny) / (CPM maksymalny - CPM spontaniczny)*100.
6. Reprezentatywne wyniki
Same komórki T nie zwiększają impedancji
Komórki T, co do zasady, nie przylegają do większości powierzchni stałych i nie wymagają adhezji do aktywacji oraz proliferacji. Sformułowano zatem hipotezę, że komórki T nie powinny wpływać na impedancję w płytkach E-plates systemu xCelligence. Aby to sprawdzić, do dołków wprowadzono albo komórki raka piersi SKBR3, albo świeżo oczyszczone ludzkie komórki T CD8. Impedancję mierzono przez 40 godzin, a reprezentatywny przykład wykazujący znikomy wpływ komórek T przedstawiono na Rysunku 1A. W przeciwieństwie do tego można by argumentować, że komórki T mogą obniżać impedancję tła, choć tylko nieznacznie. Mimo to kokultura wykazała, że proces dodawania komórek T w 18. godzinie po rozpoczęciu pomiarów impedancji spowodował zakłócenie impedancji (Rysunek 1B). Inne badania wykazały, że zakłócenia wynikały częściowo z procedur manipulacyjnych, ponieważ spadek sygnału można było zredukować, zapewniając, że temperatura roztworu zawierającego komórki T była taka sama jak wewnątrz inkubatora.
Obniżenia impedancji pośredniczone przez limfocyty T są zależne od dawki.
Użyteczność analizy opartej na impedancji w porównywaniu próbek pod kątem aktywności cytotoksycznych limfocytów T wymaga możliwości rozróżnienia pomiędzy różnymi stężeniami limfocytów T specyficznych dla antygenu. Aby sprawdzić, czy jest to możliwe, komórki SKBR3 współhodowano z różnymi stężeniami limfocytów T pochodzących z linii limfocytów T specyficznych dla HER-2/neu p369. Jak pokazano na Rysunku 2A, spadki impedancji były zależne od dawki limfocytów T. Rysunek 2B pokazuje, że indeksy komórkowe po 10 godzinach podążają za prostym wielomianem drugiego stopnia w zakresie stężeń limfocytów T. Zatem stacja xCelligence monitoruje w czasie rzeczywistym śmierć guzów SKBR3 pośredniczoną przez limfocyty T CD8 jako spadek indeksu komórkowego.
Test oparty na impedancji wykrywa limfocyty T swoiste dla antygenu
Aby ustalić, czy spadki impedancji linii komórek raka piersi SKBR3, wykazującej pozytywny wynik dla HER-2/neu i HLA-A2, wywołane przez limfocy T specyficzne dla HER-2/neu p369 były specyficzne antygenowo, oddzielne studzienki zawierające SKBR3 inkubowano również z limfocytami T pochodzącymi z linii limfocytów T specyficznych dla wirusa grypy (FLU). Limfocy T specyficzne dla FLU posłużyły jako kontrola niespecyficzna, ponieważ wykazują one pozytywny wynik dla HLA-A2, lecz nie posiadają zdolności rozpoznawania HER-2/neu. Jak pokazano na Ryc. 3, istnieje istotna różnica między aktywnością lityczną limfocytów T specyficznych dla HER-2/neu p369 a limfocytami T specyficznymi dla FLU (p<0,0001). W niektórych przypadkach limfocy T niespecyficzne dla nowotworu (np. specyficzne dla FLU lub stymulowane anty-CD3/anty-CD28) wykazały niski poziom aktywności litycznej (Ryc. 3A-B). Limfocy T mogą zabijać na dwa sposoby: niespecyficznie poprzez oddziaływania Fas:ligand Fas lub specyficznie antygenowo poprzez uwalnianie granzymów i perforyn. Aby dodatkowo potwierdzić tezę, że limfocy T specyficzne dla HER-2/neu zabijają w sposób specyficzny antygenowo, zastosowano przeciwciało blokujące ligand Fas. Jak pokazano na Ryc. 3B, przeciwciało to nie zmniejszyło aktywności litycznej limfocytów T specyficznych dla HER-2/neu p369. Przeciwciało mogło hamować oddziaływania między Fas a ligandem Fas, co wykazano w przypadku limfocytów T aktywowanych niespecyficznie za pomocą kulek anty-CD3/CD28. Wyniki te sugerują, że podczas testowania limfocytów T specyficznych dla nowotworu w zestawieniu z limfocytami T niespecyficznymi dla nowotworu, blokada ligandu Fas może być konieczna, aby zminimalizować oddziaływania niepośredniczone przez TCR. Alternatywnie, przy użyciu krótkotrwale hodowanych linii limfocytów T, w których tylko frakcja komórek jest specyficzna dla antygenu użytego do generacji ex vivo, może dojść do aktywacji limfocytów T w wyniku niedopasowania MHC, co prowadzi do lizy niespecyficznej. W takim przypadku uzasadnione może być dodanie przeciwciał blokujących nieistotne cząsteczki HLA. Aby ustalić, czy limfocy T specyficzne dla p369 zabijają komórki nowotworowe w sposób zależny od klasy I MHC, do kokultur dodano przeciwciało anty-HLA klasy I lub przeciwciało kontrolne izotypowe. Jak pokazano na Ryc. 3C, liza przez limfocy T specyficzne dla p369 została zahamowana po dodaniu przeciwciała, co wykazuje restrykcję do HLA klasy I. Na koniec, ponieważ opracowanie tego testu przeprowadzono głównie z użyciem SKBR3, istotne było sprawdzenie, czy inne przylegające komórki nowotworowe wykazujące ekspresję HLA-A2 i HER-2/neu mogą być zabijane przez limfocy T specyficzne dla p369. W związku z tym przygotowano limfocy T i dodano je w stosunku 1:5 do komórek nowotworowych wykazujących ekspresję HLA-A2 i HER-2/neu: SKBR3, MCF-7 oraz HCC1419. Linia komórek nowotworowych BT20, negatywna pod kątem HLA-A2, posłużyła jako kontrola negatywna. Jak pokazano na Ryc. 3D, wszystkie te dodatkowe komórki nowotworowe, z wyjątkiem BT20, zostały również zabite, co oceniono za pomocą impedancji. Zatem metoda ta wydaje się być użyteczna dla wielu rodzajów przylegających komórek nowotworowych.
