$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Protokół opisuje podejścia do dostarczania barwników i materiałów genetycznych do dorosłych wycinków organotypowych przy użyciu ulepszonego pistoletu genowego. Zasadniczo rodzaje barwników i różnorodność możliwych genów sprawiają, że metoda ta jest wieloaspektowa i może odpowiedzieć na szeroki zakres pytań biologicznych. Zastosowana metoda regioselektywnego dostarczania, w tym przypadku do określonego regionu mózgu, otwiera nowe możliwości eksperymentów, ponieważ heterologiczna modulacja genów zlokalizowanych obszarów w biologicznie istotnej architekturze nie była wcześniej łatwo wykonalna. Wcześniej ustaliliśmy, że metoda ta może być stosowana na dorosłych wycinkach organotypowych, w których dojrzałe synapsy są w pełni uformowane, ponieważ wykazała poprawę przeżywalności komórek i ekspresję genów heterologicznych przez wiele tygodni13. Wraz z pojawieniem się nowych i ulepszonych warunków hodowli mózgów ssaków, a także innych tkanek, zastosowanie regioselektywnych modulacji genetycznych stanie się coraz bardziej przydatne w szerokiej gamie analiz biochemicznych.
Jak podkreślimy w tym miejscu i jak już wcześniej wspomnieliśmyw innych 24 przypadkach, na dokładność i wiarygodność dostarczania danych biologicznych może mieć wpływ wiele różnych czynników. Po pierwsze, przygotowanie cząstki złota związanej z barwnikami lub DNA musi być odpowiednio zrównoważone, aby zapobiec agregacji i ułatwić wydalenie ładunku z naboju. Wapń i spermidyna w roztworze mikrocząstek DNA-złoto mogą wspomagać wiązanie cząsteczek DNA z nanocząstkami złota. Wcześniej określono zdolność nanocząstek do przenikania do komórek pod zmniejszonym ciśnieniem17. Po drugie, pistolet genowy musi być zamontowany tak stabilnie, jak to możliwe, pod odpowiednim kątem i w odpowiedniej odległości. Niezawodny manometr jest również niezbędny do odtwarzalności, utrzymania integralności tkanek i prawidłowego przyspieszenia cząsteczek złota do zamierzonych celów. Rzeczywiście, odległość, orientacja i stabilność sprzętu są również kluczowymi czynnikami dla celowania i precyzji dostarczania regioselektywnego. Ponieważ te struktury mózgu są bardzo małe, niewielkie zmiany kąta zapłonu mogą łatwo sprawić, że cała procedura będzie mniej wiarygodna. I wreszcie, przygotowanie i utrzymanie żywotnych plastrów organotypowych było najeżone trudnościami przez wiele dziesięcioleci, ale obecnie dostępne są liczne i wiarygodne protokoły dla różnych zwierząt, regionów mózgu, wieku i kokultur2,4,25,26. Procedury te powinny być zoptymalizowane pod kątem użytkownika przed poddaniem tkanek procedurom biolistycznym. Pozwoli to użytkownikowi na łatwiejsze bezstronne ustalenie wpływu cząstek biolistycznych i wpływu genu heterologicznego na jego własne hodowle. W tym celu wykorzystanie genów fluorescencyjnych, takich jak EYFP i EGFP, może zarówno umożliwić nowemu użytkownikowi przetestowanie precyzji celowania, jak i śledzenie żywotności komórek poprzez heterologiczną ekspresję genów przez dłuższy czas13. Wiele kluczowych kroków dla niezawodnego i powtarzalnego korzystania z tego protokołu zostało podkreślonych w poniższych trzech akapitach.
Aby transfekcja była skuteczna, stężenie DNA musi być odpowiednie. Zbyt niskie stężenia mogą utrudnić wydajność transfekcji, podczas gdy zbyt wysokie stężenia mogą powodować aglomerację nanocząstek. Agregaty złota mogą drastycznie zmniejszyć wydajność transfekcji, powodować nierównomierne rozkłady i mogą prowadzić do zwiększonej cytotoksyczności i stresu oksydacyjnego. Problemy z wydajnością powlekania są prawdopodobnie spowodowane wygaśnięciem roztworu spermidyny (należy go wymieniać co 2 do 3 miesięcy). Aby uzyskać odpowiedni rozkład biolistyczny, etykietowanie musi być równe. Niejednorodne znakowanie zawiesiny nanocząstki złota/DNA może być spowodowane roztworem PVP. Należy go również wymieniać co 2 do 3 miesięcy. Powlekanie nanocząstek złota można zaobserwować na elektroforezie w żelu agarozowym jako wyższe pasmo MW27.
Każdy badany system biologiczny, jak również każdy inny używany instrument, może wymagać niewielkich zmian ciśnienia gazu, aby osiągnąć zoptymalizowane poziomy transfekcji i rozprzestrzeniania się biologicznego. Krytycznym parametrem jest ciśnienie impulsu helu wymagane do usunięcia mikro- lub nanonośników z plastikowego wkładu i wprowadzenia ich do tkanki. Wysokie ciśnienie gazu wpłynie na przeżycie komórki, ponieważ wytworzy fale uderzeniowe w poprzek celu i przerwie lub oderwie tkankę od matrycy17. Wycelowanie w lufę pistoletu genowego i ustawienie aparatu dokładnie prostopadle do tkanki jest ważne dla dokładnego dostarczania biolistycznego. Wybrany obszar należy umieścić w bezpośrednim środku lufy, dokładnie w odległości 10 mm od zewnętrznego otworu. Powoduje to dostarczanie cząsteczek złota o średnicy 3 mm wokół epicentrum. Lufa pistoletu genowego powinna być czyszczona 70% etanolem po każdym użyciu. Aby chronić tkankę przed dużymi agregatami cząstek, lufa zawiera również nylonową siatkę, którą należy regularnie wymieniać, aby utrzymać optymalną wydajność. W celu wymiany siatki odkręć nakrętkę, a następnie włóż nową nylonową siatkę między nasadkę a O-ring.
Komórki znakowane fluorescencyjnie powinny być widoczne co najmniej 1 - 2 dni po transfekcji wokół epicentrum. Brak lub niewspółosiowość znakowania może wynikać z nieodpowiedniego przygotowania i niestabilności mocowania pistoletu genowego. Obserwacje komórek za pomocą mikroskopii konfokalnej zależą od wielu czynników: długości fali światła wzbudzenia/emisji, wielkości otworka, NA soczewki obiektywu, współczynnika załamania światła składowych na drodze światła, głębokości tkanki i ustawienia instrumentu. Czynniki te powinny być zoptymalizowane dla każdego badanego systemu.
Niedawne postępy w dziedzinie biolistyki zostały wykorzystane do sukcesu tej metody. Lufa pistoletu genowego użyta w tym badaniu została zmodyfikowana w celu zmniejszenia niezbędnego ciśnienia, a także skierowania biolistycznego wzoru rozproszenia do bardziej ograniczonego i specyficznego obszaru17,19. Inne modyfikacje lufy próbowały ograniczyć rozprzestrzenianie się broni biologicznej i zmniejszyć ciśnienie odpływu28, ale ta specjalnie zaprojektowana lufa pistoletu genowego zaprojektowana przez dr O'Briena jest pojedynczym elementem zamontowanym w standardowym pistolecie Helios Gene. Następnie submikrometrowe cząstki złota zostały użyte w celu zmniejszenia inwazyjności cząstek mikrometrowych, które, jak wcześniej ustaliliśmy, powodowały uszkodzenie komórek i ostatecznie utratę trwałej heterologicznej ekspresji genów. Te zmiany w procedurze biolistycznej poprawiły ogólną wykonalność i odtwarzalność metody13. Inne ulepszenia w przygotowywaniu plastrów, takie jak dogłębne rozwiązywanie problemów z procedurą krojenia, użycie matrycy DMEM-Agaroza w celu zachowania mózgu oraz wiele innych przydatnych postępów w organotypowym przygotowywaniu wycinków mózgu, o których wcześniej informowano13, umożliwiły nam zbadanie zastosowania dorosłych plastrów, które rozwinęły dojrzałe sieci synaptyczne.
W naszym badaniu wykorzystaliśmy głównie barwniki i fluorescencyjne geny heterologiczne do wizualizacji morfologii komórek jako odczytu wydajności transfekcji i zdolności do obrazowania cech morfologicznych neuronów w tkankach mózgowych myszy. Stosunek sygnału do szumu dostawy stochastycznej w określonym promieniu pozwolił nam całkowicie wyizolować port dentrytyczny pojedynczej komórki w jej naturalnym kontekście. Ze względu na to, że podejmowane są liczne wysiłki w celu zbadania tych cech morfologicznych, mapowania "konektomiki" lub oznaczania pojedynczych komórek do różnych analiz, metodę tę można łatwo połączyć z istniejącymi protokołami, takimi jak elektrofizjologia i pomiary neurytów29,30. Oczywiście, kombinacje fluorescencyjnych genów heterologicznych mogą umożliwić znacznie dokładniejsze wyznaczenie pojedynczych komórek jako stochastycznego rozkładu białek fluorescencyjnych, a ich kombinacja określiłaby kolor poszczególnych komórek31,32. Zastosowanie specyficznych dla komórek promotorów, takich jak synapsyna i białko kwasu fibrylarnego glejowego przed heterologicznym eksonem genu, może również ograniczyć ekspresję do subpopulacji33. Rzeczywiście, nieskończona różnorodność materiału genetycznego może być również dostarczana w sposób regioselektywny przez nanocząstki złota przy użyciu tej samej procedury. Całkowite transfekowane regiony można zatem analizować tradycyjnymi metodami, takimi jak rozbiór i poddanie tego regionu zachodniemu immunoblottingowi w celu przeanalizowania zlokalizowanego efektu genu heterologicznego.
Udoskonalenia w procedurach organotypowego plastrowania umożliwią również szersze wykorzystanie tkanek mózgowych do długoterminowych eksperymentów, a także umożliwią wykorzystanie innych tkanek i kokultur oraz ułatwią procedury transfekcji. Wcześniej donoszono, że transfekcja lipidów i polimerów wpływa na homeostazę błony, internalizację, przepuszczalność białek34 i często wykazuje bardzo niską skuteczność transfekcji końcowo zróżnicowanych neuronów. Celowanie w ładunek specyficzny dla komórki jest również podatne tylko na komórki, które wyrażają receptory powierzchniowe komórki potrzebne do internalizacji, i chociaż ta metoda może być wysoce selektywna, może nie mieć ukierunkowanej regioselektywności35. Poza tym wektory wirusowe są często trudne i kosztowne do wyprodukowania, wymagają rygorystycznych przepisów i czasami wykazują obawy dotyczące bezpieczeństwa. Dostarczanie biolistyczne ma zatem niezrównaną zdolność do regioselektywnej transfekcji neuronów i innych typów komórek w żywotnych tkankach. Ponieważ złoto jest nietoksyczne, dalsze postępy w stosowaniu biolistyki mogą utorować drogę do zastosowań biomedycznych, takich jak transdermalne dostarczanie farmaceutyków, nieinwazyjne dostarczanie genów in vivo , a także zlokalizowane niewirusowe terapie genowe.