| ODCZYNNIKI - Maszyna do tatuażu | | | |
|---|
| Cleanser | Systemy identyfikacji i znakowania zwierząt, Inc. | NMCR3 | Służy do czyszczenia igieł i uchwytu po tatuowaniu. |
|---|
| Suszarka maszynowa | Systemy identyfikacji i znakowania zwierząt, Inc. | NDAR4 | Służy do suszenia igieł i uchwytu po czyszczeniu. |
|---|
| Neonate Tattoo Black Pigment | Systemy identyfikacji i znakowania zwierząt, Inc. | NBP01 | |
|---|
| Aplikator do przygotowania skóry | Systemy identyfikacji i znakowania zwierząt, Inc. | Końcówka Q | NSPA1 |
|---|
| Rozwiązanie do przygotowania skóry | Systemy identyfikacji i znakowania zwierząt, Inc. | NSP01 | Ten odczynnik dostarcza cienką warstwę oleju, która zwiększa efektywność tatuowania i zapobiega blaknięciu tatuażu, poprzez: (informacje od dostawcy): 1) zapobiegając tymczasowemu zabrudzeniu skóry niewytatuowanej, umożliwiając w ten sposób łatwą ocenę jakości tatuażu na opuszkach łap, zanim szczeniak wróci do swojej domowej klatki – Poplamioną powierzchnię skóry można pomylić ze skórą wytatuowaną, 2) zmniejszenie uszkodzeń skóry podczas tatuowania – Zmiękczenie skóry i nasmarowanie igły pomoże igle wniknąć w skórę bez powodowania uszkodzenia skóry oraz 3) zapobiegnie przedostawaniu się tlenu cząsteczkowego do skóry, zmniejszając w ten sposób reakcje zapalne na reaktywne formy tlenu, które mogą być generowane. |
|---|
| ODCZYNNIKI - genotypowanie | | | |
|---|
| EZ Zestaw do genotypowania Fast Tissue/Tail PCR (format probówki paskowej) | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | |
|---|
| 2X PCR Ready Mix II | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Czerwony, ładujący barwnik do elektroforezy jest zawarty w roztworze 2X PCR Ready Mix. |
|---|
| Roztwór do lizy tkanek A | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Przygotuj roztwór do ekstrakcji DNA, mieszając 20 i mikro; l roztworu do lizy tkanek A i 180 &mikro; l roztworu do lizy tkanek B na próbkę. |
|---|
| Roztwór do lizy tkanek B | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Przygotuj roztwór do ekstrakcji DNA, mieszając 20 i mikro; l roztworu do lizy tkanek A i 180 &mikro; l roztworu do lizy tkanek B na próbkę. |
|---|
| Kwas octowy, lodowaty | VWR | BDH 3092 | |
|---|
| Gatunek zoptymalizowany pod kątem agarozy, klasa do biologii molekularnej | rpi | A20090-500 | Stosujemy 2% żele agarozowe w buforze TAE zawierające barwnik żelowy SYBR Safe DNA (rozcieńczony 10 000-krotnie) lub bromek etydyny (0,5 &mikro; g/ml objętości żelu). |
|---|
| Bromek etydyny | Sigma-Aldrich | E7637-1G | |
|---|
| Kwas etylenodiaminotetraoctowy, sól disodowa dwuwodna (EDTA) | Fisher | BP120-500 | |
|---|
| Filtrowane końcówki do pipet, bez aerozolu, 0,1-10 i mikro; l | Dot Scientific Inc | UG104-96RS | Używaj sterylnych końcówek do pipet, które są wolne od DNA, RNazy i DNazy. Na wszystkich etapach związanych z DNA należy używać końcówek pipet z filtrem, aby uniknąć zanieczyszczenia krzyżowego. |
