Monitorowanie aktywności neuronalnej u czujnego zwierzęcia aktywnie zaangażowanego w zadanie behawioralne jest kluczowe dla zrozumienia funkcji i organizacji układu nerwowego. Zewnątrzkomórkowy zapis aktywności elektrycznej pojedynczych jednostek neuronalnych od dawna jest podstawowym narzędziem neurobiologii systemowej i jest nadal szeroko stosowany. Dostępnych jest wiele typów i konfiguracji elektrod w zależności od wymagań naukowych i technicznych konkretnego eksperymentu. Przewlekle wszczepiane mikronapędy lub układy elektrod są często używane u swobodnie poruszających się zwierząt, w tym ptaków, gryzoni i naczelnych1-4. Alternatywnie, ostre penetracje mikroelektrodami metalowymi lub szklanymi za pomocą zewnętrznego mikromanipulatora są często wykorzystywane do nagrywania od znieczulonych lub skrępowanych zwierząt. Szklane elektrody do mikropipet mają tę zaletę, że mogą być używane w konfiguracji zestawionej komórkowej lub "przyłączonej do komórki" w celu jednoznacznego wyizolowania aktywności pojedynczych neuronów bez komplikacji związanych z sortowaniem szczytów post-hoc5. Elektrody te umożliwiają ponadto rejestrację z anatomicznie zidentyfikowanych komórek lub lokalizacji, ponieważ mogą być używane do wstrzykiwania małych depozytów barwnika lub znaczników neuroanatomicznych, a nawet do wypełniania pojedynczej zarejestrowanej komórki. Ta konfiguracja została z powodzeniem zastosowana u szczurów, myszy i ptaków6-10. Obecnie opisana technika koncentruje się na monitorowaniu komórkowym i zewnątrzkomórkowych złogach barwnika u czujnych, skrępowanych głowami szczurów. Należy zauważyć, że w przeciwieństwie do jednokomórkowych wypełnień zbliżeniowych, te złoża barwnika nie dostarczają informacji o morfologii komórek ani projekcjach aksonalnych11, ale umożliwiają dokładną lokalizację anatomiczną do około 50 μm i, co najważniejsze, mają znacznie wyższą wydajność u zwierząt czujnych. Informacje na temat jednokomórkowych wypełnień przykomórkowych są jednak dostarczane jako alternatywna strategia znakowania anatomicznego.
W skrócie, protokół składa się z trzech głównych faz. W pierwszej fazie szczur jest przyzwyczajany do krępowania ciała w skarpetce z tkaniny (ryc. 1) przez okres 6 dni. W drugiej fazie chirurgicznie wszczepia się zagłówek (ryc. 2) i komorę zapisu, tak aby szczur mógł być utrzymywany w płaszczyźnie stereotaktycznej podczas wielu kolejnych sesji nagraniowych (ryc. 3); Procedura ta umożliwia eksperymentatorowi ukierunkowanie określonych podkorowych obszarów mózgu do badania elektrofizjologicznego w oparciu o standardowe współrzędne odniesienia12. Trzecia faza polega na umieszczeniu szczura w odpowiednim przyrządzie do przeprowadzenia eksperymentów behawioralnych i elektrofizjologicznych (Ryc. 4), skonstruowaniu elektrody z kwarcowej rurki kapilarnej (Ryc. 5), wykonaniu zestawień neuronalnych komórkowych, które jednoznacznie izolują pojedyncze jednostki6-9 i zaznaczeniu anatomicznej lokalizacji miejsca zapisu barwnikiem Chicago Sky Blue (Ryc. 6 i 7). Nagrania wykonywane są z jednoczesnym monitorowaniem zachowań; Jednak techniczne szczegóły zachowania będą zależeć od celów naukowych każdego eksperymentu, a zatem wykraczają poza zakres pojedynczego protokołu. Po zakończeniu procedury doświadczalnej, którą można powtarzać przez wiele dni, zwierzę jest poddawane eutanazji. Mózg jest ekstrahowany i przetwarzany zgodnie ze standardowymi technikami neuroanatomicznymi przy użyciu mikroskopii jasnego pola lub mikroskopii fluorescencyjnej.