W celu oceny bioenergetyki komórek krwi, pobiera się krew pełną od ludzi poprzez nakłucie żyły do probówek próżniowych z EDTA lub ACD. Izolacja leukocytów i płytek krwi po pobraniu krwi jest przedstawiona na Rysunku 1A, zgodnie ze szczegółami zawartymi w protokole. Próbki krwi pełnej są przetwarzane w ciągu 8 hr od pobrania, aby uniknąć śmierci i aktywacji komórek. Wydłużony czas przechowywania przekraczający 8 hr nie został przebadany, lecz może prowadzić do zmian w bioenergetyce i być mniej reprezentatywny dla warunków fizjologicznych. Do izolacji komórek stosowano probówki próżniowe z kwasem cytrynowym, dekstrozą (ACD-8 ml) i EDTA, nie obserwując wpływu na funkcje bioenergetyczne izolowanych komórek. Przeciwzakrzepowe są niezbędne, ponieważ skrzepy zmniejszają liczbę otrzymanych komórek, zakłócają prawidłowe formowanie się faz podczas wirowania w gradiencie Ficoll oraz powodują uzyskanie niewielkiej ilości lub całkowity brak płytek krwi w odwirowanej surowicy. Cała krew stanowi zagrożenie biologiczne, dlatego podczas całej procedury należy stosować odpowiednie środki ochrony osobistej, nawet po wyizolowaniu populacji komórek lub przygotowaniu lizatów komórkowych. Próbki należy utylizować zgodnie z instytucjonalnymi standardami utylizacji odpadów pochodzenia ludzkiego.
Krew pełną wiruje się w celu oddzielenia osocza bogatego w płytki krwi od warstwy leukocytarnej (buffy coat), czyli białej warstwy znajdującej się bezpośrednio nad osadem erytrocytów, która zawiera leukocyty. Warstwę leukocytarną nakłada się na gradienty gęstości i wiruje, aby uzyskać mononuklearne komórki krwi obwodowej (monocyty i limfocyty) oraz komórki wielojądrowe (granulocyty). Zanieczyszczenie poszczególnych frakcji MNC i PMN erytrocytami jest na tym etapie powszechne i powinno zostać usunięte podczas oczyszczania metodą MACS. Następnie poszczególne typy komórek otrzymuje się poprzez inkubację z przeciwciałami magnetycznymi w celu uzyskania czystych frakcji. Monocyty zbiera się poprzez inkubację frakcji PBMC z CD14; ciecz przepływowa po wydzieleniu monocytów zawiera limfocyty, które następnie są oczyszczane z erytrocytów i płytek krwi. Neutrofile otrzymuje się poprzez inkubację warstwy komórek wielojądrowych z przeciwciałem CD15 (Rysunek 1A). Następnie płytki krwi można wytrącić poprzez wirowanie osocza bogatego w płytki krwi i przemyć, aby usunąć pozostałe składniki osocza. Po tych selekcjach płytki krwi, monocyty CD14+, limfocyty oraz neutrofile CD15+ mogą zostać policzone i wysiane na płytkę analizatora XF pokrytą medium do adhezji komórkowej w celu analizy bioenergetyki i wyrzutu oksydacyjnego.
Każdy etap procedury powinien być przeprowadzany w warunkach sterylnych, co jest zalecane w celu zapobiegania przedwczesnej aktywacji odpowiedzi oksydacyjnej w monocytach i neutrofilach. Wskaźnikiem niedostatecznej sterylności podczas izolacji jest sytuacja, w której neutrofile, wykazujące niewielkie lub żadne zużycie tlenu w warunkach podstawowych, rozpoczynają test przepływu zewnątrzkomórkowego z podwyższonymi pomiarami OCR, które stopniowo rosną lub spadają w trakcie analizy. Podkreślamy znaczenie obrazowania komórek za pomocą mikroskopii świetlnej przy powiększeniu 200X lub większym, aby upewnić się, że przed testem nie wystąpiły morfologiczne oznaki aktywacji. Na przykład neutrofile zazwyczaj wykazują kształt od okrągłego do nieregularnego z wyraźnymi granicami komórek, co widoczne jest na Ryc. 1B. Jednakże komórki te, po aktywacji, spłaszczają się na powierzchni płytki i tracą swoją charakterystyczną morfologię. Wcześniej opisaliśmy zmiany morfologiczne aktywowanych leukocytów i płytek krwi przy użyciu tego protokołu; w przypadku stwierdzenia aktywacji należy podjąć dodatkowe środki w celu zapewnienia warunków sterylnych8.
