Tutaj wyjaśniamy protokół modelowania mikrośrodowiska biofizycznego, w którym sieciowanie i zwiększona sztywność błony podstawnej (BM) indukowana przez zaawansowane produkty końcowe glikacji (AGE) ma patologiczne znaczenie.
Artykuł metodologiczny
Tutaj wyjaśniamy protokół modelowania mikrośrodowiska biofizycznego, w którym sieciowanie i zwiększona sztywność błony podstawnej (BM) indukowana przez zaawansowane produkty końcowe glikacji (AGE) ma patologiczne znaczenie.
Tutaj opisujemy protokół, który może być wykorzystany do badania mikrośrodowiska biofizycznego związanego ze zwiększoną grubością i sztywnością błony podstawnej (BM) podczas patologii związanych z wiekiem i zaburzeń metabolicznych (np. rak, cukrzyca, choroby mikronaczyniowe, retinopatia, nefropatia i neuropatia). Założeniem modelu jest nieenzymatyczne sieciowanie odtworzonej matrycy BM (rBM) poprzez traktowanie aldehydem glikolowym (GLA) w celu promowania wytwarzania zaawansowanych produktów końcowych glikacji (AGE) w reakcji Maillarda. Przedstawiono przykłady technik laboratoryjnych, które można wykorzystać do potwierdzenia generowania AGE, nieenzymatycznego sieciowania i zwiększonej sztywności w rBM poddanych działaniu GLA. Obejmują one przygotowanie natywnego rBM (traktowanego solą fizjologiczną buforowaną fosforanami, PBS) i sztywnego rBM (traktowanego GLA) w celu oznaczenia: zawartości jego AGE za pomocą analizy fotometrycznej i mikroskopii immunofluorescencyjnej, jego nieenzymatycznego sieciowania za pomocą elektroforezy w żelu poliakryloamidowym dodecylosiarczanu sodu (SDS PAGE) oraz mikroskopii konfokalnej oraz jego zwiększonej sztywności za pomocą reometrii. Opisana tutaj procedura może być stosowana do zwiększenia sztywności (modułów sprężystości, E) rBM do 3,2 razy, zgodnie z pomiarami wykonanymi w zdrowej i chorej tkance gruczołu krokowego człowieka. Aby odtworzyć biofizyczne mikrośrodowisko związane ze starzeniem się i chorą gruczołem krokowym, wprowadzono trzy typy komórek gruczołu krokowego do natywnego rBM i sztywnego rBM: RWPE-1, komórki nabłonka prostaty (PEC) pochodzące z normalnego gruczołu krokowego; BPH-1, PEC pochodzące z gruczołu krokowego dotkniętego łagodnym przerostem gruczołu krokowego (BPH); i PC3, komórki przerzutowe pochodzące z wtórnego guza kości wywodzącego się z raka prostaty. Można mierzyć wiele parametrów, w tym wielkość, kształt i charakterystykę inwazyjną gruczołów 3D utworzonych przez RWPE-1 i BPH-1 na natywnym i sztywnym rBM oraz średnią długość komórki, prędkość migracji i trwałość ruchu komórek sferoid 3D utworzonych przez komórki PC3 w tych samych warunkach. Można również ocenić komórkowe szlaki sygnałowe i subkomórkową lokalizację białek.
Błona podstawna (BM) to arkusz wyspecjalizowanej macierzy zewnątrzkomórkowej (ECM), która utrzymuje stabilne granice tkanek poprzez oddzielanie warstw komórek nabłonkowych od zrębu1. Sieciowanie kowalencyjne między sąsiednimi potrójnymi helisami kolagenu IV w BM stabilizuje ich boczne powiązanie poprzez ustanowienie nieregularnej sieci super skręconych helis2. Te kolagenowe sieci dożylne działają jak rusztowanie dla jego interakcji z lamininą i innymi składnikami BM1. Układ strukturalny BM zapewnia mu wytrzymałość mechaniczną i sztywność niezbędną do prawidłowego rozwoju nabłonka gruczołowego3.
Podczas starzenia się i choroby BM stopniowo gęstnieje i sztywnieje3,4. Na przykład 3-krotny wzrost modułu sprężystości (E) BM oka występuje między 50 a 80 rokiem życia w normalnej populacji, a usztywnienie to nasila się w zaburzeniach metabolicznych, takich jak cukrzyca5. Zmiany strukturalne i biomechaniczne w BM, które powodują jego zwiększoną sztywność, zachodzą, gdy jego składniki ECM, kolagen IV i laminina, stają się nieenzymatycznie usieciowane po ekspozycji na zaawansowane produkty końcowe glikacji (AGE).
