Aby uzyskać wyniki przedstawione w tej metodzie, otwarta ramka odczytu białka zielonej fluorescencji (GFP) zostaje połączona z sekwencją promotora/enhancera indukowanego zranieniem z genu Dopa Decarboxylase (Ddc), natomiast DsRed zostaje połączona z sekwencją enhancera zranienia z genu tyrosine hydroxylase (ple)4,6. W żywym embrionie Drosophila dojrzewanie fluorescencyjnego białka reporterowego zranienia jest optymalne 4-6 h po zranieniu, co pozwala na akumulację wystarczającej ilości białka do wizualizacji, a także daje czas białku fluorescencyjnemu na utlenienie do stanu fluorescencyjnego15. Do obserwacji lokalizacji reportera wystarczający jest złożony mikroskop fluorescencyjny. Aby uzyskać większe powiększenie lokalizacji reportera, optymalne jest zastosowanie mikroskopu konfokalnego w celu wygenerowania projekcji maksymalnej z wielu przekrojów optycznych (Rycina 1). Konfokalne obrazowanie in vivo embrionów Drosophila jest utrudnione przez szybkie falowania embrionu. Pełny widok embrionu można uzyskać za pomocą obiektywu 20X, a zbliżenie miejsca zranienia za pomocą obiektywu 40X. Widok z góry lokalizacji epidermalnego reportera zranienia można obrazować za pomocą 10 następujących po sobie przekrojów optycznych o grubości 1 µm. Widok boczny lokalizacji epidermalnego reportera zranienia można obrazować za pomocą 40 następujących po sobie przekrojów optycznych o grubości 1 µm.
Stosując standardowe metody krzyżowania genetycznego, możliwe jest połączenie reporterów rany z mutacjami genetycznymi. Przykładem przedstawionym w niniejszej pracy jest Flotillin-2 (Flo-2), ponieważ mutanty Flo-2 z utratą funkcji (allela null wygenerowana poprzez insercję elementu P) oraz z nadmiarem funkcji (nadekspresja wygenerowana przez powszechną ekspresję we wszystkich komórkach) wykazują, że produkt genu Flo-2 jest niezbędny i wystarczający do zahamowania lokalizacji reporterów rany Ddc-GFP9 (Ryciny 2A i 2B). Wykorzystując protokół mikroiniekcji, można sprawdzić, czy wprowadzenie roztworów chemicznych nadaktywuje lub hamuje lokalizację reporterów rany. Zarodki poddane uszkodzeniu chemicznemu były jednocześnie raniwe i iniektywne roztworem w stosunku 1:4 barwnika błękitu toluidyny 1% i rozpuszczonych związków. Barwnik błękit toluidyny pozwolił na wizualne potwierdzenie wstrzyknięcia rozpuszczonych związków do jamy ciała. Zarodki kontrolne były raniwe za pomocą złamanej igły zawierającej stosunek 1:4 barwnika błękitu toluidyny 1% i rozpuszczalnika bez związku chemicznego. Dwoma przykładami przedstawionymi w niniejszej pracy są nadtlenek wodoru (H2O2) i metylo-β-cyklodekstryna (MβCD), ponieważ oba roztwory chemiczne są wystarczające do globalnej aktywacji lokalizacji reporterów rany Ddc-GFP9 (Ryciny 2C i 2D). Nadtlenek wodoru (H2O2) rozcieńczono w H2O do stężenia 0.6 M. Metylo-β-cyklodekstrynę (MβCD) rozpuszczono w 1 mM NaOH do stężenia 3 mM. Korzystając z protokołu fiksacji zarodków, można wykryć aktywację transkrypcji genów odpowiedzi na ranę w zlokalizowanej domenie, otaczającej miejsce rany. Przykładem przedstawionym w niniejszej pracy jest hybrydyzacja in situ sond RNA w celu wykrycia transkryptów Ddc i ple4,6,9 (Ryciny 3A i 3B).

Rycina 1. Lokalizacja reporterów rany Ddc-GFP i ple-DsRed. Obrazy w świetle przechodzącym i fluorescencyjne w ranionych zarodkach typu dzikiego. (A) Widok z góry reportera rany Ddc-GFP. (B) Widok z góry reportera rany ple-DsRed. Wszystkie obrazy zostały zarejestrowane za pomocą konfokalnego mikroskopu Leica SP2 z obiektywem 20X. Strzałki wskazują miejsce rany. Linie przerywane na panelach danych wyznaczają obrysy zarodków. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy obraz.

Rycina 2. Lokalizacja reportera rany Ddc-GFP w mutantach genetycznych i embrionach po mikroiniekcjach chemicznych. Obrazy w świetle widzialnym i fluorescencyjne obrazowanie zranionych embrionów mutantów Flotillin-2 (Flo-2). (A) Mutanty Flo-2 {KG00210} z utratą funkcji, rozszerzenie aktywności reportera we wszystkich komórkach epidermy. (B) Mutanty Flo-2 (armadillo-GAL4, UAS-Flo2) z nadmiarową funkcją, zahamowanie aktywności reportera we wszystkich komórkach epidermy. (C) Mikroiniekcja roztworu nadtlenku wodoru (H2O2), rozszerzenie aktywności reportera we wszystkich komórkach epidermy. (D) Mikroiniekcja roztworu metylo-β-cyklodekstryny (MβCD), rozszerzenie aktywności reportera we wszystkich komórkach epidermy. Wszystkie obrazy zostały zarejestrowane przy użyciu konfokalnego mikroskopu Leica SP2 z obiektywem 20X. Strzałki wskazują miejsce rany. Linie przerywane na panelach z danymi wyznaczają obrysy embrionów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Rysunek 3. Detekcja transkryptów RNA genów odpowiedzi na zranienie. Obrazy fluorescencyjne hybrydyzacji in situ i detekcji RNA w zranionych embrionach wild type. Transkrypty RNA Ddc (A) oraz ple (B) gromadzą się wokół miejsca zranienia. Wszystkie obrazy zostały wykonane przy użyciu konfokalnego mikroskopu Leica SP2 z obiektywem 20X. Strzałki wskazują miejsce zranienia. Linie przerywane na panelach danych wyznaczają obrysy embrionów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Tabela 1. Podsumowanie reporterów odpowiedzi na ranienie naskórka. Wstawki czterech reporterów odpowiedzi na ranienie (Ddc, ple, msn, kkv) są dostępne zarówno na drugim, jak i trzecim chromosomie. Wszystkie reportery odpowiedzi na ranienie aktywują gen fluorescencyjny (GFP lub DsRed) w ograniczonej liczbie komórek naskórka otaczających miejsce urazu punkcyjnego w tle wild type (np. fenotyp „lokalny”). Reportery odpowiedzi na ranienie Ddc i msn wymagają Grh do aktywacji genu fluorescencyjnego po urazie punkcyjnym (np. fenotyp „brak”). Wszystkie reportery ranienia wymagają Flo-2 do lokalizacji genu fluorescencyjnego po urazie punkcyjnym (np. fenotyp „globalny”). Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy obraz.