Uproszczony schemat protokołu przedstawiono na Rysunku 2 w formie harmonogramu, w którym szczegółowo opisano główne etapy izolacji komórek, przygotowania płytki XF oraz analizy XF. Izolacja polega na rozdziału typów komórek metodą gradientu gęstości, po której następuje separacja magnetyczna. Równolegle do procesu izolacji komórek konieczne jest przygotowanie płytki XF, aby uniknąć opóźnień w wysiewaniu komórek lub rozpoczęciu analizy XF. Jest to krytyczne, ponieważ znaczne opóźnienia mogą prowadzić do aktywacji komórek i pogorszenia parametrów bioenergetycznych.
Niewystarczające stężenia komórek po izolacji są powszechnym problemem, a optymalizacja każdego procesu wirowania jest niezbędna, aby uniknąć utraty komórek. Udane izolacje przeprowadzono przy użyciu nawet 6 ml krwi, jednak można wprowadzać zmiany w zależności od stężeń krążącego pożądanego typu komórek. Jeśli gradient gęstości zostanie przygotowany nieprawidłowo, wyraźne fazy komórkowe mogą nie być widoczne i może dojść do utraty komórek (wizualną demonstrację przedstawiono w filmie instruktażowym JoVE). Niedostateczna ilość płytek krwi wyizolowanych z PRP zdarza się rzadko, ale wystąpiła w przypadkach, gdy bufor piorący nie zawierał PGI2 lub gdy izolacja odbywała się w temperaturze poniżej temperatury pokojowej. Ryzyko aktywacji płytek krwi jest często ograniczane, jeśli są one ostatnimi izolowanymi komórkami; jednak w przypadku pozostawienia płytek w buforze piorącym przez dłuższy czas, ich bioenergetyka zostanie zaburzona. Odnotowano przypadki mniejszych populacji płytek krwi, które nie tworzyły osadu podczas wirowania przy 1,500 x g, a bioenergetyka tych komórek nie została szczegółowo scharakteryzowana. Bardziej kompletny przewodnik rozwiązywania problemów znajduje się w Tabeli 2.
Profile bioenergetyczne leukocytów i płytek krwi można oznaczyć przy użyciu analizatora XF, który w sposób nieinwazyjny mierzy zużycie O2 w komórkach w czasie rzeczywistym. Każdy typ komórek jest wysiewany na płytkę XF24 w pięciu powtórzeniach, jak pokazano na Rysunku 3A. Tabela 1 przedstawia oczekiwane wartości podstawowe i wartości wyrzutu oksydacyjnego dla poszczególnych typów komórek podczas analizy oraz średnie stężenia białka na studzienkę. Dostępne są technologie o wyższej przepustowości, takie jak XF96, która umożliwia jednoczesną ocenę czterech dawców, co przedstawiono na Rysunku 3B. Po zakończeniu analizy dane są eksportowane do stacji roboczej w celu analizy z wykorzystaniem odpowiedniego oprogramowania XF oraz programu Microsoft Excel. Wartości OCR zostały znormalizowane do całkowitej zawartości białka w odpowiadających im studzienkach i wyrażone jako pmol/min/mg białka. Reprezentatywne profile bioenergetycznego wyrzutu oksydacyjnego dla każdego typu komórek zostały niedawno opisane przez nasz zespół8. Dalsza analiza parametrów bioenergetycznych testu (podstawowe, związane z ATP, wyciek protonów, maksymalne, niemitochondrialne i wyrzut oksydacyjny) może być obliczana dla poszczególnych studnikek, jak wykazano wcześniej i opisano poniżej8.
