Tutaj ilustrujemy protokół obrazowania za pomocą dwukolorowej nanoskopii STED, cytotoksycznej synapsy immunologicznej komórek NK rekapitulowanej na szkle. Za pomocą tej metody uzyskujemy rozdzielczość sub-100 nm białek synapsy i cytoszkieletu.
Artykuł metodologiczny
Tutaj ilustrujemy protokół obrazowania za pomocą dwukolorowej nanoskopii STED, cytotoksycznej synapsy immunologicznej komórek NK rekapitulowanej na szkle. Za pomocą tej metody uzyskujemy rozdzielczość sub-100 nm białek synapsy i cytoszkieletu.
Komórki NK tworzą ściśle regulowane, precyzyjnie dostrojone synapsy immunologiczne (IS) w celu lizy komórek zakażonych wirusowo lub rakotwórczych. Dynamiczna reorganizacja aktyny ma kluczowe znaczenie dla funkcjonowania komórek NK i tworzenia IS. Obrazowanie F-aktyny w synapsie tradycyjnie wykorzystuje mikroskopię konfokalną, jednak granica dyfrakcji światła ogranicza rozdzielczość mikroskopii fluorescencyjnej, w tym konfokalnej, do około 200 nm. Ostatnie postępy w technologii obrazowania umożliwiły rozwój obrazowania superrozdzielczego z ograniczoną subdyfrakcją. Aby zobrazować architekturę F-aktyny w IS, podsumowujemy cytotoksyczną synapsę komórek NK poprzez przyleganie komórek NK do aktywującego receptora na szkle. Następnie obrazujemy interesujące nas białka za pomocą dwukolorowej mikroskopii zubożenia emisji stymulowanej (STED). Daje to rozdzielczość <80 nm w synapsie. W niniejszym artykule opisujemy etapy przygotowania próbki i akwizycji obrazów za pomocą dwukolorowej nanoskopii STED w celu wizualizacji F-aktyny w NK IS. Ilustrujemy również optymalizację pozyskiwania próbek za pomocą oprogramowania Leica SP8 i bramkowanego czasowo STED. Na koniec wykorzystujemy oprogramowanie Huygens do dekonwolucji obrazów w post-processingu.
Synapsa immunologiczna to złożone środowisko białek sygnałowych i elementów cytoszkieletu. Synapsa cytolityczna została pierwotnie opisana jako mająca strukturę podobną do "strzału w dziesiątkę" z pierścieniem aktyny i cząsteczkami adhezyjnymi otaczającymi centralną domenę wydzielniczą1-4. Jednak teraz wiemy, że składa się z mikroskopijnych domen aktywnej sygnalizacji, które wymagają ciągłej dynamicznej reorganizacji cytoszkieletu dla funkcji5-11. Wiele informacji, które obecnie posiadamy na temat synaps, pochodzi z mikroskopii, a immunolodzy jako pierwsi przyjęli najnowocześniejszą technologię obrazowania.
Jedną z takich nowatorskich technologii jest mikroskopia superrozdzielcza. Konwencjonalna mikroskopia świetlna jest ograniczona przestrzennie przez barierę dyfrakcyjną światła, która wyznacza dolną granicę rozdzielczości dla całej mikroskopii fluorescencyjnej, w tym konfokalnej, na około 200 nm. W ostatnich latach opracowano kilka technik, które pozwalają na rozdzielczość poniżej bariery dyfrakcyjnej. Należą do nich mikroskopia zubożenia emisji stymulacji (STED), mikroskopia oświetlenia strukturalnego (SIM), mikroskopia stochastycznie rozdzielcza (STORM) i mikroskopia światła fotoaktywowanego (PALM). Techniki te zostały szczegółowo omówione w innym miejscu12-15, ale są opisane poniżej. Ograniczona rozdzielczość subdyfrakcji jest generowana w unikalny sposób w każdym systemie. Wybór techniki super-rozdzielczości powinien być zatem podyktowany eksperymentem i systemem eksperymentalnym, który nas interesuje.