|---|
| Końcówki do pipet z filtrem, końcówki filtrujące Premium Fit, 0,5-20 i mikro; l | Dot Scientific Inc | UG2020-RS | Używaj końcówek do pipet, które są sterylne i wolne od DNA, RNazy i DNazy. Na wszystkich etapach związanych z DNA należy używać końcówek pipet z filtrem, aby uniknąć zanieczyszczenia krzyżowego. |
|---|
| Końcówki do pipet z filtrem, końcówki filtrujące Premium Fit, 1-200 i mikro; l | Dot Scientific Inc | UG2812-RS | Używaj sterylnych końcówek do pipet, które są wolne od DNA, RNazy i DNazy. Na wszystkich etapach związanych z DNA należy używać końcówek pipet z filtrem, aby uniknąć zanieczyszczenia krzyżowego. |
|---|
| Marker masy cząsteczkowej, EZ DNA Even Ladders 100 bp | EZ BioResearch LLC | L1001 | Używamy jednego z tych trzech markerów masy cząsteczkowej. |
|---|
| Marker masy cząsteczkowej, EZ DNA Even Ladders 1000 bp | EZ BioResearch LLC | L1010 | |
|---|
| Marker masy cząsteczkowej, TrackIt, 100 bp DNA Ladder | GIBCO-Invitrogen | 10488-058 | |
|---|
| Probówki do PCR, 8-probówkowe paski z indywidualnie mocowanymi górnymi nakrętkami kopułkowymi, naturalne, 0,2 ml | USA Scientific | 1402-2900 | Używaj probówek, które są sterylne i wolne od DNA, RNazy i DNazy. Pasek z 8 probówkami jest łatwiejszy w obsłudze i grupowaniu próbek niż pojedyncze probówki. |
|---|
| Probówki PCR, Ultraflux Individual | rpi | 145660 | Używaj probówek, które są sterylne i wolne od DNA, RNazy i DNazy. |
|---|
| Probówka do mikrowirówek Seal-Rite 0,5 ml, naturalna | USA Scientific | 1605-0000 | Używaj probówek, które są sterylne i wolne od DNA, RNazy i DNazy. |
|---|
| SYBR Bezpieczne barwienie żelowe DNA * 10 000x stężenie w DMSO | GIBCO-Invitrogen | S33102 | |
|---|
| Tris base | rpi | T60040-1000 | |
|---|
| Startery do amplifikacji genu Tor1a w Δ Myszy knock-in E-torsinA: | | | 5'-AGT, CTG, TGG, CTG, GCT, CCC, CC-3' (do przodu) i 5'-CCT, CAG, GCT, GCT, AC, AAC, CAC-3' (do tyłu) (odniesienie 18). Startery te zastosowano w końcowym stężeniu 1,0 ng/&mikro; l (~0,16 &mikro; M) (odniesienie 2). |
|---|
| Startery do amplifikacji genu Tfap2a u myszy | | | 5'-GAA AGG TGT AGG CAG AAG TTT GTC AGG GC-3' (do przodu), 5'-CGT GTG GCT GTT GTT GTT GCT GAG GTA-3' (do tyłu) dla amplikonu 498-bp, 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CTT TCG-3' (do przodu), 5'-AGA CAC TCG GGC TTT GGA GGA GAT CAT TC-3' (do tyłu) dla amplikonu 983-bp, oraz 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CTT TCG-3' (do przodu), 5'-ACA GTG TAG TAA GGC AAA GCA AGG AG-3' (do tyłu) dla amplikonu z 1990 r. Te podkłady są używane w temperaturze 0,5 &mikro;M. |
|---|
| ODCZYNNIKI - hodowla | | | |
|---|
| 5-Fluoro-2′-deoksyurydyna | Sigma-Aldrich | F0503-100MG | Zobacz sekcję komentarzy urydyny, aby uzyskać więcej informacji. |
|---|
| B-27 suplement | GIBCO-Invitrogen | 17504-044 | |
|---|
| Szalki do hodowli komórkowych 35 x 10 mm, kolby | 353001 | | poddane |
|---|
