$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Oświadczenie etyczne: Badanie zostało przeprowadzone zgodnie z międzynarodowymi wytycznymi i zatwierdzone przez Instytucjonalny Komitet ds. Opieki i Użytkowania Zwierząt (IACUC) Narodowego Uniwersytetu Chiayi, ID zatwierdzenia: 99022. Wykorzystanie próbki waleni zostało dopuszczone przez Radę Rolnictwa Tajwanu (zezwolenie na badania 100M-02.1-C-99).
1. Przygotowanie próbki mięśni i SDS-PAGE
Uwaga: W tym badaniu wykorzystano próbki mięśni od 23 gatunków, w tym 16 gatunków ssaków morskich, 5 gatunków ssaków lądowych, tuńczyka i kurczaka (Tabela 1). Próbki mięśni waleni pobrano od wyrzuconych na brzeg osobników, przyłowu ryb i konfiskaty. Tkanki mięśniowe królików, szczurów, psów i kurczaków uzyskano z Centrum Diagnostyki Chorób Zwierząt Narodowego Uniwersytetu Chiayi. Próbki wołowiny, wieprzowiny, jagnięciny i tuńczyka zakupiono w lokalnym supermarkecie. Próbka mięśni foki pospolitej (Phoca vitulina) została dostarczona przez Farglory Ocean Park. Elektroforezę w żelu poliakryloamidowym z dodecylosiarczanem sodu (SDS-PAGE) zastosowano do oddzielenia rozpuszczalnych białek o różnej masie cząsteczkowej w próbkach mięśniowych.
- Przechowywać wszystkie próbki w temperaturze -20 °C do czasu użycia.
- Zaprawa należy wstępnie schłodzić w temperaturze -20 °C. Następnie włóż do niego 3 g zamrożonej próbki mięśni.
- Homogenizować próbkę z 10 ml chłodnego roztworu soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) za pomocą homogenizatora tkankowego.
- Odwirować homogenizowaną próbkę o masie 10 000 x g przez 10 minut w temperaturze 4 °C. Zebrać supernatanty i przechowywać je w temperaturze -20 °C do momentu użycia.
- Przygotować 5 ml 5% żelu do układania w stosy (3,07 ml wody destylowanej, 1,25 ml 4 x górny bufor żelowy o pH 6,8, 625 μl 40% akrylamidu, 50 μl 10% nadsiarczanu amonu (APS) i 5 μl tetrametyloetylenodiaminy (TEMED)) i 10 ml 15 % żelu rozdzielającego (3,65 ml wody destylowanej, 2,5 ml 4 x dolny bufor żelowy o pH 8,8, 3,75 ml 40% akrylamidu, 100 μl 10% APS i 4 μl TEMED).
- W komorze elektroforetycznej wlać żel do układania w stos (5% akrylamidu) na żel separujący (15% akrylamidu) po jego zestaleniu. Włóż grzebień żelowy do żelu do układania.
- Wykonaj PAGE zgodnie z następującymi warunkami: początkowy stan pracy: 100 V, 20 min i stan końcowy: 120 V, 40 min.
- Zabarwić żel kolorem Coomassie brilliant blue w temperaturze pokojowej przez 30 minut, aż żel uzyska jednolicie niebieski kolor.
Uwaga: Barwienie jest zakończone, gdy żel nie jest już widoczny w roztworze barwnika.
- Odbarwić go roztworem kwasu octowego (10%) w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę. Zaczną pojawiać się pasma. Kontynuować odbarwianie w temperaturze 4 °C przez noc, aż tło będzie czyste.
2. Synteza peptydów i produkcja przeciwciał monoklonalnych
- Pobierz sekwencje aminokwasów Mb z GenBank, w tym tuńczyka, kurczaka, strusia, ssaków domowych, fok i 18 gatunków waleni (tabela 2).
- Dopasuj sekwencje za pomocą odpowiedniego oprogramowania16:
- Uruchom Eksploratora wyrównania, wybierając opcję Wyrównaj: Edytuj/Buduj wyrównanie na pasku uruchamiania; wybierz opcję Utwórz nową linię trasowania i kliknij przycisk OK. Pojawi się okno dialogowe z pytaniem "Czy budujesz wyrównanie sekwencji DNA lub białka?"
- Kliknij przycisk oznaczony "Białko"; wybierz Dane: Otwórz: Pobierz sekwencje z pliku i wybierz plik sekwencji; wybierz polecenie menu Edytuj: Wybierz wszystko, aby wybrać wszystkie miejsca dla każdej sekwencji w zestawie danych w celu utworzenia wyrównania wielu sekwencji.
