Mezenchymalne komórki zrębu (MSC) są coraz częściej rozpoznawane ze względu na swój potencjał terapeutyczny w szerokim zakresie chorób, w tym chorób płuc. Oprócz wykorzystania MSCs szpiku kostnego i rdzenia pępowinowego w terapii egzogennych komórek, rośnie również zainteresowanie potencjałem naprawczym i regeneracyjnym rezydujących tkanki MSC. Co więcej, prawdopodobnie odgrywają rolę w prawidłowym rozwoju narządów i przypisuje się im rolę w chorobach, szczególnie tych o charakterze zwłóknieniowym. Główną przeszkodą w badaniu tych rezydujących tkankowych MSCs jest brak wyraźnego markera do izolacji i identyfikacji tych komórek. Opisana tutaj technika izolacji wykorzystuje wiele cech MSC rezydentnych w płucach (L-MSC). Po złożeniu szczurów w ofierze płuca są usuwane i wielokrotnie płukane w celu usunięcia krwi. Po mechanicznej dysocjacji za pomocą skalpela płuca są trawione przez 2-3 godziny przy użyciu mieszanki kolagenazy typu I, neutralnej proteazy i DNazy typu I. Otrzymana zawiesina jednokomórkowa jest następnie przemywana i nakładana warstwami na podłoże o gradiencie gęstości (gęstość 1,073 g/ml). Po odwirowaniu komórki z interfazy są myte i posiewane w kolbach poddanych działaniu kultur. Komórki hoduje się przez 4-7 dni w fizjologicznych warunkach 5%O2, 5% CO2 . W celu zubożenia fibroblastów (CD146-) i zapewnienia populacji składającej się wyłącznie z L-MSC (CD146+), pozytywna selekcja komórek CD146+ odbywa się poprzez selekcję kulek magnetycznych. Podsumowując, procedura ta niezawodnie wytwarza populację pierwotnych L-MSC do dalszych badań in vitro i manipulacji. Ze względu na charakter protokołu, można go łatwo przełożyć na inne eksperymentalne modele zwierzęce.