| tkankowych, T25, poddane działaniu kultur tkankowych, z nasadką z zatyczką, 25 cm2 Obszar wzrostu, 70 ml | BD falcon | 353082 | |
|---|
| Kolby do hodowli komórkowych, T75, poddane działaniu kultur tkankowych, z przechyloną szyjką, wentylowana nasadka, 75 cm2 Obszar wzrostu, 250 ml | | | BD falcon |
|---|
| polipropylen, 15 ml | | BD falcon | |
|---|
| Countess (licznik numerów komórek) | GIBCO-Invitrogen | C10312 | |
|---|
| Cytozyna β-D-Arabinofuranozyd chlorowodorek (chlorowodorek Ara-C) | Sigma-Aldrich | C6645-100mg | |
|---|
| D-(+)-glukoza (dekstroza) bezwodna, SigmaUltra, 99.5% (GC) | Sigma-Aldrich | G7528-250G | |
|---|
| Naczynie, szkło Petriego 100 x 15 mm | Pyrex | 3160-101 | |
|---|
| Woda destylowana | GIBCO-Invitrogen | 15230-147 | |
|---|
| DNaza Typ II | Sigma-Aldrich | D4527-200KU | Roztwór podstawowy przygotowuje się w stężeniu 1 500 jednostek/20 μ l = 75 000 jednostek/ml w wodzie destylowanej. |
|---|
| Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM), wysoka glukoza, GlutaMAX, pirogronian | GIBCO-Invitrogen | 10569-010, 500 ml | |
|---|
| Fast PES Filter Unit, 250 ml, membrana o średnicy 50 mm, 0,2 µ m Wielkość porów | Nalgene | 568-0020 | |
|---|
| Szybka jednostka filtrująca PES, 500 ml, membrana o średnicy 90 mm, 0,2 i mikro; m Wielkość porów | Nalgene | 569-0020 | |
|---|
| Płodowa surowica bydlęca (FBS) | GIBCO-Invitrogen | 26140-079 | |
|---|
| Szkiełko nakrywkowe, 12 mm Okrągłe, grubość 0,09– 0,12 mm, nr 0 | Carolina | 633017 | |
|---|
| GlutaMAX-I | GIBCO-Invitrogen | 35050-061 | |
|---|
| Sole zrównoważone Hanksa | Sigma-Aldrich | H2387-10X | |
|---|
| HEPES, ≥ 99,5% (miareczkowanie) | Sigma-Aldrich | H3375-250G | |
|---|
| Kwas solny, 37%, odczynnik A.C.S | . Sigma-Aldrich | 258148-100 ML | |
|---|
| Insulina | Sigma-Aldrich | I5500-250 mg | |
|---|
| Siarczan magnezu siedmiowodny, MgSO4•( 7H2O), BioUltra, ≥ 99,5% (Fluka) | Sigma-Aldrich | 63138-250G | |
|---|
| Matrigel Roztwór do membrany podstawnej, Phenol Red-Free | BD Biosciences | 356237 | Jest to materiał powłokowy do szkiełek nakrywkowych i kolb. 1) Aby go przygotować, rozmrozić roztwór Matrigel Basement Membrane Matrix na lodzie, co zwykle zajmuje ~1 dzień. Za pomocą wstępnie schłodzonej pipety rozprowadzić rozmrożony roztwór do wstępnie schłodzonych kolb T25 na lodzie i przechowywać kolby w temperaturze -20 °C. Aby przygotować roboczy roztwór Matrigel, należy rozmrozić podzielony Matrigel w kolbie na lodzie, rozcieńczyć 50-krotnie, dodając wstępnie schłodzony roztwór MEM i utrzymywać rozcieńczony roztwór w temperaturze 4 °C. Ważne jest, aby wstępnie schłodzić wszystkie kultury i podłoża, które mają kontakt z Matrigel, z wyjątkiem okresu powlekania szkiełek nakrywkowych i po ich powlekaniu, aby zapobiec przedwczesnemu tworzeniu się żelu. 2) Aby pokryć szklane szkiełka nakrywkowe lub kolby hodowlane preparatem Matrigel, należy nałożyć roztwór Matrigel na powierzchnię. Przed poszyciem komórek ważne jest, aby całkowicie wysuszyć powierzchnię. W tym celu pomocne może być zasysanie Matrigelu podczas wirowania komórkowego bezpośrednio przed posiewem komórek i pozostawienie wystarczającej ilości czasu na wyschnięcie. |