- Wybierz Wyrównanie: Wyrównaj według ClustalW z menu głównego, aby wyrównać wybrane dane sekwencji za pomocą algorytmu ClustalW; wybierz "BLOSUM" jako macierz masy białka, a następnie kliknij przycisk OK.
- Przeanalizuj wyrównanie sekwencji:
- Skoncentruj się na 5 antygenowych miejscachreaktywnych 17: stanowisku 1 (AKVEADVA, 15-22), miejscu 2 (KASEDLK, 56-62), miejscu 3 (ATKHKI, 94-99), miejscu 4 (HVLHSRH, 113-119) i miejscu 5 (KYKELGY, 145-151) i znajdź fragment zachowany wśród waleni. * (gwiazdka; symbol konsensusu w wyrównaniu (Protokół 2.2.3)) oznacza pozycje, które mają pojedynczą, w pełni zachowaną pozostałość. U waleni znaleziono następujące konserwatywne fragmenty: sekwencję KASEDLKKHG (obejmującą stanowisko 2) i sekwencję HVLHSRHP (obejmującą stanowisko 4).
- Zsyntetyzuj fragmenty sekwencji kandydującej zgodnie z analizą sekwencji i sprzęgnij z białkiem albuminy jaja kurzego (OVA) jako białkiem nośnikowym przy użyciu usług komercyjnych.
- Dodaj aminokwasy hydrofobowe (np. metioninę) do N-końca antygenowego miejsca reaktywnego, aby zapobiec rozkładowi peptydu (np. M-KASEDLKKHG).
- Wydłuż C-koniec antygenowego miejsca reaktywnego w celu wystawienia rdzenia miejsca antygenowego na działanie immunocytów. Ponadto sprzęgnij peptyd z OVA, dodając cysteinę (Cys, C) do C-końca (np. M-KASEDLKKHG-NTVL-C).
- Emulgować kompletny adiuwant Freunda dla immunogenu 1 lub niekompletny adiuwant Freunda dla immunogenu 2 z równą objętością każdego syntetycznego peptydu w PBS (3 ml, stężenie końcowe 30-50 μg/100 μl).
- Zaszczepić immunogen 1 (0,1 mg) podskórnie każdej z 5 samic myszy BALB/c.
- Wykonaj podskórne wstrzyknięcia przypominające pięć razy przy użyciu immunogenu 2 w odstępach dwutygodniowych i pobierz surowice testowe za pomocą klipsa do ogona od myszy przed każdą dawką przypominającą.
- Określić miano surowicy dla pierwszego badania przesiewowego.
- Rozpuścić 100 μg wolnego peptydu w 25 ml buforu reakcyjnego i podwielokrotność 50 μl roztworu w każdym dołku 96-dołkowej płytki. Dodać 10 μl roztworu odczynnika sprzęgającego do każdej studzienki i wymieszać płytkę. Inkubować płytkę przez 2 godziny w temperaturze pokojowej.
- Usuń zawartość studzienki, umyj każdą studzienkę 3 razy wodą destylowaną i zablokuj płytkę, dodając 200 μl roztworu blokującego. Inkubować przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej. Usuń zawartość i umyj każdą studzienkę 3 razy wodą destylowaną.
- Wykonać pośredni test ELISA (protokół 5.1-5.7) w celu określenia miana surowicy dla pierwszego badania przesiewowego. Wybierz mysz o najwyższym mianie (najwyższej gęstości optycznej) do pobierania śledziony.
- Trzy dni przed pobraniem śledziony należy wstrzyknąć podskórnie 0,1 mg immunogenu 1 myszy o najwyższym mianie.
- Zbierz komórki śledziony od wybranych immunizowanych myszy i połącz je z komórkami szpiczaka mysiego F0 (sp2/0-Ag14), aby uzyskać komórki hybrydoma dla generacjimAb 18.
- 14 dni po fuzji wybierz dodatnie klony, badając reaktywność supernatantów hybrydoma w kierunku wolnego syntetycznego peptydu za pomocą pośredniego testu ELISA (protokół 5.1-5.7).
- Rozcieńczyć komórki do odpowiedniej liczby na studzienkę, aby zmaksymalizować proporcję studzienek, które zawierają tylko jeden pojedynczy klon (klonowanie przez rozcieńczenie).
- Dodać 100 μl pożywki do hodowli komórkowych do wszystkich studzienek na płytce 96-dołkowej, z wyjątkiem basenika A1, który pozostaje pusty.
