RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Rośliny oferują nowatorski system do produkcji białek farmaceutycznych na skalę komercyjną, który jest bardziej skalowalny, opłacalny i bezpieczny niż obecne paradygmaty ekspresji. W tym badaniu przedstawiamy proste i wygodne, a jednocześnie skalowalne podejście do wprowadzenia genu docelowego zawierającego Agrobacterium tumefaciens do roślin w celu przejściowej ekspresji białka.
Hodowla komórek ssaków jest główną platformą do komercyjnej produkcji szczepionek ludzkich i białek terapeutycznych. Nie jest jednak w stanie sprostać rosnącemu światowemu zapotrzebowaniu na farmaceutyki ze względu na ograniczoną skalowalność i wysokie koszty. Zakłady okazały się jedną z najbardziej obiecujących alternatywnych platform produkcji farmaceutycznej, które są solidne, skalowalne, tanie i bezpieczne. Niedawny rozwój wektorów opartych na wirusach umożliwił szybką i przejściową ekspresję białek rekombinowanych na wysokim poziomie w roślinach. Aby jeszcze bardziej zoptymalizować użyteczność systemu ekspresji przejściowej, w tym badaniu demonstrujemy prostą, wydajną i skalowalną metodologię wprowadzania docelowego genu zawierającego Agrobacterium do tkanki roślinnej. Nasze wyniki wskazują, że agroinfiltracja zarówno metodą strzykawkową, jak i próżniową doprowadziła do skutecznego wprowadzenia Agrobacterium do liści i solidnej produkcji dwóch białek fluorescencyjnych; GFP oraz DsRed. Ponadto pokazujemy wyjątkowe zalety oferowane przez obie metody. Infiltracja strzykawkowa jest prosta i nie wymaga drogiego sprzętu. Pozwala również na elastyczność w infiltracji całego liścia za pomocą jednego genu docelowego lub wprowadzenia genów wielu celów na jednym liściu. Dzięki temu może być stosowany do ekspresji białek rekombinowanych w skali laboratoryjnej, a także do porównywania różnych białek lub wektorów pod kątem wydajności lub kinetyki ekspresji. Prostota infiltracji strzykawkowej sugeruje również jej przydatność w edukacji szkolnej i studenckiej w zakresie biotechnologii. Natomiast infiltracja próżniowa jest bardziej niezawodna i może być skalowana do komercyjnej produkcji białek farmaceutycznych. Zaletą jest również możliwość agroinfiltracji gatunków roślin, które nie są podatne na infiltrację strzykawkową, takich jak sałata i rzodkiewnik. Ogólnie rzecz biorąc, połączenie agroinfiltracji strzykawkowej i próżniowej zapewnia naukowcom i edukatorom prostą, wydajną i solidną metodologię przejściowej ekspresji białek. Znacznie ułatwi to rozwój białek farmaceutycznych i będzie promować edukację w zakresie nauk ścisłych.
