1. Tworzenie trójwymiarowych kokultur
- Dzień przed utworzeniem kokultur wyjmij Matrigel z zamrażarki i rozmroź na lodzie w lodówce o temperaturze 4 °C przez noc.
- W dniu eksperymentu przygotuj pożywkę do kokultury, która odpowiada pożywce stosowanej dla komórek nabłonkowych (w tym przykładzie pożywka HMEC: pożywka DME/F12 z dodatkiem 10% serum cielęcego, 5 μg/mL insuliny, 1 μg/mL hydrokortyzonu i 1 ng/mL EGF). Przechowuj pożywkę na lodzie przez co najmniej 1 godzinę przed zmieszaniem z Matrigelem.
- Aby rozcieńczyć rozmrożony Matrigel, określ całkowitą pożądaną ilość mieszaniny Matrigel:pożywka (300 μL na studzienkę dla płytek 24-dołkowych) i dodaj połowę tej objętości schłodzonej pożywki HMEC do sterylnej probówki na lodzie. Następnie dodaj do probówki taką samą połowę całkowitej objętości rozmrożonego Matrigelu, aby uzyskać rozcieńczenie 1:1. Przechowuj probówkę na lodzie.
- Nanieś 50 μL mieszaniny Matrigel:pożywka na środek wyznaczonych studzienek na płytce 24-dołkowej i inkubuj przez 10 min w inkubatorze o temperaturze 37 °C z nawilżonym powietrzem i 5% CO2.
- Dodaj do studzienek kolejne 450 μL mieszaniny Matrigel:pożywka i inkubuj przez kolejne 60 minut.
- Podczas inkubacji przygotuj zawiesinę 1:1 fibroblastów (tutaj h-TERT-unieśmiertelnione fibroblasty gruczołu piersiowego redukcyjnego wykazujące ekspresję GFP) i komórek nabłonkowych (tutaj h-TERT-unieśmiertelniona linia ludzkich komórek nabłonkowych gruczołu piersiowego wykazująca ekspresję RFP) w stężeniu 0,5 x 105 każdych komórek w 0,5 ml pożywki HMEC.
- Po 60-minutowym etapie inkubacji ostrożnie nanieś zawiesinę komórkową na powierzchnię zestalonego żelu i przenieś kulturę z powrotem do inkubatora.
- Nie zakłócaj kultur przez 2 dni. Po tym czasie pożywkę można wymieniać co 2-3 dni, bardzo ostrożnie aspirując ją z boku studzienki i delikatnie zastępując świeżą pożywką HMEC.
- Codziennie monitoruj tworzenie sferoidów pod mikroskopem. Kultury są zazwyczaj dojrzałe po 10-14 dniach. Wykonaj odpowiednie obrazy za pomocą mikroskopii świetlnej lub fluorescencyjnej. Rozmiar sferoidów oraz długość wypustek można zmierzyć pod mikroskopem świetlnym.
2. Izolacja komórek z kokultur sferoidów
- Bardzo delikatnie pipetuj kulturę w górę i w dół 10 razy, używając sterylnej szklanej pipety 2-mL. Alternatywnie, aby pipetować kulturę, można odciąć końcówkę plastikowego tipa do pipety 1000 µl za pomocą nożyczek wysterylizowanych w autoklawie lub poprzez zanurzenie w 70% etanolu. Przenieś kulturę za pomocą szklanej pipety lub odciętego plastikowego tipa do sterylnej probówki wirówkowej 15 ml i wiruj przez 5 min przy 2000 rpm w temperaturze pokojowej. Sferoidy komórkowe osiądą na dnie.
- Użyj sterylnej końcówki pipety Pasteura, aby delikatnie usunąć rozbitą matrycę Matrigel z górnej części wirówki w probówce.
- Dodaj 1 ml pożywki HMEC do osadu ze sferoidów, pipetuj w górę i w dół 2-3 razy za pomocą sterylnej szklanej pipety 2 mL, a następnie przenieś kulturę do dołka w 24-dołkowej płytce do hodowli tkanek.
- Pozostaw sferoidy do przyczepienia się do płytki na co najmniej 48 godzin przed zmianą pożywki. Z czasem komórki opuszczą struktury sferoidalne i zaczną rosnąć jako monowarstwy.
- Przeprowadź pasaż kultur komórkowych, gdy komórki osiągną 50% konfluencji. Najpierw przenieś kulturę do naczynia 35 mm (około 2-4 dni), a następnie do naczynia 100 mm (około 3-5 dni). Bezpośrednio przed każdym etapem pasażowania użyj sterylnej pipety Pasteura, aby ręcznie usunąć jak najwięcej pozostałych „sferoidów widm”.
- Przeanalizuj komórki metodą cytometrii przepływowej w celu oceny czystości populacji, używając odpowiednich markerów powierzchniowych komórek, a w razie potrzeby oddziel różne populacje komórek za pomocą fluorescencyjnego sortowania komórek (FACS). Izolowane komórki są teraz gotowe do dalszych analiz zgodnie z potrzebami.
3. Reprezentatywne wyniki
W trójwymiarowych kokulturach sferoidów fibroblasty z indukowanym wyciszeniem Tiam1 powodują zwiększoną inwazję w macierz komórek nabłonkowych gruczołu piersiowego (Rycina 1, porównać D, E, F z A, B, C). Fibroblasty z indukowaną nadekspresją Tiam1 powodują zmniejszoną inwazję w macierz linii komórek raka piersi SUM159 (Rycina 1, porównać J, K, L z G, H, I).
Po utworzeniu sferoidów w ko-kulturze, populacje komórek można wyizolować ze sferoidów poprzez ponowne wysianie w warunkach dwuwymiarowych, jak pokazano na Rysunku 2. W zależności od względnych szybkości wzrostu badanych komórek, czyste populacje mogą pojawić się w wyniku seryjnego pasażowania (jak pokazano na Rysunku 3) lub mogą zostać posortowane przy użyciu odpowiednich markerów komórkowych. Po izolacji z 3D ko-kultury, komórki nabłonkowe zachowują właściwości nabyte w wyniku ko-kultury z fibroblastami przez dłuższy czas, co stwarza szerokie możliwości analizy. W niniejszym przykładzie ekspozycja na fibroblasty z niedoborem Tiam1 wywołała zwiększoną migrację w ko-kulturowanych HMEC, która utrzymywała się przez wiele tygodni po izolacji z 3D ko-kultury (Rysunek 4).