Bazowy poziom zużycia tlenu (OCR) zostaje ustalony na podstawie pierwszych 3 pomiarów, jak pokazano na Rysunku 4A. Do pożywki XF wstrzykuje się oligomycynę (0,5 µg/ml), inhibitor mitochondrialnej syntazy ATP, aby oszacować OCR powiązany z syntezą ATP, reprezentowany jako OCR związany z ATP (ATP-linked). Pozostały OCR pomniejszony o OCR niemitochondrialny można przypisać do przecieku protonów. Następnie dodaje się FCCP, który jest odsprzęgaczem, aby określić maksymalny OCR, a następnie antymycynę A, inhibitor oddychania mitochondrialnego, w celu określenia niemitochondrialnych źródeł zużycia tlenu. Pojemność rezerwowa jest miarą ilości ATP, która może zostać wyprodukowana w warunkach zapotrzebowania energetycznego i może być obliczona jako różnica między maksymalnym tempem oddychania a bazowym. Aby określić zdolność do wywołania wyrzutu tlenowego, wstrzykuje się 12-mirystynian 13-octan forbolu (PMA), agonistę PKC, w celu zwiększenia aktywnościy NADPH-oksydazy, a wzrost tempa zużycia tlenu po stymulacji PMA można zmierzyć za pomocą analizatora XF. Rysunek 4B pokazuje, jak obliczać poszczególne parametry funkcji mitochondrialnej i wyrzutu tlenowego.

Rysunek 1. Izolacja leukocytów i płytek krwi z krwi pełnej. A) Świeżo pobrane próbki są rozdzielane na osocze i składniki komórkowe poprzez wirowanie, a następnie oczyszczane za pomocą gradientu gęstości Ficoll oraz magnetycznego sortowania komórek (MACS) poprzez selekcję pozytywną (monocyty i neutrofile) lub negatywną (limfocyty), podczas gdy płytki krwi są izolowane przez wirowanie osocza bogatego w płytki krwi z dużą prędkością. B) Obrazy izolowanych populacji komórek po resuspensji w XF DMEM i wysianiu przy wskazanych gęstościach komórek. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2. Przygotowanie płytek XF24 do badań bioenergetycznych leukocytów i płytek krwi. Szczegółowy harmonogram przygotowania płytki analizy XF24 poprzez izolację i wysiewanie komórek oraz nawilżanie kartridża i napełnianie portów wstrzykiwania.

Rysunek 3. Układ leukocytów i płytek krwi na płytkach analizatora XF24 i XF96. A) Leukocyty (125-250k komórek/studzienkę) i płytki krwi (25 x 106 komórek/studzienkę) od jednego dawcy są wysiewane na płytkę testową XF24 pomiędzy kontrole tła. 75 µl 10-krotnych stężenia zapasów oligomycyny (0,5 µg / ml), FCCP (0,6 µM), antymycyny-A (10 µM) oraz PMA (100 ng/ml) rozpuszczonych w medium XF są wprowadzane do wskazanych portów wtryskowych. B) Leukocyty (75-150k komórek/studzienkę) i płytki krwi (10 x106 komórek/studzienkę) od maksymalnie czterech dawców mogą być wysiewane na płytkę XF96 w całkowitej objętości 180 µl XF-DMEM. 20 µl 10-krotnych stężenia zapasów oligomycyny (1,0 µg/ml), FCCP (0,6 µM), antymycyny-A (10 µM) oraz PMA (100 ng/ml) rozpuszczonych w XF-DMEM są wprowadzane do wskazanych portów wtryskowych.