Od lat siedemdziesiątych rośliny są badane jako alternatywa dla hodowli komórek ssaków, owadów i bakterii do komercyjnej produkcji rekombinowanych białek i terapii białkowych 1. Roślinne systemy do ekspresji biofarmaceutyków okazały się obiecujące w ostatnich latach, ponieważ kilka nowatorskich metod leczenia chorób, takich jak choroba Gauchera 2 i ptasia grypa H5N1 3, odniosło sukces w badaniach klinicznych. Rozwój kompetentnych mechanizmów ekspresji białek rekombinowanych w roślinach w ciągu dziesięcioleci, które upłynęły od tych początkowych eksperymentów, stworzył potencjał dla systemów roślinnych do zmiany obecnego paradygmatu produkcji białek z trzech głównych powodów. Po pierwsze, nastąpił znaczny spadek kosztów, ponieważ bioreaktory ssaków, owadów i bakterii wymagają znacznych kosztów rozruchu, drogich pożywek wzrostowych i skomplikowanych procesów oczyszczania 4. Stworzenie stabilnych transgenicznych linii roślinnych pozwala im również wyprzedzić skalowalność innych systemów ekspresji, ponieważ rośliny wykazujące ekspresję białka mogą być uprawiane i zbierane na skalę rolniczą 5. Po drugie, roślinne systemy ekspresji znacznie zmniejszają ryzyko przeniesienia ludzkiego lub zwierzęcego patogenu z gospodarza wykazującego ekspresję białka na człowieka, co świadczy o ich wyższości w zakresie bezpieczeństwa publicznego 6. Wreszcie, rośliny wykorzystują eukariotyczny system endomembranowy, który jest podobny do komórek ssaków, co pozwala na prawidłową potranslacyjną modyfikację białek, w tym glikozylację i składanie białek wielopodjednostkowych 7. Ta zdolność stawia systemy roślinne przed tymi opartymi na systemach prokariotycznych, takich jak bakterie, ponieważ większa liczba farmaceutycznych białek rekombinowanych, w tym przeciwciał monoklonalnych (mAb), ma bardziej skomplikowaną strukturę i wymaga rozległych modyfikacji potranslacyjnych lub składania 8.
Istnieją dwa główne podejścia do wyrażania białek rekombinowanych w roślinach. Pierwszym z nich jest opracowanie stabilnej linii transgenicznej, w której DNA kodujące białko docelowe jest klonowane do kasety ekspresyjnej i wprowadzane do genomu jądrowego lub chloroplastowego. W ten sposób obce DNA staje się dziedziczne przez kolejne pokolenia i pozwala na ogromnie lepszą skalowalność, znacznie przewyższającą inne systemy ekspresji 1. Wprowadzenie egzogennego DNA do genomu jądrowego następuje zwykle poprzez zakażenie tkanki roślinnej przez Agrobacterium tumefaciens lub, rzadziej, przez bombardowanie tkanki mikropociskami 9. Hormony roślinne są następnie wykorzystywane do indukowania różnicowania i wzrostu transgenicznych tkanek roślinnych, takich jak korzenie i liście. Transformacja genomu chloroplastów nie może być osiągnięta za pomocą A. tumefaciens, ale opiera się całkowicie na cząsteczkach złota lub wolframu pokrytych DNA wystrzeliwanym balistycznie do komórek roślinnych. Drugą metodą ekspresji białka rekombinowanego w roślinach jest ekspresja przejściowa 10. W tym scenariuszu wektory pochodzące od wirusa, które zawierają gen będący przedmiotem zainteresowania, są dostarczane przez A. tumefaciens do w pełni rozwiniętych roślin w procesie zwanym agroinfiltracją. Zamiast integrować się z genomem rośliny, dostarczony konstrukt genu zacznie kierować przejściową produkcją pożądanego białka, które można zebrać i wyizolować po krótkim okresie inkubacji. Przejściowa ekspresja genów ma tę zaletę, że zapewnia większą ogólną akumulację białka, a także lepszy czas produkcji białka, ponieważ rośliny będą gotowe do zbiorów około 1-2 tygodnie po agroinfiltracji 11. Jest to znacznie szybsze niż procesy generowania, selekcji i potwierdzania stabilnych linii roślin transgenicznych, które mogą trwać od kilku miesięcy do roku. Jest to jednak również ograniczenie systemu ekspresji przejściowej, ponieważ nie da on genetycznie stabilnych linii roślin, które można wykorzystać do wygenerowania banku nasion do produkcji komercyjnej na dużą skalę. Mimo to opracowano podejścia mające na celu poprawę ekspresji przejściowej na dużą skalę. Tutaj pokazujemy jedną z metod generowania przejściowych roślin Nicotiana benthamiana wykazujących ekspresję białka przy użyciu zdekonstruowanych wektorów wirusowych dostarczanych przez A. tumefaciens.