Celem opisanej tutaj metody było stworzenie modelu do badania, w jaki sposób sztywność BM, spowodowana ekspozycją na AGE, sprzyja inwazyjności komórek nabłonka prostaty (PEC) i komórek nowotworu prostaty (PTC) w kontekście przejścia na raka prostaty z przerzutami (PCa). Aby to zrobić, poprzednia metoda stosowana do generowania 3D gruczołowych acini z komórek nabłonka sutka (MEC) w odtworzonych żelach rBM6 została dostosowana do dodatkowego etapu, w którym żele rBM są wstępnie traktowane aldehydem glikolowym (GLA). Opisano kilka technik oceny sieciowania i usztywnienia indukowanego GLA wstępnie poddanych obróbce żeli rBM, w tym analizę fotometryczną, elektroforezę w żelu poliakrylamidowym dodecylosiarczanu sodu (SDS PAGE), mikroskopię konfokalną i analizę reometryczną. Typy komórek gruczołu krokowego wybrane do hodowli na wstępnie usztywnionym rBM obejmują: RWPE-1, PEC pochodzące z normalnego gruczołu krokowego7; BPH-1, PEC pochodzące z gruczołu krokowego dotkniętego BPH8; i PC3, przerzutowe PTC pochodzące z guza wtórnego zlokalizowanego w kości kręgowej pacjenta z rakiem prostaty (PCa)9.
Oprócz postępu w badaniach nad patologią gruczołów krokowych, protokół usztywniania żeli rBM poprzez ich leczenie GLA może być dostosowany do zbadania, w jaki sposób sztywność BM przyczynia się do innych patologii związanych z wiekiem i zaburzeń metabolicznych. Na przykład, model może być bezpośrednio zastosowany do zbadania, w jaki sposób rak z przerzutami jest wywoływany przez sztywność BM w narządach takich jak piersi, okrężnica, jajnik i trzustka poprzez włączenie odpowiednich typów komórek. Co więcej, protokół może zostać dostosowany do zbadania, w jaki sposób sztywny BM sprzyja biomechanicznym mechanizmom progresji choroby w chorobach mikronaczyniowych związanych z cukrzycą, retinopatii, nefropatii i neuropatii.
1. Indukcja sztywności BM wywołana przez leczenie GLA (sieciowanie nieenzymatyczne)
2. Kwantyfikacja sieciowania nieenzymatycznego i sztywności rBM poddanego działaniu GLA
3. Hodowla i obchodzenie się z normalną linią PEC, RWPE-1
4. Hodowla i obchodzenie się z linią komórkową BPH, BPH-1
5. 3D Kultura gruczołu krokowego Acini na rodzimym i sztywnym rBM
6. 3D Hodowla agregatów komórek nowotworowych prostaty na natywnym i sztywnym rBM
Kultury 3D acini prostaty na sztywnym rBM
Po 6 dniach hodowli, PEC wywodzące się z prawidłowej tkanki prostaty (RWPE-1) (Ryc. 1A) oraz tkanki BPH (BPH-1) (Ryc. 1B) tworzą na natywnym (traktowanym PBS) rBM acini, które są zorganizowane w jednorodne sferoidy komórek nabłonkowych. Acini te wykazują również cechy wysoce zorganizowanych PEC z polaryzacją od strony apikalnej do bazalnej oraz widoczną przestrzenią luminalną13,20.
Acini utworzone przez PEC pochodzące z prawidłowej tkanki prostaty (RWPE-1) (Ryc. 1A) oraz tkanki BPH (BPH-1) (Ryc. 1B) na usztywnionym (bogatym w AGE) rBM (poddanym działaniu GLA) wykazują zaburzoną architekturę (zmiana kształtu z sferoidalnego na wielokątny oraz protruzja/migracja komórek z acini do rBM bogatego w AGE) (Ryc. 1A). Acini te charakteryzują się również silnie zdezorganizowanymi PEC, które utraciły polarność od wierzchołkową do podstawnej, z niewielką lub nieistniejącą przestrzenią luminalną13.