Rycina 4. Analiza wskaźników bioenergetycznych. A) Reprezentatywny przebieg tempa zużycia tlenu (OCR) przez mitochondria oraz wyrzutu tlenowego w monocytach. Ustalono podstawowy poziom OCR (pierwsze 3 wartości wskazane liczbami w okręgach). Następnie sekwencyjnie wstrzyknięto oligomycynę (O; 0,5 µg/ml), FCCP (F; 0,6 µM) i antymycynę-A (A; 10 µM), aby określić oddychanie mitochondrialne i pozamitochondrialne nieaktywowanych komórek. Na koniec dodano PMA (100 ng/ml), aby zmierzyć wyrzut tlenowy. B) Modułowa analiza funkcji mitochondrialnych i wyrzutu tlenowego obliczona na podstawie różnic w tempach zużycia, zgodnie z oznaczeniami.
| Optymalna gęstość wysiewu | Śr. podstawowy OCR (pmol O22/min) | Śr. OCR wyrzutu oksydacyjnego (pmol O2)2/min) | Śr. białka (µg)/dołek |
| Monocyty | 250 tys. komórek/dołek | 83.9 ( ± 13.0) | 300.3 ( ± 58.8) | 19.0 ( ± 2.4) |
| Neutrofile | 250 tys. komórek / dołek | 6.1 ( ± 2.2) | 1411.8 ( ± 233.3) | 20.6 ( ± 2.7) |
| Limfocyty | 250 tys. komórek / studzienkę | 52.9 ( ± 7.7) | 15 ( ± 4.1) | 13.2 ( ± 2.1) |
| Trombocyty | 25 x 106 komórek / studzienkę | 199.4 ( ± 20.3) | 24 ( ± 2.7) | 47.5 ( ± 3.1) |
Tabela 1. Normalne parametry dla analizy XF24: Średnie podstawowe (Rate 3) i oksydacyjne wyrzuty (Rate 7) OCR, niekorygowane względem OCR niemitochondrialnego ani białka, przedstawiono w zależności od typu komórek wysianych przy wskazanych gęstościach. Średnią zawartość białka na dołek wyznaczono za pomocą metody Lowry'ego (DC Lowry). Dane te reprezentują wartości średnie dla 6-8 zdrowych dawców, przy czym w nawiasach podano ± SEM.
| Krok | Problem | Możliwa przyczyna | Rozwiązanie |
| 1.2 | przezroczysta plazma | osadzenie się płytek krwi podczas wirowania | skrócić czas wirowania do 10 min lub zmniejszyć prędkość do 400 x g |
| mętna plazma | nadmiar lipidów | unikać pobierania krwi po posiłku |
| 1.6 | niecałkowite utworzenie się pierścieni komórkowych | nieprawidłowe przygotowanie gradientu, zimny odczynnik | unikać zaburzania gradientu podczas pipetowania, używać odczynników o temperaturze pokojowej |
| grudki w pierścieniach komórkowych | mógł nastąpić proces krzepnięcia krwi | pobierać krew z użyciem przeciwkrzepliwych, takich jak ACD lub EDTA |
| 1.10 | brak osadu komórkowego | patrz krok 1.6 | jeśli supernatant jest mętny, patrz poniżej |
| mętny supernatant | silne zanieczyszczenie gradientem Ficoll, zanieczyszczenie płytkami krwi | zwiększyć prędkość wirowania do 900 x g, rozcieńczyć większą ilością RPMI |
| 1.16, 1.17 | niska wydajność leukocytów | silne zanieczyszczenie RBC, zbyt mała ilość krwi pełnej, krzepnięcie | podwoić objętość przeciwciał i RPMI-BSA, pobrać więcej krwi, dodać przeciwkrzepliwie |
| 1.19 | agregacja płytek krwi | pominięcie PGI2, ekspozycja na zimne medium, przedłużone przechowywanie w plazmie | dodać PGI2 do buforu do płukania płytek, używać odczynników o temperaturze pokojowej |
| 1.20 | niska liczba płytek krwi | strata podczas wirowania wstępnego, agregacja płytek krwi | patrz kroki 1.2 i 1.19 |
| 2.3 | zanieczyszczenie RBC | | powtórzyć separację MACS |
Tabela 2. Rozwiązywanie problemów podczas izolacji leukocytów i płytek krwi. Tabela wymienia typowe problemy występujące podczas izolacji leukocytów i płytek krwi z krwi pełnej oraz rozwiązania, które mogą pomóc użytkownikom w procesie rozwiązywania problemów.