Opracowywane są dwie główne metody dostarczania A. tumefaciens do tkanek roślinnych: infiltracja na skali laboratoryjnej za pomocą strzykawki i infiltracja na dużą skalę za pomocą komory próżniowej. Oba protokoły zostały opisane tutaj przy użyciu N. benthamiana, która jest blisko spokrewniona z pospolitą rośliną tytoniu, jako roślina żywicielska dla przejściowej ekspresji dwóch białek fluorescencyjnych: białka zielonej fluorescencji (GFP) z meduzy Aequorea victoria i białka czerwonej fluorescencji z Discosoma coral (DsRed) 12,13. N. benthamiana jest najczęstszą rośliną żywicielską dla białka rekombinowanego, ponieważ jest podatna na transformację genetyczną, może szybko wytwarzać duże ilości biomasy i jest płodnym producentem nasion do produkcji na dużą skalę 14. Kolejną zaletą stosowania N. benthamiana jako gospodarzy do ekspresji białek jest dostępność różnorodnych wektorów ekspresyjnych 2,5. W tym badaniu dwa zdekonstruowane wektory wirusowe, jeden oparty na systemie replikonów RNA wirusa mozaiki tytoniu (TMV) (wektory MagnICON), a drugi pochodzący z systemu replikonów DNA wirusa żółtego karła fasoli (BeYDV) (wektory geminiwirusowe) 4,11,15-18 , są używane do przenoszenia genu GFP i DsRed i dostarczania ich do komórek N. benthamiana za pośrednictwem A. tumefaciens. Trzy konstrukty DNA zostaną wykorzystane do ekspresji GFP lub DsRed za pomocą wektorów MagnICON. Obejmują one moduł 5' (pICH15879) zawierający promotor i inne elementy genetyczne do kierowania ekspresją genu docelowego, moduł 3' zawierający gen będący przedmiotem zainteresowania (pICH-GFP lub pICH-DsRed) oraz moduł integrazy (pICH14011) kodujący enzym, który integruje moduły 5' i 3' razem po ekspresji 8,15. Trzy konstrukty DNA są również potrzebne do ekspresji z wektorami geminiwirusowymi. Oprócz wektorów zawierających replikon genu docelowego ( pBYGFP lub pBYDsRed), do amplifikacji docelowego replikonu 11,14,16 wymagane jest kodowanie wektorowe białka replikacyjnego (pREP110). Ponadto pożądane jest włączenie wektora kodującego supresor wyciszający p19 z wirusa karłowatości pomidora dla ekspresji genów docelowych wysokiego poziomu 11,16.
Ogólnie rzecz biorąc, istnieją trzy główne etapy wprowadzania genów białek rekombinowanych do komórek roślinnych poprzez agroinfiltrację, w tym wzrost roślin, przygotowanie kultury A. tumefaciens i infiltracja. Ponieważ każdy krok ma kluczowe znaczenie dla ostatecznego sukcesu tej procedury, poniżej znajduje się szczegółowy opis każdego z nich zarówno dla infiltracji strzykawki, jak i infiltracji próżniowej.