Rysunek 1: Komórki nabłonka prostaty hodowane jako 3D gruczołowe acini na natywnej i sztywnej zrekonstytuowanej błonie podstawnej (rBM). (A) Obrazy w jasnym polu komórek RWPE-1 hodowanych od 12 h do 6 dni na żelach rBM traktowanych PBS (natywna) lub 50 mM glikolaldehydem przez 14 h (bogata w AGE; sztywna); pasek skali = 50 µm. (B) Komórki BPH-1, hodowane zgodnie z opisem w panelu A; paski skali = 50 µm; dane są reprezentatywne dla 3 niezależnych eksperymentów. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Tabela 1: Charakterystyka cewek acynarnych nabłonka prostaty RWPE-1 hodowanych na naturalnej, półsztywnej i sztywnej zrekonstytuowanej błonie podstawnej (rBM). Cewki acynarne RWPE-1 hodowano na rBM poddanych wstępnej obróbce w PBS przez 14 h (naturalna), glikolaldehydem (GLA) przez 6 h (półsztywna) lub GLA przez 14 h (sztywna). W przypadku kształtu cewek obliczono odsetek (%) ± odchylenie standardowe (SD) cewek okrągłych, półpoligonalnych i poligonalnych na podstawie 5 niezależnych eksperymentów (ilościowo określono 50 cewek na warunek). Względną wielkość cewek obliczono (naturalna rBM = 100 %) na podstawie 3 niezależnych eksperymentów. W celu oceny inwazyjności obliczono % ± SD cewek z jedną lub więcej komórkami prototypującymi na podstawie 3 niezależnych eksperymentów. Krotność zmiany (fold change) obliczono, dzieląc średnią wartość uzyskaną w warunkach półsztywnych lub sztywnych przez odpowiednią wartość dla warunków naturalnych. Wartości p obliczono za pomocą testu t Student'a (α = 0.05).
Zależny od wieku wzrost sztywności rBM promuje migrację komórek raka prostaty PC3
Komórki PC3 hodowane na natywnej rBM migrują, utrzymując ciągły kontakt międzykomórkowy, podczas gdy komórki PC3 hodowane na rBM bogatej w AGE (sztywnej) poruszają się niezależnie od siebie (Rysunek 2A). Po 72 h hodowli komórki PC3 tworzą ogniska (sferoidy) na natywnej rBM (traktowanej PBS), natomiast komórki PC3 na sztywnej (bogatej w AGE) rBM nie tworzą sferoidów i migrują niezależnie (Rysunek 2B). Komórki PC3 na sztywnej (bogatej w AGE) rBM są bardziej wydłużone niż komórki PC3 hodowane na natywnej rBM (Rysunek 2C). Komórki PC3 na sztywnej rBM migrują szybciej niż komórki PC3 hodowane na natywnej rBM (Rysunek 2D). Komórki PC3 na sztywnej rBM wykazują zmniejszoną uporczywość ruchu w porównaniu do komórek PC3 hodowanych na natywnej rBM (Rysunek 2E).

Rycina 2: Migracja komórek nowotworu prostaty na natywnej i sztywnej zrekonstytuowanej błonie podstawnej (rBM). (A) Obrazy w jasnym polu komórek PC3 hodowanych na żelach rBM traktowanych PBS (natywne) lub 50 mM glikolaldehydem przez 14 h (bogate w AGE, sztywne). Obrazowanie komórek wykonano za pomocą mikroskopu w jasnym polu (obiektyw 10X) z częstotliwością akwizycji 1 obrazu na godzinę przez 12 h, a następnie przeprowadzono śledzenie komórek w celu wygenerowania trajektorii. Przedstawione obrazy odpowiadają punktom czasowym po 0, 3, 6, 9 i 12 h. Trajektorie pojedynczych komórek pokazano dla punktu czasowego 12 h. Pasek skali = 100 µm. (B) Komórki PC3 hodowane na natywnej lub sztywnej rBM przez 72 h, obrazowane zgodnie z opisem w panelu (A). Pasek skali = 100 µm. Szczegół pokazuje wybrany obszar przy powiększeniu 2X. (C) Średnia ± S.D. długość komórek (µm); istotna różnica między natywną rBM a sztywną rBM (p = 1.2 x 10-23). (D) Średnia ± S.D. prędkość (µm/hr) obliczona z trajektorii komórek; istotna różnica między natywną rBM a sztywną rBM (p = 0.004). (E) Średnia ± S.D. trwałość ruchu komórek (stosunek D/T, gdzie D = odległość od początku do końca trajektorii komórki, T = całkowita długość trajektorii komórki); istotna różnica między natywną rBM a sztywną rBM (p = 0.0007). Dla paneli C-E przeanalizowano >10 komórek, dane są reprezentatywne dla 3 niezależnych eksperymentów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Protokół generowania trójwymiarowych (3D) cewek gruczołowych z komórek nabłonkowych piersi (MECs) w czystych żelach z rBM6 został zmodyfikowany w poprzednim badaniu poprzez dodanie 4 mg/ml kolagenu typu I do macierzy rBM. Dodatek kolagenu spowodował wzrost modułu sprężystości żelu rBM ze 175 ± 37 do 1589 ± 380 Pa. Ten 9,1-krotny wzrost sztywności modulował wzrost, przeżywalność, migrację i różnicowanie MECs21. Protokół zmodyfikowano ponownie, wprowadzając etap traktowania D-(-)-rybozą w celu promowania nieenzymatycznego sieciowania kolagenu typu I dodanego do żelu rBM. Stwierdzono, że wynikający z tego 15-krotny wzrost sztywności współdziała z transformacją onkogenną MECs, promując ich inwazyjne zachowanie22. Podejście eksperymentalne polegające na dodawaniu kolagenu typu I do żeli rBM ułatwia bezpośrednią interakcję MECs z włóknami kolagenowymi, co w tkance ludzkiej zachodzi dopiero po proteolitycznej degradacji bariery fizycznej między stromą a nabłonkiem, tworzonej przez BM. Poprzez generowanie 3D cewek gruczołowych z komórek nabłonkowych prostaty (PECs) w czystych żelach rBM wstępnie traktowanych GLA, niniejszy protokół otwiera drogę do badania, w jaki sposób sztywność BM per se może wywoływać ich inwazyjne zachowanie (Rycina 3). Poziomy sztywności BM indukowane w tym protokole mają znaczenie fizjologiczne. Inkubacja z 50 mM GLA przez odpowiednio 6 h i 14 h zwiększyła moduły sprężystości czystego żelu rBM do 175 ± 90 oraz 322 ± 160 Pa, w porównaniu do 122 ± 55 Pa w żelach rBM traktowanych PBS (Tabela 1). Ten 1,7- do 3,2-krotny wzrost sztywności rBM odzwierciedla 2,5- do 3,4-krotny wzrost sztywności zaobserwowany w tkance złośliwej w porównaniu do prawidłowej prostaty lub tkanki z BPH23-26. Jak opisano w niedawnej publikacji13, zmiany morfologiczne indukowane przez akumulację AGE i sztywność rBM w cewkach PEC można ilościowo określić pod kątem statystycznie istotnego przejścia z kształtu zaokrąglonego na wielokątny, zmniejszenia stosunku powierzchni światła do całkowitej powierzchni cewki oraz obecności komórek migrujących z acina do bogatego w AGE rBM (Rycina 3). Immunoblotting może być również wykorzystany do oceny markerów EMT (np. utraty E-kadheryny13) oraz zachowania kurczliwego (np. fosforylowanej lekkiej łańcuchowej miozyny-2, pMLC213) w PECs hodowanych w prawidłowym oraz sztywnym rBM (Rycina 3). Dalsza ewaluacja z wykorzystaniem barwienia immunofluorescencyjnego i mikroskopii konfokalnej może zostać zastosowana do wizualizacji BM (np. lamininy, kolagenu IV i akumulacji AGE13), polarności komórkowej od strony apikalnej do bazalnej (np. apikalnej lokalizacji EEA1: wczesnego antygenu endosomalnego 1 oraz GM130: markera cis-Golgi o masie 130 kDa13) oraz wzorców rozmieszczenia cząsteczek adhezyjnych (np. lokalizacji E-kadheryny w połączeniach międzykomórkowych13) (Rycina 3).

