Pacjenci z infekcją krwi (BSI) spowodowaną bakteriami nadal mają wysoką śmiertelność wewnątrzszpitalną, wahającą się od 6 do 48%1. Podanie odpowiedniego antybiotyku empirycznego sprzyja przeżyciu, a w podgrupie pacjentów z ciężką sepsą każda godzina opóźnienia w odpowiedniej terapii koreluje ze zmniejszonym przeżyciem2,3. W związku z tym kluczowym celem laboratorium klinicznego jest szybkie wykrywanie, identyfikowanie i informowanie o obecności bakterii w posiewach krwi w celu podejmowania świadomych decyzji klinicznych. Wykazano, że laboratorium mikrobiologiczne ma największy wpływ na terapię przeciwdrobnoustrojową w momencie zgłaszania barwienia metodą Grama4, a ostatnio badanie obserwacyjne wykazało, że spektrometria mas z desorpcją/jonizacją laserową wspomaganą matrycą (MALDI-TOF MS) wykonywana bezpośrednio na bulionach z posiewów krwi wpływa na przepisywanie w ponad jednej trzeciej BSI wywołanych przez bakterie Gram-ujemne5.
Komercyjny rozwój MALDI-TOF MS doprowadził do powstania skutecznego narzędzia laboratoryjnego do identyfikacji mikroorganizmów6,7. Technologia ta jest obecnie dobrze znana i została zintegrowana z wieloma laboratoriami w celu szybkiej i dokładnej identyfikacji mikroorganizmów wyizolowanych na pożywkach stałych6,8. Bezpośrednie zastosowanie MALDI-TOF MS do bulionu z posiewów krwi (BC), które zasygnalizowały "pozytywny" dla mikroorganizmów, przemawia zarówno do klinicystów, jak i kierowników laboratoriów ze względu na możliwość uzyskania wcześniejszej identyfikacji mikroorganizmów przy niskich kosztach.
Kliniczna użyteczność bezpośredniego zastosowania MALDI-TOF MS do bulionu z hodowli krwi została ograniczona przez szeroki zakres czułości obserwowanych w porównaniu ze standardowymi metodami identyfikacji opartymi na kulturach fenotypowych, z raportami o udanej identyfikacji bakterii Gram-ujemnych w zakresie 47-98,9%9-11. Różnice w wrażliwości prawdopodobnie dotyczą składu bulionu BC, początkowego stężenia bakterii, różnic w metodach przygotowania próbek, a także szeregu organizmów Gram-ujemnych napotkanych w badanych populacjach9. W porównaniu z innymi opublikowanymi protokołami, przedstawiona tutaj metoda pozwala uniknąć użycia etanolu, chlorku amonu lub dodatkowego (niematrycowego) acetonitrylu. W rezultacie osad bakteryjny pozostanie żywotny (aż do momentu ekstrakcji białka), co pozwoli na zastosowanie potencjalnych metod badania wrażliwości fenotypowej bezpośrednio do tych organizmów w bulionie. Ponadto wykazano, że przedstawiona metoda jest niedroga, niezawodna i szybka, a identyfikacja bakterii jest dostępna w ciągu 25 minut od uzyskania wyników barwienia metodą Grama w posiewie krwi, przy minimalnym czasie pracy12.
Ta metoda to prosty wewnętrzny protokół spin-lizy, wykorzystujący ekstrakcję kwasu mrówkowego stosowaną bezpośrednio do dodatnich bulionów z hodowli krwi w celu identyfikacji bakterii Gram-ujemnych za pomocą technologii MALDI-TOF MS.