Ten artykuł przedstawia protokół dla kontekstowego i podpowiedzianego testu warunkowania strachu przy użyciu systemu analizy wideo do oceny uczenia się strachu i pamięci u myszy.
Artykuł metodologiczny
Ten artykuł przedstawia protokół dla kontekstowego i podpowiedzianego testu warunkowania strachu przy użyciu systemu analizy wideo do oceny uczenia się strachu i pamięci u myszy.
Test warunkowania strachu kontekstowego i podpowiedzianego jest jednym z testów behawioralnych, które oceniają zdolność myszy do uczenia się i zapamiętywania związku między sygnałami środowiskowymi a doświadczeniami awersyjnymi. W tym teście myszy umieszcza się w komorze kondycjonującej i podaje się im porcje bodźca warunkowego (sygnał słuchowy) i awersyjnego bodźca bezwarunkowego (elektryczny wstrząs stopą). Po pewnym czasie opóźnienia myszy są poddawane działaniu tej samej komory kondycjonującej i komory o innym kształcie z prezentacją sygnału słuchowego. Zachowanie podczas testu jest mierzone jako wskaźnik pamięci strachu. Aby automatycznie analizować zachowanie, opracowaliśmy system analizy wideo za pomocą aplikacji ImageFZ, która jest dostępna do bezpłatnego pobrania na stronie http://www.mouse-phenotype.org/. Tutaj, aby pokazać szczegóły naszego protokołu, demonstrujemy naszą procedurę dla kontekstowego i sygnalizowanego testu warunkowania strachu na myszach C57BL/6J przy użyciu systemu ImageFZ. Ponadto zweryfikowaliśmy działanie naszego protokołu i systemu analizy wideo, porównując czas zamrażania zmierzony przez system ImageFZ lub komputerowy system pomiarowy oparty na promieniach słonecznych z czasem ocenionym przez ludzkiego obserwatora. Jak pokazują nasze reprezentatywne wyniki, dane uzyskane przez ImageFZ były podobne do tych analizowanych przez ludzkiego obserwatora, co wskazuje, że analiza behawioralna przy użyciu systemu ImageFZ jest wysoce wiarygodna. Niniejszy artykuł filmowy zawiera szczegółowe informacje dotyczące procedur testowych i pomoże w zrozumieniu sytuacji eksperymentalnej.
Kontekstowy i sygnalizowany test warunkowania strachu jest paradygmatem behawioralnym używanym do oceny asocjacyjnego uczenia się strachu i pamięci u gryzoni1-3. Test ten jest szeroko stosowany do zrozumienia neurobiologicznych mechanizmów uczenia się strachu i pamięci u myszy transgenicznych i nokautujących1,4-16. Zachowanie zamrożenia, które definiuje się jako całkowity bezruch z wyjątkiem oddychania, jest powszechną reakcją na sytuacje lękowe. W tym paradygmacie behawioralnym, po tym, jak zwierzęta są wystawione na połączenie sygnału słuchowego z elektrycznym wstrząsem stopy, reagują na bodziec wywołujący strach, wykazując zachowanie zamrożenia, które jest mierzone jako wskaźnik asocjacyjnego uczenia się strachu i pamięci. Ten test wymaga mniej wyszukanego sprzętu, mniejszego wysiłku fizycznego badacza i znacznie mniej czasu na trening myszy niż inne zadania związane z uczeniem się i pamięcią; Zwykle wymaga około 5-10 minut dziennie na mysz przez 2 dni. Chociaż procedura testowa jest prosta i zajmuje niewiele czasu, badacz musi uważnie obserwować i mierzyć zachowanie myszy; W związku z tym opracowano kilka zautomatyzowanych systemów pomiarowych do przeprowadzania analizy behawioralnej17-20. Nasz system analizy wideo, który opracowaliśmy za pomocą oprogramowania ImageFZ, pozwala nam łatwo analizować zamarzanie i uzyskiwać wysoce wiarygodne wyniki. Ten artykuł zawiera szczegółowe informacje na temat naszej procedury testowania i opisuje, jak korzystać z oprogramowania ImageFZ.
Wszystkie eksperymenty powinny być przeprowadzane zgodnie z wytycznymi i protokołami ustalonymi przez lokalne Komitety ds. Opieki nad Zwierzętami i Użytkowania.