Rysunek 3: Przegląd przedstawionych tutaj różnych protokołów. Schemat przedstawia sposób przygotowania i utwardzania zrekonstytuowanej błony podstawnej (rBM) za pomocą glikolaldehydu (reakcja Maillarda), sposób wysiewania komórek na utwardzoną rBM, sposób analizy utwardzonej rBM (stopień reakcji Maillarda) oraz procedury, które można wykorzystać do analizy zmian komórkowych i molekularnych indukowanych przez rBM bogatą w AGE. AGE, zaawansowane produkty glikacji; BM, błona podstawna; DAPI, 4',6-diamidino-2-fenyloindol; EEA1, wczesny antygen endosomalny 1; GAPDH, gliceraldehyd-3-fosforanowa dehydrogenaza; GLA, glikolaldehyd; GEE, ester etylowy glicyny; GM130, marker cis-Golgiego 130 kDa; p-MLC2 (Thr18/Ser19), łańcuch lekki miozyny-2 fosforylowany w pozycjach treonina 18 i seryna 19; rBM, zrekonstytuowana błona podstawna; SDS-PAGE, elektroforeza w żelu poliakrylamidowym z dodecylofosforanem sodu. Dla acynów RWPE1 pasek skali = 10 µm; dla sferoidów komórek nowotworowych PC3 pasek skali = 100 µm. Rysunek został zmodyfikowany na podstawie referencji13. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.
Konieczne będzie podjęcie kroków rozwiązywania problemów, jeśli jako czynnik sieciujący dla rBM zostanie wybrana D-(-)-ryboza. Podczas opracowywania protokołu stwierdzono, że inkubacja z 1 M D-(-)-rybozą przez 72 hr, zgodnie z wcześniejszym opisem dla żeli rBM/kolagenowych22, prowadziła do odwodnienia i kurczenia się żeli rBM. Ocena zastosowania niższych stężeń D-(-)-rybozy oraz krótszych czasów inkubacji może pomóc w przezwyciężeniu tego ograniczenia.
Potencjalne ograniczenie w przyszłych zastosowaniach protokołu może wystąpić w sytuacjach, gdy wymagany jest wyższy poziom sztywności rBM. Jeśli w celu uzyskania większej sztywności żelu rBM zastosowane zostaną dłuższe czasy inkubacji i wyższe stężenia GLA, konieczne będzie ocenienie, czy warunki te wpływają na przeżywalność i proliferację komórek, zgodnie z wcześniejszymi opisami13. Należy również zauważyć, że inkubacja komórek RWPE-1 z surowicą indukuje fenotypową transformację typu EMT, dlatego należy unikać ekspozycji na surowicę lub materiały zawierające surowicę. Na przykład, jeśli eksperymenty obejmują transfekcję oligonukleotydów krótkiego interferującego RNA (siRNA), procedura powinna zostać zoptymalizowana przy użyciu komórek RWPE-1 hodowanych w KSFM, bez przenoszenia komórek do mediów transfekcyjnych z niską zawartością surowicy. To ograniczenie może wpłynąć na poziom wyciszenia genów osiągany podczas stosowania przejściowych metod siRNA w tym modelu. W przypadku niektórych białek docelowych zaleca się zastosowanie indukowalnych wektorów shRNA w celu regulowanego wyciszania genów i uzyskania pożądanego obniżenia poziomu białka. W przyszłych modelach można wprowadzić adaptacje uwzględniające enzymatyczne sieciowanie za pomocą oksydazy lizylowej (LOX)17 związanej z komórkami zrębu lub komórkami nowotworowymi.
Niniejszy protokół ułatwi przyszłe badania nad mechanizmami proinwazyjnymi wywołanymi przez zależną od AGE sztywność błony podstawnej w PECs (RWPE-1, BPH-1) oraz ocenę celów antymetastatycznych w inwazyjnych PTCs (PC3). Biorąc pod uwagę, że BPH jest uważana za zaburzenie metaboliczne27, protokół ten toruje również drogę do lepszego zrozumienia związku między zaburzeniami metabolicznymi a zwiększonym ryzykiem raka prostaty. Ponieważ sztywność błony podstawnej indukowana ekspozycją na AGE może być wyzwalaczem inwazyjności w innych typach nowotworów, interesujące będzie wykorzystanie tego protokołu do stworzenia podobnych modeli obejmujących prawidłowe komórki nabłonkowe i komórki nowotworowe z innych organów (np. piersi, jelita grubego, jajników, trzustki).