STED super rozdzielczość osiąga się za pomocą wiązki zubożenia torroidalnego o wysokiej intensywności, która selektywnie "wycisza" fluorescencję wokół każdego interesującego nas fluoroforu po wzbudzeniu, co skutkuje mikroskopią fluorescencji ograniczoną do subdyfrakcji16-18. Jedną z zalet STED jest to, że akwizycja obrazu jest szybka i wymaga stosunkowo niewielkiej obróbki końcowej. Podczas gdy wybór barwnika jest podyktowany położeniem widmowym wiązki zubożającej, która w dostępnym na rynku systemie znajduje się na długości fali 592 nm, dostępnych na rynku jest kilka dostępnych na rynku barwników, które umożliwiają kombinację dwóch fluoroforów. Ponadto można obrazować powszechnie stosowane reportery fluorescencyjne, takie jak GFP, co umożliwia eksperymenty z żywymi komórkami19,20.
Wcześniej używaliśmy STED do identyfikacji i ilościowego określania regionów hipogęstości F-aktyny, które są wykorzystywane przez komórki NK do degranulacji21,22. Sugerujemy, że STED jest dobrym wyborem do obrazowania synapsy immunologicznej ze względu na stosunkowo elastyczną dostępność fluoroforów i lepszą poprawę rozdzielczości w osi x-y. Ponadto, w dostępnym na rynku systemie STED wykorzystywanym w tych eksperymentach, zastosowanie szybkiego (12 000 Hz) skanera rezonansowego pozwala na szybkie pozyskiwanie obrazów przy minimalnym uszkodzeniu próbek. Ograniczona elastyczność w doborze barwników jest uważana za wadę STED12, jednak dwukolorowy STED jest stosunkowo prosty z kilkoma dostępnymi na rynku fluoroforami. Integracja STED z laserowym skaningowym mikroskopem konfokalnym pozwala również na dodatkowe obrazowanie konfokalne w połączeniu z STED, więc podczas gdy STED jest ograniczony do dwóch kanałów, dodatkowe struktury mogą być obrazowane w konfokalnym z rozdzielczością około 200 nm (E. Mace, obserwacje niepublikowane). Chociaż opisujemy zastosowanie STED do obrazowania komórek odpornościowych, technologia ta jest stosowana do różnych typów komórek, w tym komórek nerwowych, oraz do wizualizacji różnych struktur komórkowych23-26.
SIM używa innego podejścia do generowania obrazów ograniczonych subdyfrakcją. Poprzez wizualizację znanych wzorców okresowego wzbudzenia, można następnie uzyskać informacje o nieznanej strukturze badanej po transformacji matematycznej27. Daje to wzrost rozdzielczości do ~100 nm w bok28,29. Zaletą karty SIM jest to, że jest kompatybilna ze wszystkimi standardowymi barwnikami i sondami konfokalnymi, jednak wadą jest to, że pozyskiwanie obrazów jest znacznie wolniejsze, a te wymagają długiego przetwarzania końcowego12. Ogranicza to również jego zastosowanie do obrazowania żywych komórek.
Na koniec, obrazy o super rozdzielczości mogą być generowane przez stochastyczne przełączanie foto-fluoroforów. Podejście to jest wykorzystywane w mikroskopii lokalizacyjnej aktywowanej światłem (PALM) i stochastycznej mikroskopii rekonstrukcji optycznej (STORM). Skanując wiele klatek kamery i lokalizując losowo aktywowane cząsteczki, które są "włączane" i "wyłączane" w czasie, obrazy o rozdzielczości 20-30 nm są generowane ze skumulowanych klatek30-32 . Wadą tej rozdzielczości jest czas potrzebny na pozyskanie obrazów.
