Obecnie opisywane konfiguracje laserowe i strategie uwięzi są kompatybilne z szerokim zakresem testów behawioralnych gryzoni. Rzeczywiście, po lub towarzysząc stymulacji optogenetycznej in vivo , zastosowano różne testy behawioralne, które obejmują emocjonalne zadania behawioralne, warunkowanie behawioralne, paradygmaty uczenia się i pamięci, sen, pobudzenie i zadania apetytywne, aby wymienić tylko kilka (patrz Nieh i wsp.6 w celu uzyskania kompleksowej recenzji). Optogenetyka zmieniła sposób, w jaki przeprowadza się tradycyjne testy behawioralne, ponieważ wielodniowe badania można teraz skondensować w jednej sesji, w której zachowanie jest porównywane w obrębie badanych podczas różnych epok światła "włączonego" i "wyłączonego"5. Warto zauważyć, że aparaty behawioralne, które zawierają drzwi, zamknięte przedziały lub inne przeszkody, mogą wymagać modyfikacji, aby dostosować się do przejścia włókien na uwięzi.
Opisane strategie tetheringu pozwalają na jednoczesną stymulację wielu myszy za pomocą jednego lasera. Wysokowydajne optogenetyczne testy behawioralne można zatem osiągnąć dzięki zastosowaniu wielu laserów i sprzętu testowego. Liczba zwierząt, które mogą być jednocześnie stymulowane, będzie jednak ograniczona przez maksymalną moc światła, jaką można osiągnąć na każdej końcówce włókna. Maksymalna moc wyjściowa na końcówce światłowodu zależy od 1) mocy rozruchowej lasera; 2) wydajność sprzęgania i 3) liczba podziałów belki. W przypadku niebieskiego lasera o mocy 100 mW z ~80% wydajnością sprzężenia i maksymalnie 4 podziałami wiązki (jak pokazano na rysunku 4C), średnia moc na końcówce światłowodu może wynosić od 5 do 10 mW przy użyciu rdzenia 200 μm, kabli światłowodowych 0,22 NA (uwaga, spodziewaj się, że straty transmisji ze złączy obrotowych wyniosą <15%). Pomiar strumienia świetlnego na końcówce światłowodu jest niezbędny do określenia odpowiedniej mocy świetlnej do aktywacji opsyny, ponieważ opsyny różnią się wrażliwością na światło, a tym samym gęstością mocy światła (mW/mm2) wymaganą do aktywacji11. Na przykład stabilna opsyna krokowa (SSFO) działa jak akumulator fotonów i dlatego do aktywacji wymaga bardzo małej gęstości mocy światła (<8 μW/mm2)8. Porównaj to z tradycyjną rodopsyną kanałową (ChR2), która wymaga co najmniej 1 mW/mm2 światła do wywołania potencjałów czynnościowych2. Tabela 1 służy jako skrócone odniesienie do znanych minimalnych natężeń światła wymaganych do aktywacji najczęściej używanych obecnie opsyn. Na koniec należy wziąć pod uwagę, że światło rozprasza się i pochłania, gdy przemieszcza się przez tkankę mózgową, tak że więcej energii świetlnej jest potrzebne do głębszych struktur mózgu3. Pod adresem http://www.stanford.edu/group/dlab/cgi-bin/graph/chart.php dostępny jest przydatny zasób internetowy, który obliczy natężenie światła na różnych głębokościach przez tkankę mózgową, biorąc pod uwagę rozmiar rdzenia włókna, aperturę numeryczną, długość fali użytego światła oraz początkową moc światła na końcówce światłowodu. Doskonały przegląd zasad teoretycznych leżących u podstaw tych obliczeń można znaleźć w Foutz et al. (2012)12. Przykłady zastosowania tych zasad i obliczeń do projektowania eksperymentalnego przedstawiono w Aravanis et al. (2007)3 i Tye et al. (2012)13. Wykonanie tych obliczeń przed rozpoczęciem eksperymentu ma kluczowe znaczenie dla zapewnienia odpowiedniego natężenia promieniowania dla aktywacji opsyny. Biorąc pod uwagę te względy, korzystne jest zakupienie laserów o większej mocy, aby zapewnić odpowiednią moc wyjściową. Lasery o mocy wyjściowej od 100 do 200 mW są na ogół wystarczające do kompensacji małych włókien rdzeniowych, pękania wielu włókien, nieefektywności sprzęgania i strat transmisyjnych7. W przypadku korzystania z laserów o dużej mocy należy jednak zachować ostrożność, aby uniknąć uszkodzenia neuronów lub artefaktów związanych z ciepłem i światłem, które mogą wystąpić przy długotrwałym i/lub silnym oświetleniu światłem7. Bezpieczny zakres dla eksperymentów in vivo wynosi do 75 mW/mm2. 14
Decyzja o rodzaju zakupionego lasera może być skomplikowana, ponieważ należy wziąć pod uwagę wiele czynników. Na przykład lasery diodowe zapewniają bardziej stabilny i powtarzalny impulsowy sygnał wyjściowy niż lasery półprzewodnikowe pompowane diodami (DPSS) i są bardziej niezawodne w czasie w środowisku laboratoryjnym. Jednak w niektórych przypadkach bezpośrednie lasery diodowe mogą emitować niższą moc światła, ~0,1 mW, nawet gdy napięcie sterujące wynosi 0 V ze względu na stały prąd polaryzacji przesyłany do diody przez elektronikę sterującą lasera. Ta "spontaniczna" emisja ma szersze spektrum niż emisja laserowa z tego samego lasera, więc można ją specjalnie zmniejszyć, instalując filtr wąskoprzepustowy (lub "czyszczący") między laserem a sprzęgaczem (patrz lista części). Filtr ten zmniejszy również moc wyjściową o ~50% podczas laserowania, więc kup odpowiednio laser o większej mocy. Należy zauważyć, że żółte lasery DPSS są niezwykle czułe i mogą zachowywać się nieregularnie oraz mieć skróconą żywotność, jeśli są szybko modulowane przez generator impulsów. Regulacja mocy lasera żółtego powinna odbywać się za pomocą kół filtrów gęstości zewnętrznej umieszczonych na ścieżce wiązki (rozdział 1.7) podczas pracy lasera w trybie TTL+. Alternatywnie, zakup zielonego lasera DPSS o długości fali 532 nm jest opłacalną alternatywą, która może aktywować zarówno halorodopsyny, jak i archaerodopsyny.