- Dodać 200 μl zawiesiny komórek do dołka A1. Następnie szybko przenieś 100 μl z punktu A1 do punktu B1 i delikatnie wymieszaj, pipetując. Powtórzyć te rozcieńczenia 1:2 w dół całej kolumny, a następnie odrzucić 100 μl z H1, tak aby uzyskać taką samą objętość, jak studzienki nad nią.
- Dodać dodatkowe 100 μl pożywki do kolumny 1 za pomocą 8-kanałowej mikropipety. Następnie szybko przenieść 100 μl z każdej ze studzienek w kolumnie 1 do studzienek w kolumnie 2 za pomocą tej samej pipety i wymieszać, delikatnie pipetując.
- Używając tych samych końcówek, powtórz te rozcieńczenia 1:2 na całej płytce. Odrzucić 100 μl z każdej ze studzienek w ostatniej kolumnie.
- Doprowadzić końcową objętość wszystkich studzienek do 200 μl, dodając 100 μl pożywki do każdej studzienki. Inkubować płytkę w stanie niezakłóconym w temperaturze 37 °C w wilgotnym inkubatorze CO2 .
- Sprawdź każdą studzienkę i zaznacz wszystkie studzienki, które zawierają tylko jedną kolonię. Przeprowadzić dwa lub więcej klonów, aż >90% studzienek zawierających pojedyncze klony będzie dodatnich pod względem produkcji przeciwciał.
- Przesiewaj klony za pomocą western blot i dot blot (protokół 3.1-4.6). Następnie subkulturuj kolonie ze studni do większych naczyń, aby rozszerzyć komórki w celu uzyskania mAb. Zwykle każdy klon jest przenoszony do pojedynczego dołka na płytce 12- lub 24-dołkowej.
- Zmierz powinowactwo między mAb a ekstraktami mięśniowymi z krów, kóz, świń, psów, królików, tuńczyków, kurczaków, fok i czterech reprezentatywnych gatunków waleni za pomocą western blot i dot blot (protokół 3.1-4.6).
- Zaszczepić wybrane komórki hybrydoma (do 3 x 106) dootrzewnowo myszom w celu wywołania wodobrzusza. Obrzęk brzucha jest zwykle widoczny w ciągu 7-10 dni po wstrzyknięciu hybrydomy. Zebrać płyn za pomocą igły podskórnej (mniej niż 20 g).
- Wirówka wodobrzusza płyn (10 000 x g przez 10 min) w celu usunięcia komórek i zanieczyszczeń. Przefiltruj przez filtr 0,45 μm. Dodać 1 do 20 ml próbki, 15 ml buforu wiążącego i 3-5 ml buforu elucyjnego do kolumny białka G Sepharose. Zbierz frakcję elucyjną zawierającą oczyszczone przeciwciało z płynu wodobrzusza myszy.
- Określ izotyp przeciwciała za pomocą zestawu do izotypowania przeciwciał, korzystając z instrukcji producenta.
3. Western Blot
- Przygotować 2x bufor ładujący zawierający β-merkaptoetanol (BME) przez zmieszanie 950 μl 2x buforu próbki Laemmli z 50 μl BME. Rozcieńczyć supernatanty mięśniowe (protokół 1.1-1.4) w buforze ładującym w odpowiednim stosunku do uzyskania dobrych sygnałów: 1:50 (i foka) i 1:5 (zwierzęta domowe i tuńczyk) w przypadku stosowania poliklonalnego królika przeciwko ludzkiemu przeciwciału Mb oraz 1:1 (świnia, królik, kurczak i tuńczyk), 1:5 (krowa, koza i pies) i 1:25 (i foka), gdy przeciwciało pochodzi z supernatantu hybrydoma.
- Podgrzewać próbkę w temperaturze 95 °C przez 5 minut. Próbki należy załadować do studzienek z żelem SDS-PAGE (4% akryloamidu w stosy i 12% w oddzieleniu akrylamidu) wraz ze znacznikami masy cząsteczkowej. Uruchom żel na 5 minut przy 50 V, a następnie zwiększ napięcie do 150 V, aby zakończyć pracę w około 1 godzinę.
- Umieść żel w 1x buforze transferowym na 15 minut. Przenieś oddzielone białko do membran nitrocelulozowych (NC) po ich rozdzieleniu przez PAGE. Transfer może odbywać się przy napięciu 100 V przez 60-90 min.
- Przygotuj roztwór blokujący: 1x PBS zawierający 0,1% Tween 20 z 5% odtłuszczonego mleka w proszku. Zablokować membranę NC w 25 ml roztworu blokującego w temperaturze pokojowej na 1 godzinę. Przemyć trzy razy przez 5 minut każdy 15 ml soli fizjologicznej buforowanej fosforanami za pomocą Tween 20 (PBST).