Kluczowe etapy protokołu wraz z ich czasem trwania przedstawiono w Rysunku 4. Podczas pierwszego etapu niezbędne jest utrzymywanie roztworu zapasowego rBM w temperaturze 4 °C podczas rozmrażania, aby zapobiec jego polimeryzacji. Końcówki do pipet nie powinny być wprowadzane do roztworu zapasowego rM, dopóki nie zostaną schłodzone do 4 °C>. W kolejnym kroku ważne jest również upewnienie się, że szkiełka komorowe osiągnęły temperaturę 4 °C przed pokryciem ich roztworem rBM. Gdy tylko temperatura roztworu rBM wzrośnie powyżej 4 °C, ulegnie on nieodwracalnej polimeryzacji, tworząc żel. Niezbędne jest, aby nie zakłócać rBM podczas etapu polimeryzacji, aby zapewnić utworzenie gładkiej powierzchni odpowiedniej do hodowli komórkowej i analizy mikroskopowej. Czas inkubacji z GLA, z inhibitorami reakcji Maillarda (cyjanoborowodorek sodu i aminoguanidyna) lub bez nich, określi stopień sztywności żelu rBM. W przypadku zapotrzebowania na warunki półsztywne zaleca się 6-godzinną inkubację z GLA, a w przypadku warunków sztywnych – inkubację 14-godzinną (Tabela 1). Jeśli pożądany jest inny stopień sztywności, można zastosować alternatywne czasy inkubacji lub stężenia GLA. W takim przypadku konieczne jest włączenie analizy reologicznej żeli rBM jako niezbędnego etapu. Po etapie przerywania reakcji Maillarda poprzez inkubację z GEE i następujących po niej etapach płukania PBS, żele rBM można wykorzystać natychmiast lub przechowywać w temperaturze 4 °C do 48 h przed użyciem do hodowli komórek. Po przygotowaniu hodowli komórkowych ważne jest zmienianie pożywki (wraz z wszelkimi substancjami do traktowania) co dwa dni. Zaleca się utrzymywanie trójwymiarowych (3D) hodowli komórkowych przez 3-12 dni, w zależności od badanych parametrów. W przypadku 3D acini PEC zaleca się analizę hodowli po 6 dniach, a w przypadku 3D sferoidów PTC analizę zaleca się w pierwszej kolejności po 3 dniach hodowli.

Rycina 4: Przegląd protokołu z zaznaczonymi krytycznymi krokami i ramami czasowymi. Schemat blokowy przedstawia sposób przygotowania i utwardzania zrekonstytuowanej błony podstawnej (rBM) za pomocą glikolaldehydu (reakcja Maillarda) z zaznaczeniem krytycznych kroków i czasu trwania. Wskazano również punkty, w których można przerwać protokół i przechowywać żele rBM. rBM, zrekonstytuowana błona podstawna; GLA, glikolaldehyd; GEE, ester etylowy glicyny; O.N., przez noc; PBS, roztwór soli fosforanowej; R.T., temperatura pokojowa. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Dziękujemy Simonowi Haywardowi (Vanderbilt University Medical Center) za komórki BPH-1; oraz Thomasowi Coxowi i Janine Erler (Centrum Badań i Innowacji Biotechnologicznych, Uniwersytet w Kopenhadze) za ich pomoc w pomiarach reologicznych. Badanie MR-T zostało sfinansowane przez Worldwide Cancer Research, dawniej The Association of International Cancer Research (grant 08-0803 dla JS), Ambasadę Brytyjską w Montevideo oraz Agencia Nacional de Investigación e Innovación (UK_RH_2015_1_2 do MR-T). MC był wspierany przez Prostate Cancer UK (grant S14-017 dla JS i GS). KW został ufundowany przez Chińską Radę Stypendialną. MAM został sfinansowany przez Biuro Kultury Arabii Saudyjskiej.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| I - Materiał do hodowli jednowarstwowej | |||
| BPH-1 | Baza danych linii komórkowych CaP | PCaCL-132 | Kontakt: simon.hayward@mcmail.vanderbilt.edu |
| Kompletne podłoża bez keratynocytów w surowicy | ThermoFisher Scientific | 17005-075 | Nie ogrzewać się w temperaturze 37 & ordm; C przed użyciem |
| Surowica cielęca płodu | First Link UK Ltd | 02-00-850 | Sklep pod adresem -20 º C w podwielokrotnościach |