Apertura numeryczna (NA) światłowodu jest ważna do rozważenia podczas projektowania i zakupu komponentów światłowodowych do montażu lasera. NA światłowodu określa kąty promieni świetlnych, które mogą być akceptowane i emitowane na końcówce światłowodu. Jeśli włókno o wyższej NA zostanie połączone ze włóknem o niższym NA, na tym interfejsie nastąpi znaczna strata, dlatego ważne jest, aby być spójnym ze światłowodem NA w ramach jednej konfiguracji (lub zapewnić, że NA wzrasta wzdłuż ścieżki światła). Wpływ włókna NA na objętość oświetlonej tkanki mózgowej jest mniej ważny, ponieważ tkanka mózgowa jest silnie rozpraszana, a światło sprzężone ze źródła laserowego będzie miało tendencję do "niedopełniania" włókien o wysokiej zawartości NA; jednak powszechnie stosowane są światłowody o NA 0,22 i 0,37. Podobnie, sprzężenie z większego rdzenia do włókna o mniejszym rdzeniu również spowoduje znaczne straty, więc zawsze upewnij się, że używasz rosnących lub równych średnic rdzenia podczas przechodzenia od źródła lasera do implantu zwierzęcego. Ogólnie rzecz biorąc, końce włókien powinny być zawsze zakryte, gdy nie są używane, aby zapobiec gromadzeniu się kurzu i cząstek stałych. Dobrym pomysłem jest regularne czyszczenie końcówek i łączników światłowodów (dobrze sprawdza się 70% alkohol izopropylowy), aby zapewnić maksymalną moc wyjściową światła, a także testowanie mocy wyjściowej światła przez "atrapę implantu" przed rozpoczęciem eksperymentów każdego dnia.
Podczas testów behawioralnych konieczne jest podjęcie kroków w celu kontrolowania wpływu infekcji wirusowej, ekspresji białek egzogennych, światła widzialnego oraz możliwych efektów ogrzewania tkanek i artefaktów na zachowanie zwierząt. Dlatego właściwa grupa kontrolna powinna składać się ze zwierząt transdukowanych wirusem kontrolnym (np. GFP, eYFP, mCherry), które otrzymują identyczne parametry stymulacji świetlnej. Weryfikacja eksperymentalna jest kluczowym ostatnim krokiem, ponieważ dane behawioralne wykorzystywane do analizy są całkowicie zależne od prawidłowego rozmieszczenia opsyny i światłowodu w obszarze zainteresowania. W szczególności u zwierząt, u których nie wykryto żadnego sygnału immunohistochemicznego lub u których umieszczenie sygnału lub włókna nie znajduje się w obszarze zainteresowania, dane behawioralne dla tego zwierzęcia powinny zostać usunięte z eksperymentu. Dodatkowo konieczne jest przetestowanie strumienia świetlnego na końcówce światłowodu zarówno przed implantacją chirurgiczną, jak i ponownie po sekcji zwłok, aby zapewnić odpowiednią moc światła do aktywacji opsyny. U zwierząt, u których po doświadczeniach nastąpiła znaczna utrata światła przez włókno (>30%)9, należy rozważyć usunięcie danych dotyczących tego zwierzęcia. Kryteria usuwania powinny być ustalane a priori. Na koniec należy wziąć pod uwagę częstotliwość impulsów wymaganą do modulacji odpalania neuronów, która będzie zależeć od struktury mózgu i podtypów neuronów, które są celem ataku. Opublikowane parametry optogenetycznej stymulacji światłem istnieją dla wielu podtypów neuronów, jednak zdolność do modulowania odpalania neuronów powinna być niezależnie potwierdzona za pomocą zapisów elektrofizjologicznych in vivo lub wycinków mózgu.
W miarę jak ktoś nabiera wprawy w używaniu lasera i modyfikacji ustawień laserowych, kombinacje różnych długości fal mogą być przywiązane do wielu włókien na jednym zwierzęciu lub dostarczane tym samym włóknem w optogenetyce kombinatorycznej8. Stymulacja na wielu długościach fal będzie stawać się coraz ważniejsza, biorąc pod uwagę szybki rozwój rodosyn kanałowych przesuniętychku czerwieni 8, inżynierię hiperpolaryzujących opsyn z przesunięciem ku błękitowi15, zastosowanie bistabilnych opsyn o funkcji krokowej8,16,17 i ogólną rozszerzającą się listę opsyn z wyraźnymi widmami aktywacji11. To rozszerzenie zestawu narzędzi optogenetycznych pozwoli na bezprecedensową kontrolę wielu podtypów neuronalnych zarówno w obrębie obszarów mózgu, jak i między nimi, w celu określenia ich roli w zarządzaniu złożonymi stanami behawioralnymi.