Obecnie istnieje niewiele modeli pozwalających na realistyczne symulowanie złożonego mikrośrodowiska ludzkiego jelita, w którym zachodzi szereg interakcji. Prawidłowa homeostaza zależy bezpośrednio od tych oddziaływań, ponieważ kształtują one całą odpowiedź immunologiczną, indukując tolerancję na antygeny pokarmowe, przy jednoczesnym generowaniu skutecznych reakcji odpornościowych przeciwko drobnoustrojom patogennym, które zostały przypadkowo przyjęte wraz z pożywieniem.
Homeostaza jelitowa jest utrzymywana również poprzez różnorodne, złożone interakcje między mikrobiotą (w tym korzystnymi szczepami bakterii związanymi z pożywieniem) a organizmem gospodarza, które regulują przyleganie/degradację śluzu, produkcję peptydów przeciwdrobnoustrojowych przez barierę nabłonkową oraz „edukację” komórek nabłonka, kontrolującą fenotyp tolerogenny lub immunogenny specyficznych populacji komórek limfoidalnych rezydujących w jelitach. Interakcje te były dotychczas bardzo trudne do odtworzenia w testach in vitro z wykorzystaniem linii komórkowych lub mononuklearnych komórek krwi obwodowej. Ponadto modele mysie znacznie różnią się pod względem składników błony śluzowej jelit (organizacja warstwy śluzu, społeczność bakterii komensalnych) w stosunku do jelit ludzkich. W związku z tym trudne było prowadzenie badań nad różnymi terapiami, które mają zostać wprowadzone do praktyki klinicznej w przypadku istotnych schorzeń związanych ze stresem lub stanami patologicznymi, takich jak zespół jelita drażliwego, niespecyficzne zapalne schorzenia jelit czy rak jelita grubego.
Aby rozwiązać te problemy, opracowaliśmy nowatorski system umożliwiający polaryzowaną stymulację eksplantatów ludzkiej błony śluzowej jelit, które zachowują swoje uwarunkowanie in situ wynikające z oddziaływań mikrobioty gospodarza i odpowiedzi immunologicznej. Polaryzowana stymulacja apikalna ma kluczowe znaczenie dla wyniku wywołanej odpowiedzi odpornościowej. Wielokrotnie wykazano, że te same bodźce mogą wywołać całkowicie odmienne reakcje, gdy omijają powierzchnię apikalną nabłonka jelitowego, stymulując komórki nabłonkowe basolateralnie lub wchodząc w bezpośredni kontakt z komponentami blaszki właściwej, co zmienia fenotyp z tolerogennego na immunogenny i powoduje niepotrzebny oraz nadmierny stan zapalny w tym obszarze.
Osiągnęliśmy polaryzację stymulacji poprzez przyklejenie cylindra ograniczającego obszar stymulacji na powierzchni apikalnej śluzówki, zgodnie z opisem w protokole. Wykorzystaliśmy ten model do zbadania między innymi różnic w działaniu trzech różnych szczepów Lactobacilli. Wykazujemy, że system modelowy ten jest bardzo skutecznym narzędziem do oceny właściwości immunomodulujących probiotyków w warunkach zdrowia oraz choroby.