Test oparty na impedancji jest bardziej czuły niż standardowy test uwalniania chromu w wykrywaniu aktywności cytotoksycznych limfocytów T
Test uwalniania chromu (51Cr) (CRA), służący do pomiaru aktywności cytolitycznej, od dawna stanowi złoty standard monitorowania odpowiedzi limfocytów T CD8. W tym teście komórki docelowe (np. komórki nowotworowe) są znakowane 51Cr. W większości przypadków zdrowe komórki docelowe są w stanie zatrzymać większość radioznacznika w trakcie trwania testu. Do komórek docelowych dodaje się limfocyty T CD8, zazwyczaj w różnych stężeniach, a śmierć komórek docelowych jest wykrywana poprzez uwalnianie 51Cr do medium. Poza faktem wykorzystania niebezpiecznego promieniowania, dwoma głównymi problemami testu CRA są brak czułości oraz fakt, że test ten zazwyczaj wymaga dużych ilości limfocytów T CD8, co ogranicza jego użyteczność. Aby sprawdzić, czy test oparty na impedancji był czulszy niż CRA, in vitro wygenerowano limfocyty T specyficzne dla HER-2/neu p369 i naniesiono je, w różnych ilościach, albo na płytki E-plates zawierające nieznakowane komórki nowotworowe, albo na standardowe płytki polipropylenowe zawierające komórki docelowe znakowane 51Cr. Pomiary, albo impedancji, albo wolnego chromu, przeprowadzono 5 godzin po dodaniu limfocytów T. Rysunek 4, będący reprezentatywnym przykładem, pokazuje, że test impedancji daje lepsze wyniki niż test uwalniania chromu.
Zmienność wewnątrzseryjną testu opartego na impedancji zazwyczaj nie przekracza 20%.
Zbadano zmienność wewnątrzanalizową, ponieważ szersze zastosowanie tego testu będzie w dużej mierze zależało od jego powtarzalności i zmienności (Rysunek 5). Dwie linie limfocytów T specyficzne dla p369 wygenerowano niezależnie w odstępie 30 dni i dodano w trzech powtórzeniach w zakresie różnych stosunków komórek nowotworowych do limfocytów T. Wykres wstawiony w Rysunku 5 pokazuje, że linie te były w dużej mierze równoważne pod względem lizy komórek SKBR3. Dla każdego stosunku komórek obliczono i przedstawiono procentowy współczynnik zmienności. Jak pokazano na Rysunku 5, dla stosunków od 1:40 do 1:5 procentowe współczynniki zmienności (CV) wynosiły poniżej 15%. Jednakże przy stosunkach 1:2,5 i 1:1,25 wartości CV były wysokie lub nieprzewidywalne. Ze względu na znaczną zmienność biologiczną nie jest możliwe zmierzenie zmienności międzyanalizowej z użyciem pierwotnych linii limfocytów T.
Rysunek 1. Impedancja musi zostać znormalizowana po dodaniu limfocytów T. Panel A: pokazuje, że za impedancję odpowiadają komórki nowotworowe (linia czerwona), a nie limfocyty T (linia niebieska). Przedstawiono zapisy impedancji w ciągu 40 godzin dla samych komórek nowotworowych lub samych limfocytów T. Podobne wyniki uzyskano w drugim eksperymencie. Należy zauważyć, że zaburzenie sygnału w około 20 godzinie reprezentuje moment dodania limfocytów T do studzienek niezawierających komórek nowotworowych. Panel B: pokazuje, że pomiary impedancji są przejściowo zakłócone po dodaniu limfocytów T do komórek nowotworowych. Wymaga to normalizacji w określonym punkcie czasowym po dodaniu limfocytów T (patrz punkt normalizacji zaznaczony na wykresie). Krzywe zostały opracowane z podwójnych punktów danych. Krzywa dla samych komórek nowotworowych jest zaznaczona na czerwono. Pozostałe krzywe reprezentują komórki nowotworowe w kołturze z limfocytami T specyficznymi dla HER-2/neu p369 (Niebieska: stosunek 1,25 limfocytów T/komórkę nowotworową, Zielona: stosunek 40 limfocytów T/komórkę nowotworową). Każda krzywa została obliczona z podwójnych punktów danych zbieranych co 5 minut przez cały czas trwania hodowli. Wyniki są reprezentatywne dla 3 oddzielnych eksperymentów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy rysunek.
