Wirus Zachodniego Nilu (WNV), neurotropowy, flawiwirus z plusem, stanowi nowe zagrożenie dla zdrowia publicznego. Obecnie żadna szczepionka nie została zatwierdzona do stosowania u ludzi1. Wiadomo, że atenuowany szczep WNV, który ma substytucję P38G w białku niestrukturalnym (NS)4B, nie indukuje śmiertelności u myszy, ale wyższe wrodzone cytokiny i odpowiedzi komórek T u myszy niż szczepWNV NY99 typu dzikiego 2. Myszy zaszczepione mutantem NS4B-P38G były chronione przed wtórnym wyzwaniem śmiertelnym dzikim WNV. Sugeruje to, że mutant NS4B-P38G ma odpowiednie cechy dla idealnego kandydata na szczepionkę. Mechanizmy, za pomocą których mutant NS4B-P38G indukuje wysoką ochronną odporność adaptacyjną, nie są jeszcze dokładnie poznane. Receptory toll-podobne (TLR), które rozpoznają wzorce molekularne związane z patogenem, odgrywają zasadniczą rolę w inicjacji wrodzonej odporności na infekcję wirusową. Rdzeń szlaku sygnałowego TLR wykorzystuje gen pierwotnej odpowiedzi szpiku 88 (MyD88) jako główny adaptor3,4. W niedawnym badaniu wykazano, że sygnalizacja MyD88 odgrywa ważną rolę w rozwoju odporności komórkowej podczas infekcji mutantem WNV NS4B-P38G u myszy5. Komórki dentrytyczne (DC) są jednymi z najważniejszych komórek prezentujących antygen, wykazującymi unikalną zdolność do inicjowania pierwotnych odpowiedzi limfocytów T podczas infekcji wirusowej6,7. Limfocyty T CD4 + i CD8 + przyczyniają się do długotrwałej odporności ochronnej i są ważne dla przetrwania gospodarza po zakażeniu WNV typu dzikiego8,9. W tym badaniu zastosowano dwa testy immunologiczne w celu oceny funkcji tych komórek u myszy zakażonych mutacją NS4B-P38G.
Po pierwsze, test in vitro na bazie limfocytów T został wykorzystany do porównania zdolności do prezentacji antygenu przez DC myszy typu dzikiego i MyD88−/− zakażonych WNV. Aby zwiększyć czułość testu, naiwne limfocyty T CD4 + wyizolowano od myszy transgenicznych OTII, które wyrażają TCR Vα2 / Vβ5 specyficzny dla peptydu albuminy jaja kurzego (OVA) 323 - 339. DC myszy zakażonych WNV oczyszczono i współhodowano z limfocytami T CD4 + znakowanymi karboksyfluoresceiną sukcynimidylem wielkanocnym (CFSE) w obecności peptydu OVA. Po 5 dniach kohodowli komórki zebrano i utrwalono za pomocą paraformaldehydu (PFA) i przeanalizowano za pomocą cytometrii przepływowej. Testy proliferacyjne tradycyjnie przeprowadza się poprzez włączenie 5-bromo-2'-deoksyurydyny (BrdU) lub trityowanego deoksyrybozydu tyminy (3HTdr)10. Niemniej jednak testy te są albo radioaktywne, albo wymagają specjalnego sprzętu w obiektach na poziomie bezpieczeństwa biologicznego (BL) 3, w których prowadzone są badania WNV. Analiza cytometryczna przepływowa proliferacji limfocytów poprzez seryjne zmniejszanie o połowę intensywności fluorescencji ważnego barwnika CFSE stała się częściej stosowana w testach immunologicznych, ponieważ barwnik jest bardziej stabilnie i równomiernie wprowadzany do komórek, łatwo wykrywany przez cytometrię przepływową i jest nieradioaktywny11. Test ma również możliwość oceny liczby podziałów komórkowych. Jedną z głównych zalet stosowania tego testu w badaniach WNV jest to, że utrwalenie zakażonych komórek za pomocą 1-2% PFA może dezaktywować WNV12, co umożliwi pobranie próbki za pomocą cytometru przepływowego w laboratorium BL2.
Następnie, zmodyfikowana procedura barwienia cytokin wewnątrzkomórkowych (ICS) została użyta do zbadania roli sygnalizacji MyD88 w regulacji odpowiedzi limfocytów T specyficznych dla WNV u myszy zakażonych mutacją NS4B-P38G. W tym teście splenocyty wyizolowane od zakażonych myszy traktowano in vitro peptydami specyficznymi dla WNV. Brefeldyna A została dodana w celu zatrzymania cytokin w komórce. Po 5 godzinach inkubacji komórki zebrano, umyto i wybarwiono pod kątem podzbiorów limfocytów T. Komórki następnie utrwalono w PFA, przeniknięto i wybarwiono pod kątem interferonu (IFN)-γ i przeanalizowano za pomocą cytometrii przepływowej. Podobnie jak w przypadku innych testów opartych na cytometrii przepływowej, po potraktowaniu komórek buforem utrwalającym i przepuszczalnym zawierającym PFA, zakażone próbki można przenieść do laboratorium BL2 w celu dalszego przetwarzania i analizy. W kilku opublikowanych badaniach użyliśmy ICS do pomiaru funkcji efektorów limfocytów T u myszy zakażonych WNV13,14. Chociaż jest to dobrze znane, jedną z głównych wad tego testu jest to, że procedura jest bardzo długa i może być bardziej czasochłonna, gdy jest wykonywana w obiektach BL3. W tym przypadku wykazano, że metoda ICS oparta na probówkach mikrowirówkowych jest bardziej wykonalna, łatwiejsza do przeprowadzenia i mniej czasochłonna, gdy jest wykonywana w laboratorium BL3.