| PC3 | American Type Culture Collection | CRL-1435 | |
| Penicylina/streptomycyna | ThermoFisher Scientific | 15070-063 | |
| Bufor fosforanowy Sól fizjologiczna w tabletkach (Dulbecco A) | Oxoid | BR0014G | |
| RPMI 1640 średni | Sigma-Aldrich | R5886 | ciepły w 37 & ordm; C kąpiel wodna przed użyciem |
| RWPE-1 | American Type Culture Collection | CRL-11609 | |
| Roztwór trypsyny-EDTA | Sigma-Aldrich | T4049 | |
| Nazwa | Company | Numer katalogowy | Komentarze |
| II - Materiał do hodowli 3D | |||
| Acetonitryl | Sigma-Aldrich | 271004 | |
| Chlorowodorek aminoguanidyny | Sigma-Aldrich 396494 | Działa drażniąco na oczy, układ oddechowy i skórę | |
| Szkiełka komorowe, 8-dołkowe | Thermo Scientific Nunc Lab-Tek | TKT-210-816M | |
| Culture Matrix odtworzona membrana podstawna (rBM) ekstrakt zredukowanego czynnika wzrostu | AMS Biotechnology | 3445-005-01 | Przechowuj membranę podstawną (BM) przy -80 º C w podwielokrotnościach |
| Bromek cyjanu | Sigma-Aldrich | C91492 | Działa toksycznie przez skórę kontaktową i wdychanie |
| Kwas mrówkowy | Sigma-Aldrich | 695076 | |
| Chlorowodorek estru etylowego glicyny (GEE) | Sigma-Aldrich | 50060 | Działa drażniąco na oczy |
| Dimer aldehydu glikolowego (GLA) | Sigma-Aldrich | G6805 | |
| Cyjanoborowodorek sodu | Sigma-Aldrich | 71435 | Wysoce łatwopalny; Działa toksycznie przez kontakt ze skórą i wdychanie |
| Filtr strzykawkowy 0,22 mikrona | Appleton Woods | BC680 | |
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
| III - Materiał do ilościowego określenia reakcji Maillarda | |||
| 4',6-diamidyn-2-fenyloindol (DAPI) | ThemoFisher Scientific | D3571 | wrażliwy na światło i przechowywany w temperaturze -20 º C w podwielokrotnościach Cylindry |
| klonujące | Sigma-Aldrich | C1059 | |
| Kozia anty-mysia IgG (H+L) Alexa Fluor 488 koniugat | ThemoFisher Scientific | A-11001 | światłoczuły |
| Kozioł anty-królik IgG (H+L) Alexa Fluor 488 koniugat | ThemoFisher Scientific | A-11034 | światłoczuła |
| surowica kozia | Abcam | ab7481 | Przechowywać pod adresem -20 º C w podwielokrotnościach Nośniki montażowe |
| Vectashield | Vector Laboratories | H-1000 | |
| Mysz klon anty-pentozydyny PEN-12 mAb | TransGenic Inc | KH012 | |
| Paraformaldehyd (PFA) | Sigma-Aldrich | F8775 | Przechowywać w temperaturze -20 º C w podwielokrotnościach |
| Królicze przeciwciało poliklonalne anty-kolagen ludzki IV | Przeciwciała Acris | R1041 | Przechowywać w temperaturze -20 º C w podwielokrotnościach |
| Królik anty-laminina A/C pAb | Santa Cruz Biotechnology Inc | sc-7292 | Przechowywać pod adresem -20 º C w podwielokrotnościach |
| Eter tert-oktylofenylowy glikolu polietylenowego (Triton-X100) | Sigma-Aldrich | T9284 | |
| Monolaurynian glikolu polietylenowego sorbitanu (Tween-20) | Sigma-Aldrich | P1379 | |
| Kaseta do dializy Slide-A-Lyzer | ThemoFisher Scientific | 66333 | |
| Nazwa | Company | < strong>Numer katalogowy | Uwagi |
| IV - Sprzęt | |||
| ARG2 reometr rotacyjny z kontrolowanym odkształceniem | T.A. Instruments | ||
| Mikroskop Axiovert S100 (20-krotne powiększenie) | Zeiss Komora | ||
| do mikroskopu Zeiss Axio S100 | Mikroskop Solent Scientific | ||
| Confocal Axiovert 200M (powiększenie 40X, 63X) | Mikroskop Zeiss | ||
| Olympus LH50A wyposażony w kamerę cyfrową wykorzystującą kontrast fazowy | Olimpia | ||
| Spektrofotometr czytnika płytek PHERAstar Plus | BMG Labtech | ||
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Uwagi |
| V - Oprogramowanie | |||
| Image J 1.47v | Narodowy Instytut Zdrowia, USA | ||
| Urządzenia molekularne | MetaXpress |