Rysunek 2. Redukcja impedancji pośredniczona przez limfocyty T jest zależna od dawki. Panel A: Przedstawiono przebiegi impedancji komórek nowotworowych SKBR3 inkubowanych osobno lub z różnymi stężeniami specyficznych dla nowotworu limfocytów T. Każdy przebieg został obliczony z potrójnych punktów danych zbieranych co 5 minut przez cały czas trwania hodowli. Wyniki są reprezentatywne dla 3 oddzielnych eksperymentów. Panel B: Przedstawiono indeksy komórkowe po 10 godzinach dla wszystkich stężeń limfocytów T/komórek nowotworowych. Linia przerywana reprezentuje indeks komórkowy dla samych komórek nowotworowych. Każdy symbol oznacza średnią (±s.e.m.) z pomiarów wykonanych w trzech powtórzeniach. Wyniki są reprezentatywne dla 3 oddzielnych eksperymentów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy rysunek.
Rysunek 3. Test oparty na impedancji wykrywa odpowiedzi cytotoksycznych limfocytów T specyficznych dla antygenu. Panel A przedstawia poziom lizy komórek SKBR3 przez limfocyty T specyficzne dla HER-2/neu p369 (czerwony) lub limfocyty T specyficzne dla FLU (niebieski) w 5., 10. i 15. godzinie po rozpoczęciu kokultury. Każdy punkt danych stanowi średnią (±s.e.m.) z pomiarów wykonanych w trzech powtórzeniach. Wyniki są reprezentatywne dla 3 oddzielnych eksperymentów. Panel B przedstawia lizę SKBR3 przez limfocyty T specyficzne dla p369 lub niespecyficznie aktywowane limfocyty T, co wykazuje, że specyficzna dla antygenu liza nie wynika z oddziaływań Fas-ligand Fas. Czarne słupki reprezentują kokultury zawierające przeciwciało przeciwko ligandowi Fas. Każdy słupek to średnia (±s.e.m.) lizy w trzech powtórzeniach w 5. godzinie po dodaniu limfocytów T. Wyniki są reprezentatywne dla 3 oddzielnych eksperymentów. Panel C pokazuje, że liza SKBR3 przez limfocyty T specyficzne dla p369 10 godzin po dodaniu limfocytów T jest zależna od cząsteczek HLA klasy I. Podczas kokultury dodano albo blokery HLA klasy I, albo kontrolę izotypową. Każdy słupek to średnia (±s.e.m.) lizy w trzech powtórzeniach. Eksperyment ten powtórzono dwukrotnie, uzyskując podobne wyniki. Panel D przedstawia % lizy 10 godzin po dodaniu limfocytów T kilku linii komórkowych nowotworu wykazujących ekspresję HER-2/neu i będących HLA-A2+ przez limfocyty T specyficzne dla p369. BT20, linia komórkowa raka piersi ujemna pod kątem HLA-A2, została użyta jako kontrola negatywna. Każda kropka reprezentuje oddzielny eksperyment obliczony na podstawie trzech oznaczeń. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony rysunek.

Rycina 4. Test oparty na impedancji jest bardziej czuły niż test uwalniania chromu w detekcji limfocytów T specyficznych dla antygenu nowotworowego. Przedstawiono % lizy komórek SKBR3 w odpowiedzi na zmienne stężenia limfocytów T specyficznych dla p369, zmierzony 5 godzin po zmieszaniu komórek nowotworowych i limfocytów T przy użyciu zarówno testu opartego na impedancji, jak i testu uwalniania chromu. Każdy symbol oznacza średnią (±s.e.m) z trzech powtórzeń. Wyniki są reprezentatywne dla 3 oddzielnych eksperymentów.

Rycina 5. Procentowe współczynniki zmienności wewnątrz serii (% CV) testu cytotoksyczności limfocytów T opartego na impedancji. Przedstawiono średnie (±SD) % współczynników zmienności wewnątrz serii dla lizy komórek SKBR3 w zakresie różnych stężeń antygenowo-specyficznych limfocytów T. Każdy symbol reprezentuje średnią z trzech powtórzeń. Liczby naniesione na wykres to średnie wartości % CV. Panel wstawkowy przedstawia średnią (±s.e.m, n=3) % lizy komórek SKBR3 przy różnych stężeniach limfocytów T specyficznych dla p369-377. Przedstawiono dwie niezależnie wygenerowane linie limfocytów T specyficznych dla p369, uzyskane z limfocytów T od dwóch osobnych dawców.