$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Proteazy to enzymy, które biorą udział w różnych reakcjach fizjologicznych, począwszy od dobrze znanej proteolitycznej degradacji białek, w kontekście trawienia, aż po wysoce wyrafinowane kaskady proteaz zaangażowane w złożone regulacyjne szlaki sygnałowe. Proteazy dzielą się na siedem grup w zależności od ich katalitycznego miejsca aktywnego: proteazy asparaginianu, asparaginy, cysteiny, kwasu glutaminowego, metalozyny, seryny i treoniny. Różne proteazy celują w różne miejsca rozszczepienia, które nie zawsze są łatwe do przewidzenia na podstawie pierwotnej struktury białka. Baza danych MEROPS (http://merops.sanger.ac.uk/) zawiera szczegółowe informacje na temat szerokiej gamy proteaz i ich preferencyjnych miejsc cięcia. Funkcjonalnie istotne miejsca rozszczepienia można zidentyfikować za pomocą mutagenezy ukierunkowanej.
Jest dobrze znane, że proteolityczne przetwarzanie ENaC jest ważnym mechanizmem aktywacji tego konkretnego kanału jonowego1,2. Co ciekawe, istnieją dowody na to, że funkcja powiązanego kanału jonowego 1a (ASIC1a) może być również modyfikowana przez proteazy3-5. Obecnie otwartym pozostaje pytanie, czy rozszczepienie kanałów proteolitycznych odgrywa istotną rolę fizjologiczną w regulacji aktywności innych kanałów jonowych lub transporterów. Wiadomo jednak, że rozszczepienie proteolityczne aktywuje grupę receptorów sprzężonych z białkiem G, receptorów aktywowanych proteazą (PAR)6. Wykazano, że kilka proteaz serynowych (np. proteazy aktywujące kanały (CAP1-3), chymotrypsyna, trypsyna, furyna, plazmina, elastaza neutrofilowa i kalikreina) proteolitycznie aktywują ENaC2. Oprócz proteaz serynowych inne grupy proteaz mogą być zaangażowane w proteolityczną aktywację ENaC. Rzeczywiście, ostatnie dane pokazują, że metaloproteinaza meprin-β7 i katepsyna proteazy cysteinowejS 8 mogą również aktywować ENaC. Jednak (pato-)fizjologicznie istotne proteazy dla aktywacji ENaC pozostają do ustalenia i mogą się różnić w zależności od tkanki.
Wiadomo, że proteazy preferencyjnie rozszczepiają się w określonych miejscach w sekwencji aminokwasów. Na przykład chymotrypsyna proteazy serynowej wykazuje specyficzny wzór rozszczepienia, rozszczepiając się po resztach aminokwasów aromatycznych fenyloalaniny i tyrozyny. W przeciwieństwie do tego, proteaza serynowa trypsyna preferencyjnie rozszczepia się po podstawowych resztach lizynie lub argininie. Wykorzystując zmutowane ludzkie konstrukty γENaC wygenerowane przez mutagenezę ukierunkowaną na miejsce, można zidentyfikować funkcjonalnie istotne miejsca cięcia w ENaC heterologicznie wyrażane w systemie ekspresji oocytów8-13.
Poprzez wstrzyknięcie cRNA do trzech podjednostek ENaC (αβγ) do izolowanych oocytów, ENaC może być funkcjonalnie wyrażany w tych komórkach, a aktywność kanałów obecnych na błonie plazmatycznej może być mierzona za pomocą techniki dwuelektrodowego zacisku napięcia. Dzięki zastosowaniu amilorydu moczopędnego, specyficznego inhibitora ENaC, wrażliwy na amiloryd składnik prądu całej komórki, w którym pośredniczy ENaC (ΔIami), można oddzielić od niespecyficznych prądów upływowych lub od prądów przewodzonych przez inne kanały jonowe. Zatem wartości ΔIami odzwierciedlają ogólną aktywność ENaC i można je określić, odejmując prądy całokomórkowe mierzone w obecności amilordu od odpowiadających prądów całokomórkowych zarejestrowanych przy braku amilorku. Aby sprawdzić, czy proteaza ma stymulujący wpływ na ENaC, ΔIami mierzy się dwukrotnie w tym samym oocycie, tj. przed i po inkubacji oocytu w roztworze zawierającym proteazę. WzrostΔI ami od pierwszego do drugiego pomiaru wskazuje na proteolityczną aktywację ENaC. Wiadomo, że chymotrypsyna lub trypsyna maksymalnie stymulują ENaC w systemie ekspresji oocytów2,14 i mogą być stosowane do potwierdzenia, że proteolityczna aktywacja ENaC jest wykrywalna w danej partii oocytów.
Równolegle do pomiarów prądu dla całej komórki, zastosowano metodę biotynylacji9 w celu zbadania, czy wzrostΔI ami wykryty po ekspozycji oocytów na proteazy koreluje z pojawieniem się fragmentów rozszczepienia ENaC na powierzchni komórki. Białka na powierzchni komórki są znakowane biotyną i mogą być oddzielone od białek wewnątrzkomórkowych poprzez wiązanie biotynylowanych białek z kulkami agarozy znakowanymi neutrawidyną. Biotynylowane białka mogą być analizowane za pomocą western blot. Fragmenty rozszczepienia γENaC na powierzchni komórki można wykryć za pomocą specyficznego przeciwciała skierowanego przeciwko epitopowi w C-końcu γENaC. Aby zidentyfikować funkcjonalnie istotne miejsce (miejsca) rozszczepienia, przewidywane miejsca rozszczepienia można zmutować za pomocą mutagenezy ukierunkowanej na miejsce. Kanały typu dzikiego i zmutowanego są porównywane w równoległych eksperymentach z wykorzystaniem oocytów z tej samej partii.
Dzięki temu metodologicznemu podejściu po raz pierwszy wykazano, że proteolityczna aktywacja prądów całokomórkowych za pośrednictwem ENaC koreluje z zależnym od czasu pojawieniem się fragmentów rozszczepienia ENaC na powierzchni komórki. Wyniki te sugerują związek przyczynowo-skutkowy między rozszczepieniem kanału a aktywacją kanału. Ponadto, stosując mutagenezę ukierunkowaną na miejsce przypuszczalnych miejsc rozszczepienia w połączeniu z techniką dwuelektrodowego zacisku napięciowego, zidentyfikowano funkcjonalnie istotne miejsca cięcia plazminy, chymotrypsyny13 i katepsyny-S8.