1. Wzrost roślin
2. A. tumefaciens Przygotowanie kultury
2.1 Przygotowanie do infiltracji strzykawki
2.2 Przygotowanie do infiltracji próżniowej
3. Infiltracja
3.1 Infiltracja strzykawki
3.2 Infiltracja próżniowa
4. Wykrywanie i fotografowanie białek fluorescencyjnych
1. Ekspresja białek fluorescencyjnych przez infiltrację strzykawką
Aby zademonstrować skuteczność infiltracji Agrobacterium przez strzykawkę do tkanki roślinnej, przetestowaliśmy ekspresję dwóch białek fluorescencyjnych - GFP i DsRed - przez dwa różne zdekonstruowane wektory wirusowe roślin - geminiviral i MagnICON - u N. benthamiana. W przypadku liści N. benthamiana, które były całkowicie naciekane przez agrobakterie zawierające wektory geminiwirusowe, ekspresję GFP obserwowano na całej powierzchni liści w świetle UV, zaczynając już od 2 dpi i osiągając szczytową akumulację przy 4 dpi (Figura 4C). Ta wczesna ekspresja GFP przez wektor geminiwirusowy jest zgodna z wcześniejszymi wynikami innych rekombinowanych białek 14,16,18,19. Natomiast liście naciekane kombinacjami Agrobacterium zawierającymi wektory MagnICON wykazywały fluorescencję GFP dopiero po 5 dpi i osiągnęły maksymalną akumulację przy 7 dpi (Figura 4D). Nie zaobserwowano zielonej fluorescencji z liści naciekanych kontrolnymi mieszaninami Agrobacterium pREP110 + p19 (Figura 4B) lub pICH15879 + pCH14011 (dane nie pokazane), co wskazuje, że fluorescencja była specyficzna dla genu GFP i nie była wynikiem fluorescencji tła z liści. W szczytowej akumulacji fluorescencja GFP wyrażanego przez wektor MagnICON jest bardziej intensywna niż wektora geminiwirusowego (Figura 4C i 4D), podobnie jak wyniki uzyskane wcześniej dla innych białek rekombinowanych 8,18. Wzorzec ekspresji czasowej i względna intensywność fluorescencji DsRed są podobne do GFP (dane nie pokazane). Nie zaobserwowano większej martwicy na liściach naciekanych konstruktami GFP (ryc. 4A). Podobne wyniki zaobserwowano również w przypadku roślin wykazujących ekspresję DsRed, co wskazuje, że żadne z białek fluorescencyjnych nie jest wysoce toksyczne dla komórek roślinnych. Zaobserwowano jednak miejscową martwicę w miejscu nacięcia, które na zdjęciach wyglądały jak "" (ryc. 4). Gdy oba białka fluorescencyjne uległy ekspresji na tym samym liściu za pośrednictwem wektorów geminiwirusowych z naciekiem strzykawkowym, wykryto je z oczekiwanym kolorem fluorescencyjnym w miejscu, w którym były naciekane (Figura 5). Co ciekawe, jednoczesna infiltracja GFP i DsRed spowodowała żółtawą fluorescencję (Figura 5). Intensywność fluorescencji DsRed okazała się słabsza niż GFP na tym samym liściu. Może to jednak nie odzwierciedlać słabszej ekspresji DsRed, ale raczej mniej niż optymalne wzbudzenie DsRed przez światło UV. Ogólnie rzecz biorąc, nasze wyniki pokazują, że infiltracja strzykawką skutecznie wprowadza rekombinowane agrobakterie przenoszące geny do liści roślin i skutkuje silną ekspresją naszych docelowych białek. Ponadto wykazaliśmy, że metoda ta pozwala na elastyczność w infiltracji całych liści w celu maksymalnej akumulacji jednego białka docelowego lub punktowej infiltracji wielu celów białkowych za pomocą wielu wektorów w celu porównania ich ekspresji i wzorca ekspresji.
2. Ekspresja białek fluorescencyjnych przez infiltrację próżniową
Infiltracja próżniowa została również zbadana w celu opracowania skalowalnej metody agroinfiltracji, która może być wykorzystana do produkcji na dużą skalę rekombinowanych białek przez roślinne systemy ekspresji przejściowej. Nasze wyniki wskazują, że czasowy wzorzec ekspresji GFP lub DsRed przez wektory geminiwirusowe i MagnICON nie został zmieniony przez zmianę metody infiltracji i pozostał podobny do infiltracji strzykawki. Ponieważ cały pęd rośliny jest zanurzony w mieszaninie infiltracyjnej podczas infiltracji próżniowej, zaobserwowano fluorescencję GFP (ryc. 6) dla wszystkich liści infiltrowanych roślin. W porównaniu z infiltracją strzykawkową jest bardziej wytrzymały i może osiągnąć infiltrację każdej rośliny w znacznie krótszym czasie. Na przykład, wykwalifikowany uczeń potrzebuje 15 minut, aby przeniknąć strzykawką do całej 6-tygodniowej rośliny N. benthamiana. W przeciwieństwie do tego, ta sama roślina może być infiltrowana w ciągu 3 minut przez próżnię od początku do końca, a wiele roślin może być infiltrowanych w tym samym czasie.