|---|
| Minimum Essential Medium (MEM) | GIBCO-Invitrogen | 51200-038 | |
|---|
| MITO+ Przedłużacz surowicy, 5 ml | BD Biosciences | 355006 | |
|---|
| Płytki wielodołkowe, 24-dołkowe płytki BD Falcon 353047 | | | |
|---|
| tkankowej, płytki 6-dołkowe poddane kulturze tkankowej | BD falcon | 353046 | |
|---|
| Neurobasal-A Medium (1X), płyn | GIBCO-Invitrogen | 10888-022 | |
|---|
| Kwas azotowy | VWR | bdh 3044 | |
|---|
| NS (suplement neuronalny) 21 | przygotowane w laboratorium | | Źródło: odniesienie 69 |
|---|
| Pipety Pasteura, 5 i frac34; ” | Fisher | 13-678-6A | Użyj tego bawełnianego wkładu 5 i frac34; ” Pipeta Pasteura do rozcierania komórkowego. Wcześniej wypoleruj końcówkę na gorąco, aby wygładzić powierzchnię cięcia i zmniejszyć średnicę wewnętrzną do 50-80% oryginału. Zbyt mała końcówka zakłóci pracę komórek i zmniejszy ich żywotność, ale zbyt duża końcówka zmniejszy skuteczność rozcierania. |
|---|
| Pipety Pasteura, 9" | Fisher | 13-678-6B | |
|---|
| Chlorek potasu (KCl), SigmaUltra, ≥ 99.0% | Sigma-Aldrich | P9333-500G | |
|---|
| Pipeta serologiczna, 2 ml | BD falcon | 357507 | |
|---|
| Pipeta serologiczna, 5 ml | Pipeta serologiczna 357543 | | |
|---|
| 10 ml | Pipeta sokol | 357551 | |
|---|
| Pipeta serologiczna, 25 ml | Pipeta sokoła 357525 | | |
|---|
| BD, 50 ml | BD falcon | 357550 | |
|---|
| Wodorowęglan sodu (NaHCO3, wodorowęglan sodu), SigmaUltra, ≥ 99,5% | Sigma-Aldrich | S6297-250G | |
|---|
| Chlorek sodu (NaCl), SigmaUltra, ≥ 99,5% | Sigma-Aldrich | S7653-250G | |
|---|
| Wodorotlenek sodu (NaOH), granulki, 99,998% metali śladowych na bazie | Sigma-Aldrich | 480878-250G | |
|---|
| Fosforan sodu dwuzasadowy siedmiowodny (Na2HPO4•( 7H2O)), ≥ 99,99%, Aldrich | Sigma-Aldrich | 431478-250G | |
|---|
| Sacharoza, SigmaUltra, ≥ 99,5% (GC) | Sigma-Aldrich | S7903-250G | |
|---|
| Filtr strzykawkowy, sterylny, 0,2 i mikro; m | 431219 | | Corning |
|---|
| , 3 ml | BD falcon | 309585 | |
|---|
| Transferyna, Holo, osocze bydlęce | Calbiochem | 616420 | |
|---|
| Barwienie błękitem trypanowym, 0,4% | GIBCO-Invitrogen | T10282 | Służy do liczenia żywych/martwych komórek. Wymień stary roztwór błękitu trypanowego, jeśli jest ponownie używany wiele razy (np. kilka razy w tygodniu przez kilka tygodni), ponieważ spowoduje on wytrącenie się osadów i spowoduje błędne odczyty gęstości komórkowej. |
|---|
| Trypsyna, typ XI | Sigma-Aldrich | T1005-5G | |
|---|
| Roztwór trypsyny-EDTA, 0,25% | GIBCO-Invitrogen | 25200-056 | |
|---|
| Uridine | Sigma-Aldrich | U3003-5G | Roztwór podstawowy przygotowuje się w 50 mg 5-fluoro-2'-deoksyurydyny i 125 mg urydyny w 25 ml DMEM (odpowiednio 8,12 i 20,48 mM). |
|---|
| ODCZYNNIKI - immunocytochemia | | | |
|---|
