Enzymatyczne biosensory mikroelektrodowe (również określane jako czujniki w niniejszym manuskrypcie) były cennym narzędziem do badania dynamicznych procesów sygnalizacyjnych w żywych komórkach i tkankach. Czujniki zapewniają zwiększoną rozdzielczość czasową i przestrzenną komórkowych cząsteczek sygnalizacyjnych w biologicznie istotnych stężeniach. Zamiast pobierać próbki i analizować płyny pozakomórkowe pobierane w odstępach czasu przez długi czas, czujniki te reagują tak szybko, jak ich enzymy reagują na analit, zapewniając w ten sposób pomiary w czasie rzeczywistym1,2. Szybkie wykrywanie śródmiąższowych stężeń czynników autokrynnych i parakrynnych, takich jak puryny lub nadtlenek wodoru, oraz dynamika ich uwalniania mogą być wykorzystane do ustalenia profilu działania leków w warunkach normalnych i patologicznych 3. Obecnie większość zastosowań wykorzystujących czujniki dotyczy wycinków tkanki mózgowej i kultur komórkowych4-10. Protokoły szczegółowo opisane w tym manuskrypcie mają na celu ustalenie środków do dokładnego pomiaru stężeń analitów w czasie rzeczywistym w całych nerkach.
Następujące protokoły zostały opracowane do badania śródmiąższowej sygnalizacji ATP i H2O2 w nerkach. W natywnym środowisku nerek zewnątrzkomórkowe ATP jest szybko katabolizowane przez endogenne ektonukleotydazy do swoich pochodnych (ADP, AMP i adenozyny). Zastosowane tutaj czujniki są wysoce selektywne w stosunku do ATP w stosunku do innych puryn lub produktów degradacji ATP11. Jest to ogromna zaleta, ponieważ umożliwia dokładne monitorowanie stałych i dynamicznych stężeń uwalniania ATP oraz jego funkcji sygnalizacyjnej. Śródmiąższowe stężenie ATP mierzy się za pomocą kombinacji dwóch mikroelektrod, czujnika ATP i czujnika Null. Czujnik Null w połączeniu z aplikacjami katalazy jest w stanie wykryć śródmiąższowe stężeniaH2O2 12. W poniższych protokołach zastosowano dwie różne konstrukcje czujników, które mają charakterystykę optymalną dla zastosowań ex vivo lub in vivo.
Oba projekty opierają się na sekwencyjnej reakcji katalitycznej kinazy glicerolowej i oksydazy glicero-3-fosforanowej zawartych w warstwie enzymatycznej czujnika i są napędzane przez obecność ATP. W zestawie czujników stosowanych w badaniach ex vivo,H2O2, końcowy produkt reakcji enzymatycznej, jest wykrywany przez utlenianie na elektrodzie drutowej platynowo-irydowej (Pt-Ir). Czujniki do badań in vivo opierają się natomiast na redukcjiH2O2na złotej elektrodzie pokrytej mediatorem, przeznaczonej do tkanek perfundowanych krwią. Na rysunku 1 przedstawiono schemat obu protokołów opisanych w tym manuskrypcie. Czujnik Null jest identyczny z odpowiadającym mu czujnikiem ATP, z wyjątkiem tego, że nie ma związanych enzymów. Dlatego oprócz wykrywaniaH2O2 za pomocą enzymu katalazy, czujnik Null mierzy zakłócenia niespecyficzne. Stężenia ATP oblicza się, odejmując od sygnału czujnika ATP wykryte zakłócenia niespecyficzne Null i tłoH2O2. Na rynku dostępnych jest również kilka czujników do wykrywania innych analitów, w tym adenozyny, jonozyny, hipoksantyny, acetylocholiny, choliny, glutaminianu, glukozy, mleczanu, d-seryny do zastosowań ex vivo lub adenozyny, jonozyny i hipoksantyny do in vivo w połączeniu z odpowiednim czujnikiem Null.
Zdolność czujnika do dokładnego wykrywania analitów zależy od prawidłowych kalibracji wstępnych i końcowych13. Gwarantuje to, że analiza uwzględnia dryft czułości czujnika, który występuje podczas stosowania w tkankach biologicznych. W czujniku znajduje się zapas glicerolu, który jest używany jako odczynnik w reakcjach enzymatycznych czujnika. Jeśli czujnik nie jest używany w roztworach do kąpieli zawierających glicerol, z czasem zostanie wypłukany. Krótsze czasy nagrywania są wtedy konieczne, aby zminimalizować dryft czujnika. Ponadto zanieczyszczenie czujników przez endogenne proteazy i fragmenty białek może znacznie zmniejszyć czułość czujników14.
Niniejszy manuskrypt ustanawia użycie enzymatycznych biosensorów mikroelektrodowych do preparatów nerek ex vivo i in vivo. Kwantyfikacja analitów w czasie rzeczywistym dostarcza bezprecedensowych szczegółów sygnalizacji komórkowej, które mogą ujawnić nowe informacje na temat mechanizmów chorób nerek i czynników farmakologicznych.