Rysunek 1. Wzrost roślin N. benthamiana za pomocą granulek torfu i tac wzrostowych. Rośliny typu dzikiego w 0 (A), 2 (B), 4 (C) i 6 (D) tygodniu po wysianiu.

Rysunek 2. Naciek strzykawkowy liści N. benthamiana z Agrobacterium tumefaciens. Szczep GV3101 A. tumefaciens zawierający wektory MagnICON wykazujące ekspresję GFP został ponownie zawieszony w buforze infiltracyjnym i załadowany do strzykawki bez igły. Nacięcie zostało utworzone za pomocą igły na tylnej stronie 6-tygodniowego liścia rośliny (A). Otwór strzykawki umieszczono przy nacięciu (B), a agrobakterie w buforze infiltracyjnym wstrzyknięto do przestrzeni międzykomórkowej liścia przez nacięcie (C).

Rysunek 3. Naciekanie próżniowe liści N. benthamiana przez Agrobacterium tumefaciens. Szczep GV3101 A. tumefaciens zawierający docelowe wektory eksprymujące białko zawieszono ponownie w buforze infiltracyjnym i załadowano do 3-litrowej wanny. Wannę umieszczono następnie w eksykatorze próżniowym, który był podłączony do pompy próżniowej (A). 6-tygodniową roślinę umieszczono do góry nogami na płycie eksykatora (B). Cały system liści i łodyg został następnie zanurzony w wannie, gdy płyta została umieszczona na szczycie komory (C). Agroinfiltrację osiągnięto poprzez dwukrotne zastosowanie i uwolnienie próżni o ciśnieniu 100 mbar przez 1 minutę. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą liczbę.

Rysunek 4. Ekspresja GFP w liściach agroinfiltrowanych strzykawki. Całe liście N. benthamiana były infiltrowane szczepem GV3101 A. tumefaciens zawierającym gen GFP w wektorze geminiwirusowym (A i C) lub MagnICON (D). Liście kontroli ujemnej zostały naciekane szczepami agrobakterii, które nie zawierają tego genu GFP (B). Liście fotografowane były w świetle białym (A) lub UV (B-D) o rozdzielczości 4 dpi (A-C) lub 7 dpi (D).

Rysunek 5. Ekspresja GFP i DsRed w liściach strzykawkowych agroinfiltrowanych. Liście N. benthamiana były naciekane punktowo przez GV3101 zawierający geny GFP, DsRed lub zarówno GFP, jak i DsRed w wektorach geminiwirusowych. Punkt kontroli ujemnej infiltrowano pREP110+p19. Liście zostały sfotografowane w świetle UV w rozdzielczości 4 dpi.

Rysunek 6. Ekspresja GFP w liściach agroinfiltrowanych próżniowo. Liście N. benthamiana zostały naciekane przez GV3101 zawierającego gen GFP w wektorach MagnICON. Liście zostały sfotografowane w świetle UV w rozdzielczości 7 dpi.
Autorzy nie mają konkurencyjnych interesów finansowych.
Rośliny oferują nowatorski system do produkcji białek farmaceutycznych na skalę komercyjną, który jest bardziej skalowalny, opłacalny i bezpieczny niż obecne paradygmaty ekspresji. W tym badaniu przedstawiamy proste i wygodne, a jednocześnie skalowalne podejście do wprowadzenia genu docelowego zawierającego Agrobacterium tumefaciens do roślin w celu przejściowej ekspresji białka.