- Inkubować błonę i przeciwciało pierwszorzędowe (płyn wodobrzuszny lub supernatant hybrydoma) w 10 ml buforu do rozcieńczania przeciwciał rozcieńczonym 5% roztworem blokującym w temperaturze 4 °C przez noc.
- Ponownie przemyć membranę trzy razy PBST, aby usunąć nadmiar przeciwciał.
- Inkubować błonę z kozią anty-mysią IgG sprzężoną z fosfatazą alkaliczną w stosunku 1:1,250 w roztworze blokera z delikatnym mieszaniem przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
- Ponownie umyć membranę i inkubować ją w mieszaninie substratu fosfatazy 5-bromo-4-chloro-3-indolilowo-fosforanowej/p-nitroniebieskiego chlorku tetrazolu (BCIP/NBT) przez 10 do 20 minut, aż do uzyskania koloru.
- Zatrzymaj reakcję, myjąc membranę w kilku zmianach wody destylowanej.
4. Plama punktowa
- Rozcieńczyć supernatanty mięśniowe (protokół 1.1-1.4) w 5% albuminie surowicy bydlęcej (BSA) w PBST w odpowiednim stosunku dla uzyskania dobrych sygnałów: 1:5 dla zwierząt domowych i tuńczyka oraz 1:25 dla waleni i fok. Umieścić 5 μl próbek na membranie. Zminimalizuj obszar, w który wnika roztwór (zwykle o średnicy 3-4 mm), nakładając go powoli.
- Wysuszyć membranę w temperaturze pokojowej (np. w przepływie laminarnym przez 30-60 minut), zablokować ją roztworem blokującym na szalce Petriego na 1 godzinę w temperaturze pokojowej i przemyć PBST.
- Inkubować błonę z pierwszorzędowym przeciwciałem (mAb z supernatantu hybrydoma w stosunku 1:10 000 lub płyn wodobrzuszny w stosunku 1:100 000 rozcieńczony w 5% roztworze blokującym) przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
- Użyj PBST do trzykrotnego przemycia membrany przez 5 minut w celu usunięcia nadmiaru przeciwciała, a następnie inkubuj ją z przeciwciałem drugorzędowym (kozia anty-mysia IgG sprzężona z fosfatazą alkaliczną w stosunku 1:1,250 w 5% roztworze blokującym) przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
- Ponownie umyć membranę i inkubować ją w mieszaninie substratu fosfatazy BCIP/NBT w ciągu 10 do 20 minut, aż do uzyskania koloru.
- Zatrzymaj reakcję, myjąc membranę w kilku zmianach wody destylowanej.
5. Pośredni ELISA
- Przygotować bufor do przemywania (0,002 M soli fizjologicznej buforowanej imidazolem z 0,02% Tween 20). Umyj płytkę 3 razy buforem myjącym między każdym kolejnym krokiem (protokół 5.2-5.5).
- Przygotować rozcieńczenie supernatantów mięśniowych w stosunku 1:25 (protokół 1.1-1.4) w buforze powlekającym. Pokryć 96-dołkową płytkę ELISA 100 μl rozcieńczonymi supernatantami w temperaturze 4 °C przez noc i zablokować ją buforem blokującym (1% BSA w PBS) przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
- Przygotować rozcieńczenie oczyszczonego mAb w stosunku 1:2,000 z rozcieńczonym buforem i dodać 100 μl rozcieńczonego mAb do każdego dołka. Inkubować płytkę przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej.
- Dodać kozią antymysią IgG sprzężoną z peroksydazą chrzanową (rozcieńczenie 1:200 w rozcieńczonym buforze) do dalszej inkubacji.
- Dodać substrat peroksydazy do każdego dołka (100 μl/dołek) i inkubować przez 10-15 minut.
- Zatrzymać reakcję enzymatyczną za pomocą roztworu zatrzymującego peroksydazę (100 μl/dołek), gdy obserwuje się rozwój koloru.
- Odczytaj gęstość optyczną przy 450 nm za pomocą spektrofotometru mikropłytkowego.
6. Przygotowanie mAb znakowanego złotem koloidalnym
Uwaga: Kolor roztworu złota koloidalnego i mieszaniny powinien być zawsze czerwony. Dostosuj pH, stężenie mAb, prędkość wirowania, gdy zauważy się osad. Kroki 6.1 i 6.2 są krokami optymalizacji.
