$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Od lat siedemdziesiątych rośliny są badane jako alternatywa dla hodowli komórek ssaków, owadów i bakterii do komercyjnej produkcji rekombinowanych białek i terapii białkowych 1. Roślinne systemy do ekspresji biofarmaceutyków okazały się obiecujące w ostatnich latach, ponieważ kilka nowatorskich metod leczenia chorób, takich jak choroba Gauchera 2 i ptasia grypa H5N1 3, odniosło sukces w badaniach klinicznych. Rozwój kompetentnych mechanizmów ekspresji białek rekombinowanych w roślinach w ciągu dziesięcioleci, które upłynęły od tych początkowych eksperymentów, stworzył potencjał dla systemów roślinnych do zmiany obecnego paradygmatu produkcji białek z trzech głównych powodów. Po pierwsze, nastąpił znaczny spadek kosztów, ponieważ bioreaktory ssaków, owadów i bakterii wymagają znacznych kosztów rozruchu, drogich pożywek wzrostowych i skomplikowanych procesów oczyszczania 4. Stworzenie stabilnych transgenicznych linii roślinnych pozwala im również wyprzedzić skalowalność innych systemów ekspresji, ponieważ rośliny wykazujące ekspresję białka mogą być uprawiane i zbierane na skalę rolniczą 5. Po drugie, roślinne systemy ekspresji znacznie zmniejszają ryzyko przeniesienia ludzkiego lub zwierzęcego patogenu z gospodarza wykazującego ekspresję białka na człowieka, co świadczy o ich wyższości w zakresie bezpieczeństwa publicznego 6. Wreszcie, rośliny wykorzystują eukariotyczny system endomembranowy, który jest podobny do komórek ssaków, co pozwala na prawidłową potranslacyjną modyfikację białek, w tym glikozylację i składanie białek wielopodjednostkowych 7. Ta zdolność stawia systemy roślinne przed tymi opartymi na systemach prokariotycznych, takich jak bakterie, ponieważ większa liczba farmaceutycznych białek rekombinowanych, w tym przeciwciał monoklonalnych (mAb), ma bardziej skomplikowaną strukturę i wymaga rozległych modyfikacji potranslacyjnych lub składania 8.
Istnieją dwa główne podejścia do wyrażania białek rekombinowanych w roślinach. Pierwszym z nich jest opracowanie stabilnej linii transgenicznej, w której DNA kodujące białko docelowe jest klonowane do kasety ekspresyjnej i wprowadzane do genomu jądrowego lub chloroplastowego. W ten sposób obce DNA staje się dziedziczne przez kolejne pokolenia i pozwala na ogromnie lepszą skalowalność, znacznie przewyższającą inne systemy ekspresji 1. Wprowadzenie egzogennego DNA do genomu jądrowego następuje zwykle poprzez zakażenie tkanki roślinnej przez Agrobacterium tumefaciens lub, rzadziej, przez bombardowanie tkanki mikropociskami 9. Hormony roślinne są następnie wykorzystywane do indukowania różnicowania i wzrostu transgenicznych tkanek roślinnych, takich jak korzenie i liście. Transformacja genomu chloroplastów nie może być osiągnięta za pomocą A. tumefaciens, ale opiera się całkowicie na cząsteczkach złota lub wolframu pokrytych DNA wystrzeliwanym balistycznie do komórek roślinnych. Drugą metodą ekspresji białka rekombinowanego w roślinach jest ekspresja przejściowa 10. W tym scenariuszu wektory pochodzące od wirusa, które zawierają gen będący przedmiotem zainteresowania, są dostarczane przez A. tumefaciens do w pełni rozwiniętych roślin w procesie zwanym agroinfiltracją. Zamiast integrować się z genomem rośliny, dostarczony konstrukt genu zacznie kierować przejściową produkcją pożądanego białka, które można zebrać i wyizolować po krótkim okresie inkubacji. Przejściowa ekspresja genów ma tę zaletę, że zapewnia większą ogólną akumulację białka, a także lepszy czas produkcji białka, ponieważ rośliny będą gotowe do zbiorów około 1-2 tygodnie po agroinfiltracji 11. Jest to znacznie szybsze niż procesy generowania, selekcji i potwierdzania stabilnych linii roślin transgenicznych, które mogą trwać od kilku miesięcy do roku. Jest to jednak również ograniczenie systemu ekspresji przejściowej, ponieważ nie da on genetycznie stabilnych linii roślin, które można wykorzystać do wygenerowania banku nasion do produkcji komercyjnej na dużą skalę. Mimo to opracowano podejścia mające na celu poprawę ekspresji przejściowej na dużą skalę. Tutaj pokazujemy jedną z metod generowania przejściowych roślin Nicotiana benthamiana wykazujących ekspresję białka przy użyciu zdekonstruowanych wektorów wirusowych dostarczanych przez A. tumefaciens.