Rycina 1. Obrazowanie uformowanych kokultur sferoidów w mikroskopii świetlnej i fluorescencyjnej. Kultury sferoidów utworzono z linii komórkowych nabłonka gruczołów mlekowych oraz fibroblastów i pozostawiono do wzrostu w kulturze na 10-14 dni. A-F: komórki nabłonkowe = HMEC-mCherry. G-L: komórki nabłonkowe = SUM159-mCherry. A-C, G-I: fibroblasty = kontrolne komórki RMF-GFP. D-F: fibroblasty = RMF-GFP z wyciszeniem Tiam1. J-L: fibroblasty = RMF-GFP z nadekspresją Tiam1. Strzałki wskazują wypustki nabłonkowe naciekające macierz.

Rysunek 2. Sekwencyjne obrazowanie hodowli pod mikroskopem świetlnym i fluorescencyjnym po izolacji z hodowli w Matrigelu. Dzień 0 oznacza obrazowanie bezpośrednio po izolacji; dni 1, 2 i 5 wskazują liczbę dni po izolacji. Korona komórek opuszczających sferoid powiększa się z czasem. Ostatecznie pozostaje „widmowy” sferoid z bardzo niewielką liczbą komórek (strzałka). Po usunięciu sferoidów widmowych i pierwszym pasażu pozostaje bardzo mało sferoidów.

Rycina 3. Analiza cytometrii przepływowej komórek po izolacji z kokultury w Matrigelu. Po dojrzewaniu kokultur sferoidalnych komórki są izolowane z kokultury 3D poprzez pipetowanie i seryjne pasażowanie. Alikwoty próbek są analizowane za pomocą cytometrii przepływowej (w tym przykładzie z wykorzystaniem fluorescencji zielonej i czerwonej w celu zidentyfikowania odpowiednio fibroblastów wykazujących ekspresję GFP oraz komórek nabłonkowych wykazujących ekspresję mCherry), aby określić względne liczebności populacji komórek nabłonkowych i fibroblastów.

Rycina 4. Migracja komórek HMECs w układzie Transwell utrzymuje się po izolacji z kokultury w Matrigelu. Po uzyskaniu czystych populacji poprzez hodowlę lub sortowanie komórek metodą fluorescencyjną, komórki można poddać dowolnej analizie. Przedstawiono ocenę migracji komórek HMECs kokultywowanych z fibroblastami kontrolnymi (C) lub fibroblastami z niedoborem Tiam1 (shT) przez perforowane membrany Transwell w 2., 4. i 8. tygodniu po izolacji z kokultury.