- Dodać oczyszczony wykrywający mAb (50 μg/ml, 3 μl) do 100 μl koloidalnego roztworu złota o wartościach pH w zakresie 5-9. Minimalne pH, które utrzymuje kolor czerwony przez dwie godziny, jest uważane za optymalne pH. Uwaga: W tym badaniu użyto 0,1 M węglanu potasu do dostosowania roztworu złota koloidalnego (40 nm) do pH 8,0 (optymalne pH).
- Dodać różne ilości oczyszczonego wykrywającego mAb (500 μg/ml, 1-20 μl) do 100 μl roztworu złota koloidalnego o pH 8,0. Uwaga: Optymalne stężenie w tym badaniu wynosi 6 μg/ml (bez czarnego osadu).
- Zgodnie z powyższymi wynikami dodać kroplami 60 μg oczyszczonego mAb wykrywającego do 10 ml roztworu złota koloidalnego. Mieszaninę delikatnie emulgować w temperaturze pokojowej przez 10 minut. Dodać 2 ml 5% roztworu BSA w PBS (pH 7,4) do mieszaniny i delikatnie emulgować w temperaturze pokojowej przez 15 minut, aby zmniejszyć zakłócenia tła.
- Odwirować mieszaninę przy 10 000 x g przez 30 minut w temperaturze 4 °C.
- Ostrożnie usunąć supernatant z niesprzężonym przeciwciałem i zawiesić powstałe osadki w 4 ml PBST zawierającym 1% BSA i 0,1% Tween 20, a następnie powtórzyć kilkakrotnie wirowanie i zawiesinę.
- Zawiesić końcowe osady w 1 ml PBST i przechowywać w temperaturze 4 °C do czasu ich wykorzystania.
7. Budowa paska odpornościowego
Uwaga: Rysunek 1 przedstawia projekt paska odpornościowego. Przygotuj i zmontuj paski w warunkach laboratoryjnych o niskiej wilgotności (< 20% wilgotności względnej), aby przedłużyć okres przechowywania (> 1 rok). Wymiary bloczków i membrany to: podkładka sprzężona 300 mm x 10 mm, podkładka chłonna 300 mm x 24 mm, podkładka na próbkę 300 mm x 24 mm, membrana NC 300 mm x 25 mm, tektura 300 mm x 80 mm.
- Dodać roztwór mAb znakowany złotem koloidalnym z kroku 6.6 za pomocą mikropipety, aby nasycić koniugatową podkładkę, a następnie wysuszyć ją w temperaturze 37 °C przez 1 godzinę przed złożeniem.
- Rozprowadzić swoiste mAb wychwytujące antygen (500 μg/ml) w strefie testowej i królicze przeciwciało anty-mysie IgG (500 μg/ml) w strefie kontrolnej w celu wykrycia mAb na membranie NC za pomocą pipety lub drukarki immunopaskowej. Zachowaj odległość (>5 mm) między dwiema strefami, aby uniknąć zakłóceń.
- Wklej sprzężoną podkładkę, podkładkę chłonną i membranę NC na tekturę za pomocą taśmy dwustronnej.
Uwaga: Nakładaj na siebie podkładki po każdej stronie membrany NC na około 2 mm. Niewłaściwa konstrukcja paska spowoduje niepełny test.
- Umieść podkładkę próbki na bloczku sprzężonym (2 mm) i wklej ją na tekturze.
- Utwórz paski o szerokości 6 mm za pomocą gilotyny do papieru. Zapakuj paski w torebkę z folii aluminiowej ze środkiem osuszającym i przechowuj je w temperaturze 4 °C do czasu użycia.
8. Test reaktywności krzyżowej
- Homogenizować 0,03 g próbki surowych mięśni z 1 ml PBS (zawierającym 0,1% BSA) w probówce wirówkowej o pojemności 1,5 ml za pomocą bambusowego patyczka lub pręta szlifierskiego.
- Przytrzymaj pasek za koniec przeciwny do obszarów testowych i zanurz część podkładki próbki w próbce na 5-10 minut i obserwuj wynik bezpośrednio.
- Opcjonalnie: Zebrać 500 μl supernatantu i przenieść go do nowej probówki wirówkowej.
Uwaga: Ten krok jest zalecany, jeśli sygnał nie jest oczywisty, gdy pasek jest bezpośrednio zanurzony w supernatantze.
- Przetestuj różne próbki mięśni w trzech egzemplarzach.
Uwaga: Tutaj przetestowaliśmy tuńczyka, kurczaka, fokę, 15 gatunków waleni i 5 gatunków ssaków lądowych.
- Niech pięciu niezależnych inspektorów powtórzy punkt 8.3 pięć razy, tj. zużywa w sumie 575 pasków.