Opracowywane są dwie główne metody dostarczania A. tumefaciens do tkanek roślinnych: infiltracja na skali laboratoryjnej za pomocą strzykawki i infiltracja na dużą skalę za pomocą komory próżniowej. Oba protokoły zostały opisane tutaj przy użyciu N. benthamiana, która jest blisko spokrewniona z pospolitą rośliną tytoniu, jako roślina żywicielska dla przejściowej ekspresji dwóch białek fluorescencyjnych: białka zielonej fluorescencji (GFP) z meduzy Aequorea victoria i białka czerwonej fluorescencji z Discosoma coral (DsRed) 12,13. N. benthamiana jest najczęstszą rośliną żywicielską dla białka rekombinowanego, ponieważ jest podatna na transformację genetyczną, może szybko wytwarzać duże ilości biomasy i jest płodnym producentem nasion do produkcji na dużą skalę 14. Kolejną zaletą stosowania N. benthamiana jako gospodarzy do ekspresji białek jest dostępność różnorodnych wektorów ekspresyjnych 2,5. W tym badaniu dwa zdekonstruowane wektory wirusowe, jeden oparty na systemie replikonów RNA wirusa mozaiki tytoniu (TMV) (wektory MagnICON), a drugi pochodzący z systemu replikonów DNA wirusa żółtego karła fasoli (BeYDV) (wektory geminiwirusowe) 4,11,15-18 , są używane do przenoszenia genu GFP i DsRed i dostarczania ich do komórek N. benthamiana za pośrednictwem A. tumefaciens. Trzy konstrukty DNA zostaną wykorzystane do ekspresji GFP lub DsRed za pomocą wektorów MagnICON. Obejmują one moduł 5' (pICH15879) zawierający promotor i inne elementy genetyczne do kierowania ekspresją genu docelowego, moduł 3' zawierający gen będący przedmiotem zainteresowania (pICH-GFP lub pICH-DsRed) oraz moduł integrazy (pICH14011) kodujący enzym, który integruje moduły 5' i 3' razem po ekspresji 8,15. Trzy konstrukty DNA są również potrzebne do ekspresji z wektorami geminiwirusowymi. Oprócz wektorów zawierających replikon genu docelowego ( pBYGFP lub pBYDsRed), do amplifikacji docelowego replikonu 11,14,16 wymagane jest kodowanie wektorowe białka replikacyjnego (pREP110). Ponadto pożądane jest włączenie wektora kodującego supresor wyciszający p19 z wirusa karłowatości pomidora dla ekspresji genów docelowych wysokiego poziomu 11,16.
Ogólnie rzecz biorąc, istnieją trzy główne etapy wprowadzania genów białek rekombinowanych do komórek roślinnych poprzez agroinfiltrację, w tym wzrost roślin, przygotowanie kultury A. tumefaciens i infiltracja. Ponieważ każdy krok ma kluczowe znaczenie dla ostatecznego sukcesu tej procedury, poniżej znajduje się szczegółowy opis każdego z nich zarówno dla infiltracji strzykawki, jak i infiltracji próżniowej.