| Przeciwciało, królicze poliklonalne przeciwciało anty-MAP2 | Merck Millipore | AB5622 | |
|---|
| , mysi monoklonalny koktajl anty-GFAP | Merck Millipore | NE1015 | |
|---|
| SPRZĘT - tatuaż | | | |
|---|
| AIMS | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NEO– 9 | Ten system tatuażu noworodków gryzoni to system elektryczny, który działa poprzez szybkie przesuwanie 1- lub 3-punktowych igieł do tatuażu pionowo w głąb skóry. Aktywuj maszynkę do tatuażu raz na około 0,5 sekundy, podczas gdy końcówki igieł do tatuażu są trzymane prostopadle do powierzchni skóry. Preferujemy tatuowanie trzyigłowe, aby zmaksymalizować wytatuowany obszar, ale tatuowanie jednoigłowe jest skuteczne na węższych obszarach, np. palcach u nóg lub jeśli konieczna jest precyzyjna kontrola mechaniczna, np. gdy tatuowane są liczby. Dwie rundy tatuowania z najmniejszą prędkością (ustawienie "1" z 3 kroków) są zazwyczaj wystarczające, aby uzyskać widoczny i długotrwały tatuaż opuszków łap. |
|---|
| WYPOSAŻENIE - system do genotypowania | | | |
|---|
| Elektroforeza, poziomy, Wide Mini– Komórka podrzędna GT | BIO– RAD | 170– 4405 | Typowe parametry elektroforezy to natężenie pola elektrycznego o natężeniu 6 V/cm i czas trwania 25 minut dla żelu o długości 10 cm. |
|---|
| FluorChem 8800 | ProteinSimple | FluorChem 8800 | |
|---|
| PCR, MJ Mini Thermal Cycler | BIO-RAD | PTC-1148EDU | Nasze reakcje PCR dla genu Tor1a w Δ Myszy knock-in E-torsinA są następujące: 1 cykl denaturacji w 94 ° C przez 3 minuty, 35 cykli denaturacji w 94 ° C przez 30 sekund, wyżarzanie w temperaturze 58 ° C przez 30 sekund, przedłużenie na 72 i #176; C przez 2 min. Po tym następuje ostateczne rozszerzenie na 72 i #176; C przez 10 minut i trzymając w temperaturze 4 °C. |
|---|
| Zasilacz, PowerPac Basic | BIO-RAD | 164-5050 | |
|---|
| SPRZĘT - hodowle | | | |
|---|
| Automatyczny licznik komórek, Countess | GIBCO-Invitrogen | C10310 | Ten automatyczny licznik komórek oddzielnie mierzy gęstość żywych i martwych komórek (odpowiednio niebarwionych i barwionych błękitem trypanowym). Ważne jest, aby znać optymalny zakres pomiarów gęstości: licznik, którego używamy, ma najwyższą dokładność w zakresie od 1 x 105 do 4 x 106 komórek/ml. Jeśli zmierzone wartości gęstości komórek wykraczają poza zalecany zakres, należy odpowiednio wyregulować objętość ponownego zawieszenia. |
|---|
| Szafa bezpieczeństwa biologicznego, klasa II, typ A2 | NUAIRE | NU-425-400 | Ten kaptur jest używany do wszystkich procedur hodowli komórkowych, z wyjątkiem sekcji mózgu. |
|---|
| Inkubator CO2, AutoFlow, kontrola wilgotności Płaszcz wodny | NUAIRE | NU-4850 | |
|---|
| Pozioma czysta ławka | NUAIRE | NU-201-330 | Ta czysta ławka służy do sekcji mózgu (kroki 3.1.1 i 3.1.2 "Rozwarstwienie mózgu i dysocjacja komórkowa)". |
|---|
| Wytrząsarka wolnoobrotowa Orbit LS | Labnet | S2030-LS-B | |
|---|
| SORVALL RC-6 Plus Superspeed Wirówka | Fisher | 46910 (wirówka)/46922 (wirnik) | |
|---|