1. Ustawienie aparatury
2. Przygotowanie zwierząt
3. Kondycjonowanie
4. Test kontekstowy
5. Test Cued
6. Analiza obrazu
7. Rozwiązywanie problemów
W teście warunkowania lękowego eksperymentatorzy-ludzie ilościowo określali zachowanie zamarcia (freezing) poprzez pracochłonną bezpośrednią obserwację26-29, jednak ostatnio do automatycznego pomiaru zachowania zamarcia stosuje się pomiary komputerowe oparte na fotokomórkach (np. system „Freeze Monitor”) oraz systemy analizy obrazu26,30-32. ImageFZ to zautomatyzowany system analizy obrazu, który generuje wyniki porównywalne z tymi uzyskanymi poprzez obserwację ludzką, jak opisano poniżej. W niniejszym badaniu porównano wyniki obserwacji ludzkiej z wynikami analizy ImageFZ przy różnych parametrach: „Rate (frame/sec)” oraz „Freezing criterion (pixels)”. W eksperymencie wykorzystano pięć samców myszy C57BL/6J (średnia masa ciała ± SD (g), 31,4±3,55; średni rozmiar ciała ± SD (pixels), 351,6±62,2) w wieku od 15 do 27 tygodni. Obserwacja ludzka była prowadzona przy użyciu programu do rejestracji zdarzeń (oprogramowanie dla systemu Macintosh OS9); zdarzenie polegające na naciśnięciu klawisza, trwające 2 s lub dłużej w czasie, gdy mysz wykazywała brak ruchu, uznawano za „zamarcia”. Procent zamarcia obliczano co 60 s w każdym teście i wykorzystywano do analiz korelacyjnych. Procent zamarcia oceniony przez 2 obserwatorów (wiarygodność międzyobserwatorska: dla warunkowania r=0,879; dla testu kontekstowego r=0,957; dla testu z sygnałem r=0,866; dla wszystkich przypadków r=0,888) uśredniano w celu uzyskania wyniku ludzkiego. Zbadano korelacje między procentami zamarcia zmierzonymi za pomocą ImageFZ przy każdej częstotliwości klatek (tj. 1, 2 i 4 fps) a wynikami uzyskanymi poprzez obserwacje ludzkie. Jak pokazano na Rysunku 4, procenty zamarcia obliczone przez ImageFZ (1, 2 i 4 fps) były silnie skorelowane ze średnią wartością uzyskaną z pomiarów 2 obserwatorów. Co istotne, przechwytywanie obrazów przy wyższej częstotliwości klatek nie zawsze daje najlepszą korelację. Analiza obrazu przy 1 fps generowała wyniki zbliżone do tych uzyskanych od obserwatorów ludzkich w każdym teście. Zbadano korelacje między procentami zamarcia zmierzonymi poprzez obserwacje ludzkie a wynikami z ImageFZ przy każdym ustawieniu parametru „Freezing criterion (pixels)” (tj. 20, 30 i 40 pixels). Procenty zamarcia obliczone za pomocą ImageFZ przy „Freezing criterion (pixels)” wynoszących 20, 30 i 40 pixels były we wszystkich przypadkach silnie skorelowane z wynikami uzyskanymi poprzez obserwacje ludzkie (Rysunek 5). Jak pokazano na Rysunku 5D, gdy kryterium zamarcia jest ustawione na niską wartość, subtelny ruch myszy, uznany za „zamarcia” przez obserwatorów ludzkich, zostanie uznany za „brak zamarcia” przez ImageFZ. I odwrotnie, jeśli kryterium zostanie ustawione na wysoką wartość, ruch myszy, oceniony jako „brak zamarcia” przez obserwatorów ludzkich, zostanie uznany za „zamarcia” przez ImageFZ (Rysunki 5C, 5F oraz 5I). Zatem w celu uzyskania najwiarygodniejszych wyników każdy parametr programu ImageFZ powinien zostać skalibrowany przy użyciu danych uzyskanych poprzez obserwacje ludzkie w każdym środowisku testowym.
Dodatkowo porównaliśmy wyniki uzyskane przez obserwatora ludzkiego, przy użyciu komputerowego systemu pomiarowego opartego na wiązkach światła (system Freeze Monitor), z wynikami uzyskanymi za pomocą ImageFZ (patrz Rycina 6). Obserwator nie wiedział, do której grupy zabiegowej przypisane są zwierzęta, ani nie znał wyników oceny ImageFZ. W odniesieniu do ustawień parametrów systemu Freeze Monitor zastosowaliśmy trzy miary procentowego zamarcia z wcześniej zwalidowanego systemu30. W skrócie, mierzono liczbę 10-sekundowych interwałów, w których zwierzęta potrzebowały więcej niż 1 lub 2 s na przekroczenie pierwszej nowej wiązki w interwale (odpowiednio 1sec 10sec i 2sec 10sec) oraz latencję między początkiem każdego 5-sekundowego interwału a przerwaniem trzeciej nowej wiązki w tym interwale (Latency3). Obliczono procent interwałów, podczas których mysz wykazywała zamarcie, lub procent całkowitego czasu wymaganego do przerwania trzeciej wiązki światła.
Procenty zamarcia mierzone w każdym systemie przedstawiono na Rysunku 6. Grupy porównano za pomocą dwuczynnikowej analizy wariancji (ANOVA) z powtarzanymi pomiarami, a następnie przeprowadzono testy t (patrz Tabela 1). Procenty zamarcia zmierzone za pomocą ImageFZ (Rysunek 6B) były bardziej zbliżone do tych ocenianych poprzez obserwację ludzką (Rysunek 6A) niż dane uzyskane przy użyciu systemu opartego na wiązkach fotokomórek (Rysunki 6C-E). Procenty zamarcia mierzone programem ImageFZ w każdym teście były silnie skorelowane z tymi ocenianymi poprzez obserwację ludzką (warunkowanie, r=0,947; test kontekstowy, r=0,970; test sygnałowy, r=0,934), podczas gdy korelacje między procentami zamarcia mierzonymi za pomocą komputerowego systemu pomiarowego opartego na wiązkach fotokomórek (1sec 10sec, 2sec 10sec lub Latency3) a obserwatorem ludzkim były niższe (warunkowanie, r=0,503, 0,593 i 0,761; test kontekstowy, r=0,772, 0,819 i 0,912) w porównaniu do korelacji między procentami zamarcia mierzonymi za pomocą ImageFZ a obserwacją ludzką (Rysunki 7A i 7B). Dodatkowo Rysunek 7 wykazuje, że różnice między procentami zamarcia uzyskanymi poprzez obserwację ludzką a za pomocą ImageFZ dla każdej myszy były najmniejszymi różnicami. Wyniki te wskazują, że procenty zamarcia mierzone za pomocą ImageFZ były zbliżone do tych uzyskanych poprzez obserwację ludzką oraz że ImageFZ charakteryzuje się wysoką dokładnością w pomiarze poziomu zamarcia.

Rysunek 1. Aparatura do testu warunkowania lękowego kontekstowego i sygnałowego. (A) Akrylowa kwadratowa komora do warunkowania i testu kontekstowego, (B) metalowe kratki na białej plastikowej podłodze dla myszy czarnych, agouti lub rozjaśnionych brązowych (góra) oraz przewodzące prąd czarne metalowe kratki na czarnej plastikowej podłodze dla myszy białych (dół); powiększone obrazy kratek znajdują się w prawym panelu, (C) generator białego szumu/tonu oraz generator wstrząsów, (D) dźwiękoszczelny pokój oraz (E) akrylowa trójkątna komora z płaską podłogą do testu sygnałowego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Rysunek 2. Schematyczne przedstawienie protokołu. (A) Przegląd testu warunkowania lękowego kontekstowego i sygnałowego, (B) warunkowanie, (C) test kontekstowy oraz (D) test sygnałowy. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Rysunek 3. Analiza obrazu za pomocą programu ImageFZ. Dla każdej pary następujących po sobie obrazów program ImageFZ oblicza wielkość obszaru (pikseli), przez który poruszała się mysz. Gdy obszar ten znajduje się poniżej określonego progu (np. 30 pikseli), zachowanie jest oceniane jako „zamieranie” (freezing). Gdy wielkość obszaru jest równa lub przekracza próg, zachowanie jest uznawane za „brak zamierania” (non-freezing). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Rysunek 4. Porównanie procentowej ilości zamarcia obliczonej z obrazów o różnych częstotliwościach klatek przy użyciu ImageFZ z wartościami zmierzonymi poprzez obserwację ludzką. Testy warunkowania lękowego przeprowadzono na samcach myszy C57BL/6J (n=5). Podczas testów dwóch obserwatorów oceniało zachowanie zamarcia. Jednocześnie rejestrowano obrazy na żywo z częstotliwością 4 fps przy użyciu programu ImageFZ. Pliki zarejestrowane przy 4 fps zostały pomniejszone po ekstrakcji klatek, aby odpowiadały obrazom zarejestrowanym przy 1 fps lub 2 fps. Wartości parametru „Rate (frame/sec)” ustawiono na 1, 2 lub 4 fps, a procentowe wartości zamarcia w każdym 60-sekundowym przedziale obliczono z plików obrazów za pomocą analizy offline w programie ImageFZ. Każda kropka reprezentuje procent zamarcia dla każdego 60-sekundowego przedziału. Obliczono współczynniki korelacji Pearsona między danymi uzyskanymi z obserwacji ludzkiej a analizą ImageFZ. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy obraz.

Rysunek 5. Porównanie procentowych wartości zamarcia obliczonych z obrazów dla różnych wartości kryterium zamarcia przy użyciu ImageFZ oraz wartości zmierzonych podczas obserwacji ludzkiej. Testy warunkowania lękowego przeprowadzono z użyciem samców myszy C57BL/6J (n=5). Podczas testów dwóch obserwatorów rejestrowało zachowania zamarcia, a obrazy na żywo były przechwytywane za pomocą programu ImageFZ. Procent zamarcia w każdym 60-sekundowym przedziale czasowym obliczono z obrazów (1 klatka/s) poprzez analizę offline w programie ImageFZ, ustawiając wartości parametru „Freezing criterion (pixels)” na 20, 30 lub 40 pikseli. Każda kropka reprezentuje procent zamarcia dla każdego 60-sekundowego przedziału. Dla każdego testu obliczono współczynniki korelacji Pearsona pomiędzy danymi uzyskanymi z obserwacji ludzkiej a analizą ImageFZ. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Rycina 6. Procenty zamierania mierzono przy użyciu systemów zautomatyzowanych oraz obserwacji ludzkiej w grupach niewarunkowanych i warunkowanych samców myszy C57BL/6J (n=5 w każdej grupie). (A) obserwacja ludzka, (B) ImageFZ, (C) system Freeze Monitor 1 (1sec 10sec), (D) system Freeze Monitor 2 (2sec 10sec) oraz (E) system Freeze Monitor 3 (Latency3). Porównania grup przeprowadzono za pomocą dwuczynnikowej analizy wariancji z powtarzanymi pomiarami (two-way repeated measures ANOVA), a następnie testów t (grupa niewarunkowana vs. grupa warunkowana, *, P<0.05; †, p<0.01). Dane uzyskane za pomocą ImageFZ były zbliżone do danych ocenianych poprzez obserwację ludzką. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy obraz.

Rycina 7. Korelacja i rozkład częstości różnic między procentami zamierania zmierzonymi za pomocą systemów zautomatyzowanych oraz obserwacji ludzkiej. (A-B) Przedstawiono wykresy rozrzutu oraz współczynniki korelacji Pearsona pomiędzy procentami zamierania ocenianymi przez systemy zautomatyzowane a obserwacje ludzkie. Procenty zamierania obliczone przy użyciu ImageFZ były silnie skorelowane z tymi uzyskanymi w drodze obserwacji ludzkiej. (C-F) Występowanie różnic mniejszych niż 10% między procentami zamierania uzyskanymi z systemów zautomatyzowanych a obserwacjami ludzkimi było najwyższe w przypadku porównania danych analizowanych za pomocą ImageFZ z danymi analizowanymi przez obserwatora. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.
| Analizy ANOVA | |||
| Warunek | Czas | Warunek x Czas | |
| Dzień 1 (kondycjonowanie) | |||
| Człowiek | F(1,8)=28,53, p=0,0007 | F(7,56)=20,79, p<0.0001 | F(7,56)=16,58, p<0.0001 |
| ImageFZ | F(1,8)=13,97, p=0,0057 | F(7,56)=21,40, p<0.0001 | F(7,56)=11,69, p<0.0001 |
| Monitor zamrażania (1 s 10 s) | F(1,8)=5,16, p=0,0528 | F(7,56)=2,39, p=0,0329 | F(7,56)=0,72, p=0,6572 |
| Monitor zamrażania (2 sek 10 sek) | F(1,8)=4,07, p=0,0782 | F(7,56)=3,44, p=0,0039 | F(7,56)=1,52, p=0,1803 |
| Monitor zamrażania (Latency3) | F(1,8)=4,44, p=0,0682 | F(7,56)=9,94, p<0.0001 | F(7,56)=4,33, p=0,0007 |
| Dzień 2 (kontekst) | |||
| Człowiek | F(1,8)=42,94, p=0,0002 | F(4,32)=1,91, p=0,1336 | F(4,32)=1,48, p=0,2302 |
| ImageFZ | F(1,8)=49,61, p=0,0001 | F(4,32)=2,06, p=0,1087 | F(4,32)=0,83, p=0,5174 |
| Monitor zamrażania (1 s–10 s) | F(1,8)=20,28, p=0,002 | F(4,32)=1,63, p=0,1918 | F(4,32)=0,55, p=0,6997 |
| Monitor zamrażania (2 s – 10 s) | F(1,8)=40,20, p=0,0002 | F(4,32)=2,66, p=0,0504 | F(4,32)=1,20, p=0,3306 |
| Monitor zamrażania (Latency3) | F(1,8)=35,30, p=0,0003 | F(4,32)=2,49, p=0,0626 | F(4,32)=1,09, p=0,3793 |
Tabela 1. Porównania statystyczne.
Kontekstowy i sygnalizowany test warunkowania strachu jest jednym z najczęściej stosowanych paradygmatów do oceny uczenia się i pamięci. Ten test jest formą warunkowania Pawłowa, w którym dokonuje się skojarzenia między kontekstem i/lub bodźcem warunkowym (wskazówka słuchowa) a bodźcem awersyjnym (elektryczny wstrząs stopą). Po nawet pojedynczym sparowaniu sygnału kontekstowego/słuchowego i wstrząsu stopą, myszy wykazują długotrwałe zamrożenie w obliczu kontekstu lub wskazówki. W tym teście zachowanie zamrożenia jest używane jako wskaźnik pamięci strachu. Badania farmakologiczne i badania nad zmianami chorobowymi wykazały, że tworzenie, konsolidacja i odzyskiwanie pamięci są regulowane przez kilka regionów mózgu, takich jak ciało migdałowate, hipokamp i kora przedczołowa3,33-35. Ponadto badania genetyki molekularnej wykazały rolę określonych genów i cząsteczek zaangażowanych w uczenie się i pamięć w tych regionach mózgu przy użyciu genetycznie zmodyfikowanych myszy36. Dlatego ten test jest prosty i przydatny do badania neurobiologicznych podstaw uczenia się i pamięci strachu. W tym artykule filmowym przedstawiliśmy nasz protokół, aby zapewnić eksperymentatorom szczegółowe informacje umożliwiające zrozumienie i łatwe wykonanie testu.
Zachowanie związane z zamrożeniem określono ilościowo poprzez bezpośrednią obserwację przez eksperymentatorów na ludziach. Oczekuje się, że dobrze wyszkolony eksperymentator uzyska wiarygodne, stabilne wyniki we wszystkich obserwacjach. Jednak metoda ta wiąże się z potencjalnymi problemami, takimi jak różnice w metodzie obserwacyjnej, stronniczość obserwatora i proste błędy w kwantyfikacji, co utrudnia bezpośrednie porównanie wyników od niezależnych eksperymentatorów i różnych laboratoriów. Zastosowano również zautomatyzowany komputerowy system pomiarowy oparty na promieniach słonecznych26,30-32. Jednak system ten stwarza również potencjalne problemy w pomiarze zachowań związanych z zamarzaniem. Ze względu na rozmieszczenie czujników, system ten może nie być w stanie wykryć niewielkich ruchów głowy, które zwykle byłyby oceniane jako "aktywne" przez obserwację człowieka. Ponadto drżenie podczas zamrażania można uznać za niezamarzające, ponieważ gdy zwierzę zamarza, w wyniku drżenia obserwuje