Dziękujemy R. Sunowi i innym studentom Laboratorium Chena za ich wkład w tworzenie materiału roślinnego. Dziękujemy również Dr. D. Green za wsparcie badań licencjackich w College of Technology and Innovation (CTI). Badania te były częściowo wspierane przez granty NIH U01 AI075549 i 1R21AI101329 dla Q. Chena oraz grant SSE od CTI z Arizona State University dla Q. Chena. K. Leuzinger, M. Dent, J. Hurtado i J. Stahnke są studentami studiów licencjackich wspieranymi przez grant SSE.
| Reodczynniki | |||
| GFP | Invitrogen | V353-20 | www.invitrogen.com Zobacz odniesienie: Lico i Chen, et al 2008 |
| DsRed | Clontech | 632152 | www.clontech.com Zobacz odniesienie: Baird i Zacharias, et al 2000 |
| MagnICON Vector | Icon Genetics | n/a | www.icongenetics.com Zobacz odniesienie: giritch i Marillonnet, et al 2006 |
| Geminiviral | Vector Author' s Lab | n/a | Zobacz odniesienie: Chen and He, et al 2011 |
| N. benthamiana | Author' s Lab | n/a | herbalistics.com.au |
| Agrobacterium tumefaciens szczep gv3101 | Autor' s Lab | n/a | Zobacz odniesienie: Lai i Chen 2012 |
| LB Agar Carbenicillin-100, płytki | Sigma | L0418 | www.sigmaaldrich.com |
| LB Agar Kanamycin-50, płytki | Sigma | L0543 | www.sigmaaldrich.com |
| Siarczan magnezu hepa hydrat | Sigma | M2773-500 g | www.sigmaaldrich.com |
| Bacto-Tryptone | Fisher | 73049-73-7 | www.fishersci.com |
| Ekstrakt drożdżowy Bacto | Becton, Dickinson CO. | REF 212750 | www.bd.com |
| Difco Nutrient Bulion | Becton, Dickinson CO. | REF 234000 | www.bd.com |
| MES hydrate Buffer | Sigma | M8250-1kg | www.sigmaaldrich.com |
| Carbenicillin | Sigma | C1613-1ML | <a href="http://www.sigmaaldrich.com/" target="_blank"> www.sigmaaldrich.com |
| Kanamycin | Sigma | 70560-51-9 | www.sigmaaldrich.com |
| Wodorotlenek sodu | Sigma | 221465www.sigmaaldrich.com | |
| Jack' s Nawóz | Hummert International | 25 lipca | www.hummert.com |
| Equipment | |||
| Vacuubrand MD4 Pompa próżniowa | Fisher | 13-878-113 | www.fishersci.com |
| Powietrze próżniowe Zawór regulacyjny | Fisher | NC9386590 | www.fishersci.com |
| Eksykator 12 1/8" z O-ringiem | Fisher | 08-594-15C | www.fishersci.com |
| 3 L Pojemnik | Rubber-Maid | n/a | Rubbermaid Servn' Miska oszczędnościowa, 10 filiżanek będzie działać |
| talerz/półka 230ML | Fisher | NC9489269 | www.fishersci.com |
| Peat Pellet | Hummert International | 14-2370-1 | www.hummert.com |
| Taca do rozmnażania Kopuła | hydrofarm | 132052 | www.hydroponics.net |
| Hydrofarm z tacą propagacyjną | 138758 | www.hydroponics.net | |
| Siewnik ręczny Virbo | Gro-Mor INC | n/a | www.gro-morent.com |
| Flora Cart 4 półki | Hummert International | 65-6924-1 | www.hummert.com |
| 15 ml Probówki hodowlane z okrągłym dnem | Sigma | CLS430172-500EA | <a href="http://www.sigmaaldrich.com/" target="_blank">http://www.sigmaaldrich.com |
| Spektrofotometr | Bio-Rad | 170-2525 | www.bio-rad.com |
| Spektrofotometr Kuwety | Bio-Rad | 223-9950 | www.bio-rad.com |
| Probówki do mikrowirówek | USA Scientific | 1415-2500 | www.usascientific.com |
| Wirówka stołowa | Bio-Rad | 166-0602EDU | <a href="http://www.bio-rad.com/" target="_blank">www.bio-rad.com |
| Inkubator/Wytrząsarka | Eppendorf | Excella E25 | www.eppendorf.com |
| Model światła ultrafioletowego#: UVGL-25 | UVP | 95-0021-12 | www.uvp.com |