Tutaj pokazujemy szczegółowo protokół przygotowania i obrazowania próbek dwukolorowych w STED. W tym systemie wzbudzenie odbywa się za pomocą impulsowego, przestrajalnego lasera ze światłem białym. Ze względu na charakter impulsowej wiązki wzbudzenia, możliwe jest bramkowanie czasowe detekcji, co dodatkowo zwiększa rozdzielczość. Ponadto system jest wyposażony w hybrydowe detektory gadolinu (HyD), które są bardziej czułe niż konwencjonalne lampy fotopowielaczy, co pozwala na mniejsze zapotrzebowanie na moc lasera. Wiązka zubożająca dla STED jest stosowana w sposób ciągły i jest dostrojona do 592 nm, co będzie dyktować wybór barwników dostępnych dla dwóch kolorów STED. Powszechnie stosowane kombinacje barwników obejmują zazwyczaj jedną pobudliwą o długości 488 nm (taką jak Alexa Fluor 488, Oregon Green, DyLights green lub Chromeo 488) i jedną pobudliwą o długości 458 nm (taką jak Pacific Orange lub Horizon V500). Tak więc, podczas gdy wykrywanie dwóch barwników będzie w podobnym zakresie (i oba są dostępne za pomocą lasera zubożającego), wzbudzenie będzie następować przy różnych długościach fal. Dzięki przestrajalnemu laserowi światła białego i przestrajalnym detektorom maksymalizacja sygnału przy jednoczesnej eliminacji nakładania się widma jest dość łatwa. W związku z tym odnieśliśmy duży sukces dzięki kombinacjom dostępnych na rynku barwników, takich jak Pacific Orange i Alexa Fluor 488 (stosowany tutaj). Nasz protokół jest dostosowany i opisuje ocenę ludzkich komórek NK, ponieważ reprezentuje to historyczne skupienie naszego laboratorium. W tym przykładzie wykorzystujemy w szczególności linię komórkową NK92, ponieważ jest to jedna z tych, które regularnie stosowaliśmy w naszych pracach eksperymentalnych21,33.
1. Pokryj szkiełka nakrywkowe przeciwciałem
2. Aktywuj komórki NK na szkiełkach nakrywkowych; Naprawa i przepuszczalność
3. Plamy
4. Zamontuj szkiełka nakrywkowe na slajdach
5. Konfiguracja eksperymentalna
6. Optymalizacja ustawień
7. Akwizycja obrazu
8. Dekonwolucja
Oczywiście, głównym celem obrazowania w superrozdzielczości będzie poprawa w stosunku do konwencjonalnej mikroskopii konfokalnej. Istnieją jednak pewne typowe pułapki, które mogą prowadzić do nieoptymalnej rozdzielczości. Wymagają one, aby każdy eksperyment był optymalizowany indywidualnie. W naszym reprezentatywnym eksperymencie obrazujemy sieć F-aktyny w komórce NK aktywowanej przez przeciwciało związane ze szkłem. Najczęstsze przyczyny (i korekcje) braku lepszej rozdzielczości STED w porównaniu z konfokalnymi są następujące:
Poprzez osiągnięcie prawidłowej równowagi między czasem przebywania pikseli, mocą lasera wzbudzenia i mocą lasera zubożającego, można wygenerować obraz o zwiększonej rozdzielczości i wystarczającej ilości informacji (Rysunek 1c). Rozdzielczość można jeszcze bardziej poprawić, stosując dekonwolucję (rysunek 1d). Gdy akwizycja jest zoptymalizowana, dekonwolucja poprawi rozdzielczość zarówno jakościowo, jak i ilościowo, a rozdzielczość poniżej 100 nm powinna być rutynowo osiągalna.

Rysunek 1. Optymalizacja akwizycji i typowe pułapki obrazowania chorób przenoszonych drogą płciową. Komórki NK92 aktywowano na szkle powlekanym anty-CD18 i -NKp30 przez 20 minut, a następnie utrwalono, przeniknięto i wybarwiono na F-aktynę za pomocą Phalloidin Alexa Fluor 488. a) Przykład utraty informacji o obrazie z powodu niedostatecznego próbkowania. b) Przykład utraty rozdzielczości z powodu bielenia/nadpróbkowania c) warunki zoptymalizowane d) zoptymalizowane warunki prowadzą do większej poprawy rozdzielczości dzięki dekonwolucji. Podziałka = 5 μm.