się przerywane przerwy w wiązce światła. Jako alternatywną metodę opracowano zautomatyzowane systemy analizy obrazów i wideo17-20,37,38. Anagnostaras i wsp.37 opisało kilka systemów z programami do analizy obrazu, które mają dobrą trafność i dobrze zamrażają wyniki17,20,37-38. Jednak większość tych systemów i programów analitycznych musi być pozyskiwana od dostawców komercyjnych i jest zazwyczaj kosztowna. Opracowaliśmy oprogramowanie ImageFZ do analizy zachowań związanych z zamarzaniem, a program ten jest rozpowszechniany jako darmowy program. ImageFZ wykrywa mysz jako ciało pikseli (cząsteczkę) i rozróżnia subtelne ruchy myszy jako "zamrożenie" lub "niezamrożenie" w zależności od ilości obszaru nienakładających się obszarów między cząstkami każdej pary kolejnych obrazów. Jak pokazują reprezentatywne wyniki, pomiary za pomocą programu ImageFZ są zgodne lub dokładniejsze niż uzyskane przy użyciu innych metod. W ten sposób program ImageFZ automatycznie mierzy zachowanie, które ludzcy obserwatorzy oceniają jako zamrożenie, przy użyciu zdefiniowanych kryteriów. Ponadto program ImageFZ oblicza przebytą odległość (cm) przed, w trakcie i po ekspozycji na wstrząsy stóp, ułatwiając ocenę wrażliwości na wstrząsy i analizę zachowania podczas zamarzania.
Między laboratoriami istnieją różnice metodologiczne. Różnice te mogą powodować trudności w porównywaniu danych między laboratoriami i powielaniu wyników w różnych laboratoriach. Aby uzyskać bardziej stabilne i porównywalne dane, konieczna jest standaryzacja protokołu testowego w jak największym stopniu. System analizy z ImageFZ prowadzi do automatyzacji procedur testowych, co może przyczynić się do standaryzacji protokołów stosowanych w laboratoriach.
Podczas analizy zachowań związanych z zamrożeniem należy wziąć pod uwagę kilka reakcji behawioralnych. Po pierwsze, gdy zwierzęta znajdują się w przerażającej sytuacji, mogą uciec zamiast zamarznąć39. Ucieczka jest jedną z reakcji strachu, a jej wystąpienie doprowadzi do niedoszacowania pamięci strachu. Po drugie, zamrażanie może zależeć od ogólnego poziomu aktywności, a poziom aktywności u myszy eksperymentalnych i kontrolnych musi zostać zbadany. Na przykład, chociaż myszy pozbawione receptora muskarynowego acetylocholiny M1 wykazywały obniżony poziom zamrażania w porównaniu z myszami typu dzikiego, różne testy behawioralne wykazały, że wyniki można przypisać ich fenotypowi nadpobudliwości, a nie upośledzeniupamięci. ImageFZ oblicza odległość (cm) przebytą przez obiekty. Dane są dostępne w celu zbadania, czy istnieją różnice w ogólnych poziomach aktywności między uczestnikami. Jeśli istnieje różnica w przebytym dystansie w grupie, jednym z możliwych podejść do problemu jest rozważenie dystansu przebytego w ciągu pierwszych 2 minut treningu jako aktywności wyjściowej i zastosowanie współczynnika tłumienia (współczynnik tłumienia = (aktywność podczas testowania)/(aktywność podczas linii bazowej + aktywność podczas testowania)) jako drugorzędny wskaźnik strachu17,40. Wreszcie, różnica we wrażliwości na ból, wywołująca zmiany w reaktywności na elektryczny wstrząs stopy, jeśli występuje, może skutkować zmianami w zachowaniu podczas zamarzania. ImageFZ oblicza również szczegółowo przebytą odległość (cm) od 2 sekund przed ekspozycją na wstrząs stopy o długości 2 sekund do 2 sekund po jego ekspozycji (przez 6 sekund), co można wykorzystać jako wskaźnik wrażliwości na wstrząsy.
Systemy analizy wideo zostały opracowane w celu pomiaru zamarzania myszy albinosów, czarnych, agouti i rozcieńczonych brązowych. ImageFZ wykorzystuje czarną tacę podłogową i czarne siatki do badania białych myszy (patrz rysunek 1B). Czarne siatki są wykonane ze specjalnie przetworzonych metali pokrytych czarną farbą i mają przewodność elektryczną podobną do niepowlekanych siatek metalowych, które są zwykle używane do czarnych myszy. ImageFZ analizuje również zachowanie zamarzania u szczurów i innych gryzoni poprzez dostosowanie parametrów programu. W obecnej wersji ImageFZ zachowanie obiektu jest rejestrowane za pomocą kamery wideo umieszczonej na górnej ścianie w celu analizy zamrożenia. ImageFZ może być również używany w konfiguracji, w której obrazy są rejestrowane z boku komory. Ponadto ImageFZ steruje maksymalnie 4 aparatami. Ta funkcja pozwala badaczowi na jednoczesne badanie 4 myszy, oszczędzając czas i zmniejszając potencjalne wpływy wynikające z różnic w czasie wykonania każdego obiektu i kolejności testowania zachowania. W ten sposób ImageFZ upraszcza procedurę testowania i analizy zachowań związanych z zamrażaniem, a program ten ułatwia testowanie przy mniejszym nakładzie pracy i bez żadnego szkolenia w zakresie eksperymentów behawioralnych.
W laboratorium Miyakawa oceniliśmy ponad 110 szczepów genetycznie modyfikowanych myszy i myszy kontrolnych typu dzikiego w kontekście, w teście warunkowania strachu kontekstowego i sygnalizacyjnego, wykorzystując system analizy wideo w celu wyjaśnienia wpływu danego genu na uczenie się i pamięć41-42. Uzyskaliśmy duży zestaw surowych danych dla ponad 5000 myszy. Surowe dane, które zostały wykorzystane w opublikowanych artykułach naukowych4-16 , są zawarte w "Bazie danych fenotypów myszy" jako publiczna baza danych (URL: http://www.mouse-phenotype.org/). Niniejszy artykuł filmowy zawiera szczegółowe informacje dotyczące szczegółów naszej procedury eksperymentalnej i pomaga w zrozumieniu sytuacji testowej.
Potwierdzamy, że nie ma żadnych znanych konfliktów interesów związanych z tą publikacją i nie było znaczącego wsparcia finansowego dla tej pracy, które mogłoby wpłynąć na jej wynik.
Niektóre z pokazanych tutaj danych zostały uzyskane w laboratorium dr Jacqueline N. Crawley w Narodowym Instytucie Zdrowia Psychicznego Stanów Zjednoczonych i chcielibyśmy jej podziękować za umożliwienie nam pokazania danych w artykule. Dziękujemy również Kazuo Nakanishi za pomoc w opracowaniu programu ImageFZ do analizy behawioralnej. Badania te były wspierane przez Grant-in-Aid for Scientific Research (B) (21300121), Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Comprehensive Brain Science Network) z Ministerstwa Edukacji, Nauki, Sportu i Kultury Japonii, grant z Neuroinformatics Japan Center (NIJC) oraz granty z CREST Japońskiej Agencji Nauki i Technologii (JST).
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Program ImageFZ | Opracowany przez Tsuyoshi Miyakawa | Ten program jest dostępny za pośrednictwem O'Hara & Co., Tokio, Japonia i do bezpłatnego pobrania pod adresem http://www.mouse-phenotype.org/. To oprogramowanie działa w 32-bitowym systemie Windows XP/Vista/7. | |
| Komora kondycjonowania | O' Hara & Co., Japonia | CL-3002L | Do myszy. |
| Komora testowa | O' Hara & Co., Japonia | CLT-3002L | Do myszy. |
| Interfejs | O' Hara & Co., Japonia | CL-1040 | Interfejs zawiera generator białego szumu/tonów, który może być sterowany przez program ImageFZ. |
| Mieszany generator wstrząsów | O' Hara & Co., Japonia | SGA-2040 | Generator wstrząsów może być sterowany przez program ImageFZ. |
| Tester siatki wstrząsowej (amperomierz) | O' Hara & Co., Japonia | SG-T | |
| Urządzenie do przechwytywania wideo USB | XLR8 | USB2IVOSX | |
| Poczwórny rozdzielacz obrazu | Bezprzewodowy Tsukamoto Co., Ltd., Japonia | 400AS | |
| Dźwiękoszczelny pokój | O' Hara & Co., Japonia | CL-4210 | |
| Monitor zamarzania | San Diego Instruments, Inc., CA, USA | Matryca fotoskopowa 16 x 16 ( rozstaw 2,5 cm) |
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie