1. Znakowanie przeciwciał (Rysunek 1)
- Przygotować bufor NaHCO3 0,1 M:
- 8,4 g NaHCO3
- 29,2 g NaCl
- 1 liter H2O
- Dostosować pH buforu do wartości 8,4 za pomocą tego roztworu (10,6 g Na2CO3, 29,2 g NaCl, 1 liter H20).
- Dodać 35 μl Atto550 NHS do 70 μl przeciwciał anti-hnRNPA1 oraz 500 μl buforu NaHCO3 i inkubować w rotatorze przez 1 h w temperaturze pokojowej. Po godzinnej rotacji wprowadzić mieszaninę do dializatora i dializować w 2 litrach PBS przez noc.
- Następnego dnia skoncentrować zdializowane przeciwciała anti-hnRNPA1 znakowane Atto550 NHS, wykorzystując kolumnę wirową (Amicon Ultra 0,5).
- Po skoncentrowaniu przeciwciał anti-hnRNPA1 znakowanych Atto550 NHS, zmierzyć stężenie próbki za pomocą nanodropu.
2. Transfekcja przeciwciał (Rysunek 2)
- 24 godziny przed transfekcją wysiać 105 komórek/dołka w 500 μl pożywki Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM/F12+10% FBS+1% antybiotyku) na szkiełko z 8 dołkami. Konfluencja komórek powinna wynosić co najmniej 70%.
- Dwadzieścia cztery godziny po wysianiu dodać 2 μl odczynnika Ab-DeliverIN do probówki Eppendorfa.
- Następnie do tej samej probówki Eppendorfa dodać 2 μg przeciwciała anty-hnRNPA1 znakowanego Atto550 NHS (0,5 μg/μl) i inkubować przez 10-15 min w RT.
- Podczas inkubacji odessać pożywkę i dodać do komórek 394 μl świeżej pożywki DMEM.
Uwaga: Do jednej komory z nienaruszonymi komórkami dodaj 500 μl DMEM, aby służyła ona jako kontrola.
- Po inkubacji do mieszaniny przeciwciał należy dodać 100 μl DMEM, wymieszać poprzez pipetowanie w górę i w dół, a następnie dodać do komórek w DMEM, tak aby uzyskać całkowitą objętość 500 μl.
- Po 48 godz. od podania przeciwciał należy wymienić medium.
Uwaga: Protokół powtórzono z użyciem rIgG znakowanych FITC jako kontroli pozytywnej.
3. Obrazowanie żywych i utrwalonych komórek w celu określenia wydajności
- Obrazuj żywe komórki po 48 h, używając filtra Cy3 w mikroskopie fluorescencyjnym, aby zobrazować przeciwciała znakowane Atto550 NHS po transfekcji.
- Po zakończeniu obrazowania na żywo odessaj medium i utrwal komórki.
- Po odessaniu medium potraktuj komórki 0,4% Paraformaldehydem przez 15 min w temperaturze pokojowej. Przemyj komórki 4 x 5 min roztworem PBS. Następnie zamknij preparaty w medium montażowym zawierającym odczynik DAPI i przymocuj szkiełko nakrywkę. Zmierz wydajność transfekcji utrwalonych komórek za pomocą oprogramowania Axiovision. Jeśli oprogramowanie Axiovision nie jest dostępne, po prostu policz ręcznie zdarzenia na obrazie i wprowadź wyniki do obliczeń w punkcie 3.7. Alternatywnie do tych obliczeń można wykorzystać oprogramowanie ImageJ.
- Najpierw użyj pomiaru „Events”, aby policzyć całkowitą liczbę komórek na wybranym obrazie przy powiększeniu 20x.
- Następnie użyj pomiaru „Events”, aby policzyć komórki, które nie zostały pomyślnie przetransfekowane przeciwciałami na tym samym obrazie przy powiększeniu 20x.
- Aby uzyskać dostęp do zmierzonych „Events” w formacie przypominającym arkusz Excel, kliknij „Properties”, wybierz zakładkę „Measurement” i kliknij „As Table”, aby wyświetlić wyniki w formie tabeli.
- Na koniec wykonaj poniższe obliczenia, aby określić wydajność transfekcji poprzez porównanie dwóch wcześniej zmierzonych wartości: ((Całkowita liczba komórek - Komórki nietransfekowane) / Całkowita liczba komórek) x 100 = Wydajność transfekcji.
4. Reprezentatywne wyniki
Obrazy na żywo neuronów niezatransfekowanych (Rysunek 3A) w porównaniu do neuronów zatransfekowanych (Rysunek 3B) wykazują, że znakowanie przeciwciałami (kolor czerwony lub zielony na każdym rysunku) jest wyraźnie widoczne wewnątrz komórek (Rysunek 3B, C, D). Po odessaniu i przemyciu medium w celu usunięcia przeciwciał znajdujących się między komórkami lub przylegających do ich powierzchni, znakowane przeciwciała nadal pozostają wewnątrz neuronów (Rysunek 3C, D). Aby obliczyć wydajność transfekcji, należy użyć oprogramowania Axiovision do wyznaczenia całkowitej liczby komórek w porównaniu do komórek, które nie zostały pomyślnie zatransfekowane. Wartości te wprowadzono do wzoru na wydajność transfekcji, aby uzyskać wydajność transfekcji jako procent całkowitej liczby komórek (Rysunek 4).

Rysunek 1. Schemat blokowy procedur stosowanych do znakowania przeciwciał za pomocą estru Atto 550 NHS, a następnie kroków niezbędnych do zagęszczenia znakowanych przeciwciał. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony rysunek.

Rysunek 2. Schemat procedur wykorzystywanych do transfekcji znakowanych przeciwciał do żywych komórek w hodowli. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy rysunek.

Rycina 3. Obrazy żywych neuronów po 48 h od transfekcji.

Rycina 4. Obrazy po utrwaleniu i przemyciu z policzonymi zdarzeniami w celu określenia wydajności transfekcji.