Poprawa rozdzielczości w stosunku do konfokalnej będzie w pewnym stopniu zależna od czynników, których nie można kontrolować. Czynniki te obejmują drobne aberracje w grubości szkiełka nakrywkowego i niespójności w mediach montażowych. Ważne jest, aby temperatura i wilgotność w pomieszczeniu do obrazowania były jak najbardziej spójne, a wiązka STED powinna być ponownie ustawiana co około 60 minut. Jak wspomniano w procedurach, należy unikać stosowania medium montażowego VECTASHIELD, ponieważ nie jest ono kompatybilne z STED. Oprócz tego należy zawsze używać szkiełek nakrywkowych #1,5, a jeśli są dostępne, używać tych, które zostały sprawdzone do określonej grubości.
Jedną z modyfikacji opisanego tutaj podejścia jest obrazowanie dodatkowych kanałów w konfokalu, przy użyciu fluoroforów, które emitują na większej długości fali niż wiązka STEM. W ten sposób można obrazować do czterech kanałów (dwa w konfokalu, dwa w STED). Jeśli jednak przyjmiemy to podejście, kanały z fluoroforami emitującymi powyżej lasera zubożającego STED będą musiały zostać najpierw zobrazowane, ponieważ zastosowanie wiązki STED spowoduje wyczerpanie fotonów w tych kanałach. Jedną z zalet tej techniki jest zastosowanie bramkowania czasowego, które również poprawi rozdzielczość w konfokalnym poprzez wyeliminowanie emisji z fotonów o krótkim czasie życia34. W szczególności zastosowanie bramkowania czasowego, czyli taktowania detektorów emisji odpowiadającego wzbudzeniu impulsowemu STED, zmniejszy fluorescencję tła od odbicia od szkła nakrywkowego podczas obrazowania z bliska. Nawet w eksperymencie, który nie nadaje się do STED, jeśli używasz impulsowego źródła wzbudzenia, bramkowanie czasowe może być użytecznym narzędziem do poprawy rozdzielczości w konfokalu.
Istnieją różne modyfikacje, które można wykorzystać do poprawy rozdzielczości w STED. Jednym z nich jest zmniejszenie rozmiaru otworu w stosunku do standardowej jednostki 1 Airy, chociaż zmniejszy to również ilość światła docierającego do próbki. Można to skompensować poprzez zwiększenie mocy lub wzmocnienia lasera. Innym jest zwiększenie średniej liniowej, co zwiększy ilość informacji zbieranych dla każdego fotonu, poprawiając rozdzielczość. Również w tym przypadku może się to jednak odbyć kosztem fotowybielania próbki, dlatego konieczne będzie znalezienie równowagi między rozdzielczością a wybielaniem. Podobnie, stosowanie białek fluorescencyjnych, takich jak GFP, będzie wymagało starannej optymalizacji, aby uniknąć wybielania. W razie potrzeby można to osiągnąć poprzez zmniejszenie mocy lasera STED. Dłuższe punkty czasowe pozwolą również na większą regenerację fotonów i zmniejszenie bielenia. Korekta fotowybielania powinna być uwzględniona podczas analizy żywej choroby przenoszonej drogą płciową.
