W ostatnich latach stało się coraz bardziej oczywiste, że mikrośrodowisko mechaniczne, oprócz czynników biochemicznych, odgrywa ważną rolę w regulacji funkcjonalności komórek. Komórki mogą wyczuwać i reagować na sztywność podłoża, do którego są przylegają (jak w hodowli 2D) lub są otoczone (jak w hodowli 3D) 3-7. W ten sposób komórki mogą modulować swoje różnicowanie3, morfologię4, migrację/ruchliwość5, właściwości biofizyczne6, wzrost7 i inne procesy.
Komórki nowotworowe również reagują na sztywność matrycy 2D i 3D za pomocą skoordynowanej, hierarchicznej mechanochemicznej kombinacji receptorów adhezyjnych i związanych z nimi białek błonowych transdukcji sygnału, architektury cytoszkieletu i silników molekularnych1, 2. Na przykład komórki nabłonka sutka (MEC) tworzą normalną miąższ groniasty, gdy są hodowane na substratach 150 Pa, co jest podobne do sztywności zdrowej tkanki sutka. Co ciekawe, wykazują one cechy rozwijającego się guza, zarówno strukturalne, jak i transkrypcyjne, gdy są hodowane na sztywniejszych podłożach (> 5000 Pa), które naśladują sztywność zrębu guza8. Ponadto inny eksperyment pokazuje, że nowotworowi piersi towarzyszy sieciowanie kolagenu i usztywnienie ECM9. Ostatnie eksperymenty pokazują, że ludzkie komórki raka jelita grubego (HCT-8) wykazują przerzuty, takie jak fenotyp (MLP), gdy są hodowane na substratach 2D o fizjologicznie istotnej sztywności (20-47 kPa), ale nie na bardzo sztywnych (3,6 GPa) substratach10-12. Komórki te najpierw tworzą skupiska komórek przypominające nowotwór, a następnie dysocjują od siebie, zaczynając od peryferii. Gdy zachodzi ta zmiana morfologiczna nabłonkowa do zaokrąglonej (przejście E do R), proliferują się, zmniejszają adhezję komórka-komórka i komórka-ECM i stają się migrujące. Komórki HCT-8 hodowane na bardzo twardych podłożach polistyrenowych nie wykazują tych złośliwych cech. W związku z tym wysunięto hipotezę, że komórki HCT-8 stają się przerzutowe pod wpływem odpowiedniego mikrośrodowiska. Warto zauważyć, że eksperymenty te są przeprowadzane na unieśmiertelnionych liniach komórek rakowych lub komórkach pierwotnych pochodzących z myszy, a nie na pierwotnych ludzkich komórkach rakowych.
Niedawne badanie sugeruje, że zwiększony stres trakcyjny komórkowy może być wykorzystany jako potencjalna biofizyczna sygnatura dla komórek przerzutowych13. Badanie polega na pomiarze siły pociągowej dla różnych linii komórek nowotworowych u ludzi na żelach poliakrylamidowych. Stwierdzono, że przerzutowe komórki rakowe mogą wywierać znacznie większy stres trakcyjny w porównaniu z komórkami bez przerzutów we wszystkich przypadkach13. Jednak wyniki te są bezpośrednio sprzeczne z wcześniej opublikowanymi odkryciami dotyczącymi linii komórkowych raka piersi pochodzących z myszy14. Ponadto niedawne badanie podkreśla niezwykłe różnice między unieśmiertelnionymi i pierwotnymi komórkami ludzkimi w ich profilowaniu białek przebudowy cytoszkieletu i ekspresji białek przetrwania komórek15. Dlatego ważne jest, aby ponownie przyjrzeć się wielu testom biofizycznym, w tym trakcji dla pierwotnych ludzkich komórek rakowych. To odpowie na pytanie, czy komórki pierwotne podsumowują unieśmiertelniony trend trakcji linii komórek rakowych.
Opisany tutaj protokół jest zoptymalizowany do izolacji pierwotnych komórek ludzkiego jelita grubego (zarówno zdrowych, jak i nowotworowych) oraz do hodowli ich na miękkich podłożach (hydrożele poliakrylamidowe), jak również na szalkach Petriego. Protokół opiera się na trawieniu, a następnie enzymatycznej dysocjacji próbki tkanki chirurgicznej na zawiesinę pojedynczej komórki16. Według naszej wiedzy jest to pierwsza demonstracja hodowli izolowanego pierwotnego guza jelita grubego i normalnych komórek bezpośrednio na miękkich podłożach hydrożelowych z osadzonymi mikrogranulkami fluorescencyjnymi do cytometrii trakcyjnej. Przezroczyste podłoża żelowe umożliwiają również barwienie immunologiczne. Test ten ujawnił różnice w organizacji F-aktyny i ogniskowych adhezjach w pierwotnych ludzkich komórkach okrężnicy w miarę zmian sztywności substratu. Ta platforma hodowli komórkowych otwiera możliwość zbadania różnych właściwości biofizycznych pierwotnych komórek ludzkich, takich jak sztywność komórek i trakcja, jako parametrów prognostyki raka.