Oczywiście możliwe jest również obrazowanie w 3 wymiarach w STED, które również da poprawę w stosunku do konwencjonalnego obrazowania konfokalnego. Jest to szczególnie ważne, jeśli odbywa się to w połączeniu z dekonwolucją, chociaż należy zachować ostrożność, aby skorygować dryft, który występuje podczas obrazowania wielu płaszczyzn w osi z. W przypadku korzystania z oprogramowania Huygens do dekonwolucji, korekcję tę uzyskuje się za pomocą funkcji "stabilizacji obrazu". Dzięki takiemu podejściu poprawi się rozdzielczość w osi z. Jest to ogromna poprawa w porównaniu z konwencjonalnym obrazowaniem konfokalnym, które ma słabą rozdzielczość osiową, a nawet w porównaniu z samym STED, który również ma stosunkowo słabą rozdzielczość osi z. Podczas pozyskiwania wielu stosów w STED należy zachować ostrożność, aby uniknąć wybielania próbki, a w razie potrzeby można w tym celu zmniejszyć uśrednianie linii lub intensywność mocy lasera. Ponownie należy zauważyć, że w przypadku obrazowania innych fluoroforów, które nie są odpowiednie dla STED, zastosowanie wiązki zubożającej w pierwszym sekwencyjnym skanie zapobiegłoby emisji z tych kanałów. W związku z tym podejście mieszane STED/konfokalne (przy użyciu skanowania konfokalnego w kanałach, które emitują o długości fali większej niż 592 nm) niestety nie będzie odpowiednie dla 3D.
Podsumowując, wybraliśmy STED jako podejście ze względu na jego względną łatwość aplikacji i poprawę rozdzielczości w porównaniu ze standardowym obrazowaniem konfokalnym. W obrazowaniu synapsy immunologicznej okazał się skuteczną i cenną techniką, która pozwala nam dostrzec szczegóły w architekturze F-aktyny, które nie są możliwe w rozdzielczości powyżej 200 nm. Chociaż wiele z tych szczegółów wydaje się subtelnych, mogą one mieć głęboki wpływ na funkcjonowanie komórek NK. W ten sposób stosujemy najnowszą technologię obrazowania nanoskopowego do uzyskiwania informacji, które mają kluczowe znaczenie dla utrzymania zdrowia ludzkiego.
Autorzy oświadczają, że nie mają konkurencyjnych interesów finansowych. Częściowy koszt publikacji tego artykułu został pokryty przez Leica Microsystems, Inc.
Dziękujemy Geoffowi Danielsowi za pomoc techniczną. Praca ta została sfinansowana przez R01 AI067946 J.S.O.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| #1.5 Szkiełka nakrywkowe | VWR | 48393-172 | |
| BD Cytofix/Cytoperm | BD Biosciences | 554722 | |
| Albumina surowicy bydlęcej | Sigma | A2153 | |
| Aplikator z bawełnianą końcówką | Fisher Scientific | S450941 | |
| Probówki wirówkowe Falcon (50 ml) | VWR | 352070 | |
| Surowica cielęca płodu (FCS) (500 ml) | Atlantic Biologicals | S11050 | |
| Kozia anty-królik Pacific Orange | Life Technologies | P31584 | |
| Wycieraczki laboratoryjne | VWR | 82003-820 | |
| Lakier do paznokci | VWR | 100491-940 | |
| Komórki NK-92 | ATCC | CRL-2407 | |
| Falloidyna Alexa Fluor 488 | Life Technologies | A12379 | |
| Sól fizjologiczna buforowana fosforanami | Life Technologies | 14190250 | |
| Przedłużony odczynnik zapobiegający blaknięciu | Life Technologies | P7481 | |
| Oczyszczony anty-CD18 | Biolegend | 301202 | |
| Oczyszczony anty-NKp30 | Biolegend | 325202 | |
| Oczyszczony anty-perforyna | Biolegend | 308102 | |
| RPMI 1640 podłoże ( 500 ml) | Life Technologies | 11875-093 | |
| Saponina z kory Quillaja | Sigma | S4521 | |
| Długopis Super PAP | Life Technologies | 008899 | |
| Triton X-100 | Mikroskopia elektronowa Nauki | 22142 | |
| Oprogramowanie do dekonwolucji Huygensa | SVI | Skontaktuj się z firmą | |
| Leica SP8 TCS STED | Leica Firma Microsystems | skontaktuj się z firmą |
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie